Name: Alta risoluzione In Vivo Manuale Protocollo Segmentazione for Human ippocampale Sottocampi Utilizzando 3T Risonanza Magnetica (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2015-11-10T14:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 3 s
Description: Impara la segmentazione manuale ad alta risoluzione dei sottocampi ippocampali umani utilizzando risonanza magnetica 3T. Questo protocollo anatomico migliora le tecniche di neuroimaging per studiare alterazioni strutturali in condizioni fisiologiche e patologiche.

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Gli autori desiderano ringraziare il sostegno della Fondazione CAMH, grazie a Michael e Sonja Koerner, la Famiglia Kimel, e la Paul E. Garfinkel Nuova Investigator Catalyst Award. Questo progetto è stato finanziato dal Fonds de Recherches Santé Québec, la Canadian Institutes of Health Research (CIHR), le scienze naturali e ingegneria Research Council del Canada, del Brain Institute Weston, Società di Alzheimer del Canada, e il Micheal J. Fox Foundation per di Parkinson Research (MMC), così come CIHR, il Mental Foundation dell&#39;Ontario Salute, NARSAD, e l&#39;Istituto Nazionale di Salute Mentale (R01MH099167) (ANV). Gli autori desiderano inoltre ringraziare Anusha Ravichandran per assistenza acquisizione delle immagini.

I partecipanti allo studio Il protocollo in questo manoscritto è stato sviluppato per cinque immagini rappresentative ad alta risoluzione raccolti da volontari sani (3F, 2M, 29-57 anni, media 37). Che erano liberi di disturbi e casi di grave trauma cranico neurologici e neuropsichiatrici. Tutti i soggetti sono stati reclutati presso il Centro per la Salute Mentale e Dipendenze (CAMH). Lo studio è stato approvato dal Comitato Etico CAMH Research ed è stato condotto in linea con la Dichiarazione di Helsinki. Tutti i soggetti forniti scritto, consenso informato per l'acquisizione dei dati e la condivisione. Per i dettagli sulla sequenza di acquisizione utilizzato per raccogliere queste immagini, si rimanda al Winterburn et al., 2013 e Parco et al., 2014. 26,34 Immagini per tutti i cinque soggetti sono stati controllati per la qualità e conservati. L'ippocampo attraversato una media di 118 fette coronali in queste immagini. 1. Software Set-up <ol><li> Aperto Display: </li></ol> 2. Tutta Hippocampus Segmentazione manuale <ol><li> Set-up: Uso di un'immagine T1 pesate, scorrere fino alla fetta antero-più coronale dell'ippocampo. Per avanzare le fette in direzione anteriore, usare il tasto '+'; utilizzare il tasto '-' per muoversi nella direzione posteriori. </li><li><strong sezione a: anteriore-most slice: utilizzando il pulsante destro del mouse disegnare bordo esterno la maggior parte della materia grigia dell dove si incontra bianca lobo temporale che circonda e usare ad alta intensit alveus per assistere con superiore l>12,22. Utilizzare il tasto E (Label Fill) nel menu di segmentazione della finestra di navigazione per riempire l'etichetta all'interno del bordo. Continuare ad applicare questi confini in tutta la testa dell'ippocampo anteriore. </li><li> Fetta B: ippocampale capo 1 (Figura 1B): <ol><li> Superior, inferiori, laterali, confini mediale: Continuare a disegnare i bordi come descritto al punto 2.2, utilizzando la sostanza bianca del lobo temporale e alveus come guida. </li><li> Border Supero-mediale: Per questo, utilizzando la vista assiale, tracciare una linea orizzontale dal bordo anteriore del dell'ippocampo laterali 29, e includere qualsiasi cosa, al di sotto di questa linea come ippocampo.NOTA: Il confine supero-mediale diventa più ambigua in queste sezioni, in cui la materia grigia dell'ippocampo si fonde con la materia grigia dell'amigdala. </li></ol></li><li> Fetta C: ippocampale Head 2 con Dentations: a seconda del soggetto, i dentations dell'ippocampo possono essere visibili per 3-4 fette (in genere, sono più visibili sul pesata in T2 contro le immagini pesate in T1). In queste fette, continuare a utilizzare la materia bianca del alveus e lobo temporale per guidare confine segmentazione 12,22. Per ulteriori informazioni, seguire i passaggi 2.5.1-2.5.2. </li><li> Fetta D: Testa ippocampale 3: <ol><li> Superior, inferiori, laterali, bordi mediali: disegnare il bordo inferiore dell'ippocampo nella materia bianca del lobo temporale, il bordo laterale al corno inferiore del ventricolo laterale, il bordo superiore, seguendo la curva delle dentations, al sostanza bianca del alveus / fimbria, e il bordo mediale al regio ipointensan della cisterna ambientale 12,22. </li><li> Supero-mediale e confini infero-mediale: continuano a definire il confine supero-mediale come descritto al punto 2.3.2. Disegnare la parte inferiore del bordo mediale in cui l'ippocampo si assottiglia leggermente e si estende nella materia grigia lievemente iperintensa della corteccia entorinale 12,22. </li></ol></li><li> Fetta E: ippocampale Testa 4 con uncus: Continuare a disegnare i confini inferiori, laterali e superiori descritti nei passaggi 2.5.1-2.5.2. Includere il uncus (che si trova medaglia al corpo principale dell'ippocampo ed è circondata da CSF bassa intensità) nella ippocampale segmentazione 12,2 2. </li><li> Fetta F: ippocampale Corpo: Continuare a disegnare i confini inferiori, laterale, mediale, e superiori descritti nei passaggi 2.5.1-2.5.2. Disegnare il confine infero-mediale nel punto in cui l'ippocampo si assottiglia mentre transita di corteccia entorinale / para-ippocampale giro 12,22.Non includere il CSF a bassa intensità del solco ippocampale rudimentale nella segmentazione. </li><li> Fetta G: Coda ippocampale 1: Iniziare segmentare le fette di coda di tipo dell'ippocampo quando i cru del fornice è il primo visibile. Escludere il giro fascicolare (una struttura della materia grigia che si fonde con l'ippocampo in alcune parti della coda dell'ippocampo) dalla segmentazione estrapolando la forma del giro fascicular in coda dell'ippocampo da più sezioni anteriori 12,22. Questa estrapolazione non è possibile solo per 2-3 fette, dopo di che le due strutture non possono essere accuratamente distinti; a questo punto, trattare tutti materia grigia visibili in quest'area ippocampo. </li><li> Fetta H: Coda ippocampale 2: Segmento materia grigia a bassa intensità della coda dell'ippocampo posteriore, dalla materia bianca ad alta intensità circostante. </li><li> Slice I: posteriore-Most Slice: Segmento piccola area rimanente della materia grigia dell'ippocampo dala materia bianca intorno del lobo temporale. </li></ol> 3. ippocampale sottocampo segmentazione manuale <ol><li> Set-up: Uso di un'immagine pesate in T2, scorrere fino alla fetta antero-più coronale dell'ippocampo (come al punto 2.1). Per cambiare il colore del pennello, selezionare D (Set Vernice Lbl :) sul menu segmentazione nella finestra di navigazione. Il terminale di comando chiederà: "Inserire label vernice corrente:". Inserire un numero compreso tra 1 e 255. Ogni numero corrisponde ad un colore un'etichetta diversa. </li><li> Fetta A: anteriore-Most Slice: Dal momento che le divisioni di sottocampo non sono ancora visibili nel antero-più slice, tracciare una linea che divide la materia visibile ippocampale grigio lungo il suo più lungo l'asse visibile (che non è necessariamente parallela ad uno qualsiasi degli assi cardinali) in due sezioni uguali di approssimare il vero 12,22 anatomia. Etichettare il superiore di queste due sezioni come CA1 e la sezione inferiore come subiculum da choosing un'etichetta di colore diverso per ogni sottocampo 23,35. </li><li> Fetta B: ippocampale Testa 1: Etichettare la zona a bassa intensità nel mezzo della formazione dell'ippocampo come SR / SL / SM 13,37. Quando la curva lungo il bordo inferiore dell'ippocampo diventa chiaro, utilizzare questo come punto di riferimento il margine laterale che separa il subiculum dal CA1 12,22. Continua a seguire l'asse più lungo dell'ippocampo per disegnare il bordo CA1-subiculum sul supero-mediale punta 37. </li><li> Fetta C: Testa ippocampale 2 con Dentations: <ol><li> SR / SL / SM, CA4 / DG, e subiculum: Etichettare la SR / SL / SM, CA4 / DG, e subiculum come descritto per fetta D (punto 3.5.1). </li><li> CA2 / CA3 e CA1: Definire il confine tra CA1 e CA2 / CA3 come linea 45 ° Angolo estende nella direzione supero-laterale dal bordo più supero-laterale del SR / SL / SM 12,22. Estrarre il CA2 / CA3 medialmente lungo il bordo superiore al trogolo tra dentale 12,22. Etichettare il resto del bordo superiore come CA1 12,22. </li></ol></li><li> Fetta D: ippocampale Head 3 <ol><li> SR / SL / SM, CA4 / DG, e subiculum: Etichettare la band / SL / SM SR buio prima, che seguirà la curva della CA1 37. Etichettare qualsiasi materia grigia ad alta intensità all'interno del SR / SL / SM come CA4 / DG 12,22,23,35,37. Questo non può essere una regione continua, come in Figura 2C. Continuare a definire il confine subiculum-CA1 utilizzando la curva nell'ippocampo inferiori 12,22. </li><li> CA2 / CA3 e CA1: Continuare a definire il CA1 e CA2 confine / CA3 come al punto 3.4.2. Estrarre il CA2 / CA3 medialmente metà lungo il bordo superiore dell'ippocampo 12,22 ed etichettare l'altra metà del bordo superiore come CA1 12,22. </li><li> Testa dell'ippocampo supero-mediale: In questa fetta, dividere la testa dell'ippocampo supero-mediale verticalmente a metà. Etichettare il mezzo mediale come SR / SL / SM 12. Dividere il lateralemetà in mezzo di nuovo, questa volta in senso orizzontale. Etichettare la parte superiore come CA4 / DG e la parte inferiore come CA2 / CA3 12. </li></ol></li><li> Fetta E: ippocampale Testa 4 con uncus <ol><li> Testa dell'ippocampo laterale (subiculum): Nella porzione laterale di queste fette, definisce il confine subiculum-CA1 come una linea verticale che si estende in direzione inferiore dal bordo più mediale del CA4 / DG 12,22. </li><li> Laterale testa ippocampale (CA1, CA2 / CA3, CA4 / DG, SR / SL / SM.): Definire il confine CA1-CA2 / CA3 nello stesso modo come al punto 3.4.2. Continuare per etichettare il SR / SL / SM come regione di bassa intensità seguendo la curva delle regioni CA. Etichettare il CA4 / DG come la cavità centrale all'interno del SR / SL / SM, come al punto 3.5.1. </li><li> Uncal testa ippocampale (SR / SL / SM): Etichetta il uncus dell'ippocampo per circa 10 fette come le transizioni testa dell'ippocampo nel corpo ippocampale. Nel uncus, etichettare la regione a bassa intensità al centro come SR / SL / SM (quando questo è difficile da vedere, approssimare l'anatomia segmentando una linea larga 2-3 voxel il centro del uncus) 12. </li><li> Testa dell'ippocampo Uncal (CA2 / CA3, CA4 / DG): Disegnare una linea sul bordo superiore della / SL sezione SR / SM lungo infero-laterale / supero-mediale asse del uncus. Etichetta tutta la materia grigia sopra di questa linea come CA2 / CA3 12. Etichettare qualsiasi materia grigia senza etichetta sotto di questa linea (su entrambi i lati del SR / SL / SM) come CA4 / DG 12. </li></ol></li><li> Fetta F: ippocampale Corpo: Continuare ad applicare i confini descritti nel passaggio 3.6.1-3.6.2. </li><li> Fetta G: Coda ippocampale 1: Continuare ad applicare le regole descritte nel passaggio 3.6.1-3.6.2. Il confine subiculum-CA1 diventa una linea di 45 ° angolo di estensione in direzione infero-mediale dal bordo mediale del CA4 / DG 12,22. </li><li> Fetta H: Coda ippocampale 2: Una volta che il giro fascicolari non possono più essere distinti dal formatio ippocampalen, etichettare l'intero strato esterno come CA1, la zona a bassa intensità all'interno di questo come SR / SL / SM (come in fette precedenti) e ogni materia grigia rimanendo al centro come CA4 / DG 12,22. </li><li> Slice I: posteriore-Most Slice: Una volta che il buio SR / SL / SM non è più visibile al centro della formazione dell'ippocampo, etichettare l'intera struttura come CA1 12,22. </li></ol> 4. Protocollo Affidabilità <ol><li> Resegment destra oa sinistra ippocampo di ogni soggetto dopo aver atteso circa un mese dal compiere segmentazione originale. Segmento tutti i sottocampi lungo tutta la lunghezza antero-posteriore dell'ippocampo, cercando di seguire le regole di protocollo nel modo più coerente possibile. </li><li> Calcolare kappa della Dice tra i volumi originali e resegmented: <img alt="Equazione 1" src="/files/ftp_upload/51861/51861eq1.jpg"> dove k = Dice di kappa e A e B sono volumi di etichette. </li></ol>

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</ol>

Gli autori non hanno conflitti di interesse da dichiarare.

Segmentazione sottocampo ippocampale di immagini RM è ben rappresentata nella letteratura. Tuttavia, protocolli esistenti escludono parti dell&#39;ippocampo 20,23,33,35, si applicano solo alle immagini fisse 37, o richiedono scanner ultra-alto campo per l&#39;acquisizione di immagini 35,37. Questo manoscritto offre un protocollo di segmentazione comprende cinque suddivisioni principali (CA1, CA2 / CA3, CA4 / giro dentato, SR / SL / SM e subiculum) dell&#39;ippocampo e copre l&#39;intera ...

L&#39;ippocampo è una struttura mediale lobo temporale ampiamente studiato che è associato con la memoria episodica, navigazione spaziale, e altre funzioni cognitive 10,31. Il suo ruolo in malattie neurodegenerative e neuropsichiatrici come del morbo di Alzheimer, la schizofrenia e il disturbo bipolare è ben documentato 4,5,18,24,30. L&#39;obiettivo di questo manoscritto è quello di fornire ulteriori dettagli al protocollo di segmentazione manuale pubblicato in precedenza per 34 sottocampi di ippocampo umani ad alta risoluzione risonanza magnetica (MR) immagini acquisite a 3T. Inoltre, la componente video che accompagna questo manoscritto fornirà ulteriore assistenza ai ricercatori che desiderano implementare il protocollo sui propri set di dati. L&#39;ippocampo può essere diviso in sottocampi sulla base delle differenze osservate nei citoarchitettoniche istologicamente preparati post mortem provini 12,22. Tali esemplari post mortem definiscono il ground verità per l&#39;identificazione e lo studio di sottocampi dell&#39;ippocampo; tuttavia preparazioni di questo tipo richiedono competenze ed attrezzature per la colorazione specializzate, e sono limitati dalla disponibilità di tessuto fissato, soprattutto nelle popolazioni malate. Imaging in vivo ha il vantaggio di un più ampio pool di soggetti, e presenta anche la possibilità di follow gli studi e le modifiche di osservazione nelle popolazioni. Anche se è stato dimostrato che intensità di segnale a ex vivo immagini RM T2-pesate riflettere densità cellulare 13, è ancora difficile individuare i confini indiscussi tra sottocampi utilizzando esclusivamente intensità di segnale MR. In quanto tale, sono stati sviluppati una serie di approcci diversi per identificare dettagli a livello di istologia sulle immagini RM. Alcuni gruppi hanno compiuto sforzi per ricostruire e digitalizzare set di dati istologici e poi utilizzare queste ricostruzioni con le tecniche di registrazione di immagini per localizzare dell&#39;ippocampo sottocampo neuroanatomy su in vivo MR 1,2,8,9,14,15,17,32. Anche se questa è una tecnica efficace per mappare una versione della verità terra istologico direttamente sulle immagini RM, le ricostruzioni di questo tipo sono difficili da completare. Progetti come questi sono limitati dalla disponibilità di esemplari intatti mediale del lobo temporale, tecniche istologiche, la perdita di dati durante la lavorazione, istologica e le incongruenze morfologiche fondamentali tra il cervello in vivo fisse e in. Altri gruppi hanno usato gli scanner ad alto campo (7T o 9.4T), nel tentativo di acquisire in vivo o ex vivo con immagini abbastanza piccolo (0,20-,35 mm isotropo) dimensione voxel di visualizzare spazialmente localizzate le differenze di contrasto delle immagini che vengono utilizzate per dedurre confini tra sottocampi 35,37. Anche a 7T-9.4T e con una piccola dimensione voxel, le caratteristiche citoarchitettoniche dei sottocampi ippocampali non sono visibili. Come tali, sono stati sviluppati protocolli segmentazione manuali che unpproximate noti confini istologici sulle immagini RM. Questi protocolli stabiliscono limiti sottocampo interpretando le differenze di contrasto immagine locali e la definizione regole geometriche (come linee rette e angoli) relativi alle strutture visibili. Anche se le immagini scattate ad una elevata intensità di campo sono in grado di offrire un quadro dettagliato delle sottocampi dell&#39;ippocampo, scanner ad alta campo non sono ancora comuni in ambito clinico o di ricerca, in modo da protocolli 7T e 9.4T attualmente hanno limitato l&#39;applicabilità. Sono stati sviluppati protocolli simili per immagini raccolte su 3T e 4T scanner 11,20,21,23,24,25,28,33. Molti di questi protocolli sono basati su immagini con sub-1mm dimensioni voxel voxel nel piano coronale, ma hanno grandi spessori di fetta (0,8-3 mm) 11,20,21,23,25,28,33 o grandi distanze inter-slice 20,28, entrambi che si traducono in un significativo distorsione di misurazione nella stima dei volumi dei singoli sottocampi. Inoltre, molti dei protocolli esistenti 3Tescludere sottocampi in tutto o in parte della testa o la coda ippocampale 20,23,25,33 o non forniscono segmentazioni dettagliate delle sottostrutture importanti (ad esempio, combinare il DG con CA2 / CA3 o non includono gli strati radiatum / lacunosum / moleculare di CA) 11,20,21,23,24,25,28,33. Vi è quindi una necessità nel campo per una descrizione dettagliata di un protocollo che può identificare attendibilmente sottocampi pertinenti in tutta la testa, il corpo e la coda dell&#39;ippocampo che si basa su uno scanner comunemente disponibili in ambito clinico e di ricerca. Gli sforzi sono attualmente in corso da parte del Gruppo Sottocampi Hippocampal (www.hippocampalsubfields.com) per armonizzare il processo di segmentazione dell&#39;ippocampo sottocampo tra laboratori, simile a uno sforzo di armonizzazione esistente per tutta la segmentazione dell&#39;ippocampo 6, e un documento iniziale confrontando 21 protocolli esistenti è stato recentemente pubblicato 38 . Il lavoro di questo gruppo sarà chiarire ulteriormente ottimale proce segmentazionedure. Questo manoscritto fornisce istruzioni dettagliate video scritte e per attuare il protocollo di segmentazione affidabile sottocampo ippocampale descritto in precedenza da Winterburn e colleghi su 34 immagini ad alta risoluzione 3T MR. Il protocollo è stato implementato su cinque immagini di controlli sani per tutta la ippocampo e cinque sottocampi dell&#39;ippocampo CA1, CA2 (/ CA3, CA4 / giro dentato, strati radiatum / lacunosum / moleculare e subiculum). Queste immagini segmentate sono a disposizione del pubblico online (cobralab.ca/atlases/Hippocampus). Il protocollo e le immagini segmentate saranno utili per i gruppi che desiderano studiare dettagliata neuroanatomia ippocampale in immagini RM.

<table><tbody><tr><td>Discovery MR750 3T</td><td>GE</td><td></td><td>O scanner 3T equivalente</td></tr><tr><td>Kit di strumenti Minc</td><td>McConnell Brain Imaging Center, Montreal Neurological Institute</td><td></td><td>Open source: http://www.bic.mni.mcgill.ca/ServicesSoftware/ServicesSoftwareMincToolKit</td></tr></tbody></table>

alta risoluzione in vivo manuale protocollo segmentazione for human ippocampale sottocampi utilizzando 3t risonanza magnetica

High-resolution In Vivo Manual Segmentation Protocol for Human Hippocampal Subfields Using 3T Magnetic Resonance Imaging

L&#39;ippocampo umano è stata ampiamente studiata nel contesto della memoria e funzione cerebrale normale e il suo ruolo in diversi disturbi neuropsichiatrici è stato fortemente studiato. Mentre molti studi di imaging trattano l&#39;ippocampo come un&#39;unica struttura neuroanatomica unitaria, è, infatti, costituito da diversi sottocampi che hanno una geometria complessa tridimensionale. Come tale, è noto che questi sottocampi svolgono funzioni specializzate e sono differenzialmente influenzati attraverso il corso di diversi stati patologici. La risonanza magnetica (MR) possono essere utilizzati come un potente strumento per interrogare la morfologia dell&#39;ippocampo e dei suoi sottocampi. Molti gruppi usano software avanzato di imaging e hardware (&gt; 3T) per l&#39;immagine dei sottocampi; tuttavia questo tipo di tecnologia non può essere prontamente disponibili in molti centri di ricerca e di imaging clinico. Per rispondere a questa esigenza, questo manoscritto fornisce un protocollo dettagliato passo-passo per segmentare la lunghezza antero-posterioredell&#39;ippocampo e dei suoi sottocampi: cornu Ammonis (CA) 1, CA2 / CA3, CA4 / giro dentato (DG), strati radiatum / lacunosum / moleculare (SR / SL / SM), e subiculum. Questo protocollo è stato applicato a cinque soggetti (3F, 2M, 29-57 anni, 37 avg.). Affidabilità protocollo è valutata resegmenting destra oa ippocampo fianco di ogni soggetto e calcolando la sovrapposizione con kappa metrica della Dice. Media di Dice kappa (range) attraverso cinque soggetti sono: intero ippocampo, 0,91 (0,90-0,92); CA1, 0,78 (0,77-0,79); CA2 / CA3, 0,64 (,56-0,73); CA4 / giro dentato, 0,83 (0,81-0,85); strati radiatum / lacunosum / moleculare, 0,71 (0,68-0,73); e subiculum 0,75 (0,72-0,78). Il protocollo di segmentazione qui presentata fornisce altri laboratori con un metodo affidabile per studiare l&#39;ippocampo e sottocampi dell&#39;ippocampo in vivo utilizzando comunemente disponibili strumenti MR.

. I risultati del test di affidabilità protocollo sono riassunti nella Tabella 2 Per l'intero ippocampo bilaterale, significa sovrapposizione spaziale come misurato dalla kappa di Dice è 0.91 e varia 0,90-0,92. I valori kappa sottocampo vanno da 0,64 (CA2 / CA3) a 0,83 (CA4 / giro dentato). Volumi medi di tutti sottocampi e tutta ippocampo sono riportati in Tabella 3. Volumi per l'intera gamma da ippocampo 2456.72-3325.02 mm 3. Il CA2 / CA3 è...

L'obiettivo di questo manoscritto è studiare l'ippocampo e i sottocampi dell'ippocampo utilizzando la risonanza magnetica. Il manoscritto descrive un protocollo per segmentare l'ippocampo e cinque sottostrutture dell'ippocampo: cornu ammonis (CA) 1, CA2/CA3, CA4/giro dentato, strata radiatum/lacunosum/molecolare e subiculum.

Alta risoluzione In Vivo Manuale Protocollo Segmentazione for Human ippocampale Sottocampi Utilizzando 3T Risonanza Magnetica

The human hippocampus has been broadly studied in the context of memory and normal brain function and its role in different neuropsychiatric disorders has ...

L'obiettivo generale di questo protocollo è fornire un metodo affidabile e anatomicamente accurato per segmentare l'ippocampo umano con sottocampi su immagini di risonanza magnetica. Qui, i sottocampi dell'ippocampo sono divisi in cinque etichette, CA uno, CA due, ca tre, CA quattro, giro dentato, S-R-S-L-S-M e icm. Questo metodo può aiutare a rispondere a domande chiave nel campo del neuroimaging, come ad esempio come cambia la struttura del sottocampo dell'ippocampo negli stati sani e patologici.Il vantaggio principale di questa tecnica è che è adattata alle immagini ad alta risoluzione raccolte su uno scanner a tre T e include definizioni di sottocampo per l'intera lunghezza anteriore posteriore dell'ippocampo. Inizia inserendo la seguente scena di comando qui nel terminale. Per aprire l'interfaccia del software su un'immagine pesata T uno, ingrandire la vista coronale e ingrandire l'ippocampo, selezionare la segmentazione nella finestra di navigazione, quindi selezionare il raggio XY.Impostate la dimensione del pennello XY su 0,1. Scorri fino alla fetta coronale più anteriore dell'ippocampo per la fetta a, la fetta di mott anteriore. Disegna il bordo più esterno della materia grigia ippocampale dove incontra la materia bianca del lobo temporale circostante e usa la materia bianca ad alta intensità delle alve per aiutare con il bordo superiore.Utilizzare il tasto di riempimento dell'etichetta nel menu di segmentazione della finestra di navigazione per inserire l'etichetta all'interno del bordo. Per la fetta B, ha vinto la testa dell'ippocampo. Continua a disegnare i bordi della testa dell'ippocampo usando la sostanza bianca del lobo temporale e delle alve come guida.Successivamente per la fetta C, la testa dell'ippocampo due con dazioni. Disegna le dazioni dell'ippocampo usando la sostanza bianca dell'alius. Quindi usa la vista assiale per tracciare una linea orizzontale dal bordo anteriore dell'ippocampo laterale e designare qualsiasi cosa al di sotto di questa linea come parte dell'ippocampo.Ora per la fetta D, la testa dell'ippocampo, tre, disegna il bordo inferiore dell'ippocampo in corrispondenza della sostanza bianca del lobo temporale e il bordo laterale in corrispondenza del corno inferiore del ventricolo laterale. Tracciare il bordo superiore in corrispondenza della sostanza bianca dell'alius fibr e il bordo mediale in corrispondenza della regione ipo-intensa della cisterna ambientale. Per la fetta, E, disegna i bordi inferiore, laterale, superiore e mediale.Come prima, definisci il bordo mediale di inferenza disegnando la porzione inferiore del bordo mediale dove l'ippocampo si assottiglia leggermente e si estende nella materia grigia della corteccia interale. In queste fette, includere l'onere nelle segmentazioni ippocampali. Quindi designare il corpo dell'ippocampo sulla fetta F.As prima, non includere il liquido spinale cerebrale a bassa intensità del solco ippocampale vestigiale nella segmentazione.Ora per il segmento G della fetta, la coda dell'ippocampo inizia a segmentare la coda. Quando la crociera del fornice è visibile per la prima volta. Escludere il giro vescicolare estrapolando la forma del giro vescicolare nella coda dell'ippocampo per fette più anteriori.Quando il giro vescicolare non può più essere distinto, trattare tutta la materia grigia visibile come coda ippocampale. Quindi per la fetta H, la coda ippocampale a due segmenti, la materia grigia a bassa intensità della coda ippocampale posteriore dalla sostanza bianca circostante ad alta intensità. Infine, o occhio a fette, il segmento più posteriore della fetta, la piccola area rimanente della materia grigia ippocampale dalla sostanza bianca circostante del lobo temporale.Inizia scorrendo fino alla fetta coronale più anteriore dell'ippocampo su un'immagine pesata T due. Cambia il colore del pennello selezionando imposta etichetta vernice e inserendo un numero compreso tra uno e 255 nel terminale. Per la fetta A, la fetta più anteriore, traccia una linea che divide la materia grigia ippocampale visibile lungo il suo asse visibile più lungo in due sezioni uguali.Usa due colori diversi per etichettare la parte superiore di queste due sezioni come ca uno e la sezione inferiore come il sulu per la fetta B, quella della testa dell'ippocampo. Etichetta l'area a bassa intensità al centro della formazione ippocampale. Come SR SLSM, definire il bordo csum ca uno inferolaterale alla curva nell'ippocampo inferiore.Continua a seguire l'asse più lungo dell'ippocampo per disegnare il bordo del circa uno sulu sulla punta mediale superiore per la fetta C, la testa dell'ippocampo. Due con le tentazioni. Etichettare la banda scura S-R-S-L-S-M che segue la curva dell'etichetta ca one, qualsiasi materia grigia ad alta intensità all'interno del S-R-S-L-S-M come CA quattro dg.Quindi definisci il bordo del sicm ca uno usando la curva e l'ippocampo inferiore. Definisce il confine tra CA uno e ca due, CA tre come una linea angolare di 45 gradi, che si estende in direzione superolaterale dal bordo più superlaterale del S-R-S-L-S-M. Estendere il ca due CA tre medialmente lungo il bordo superiore fino alla depressione tra le dazioni ed etichettare il resto del bordo superiore come ca uno per la fetta D, la testa ippocampale tre.Etichettare S-R-S-L-S-M CA four, DG e ICM esattamente come appena descritto. Per la fetta C, estendere il CA due, il CA tre medialmente a metà del bordo superiore ed etichettare l'altra metà del bordo superiore come CA uno. Dividi a metà la testa dell'ippocampo super mediale verticalmente.Etichettare la metà mediale come S-R-S-L-S-M. Quindi, orizzontalmente, dividere la metà laterale a metà. Ancora una volta, etichettare la porzione inferiore come CA due, CA tre ed etichettare la porzione superiore come CA quattro DG per la fetta E, la testa ippocampale quattro con Angus.Definite il bordo del saeculum ca one come una linea verticale che si estende nella direzione inferiore dal bordo più mediale del CA quattro dg. Continuare a definire i confini CA uno, CA due, CA tre s, RSL, SM e CA quattro DG. Come prima, etichettare l'onere dell'ippocampo come la testa dell'ippocampo passa al corpo dell'ippocampo nell'etichetta dell'onus, la regione a bassa intensità al centro come SRSL sm.Continuando sulla fetta E, tracciare una linea sul bordo superiore della sezione S-R-S-L-S-M lungo l'asse supermediale inferolaterale dell'etichetta UCAS. Tutta la materia grigia al di sopra di questa linea come CA due, CA tre, etichettare qualsiasi materia grigia non etichettata al di sotto di questa linea come CA quattro D.Next, o fettare F, il corpo dell'ippocampo. Continuare ad applicare i bordi per il sulu S-R-S-L-S-M ca quattro, DG ca due, CA tre come indicato per la fetta E sulla fetta G, la coda ippocampale uno.Il bordo ICM ca one diventa una linea angolare di 45 gradi, che si estende in direzione inframediale dal bordo mediale del CA quattro DG per la fetta H. La coda ippocampale due etichetta lo strato interno a bassa intensità come S-R-S-L-S-M e lo strato esterno ad alta intensità come CA uno. Una volta che il giro vescicolare non può più essere distinto dalla formazione ippocampale, etichetta qualsiasi sostanza grigia rimanente nel mezzo come CA quattro dg. Infine, per l'occhio a fette, la fetta più posteriore lascia l'intera struttura come CA uno.Una volta che il buio S-R-S-L-S-M non è più visibile nella formazione ippocampale, questo protocollo utilizza la risonanza magnetica per segmentare l'ippocampo umano. Qui, l'intero ippocampo è diviso in nove fette coronali utilizzando immagini pesate T uno. Cinque sottocampi dell'ippocampo vengono quindi segmentati utilizzando T due immagini pesate qui, il CA uno, CA due, CA tre, CA quattro, giro denato, S-R-S-L-S-M e ICM possono essere visti all'interno di questa fetta di testa dell'ippocampo.Una volta padroneggiata, questa tecnica può essere completata per ogni soggetto in 40 ore se eseguita correttamente. È importante ricordare di seguire il più possibile i modelli di intensità nelle immagini e di essere coerenti con i bordi tra i soggetti seguendo questa procedura. Altre tecniche di segmentazione automatizzata possono essere eseguite per rispondere a domande sul volume e la forma dell'ippocampo in popolazioni vulnerabili come quelle sottoposte a invecchiamento sano o affette da malattia di Alzheimer.Dopo aver visto questo video, dovresti essere in grado di replicare in modo affidabile questo protocollo e ottenere informazioni dettagliate sull'anatomia dettagliata del sottocampo ippocampale dei tuoi soggetti.

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Alta risoluzione In Vivo Manuale Protocollo Segmentazione for Human ippocampale Sottocampi Utilizzando 3T Risonanza Magnetica

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