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Il DFE o DsRed-2F5-epitopo è una proteina di fusione ricombinante che comprende DsRed, una proteina fluorescente, e l'epitopo 2F5, un segmento dell'antigene glicoproteico dell'involucro HIV-1. Questo epitopo ha un'elevata affinità per il suo paratopo, una regione nella regione che determina la complementarità sull'anticorpo monoclonale 2F5.
Per purificare gli anticorpi monoclonali 2F5 da un campione grezzo, prelevare una colonna impacchettata con perle di resina porosa contenenti ligandi di affinità DFE immobilizzati sulla loro superficie. Sciacquare la colonna con un tampone di equilibratura adatto per mantenere il pH ed evitare interazioni non specifiche tra i componenti del campione e la resina nelle fasi successive.
Caricare il campione contenente gli anticorpi monoclonali 2F5 target nella colonna. Gradualmente, gli anticorpi nel campione iniziano a fluire attraverso la colonna o la fase stazionaria.
Durante il flusso, gli anticorpi interagiscono in modo reversibile con i ligandi di affinità DFE immobilizzati sulla fase stazionaria. In queste interazioni, il paratopo dell'anticorpo 2F5 si lega specificamente al suo epitopo complementare sul ligando DFE.
Lavare la colonna con un tampone di equilibratura per rimuovere il campione indesiderato legato in modo non specifico alla colonna. Passare un tampone di eluizione attraverso la colonna.
L'elevata forza ionica del tampone destabilizza le interazioni tra i ligandi DFE e gli anticorpi monoclonali 2F5. Di conseguenza, gli anticorpi monoclonali eluiscono come frazioni dalla colonna.
Raccogli le frazioni di anticorpi purificate e conservale per le applicazioni a valle.
Innanzitutto, preparare 100 millilitri dell'estratto vegetale chiarificato contenente 2F5 o del surnatante del sistema di espressione cellulare preferito, che contiene anche 2F5. Successivamente, preparare il tampone di equilibratura e il tampone di eluizione ad alta forza ionica, come indicato nel protocollo di testo. Lavare il sistema cromatografico con i tamponi.
Montare una colonna di affinità DFE sul sistema cromatografico ed equilibrare con 5 CV di tampone di equilibrazione a una velocità di flusso di 1 millilitro al minuto. Monitorare l'assorbanza UV a 280 nanometri. Quindi, caricare 80 millilitri dell'estratto vegetale chiarificato o del surnatante sulla colonna a una velocità di flusso di 0,5 millilitri al minuto per garantire un tempo di contatto di 2 minuti. Raccogli i campioni a flusso continuo in frazioni di 2 millilitri per la ricostruzione della curva di sfondamento.
Conservare i campioni a flusso continuo a 4 gradi Celsius, se non è possibile un'analisi immediata del campione. Successivamente, lavare la colonna con 6 CV di tampone di equilibratura. Raccogli un campione all'inizio, a metà e alla fine del lavaggio. Eluire l'mAb 2F5 con 5 volumi di tampone di eluizione ad alta forza ionica. Raccogli la frazione DFE quando il segnale UV a 280 nanometri è aumentato a 5 unità di assorbanza milli sopra la linea di base.