Alta risoluzione In Vivo Manuale Protocollo Segmentazione for Human ippocampale Sottocampi Utilizzando 3T Risonanza Magnetica

L'obiettivo generale di questo protocollo è fornire un metodo affidabile e anatomicamente accurato per segmentare l'ippocampo umano con sottocampi su immagini di risonanza magnetica. Qui, i sottocampi dell'ippocampo sono divisi in cinque etichette, CA uno, CA due, ca tre, CA quattro, giro dentato, S-R-S-L-S-M e icm. Questo metodo può aiutare a rispondere a domande chiave nel campo del neuroimaging, come ad esempio come cambia la struttura del sottocampo dell'ippocampo negli stati sani e patologici.

Il vantaggio principale di questa tecnica è che è adattata alle immagini ad alta risoluzione raccolte su uno scanner a tre T e include definizioni di sottocampo per l'intera lunghezza anteriore posteriore dell'ippocampo. Inizia inserendo la seguente scena di comando qui nel terminale. Per aprire l'interfaccia del software su un'immagine pesata T uno, ingrandire la vista coronale e ingrandire l'ippocampo, selezionare la segmentazione nella finestra di navigazione, quindi selezionare il raggio XY.

Impostate la dimensione del pennello XY su 0,1. Scorri fino alla fetta coronale più anteriore dell'ippocampo per la fetta a, la fetta di mott anteriore. Disegna il bordo più esterno della materia grigia ippocampale dove incontra la materia bianca del lobo temporale circostante e usa la materia bianca ad alta intensità delle alve per aiutare con il bordo superiore.

Utilizzare il tasto di riempimento dell'etichetta nel menu di segmentazione della finestra di navigazione per inserire l'etichetta all'interno del bordo. Per la fetta B, ha vinto la testa dell'ippocampo. Continua a disegnare i bordi della testa dell'ippocampo usando la sostanza bianca del lobo temporale e delle alve come guida.

Successivamente per la fetta C, la testa dell'ippocampo due con dazioni. Disegna le dazioni dell'ippocampo usando la sostanza bianca dell'alius. Quindi usa la vista assiale per tracciare una linea orizzontale dal bordo anteriore dell'ippocampo laterale e designare qualsiasi cosa al di sotto di questa linea come parte dell'ippocampo.

Ora per la fetta D, la testa dell'ippocampo, tre, disegna il bordo inferiore dell'ippocampo in corrispondenza della sostanza bianca del lobo temporale e il bordo laterale in corrispondenza del corno inferiore del ventricolo laterale. Tracciare il bordo superiore in corrispondenza della sostanza bianca dell'alius fibr e il bordo mediale in corrispondenza della regione ipo-intensa della cisterna ambientale. Per la fetta, E, disegna i bordi inferiore, laterale, superiore e mediale.

Come prima, definisci il bordo mediale di inferenza disegnando la porzione inferiore del bordo mediale dove l'ippocampo si assottiglia leggermente e si estende nella materia grigia della corteccia interale. In queste fette, includere l'onere nelle segmentazioni ippocampali. Quindi designare il corpo dell'ippocampo sulla fetta F.As prima, non includere il liquido spinale cerebrale a bassa intensità del solco ippocampale vestigiale nella segmentazione.

Ora per il segmento G della fetta, la coda dell'ippocampo inizia a segmentare la coda. Quando la crociera del fornice è visibile per la prima volta. Escludere il giro vescicolare estrapolando la forma del giro vescicolare nella coda dell'ippocampo per fette più anteriori.

Quando il giro vescicolare non può più essere distinto, trattare tutta la materia grigia visibile come coda ippocampale. Quindi per la fetta H, la coda ippocampale a due segmenti, la materia grigia a bassa intensità della coda ippocampale posteriore dalla sostanza bianca circostante ad alta intensità. Infine, o occhio a fette, il segmento più posteriore della fetta, la piccola area rimanente della materia grigia ippocampale dalla sostanza bianca circostante del lobo temporale.

Inizia scorrendo fino alla fetta coronale più anteriore dell'ippocampo su un'immagine pesata T due. Cambia il colore del pennello selezionando imposta etichetta vernice e inserendo un numero compreso tra uno e 255 nel terminale. Per la fetta A, la fetta più anteriore, traccia una linea che divide la materia grigia ippocampale visibile lungo il suo asse visibile più lungo in due sezioni uguali.

Usa due colori diversi per etichettare la parte superiore di queste due sezioni come ca uno e la sezione inferiore come il sulu per la fetta B, quella della testa dell'ippocampo. Etichetta l'area a bassa intensità al centro della formazione ippocampale. Come SR SLSM, definire il bordo csum ca uno inferolaterale alla curva nell'ippocampo inferiore.

Continua a seguire l'asse più lungo dell'ippocampo per disegnare il bordo del circa uno sulu sulla punta mediale superiore per la fetta C, la testa dell'ippocampo. Due con le tentazioni. Etichettare la banda scura S-R-S-L-S-M che segue la curva dell'etichetta ca one, qualsiasi materia grigia ad alta intensità all'interno del S-R-S-L-S-M come CA quattro dg.

Quindi definisci il bordo del sicm ca uno usando la curva e l'ippocampo inferiore. Definisce il confine tra CA uno e ca due, CA tre come una linea angolare di 45 gradi, che si estende in direzione superolaterale dal bordo più superlaterale del S-R-S-L-S-M. Estendere il ca due CA tre medialmente lungo il bordo superiore fino alla depressione tra le dazioni ed etichettare il resto del bordo superiore come ca uno per la fetta D, la testa ippocampale tre.

Etichettare S-R-S-L-S-M CA four, DG e ICM esattamente come appena descritto. Per la fetta C, estendere il CA due, il CA tre medialmente a metà del bordo superiore ed etichettare l'altra metà del bordo superiore come CA uno. Dividi a metà la testa dell'ippocampo super mediale verticalmente.

Etichettare la metà mediale come S-R-S-L-S-M. Quindi, orizzontalmente, dividere la metà laterale a metà. Ancora una volta, etichettare la porzione inferiore come CA due, CA tre ed etichettare la porzione superiore come CA quattro DG per la fetta E, la testa ippocampale quattro con Angus.

Definite il bordo del saeculum ca one come una linea verticale che si estende nella direzione inferiore dal bordo più mediale del CA quattro dg. Continuare a definire i confini CA uno, CA due, CA tre s, RSL, SM e CA quattro DG. Come prima, etichettare l'onere dell'ippocampo come la testa dell'ippocampo passa al corpo dell'ippocampo nell'etichetta dell'onus, la regione a bassa intensità al centro come SRSL sm.

Continuando sulla fetta E, tracciare una linea sul bordo superiore della sezione S-R-S-L-S-M lungo l'asse supermediale inferolaterale dell'etichetta UCAS. Tutta la materia grigia al di sopra di questa linea come CA due, CA tre, etichettare qualsiasi materia grigia non etichettata al di sotto di questa linea come CA quattro D.Next, o fettare F, il corpo dell'ippocampo. Continuare ad applicare i bordi per il sulu S-R-S-L-S-M ca quattro, DG ca due, CA tre come indicato per la fetta E sulla fetta G, la coda ippocampale uno.

Il bordo ICM ca one diventa una linea angolare di 45 gradi, che si estende in direzione inframediale dal bordo mediale del CA quattro DG per la fetta H. La coda ippocampale due etichetta lo strato interno a bassa intensità come S-R-S-L-S-M e lo strato esterno ad alta intensità come CA uno. Una volta che il giro vescicolare non può più essere distinto dalla formazione ippocampale, etichetta qualsiasi sostanza grigia rimanente nel mezzo come CA quattro dg. Infine, per l'occhio a fette, la fetta più posteriore lascia l'intera struttura come CA uno.

Una volta che il buio S-R-S-L-S-M non è più visibile nella formazione ippocampale, questo protocollo utilizza la risonanza magnetica per segmentare l'ippocampo umano. Qui, l'intero ippocampo è diviso in nove fette coronali utilizzando immagini pesate T uno. Cinque sottocampi dell'ippocampo vengono quindi segmentati utilizzando T due immagini pesate qui, il CA uno, CA due, CA tre, CA quattro, giro denato, S-R-S-L-S-M e ICM possono essere visti all'interno di questa fetta di testa dell'ippocampo.

Una volta padroneggiata, questa tecnica può essere completata per ogni soggetto in 40 ore se eseguita correttamente. È importante ricordare di seguire il più possibile i modelli di intensità nelle immagini e di essere coerenti con i bordi tra i soggetti seguendo questa procedura. Altre tecniche di segmentazione automatizzata possono essere eseguite per rispondere a domande sul volume e la forma dell'ippocampo in popolazioni vulnerabili come quelle sottoposte a invecchiamento sano o affette da malattia di Alzheimer.

Dopo aver visto questo video, dovresti essere in grado di replicare in modo affidabile questo protocollo e ottenere informazioni dettagliate sull'anatomia dettagliata del sottocampo ippocampale dei tuoi soggetti.