Name: Medico-grade di destinazione sterilizzabile per fetoscope ottico Distortion calibrazione Fluid-immersi (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-02-23T13:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 3 s
Description: Impara a calibrare endoscopi sterili per chirurgia fetale con un target in acciaio inox 316 sabbiato e inciso al laser. Questo metodo rapido migliora la precisione dell'imaging e supporta l'elaborazione avanzata delle immagini.

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Questo lavoro è stato supportato attraverso un premio per l'Ingegneria Innovativa per la Salute dal Wellcome Trust [WT101957], dall'Engineering and Physical Sciences Research Council (EPSRC) [NS/A000027/1] e da un National Institute for Health Research Biomedical Research Centre UCLH/UCL High Impact Initiative. Jan Deprest è finanziato dal Fonds voor Wetenschappelijk Onderzoek Vlaanderen (FWO; JD come ricercatore clinico 1.8.012.07). Danail Stoyanov riceve finanziamenti dall'EPSRC (EP/N013220/1, EP/N022750/1), dal progetto EU-FQ CASCADE (FP7-ICT-2913-601021) e dal progetto EU-Horizon2020 EndoVESPA (H2020-ICT- 2015-688592). Sebastien Ourselin riceve finanziamenti dall'EPSRC (EP/H046410/1, EP/J020990/1, EP/K005278) e dall'MRC (MR/J01107X/1). Marcel Tella è supportato dall'UCL Centre for Doctoral Training in Medical Imaging (EP/L016478/1), finanziato dall'EPSRC.

1. Realizzazione di destinazione <ol><li> Sabbiatura <ol><li> Preparare una lamiera di acciaio inossidabile 316 con uno spessore di 1,2 mm. Usando una matita o un chiodo, disegnare un quadrato mm 40 mm x 40 sul foglio con l&#39;aiuto di un righello. </li><li> Tagliare il quadrato disegnato con un cutter in metallo manuale. ATTENZIONE! Guardare le dita. </li><li> Utilizzare un file per arrotondare gli angoli ei lati del campione. ATTENZIONE! Sono molto taglienti; stai attento. </li><li> Preparare una scala blocco di legno o di metallo di dimensioni leggermente maggiori rispetto alla lamiera di acciaio inox. Posizionare il foglio singolo su di esso; fare questo al fine di evitare la flessione del campione durante la sabbiatura. </li><li> Posizionare il gruppo nella camera di scoppio interna. Ricordatevi di usare un collettore di polveri e per sigillare ermeticamente la camera di scoppio interno; altrimenti, la sabbia si diffonderà in tutto durante il processo. Indossare occhiali di sicurezza per proteggere gli occhi. </li><li> Posizionare una pistola a getto perpendicolare e almeno 4-5 cm dalla superficie metallica. Applicare il contr piedeolo per sabbiatura. Mettere il campione sul pezzo di legno (1-2 cm di spessore) con una morsa, come il flusso di sabbia ad alta pressione può deformare il campione. Durante sabbiatura, tenere saldamente il campione dal bordo del pezzo di legno o utilizzando un altro vizio. </li><li> Ripetere la sabbiatura sul lato opposto se è desiderabile avere un modello di calibrazione inciso su entrambi i lati. </li></ol></li><li> patterning laser <ol><li> Progettare un modello di cerchi asimmetrici, come mostrato in Figura 1. </li><li> Preparare un file di formato di scambio di disegno (DXF) del disegno o utilizzando il software CAD o in un altro linguaggio di programmazione adatto. NOTA: Per comodità, un&#39;applicazione Python in grado di generare file DXF per la progettazione di cui al presente documento viene fornito come parte della domanda GUI compatta 16. </li><li> Importare i file DXF nel software di taglio laser. </li><li> Impostare i seguenti parametri per sfondo incisione. Potenza del laser: 40%, velocità di scansione:80 cm / s, Frequenza: 4.000 Hz, numero di passaggi: 1. </li><li> Impostare i seguenti parametri per l&#39;incisione del modello. Laser di potenza: 40%, Velocità di scansione: 2,1 cm / s, Frequenza: 4.000 Hz, numero di passaggi: 1. </li><li> Mettere il campione sulla piattaforma di lavoro e allineare il modello di taglio utilizzando il software. </li><li> Dopo il laser esegue il taglio, pulire il campione mediante immersione in alcool. Non utilizzare salviette, come fanno di solito lasciano residui indesiderabili. </li></ol></li><li> Sterilizzazione <ol><li> Avvolgere il campione sterilizzato in un pacchetto sterilizzazione e inserirla nell&#39;unità di sterilizzazione (autoclave). </li><li> Aggiungere acqua (l&#39;acqua non distillata) per l&#39;autoclave e seguire la guida utente / raccomandazioni del costruttore per sterilizzare il bersaglio. </li></ol></li></ol> Calibrazione 2. peri-operatorio <ol><li> software di calibrazione <ol><li> Installare il &quot;endocal&quot; pacchetto software di calibrazione endoscopio fornito su GitHub 16(Seguire le istruzioni del file README in esso). NOTA: Questo software avvolge il modulo di calibrazione fotocamera OpenCV 17 in un&#39;applicazione convenienza facile da usare. La domanda prevista funziona in due modalità: online e offline. La modalità online acquisisce il flusso video direttamente dall&#39;hardware frame-grabber compatibili. La modalità offline consente di ottenere immagini di carico endoscopio sia da un file video o una cartella con un numero di fotogrammi video salvati come file immagine. Vedere README per l&#39;hardware supportato e le istruzioni dettagliate su come utilizzare questi due modi. </li></ol></li><li> acquisizione di video endoscopica NOTA: Le seguenti istruzioni sono per la calibrazione on-line (come descritto sopra), ma sono applicabili anche alla calibrazione in linea. <ol><li> Posizionare il foglio di calibrazione in un contenitore fluido sterile, come un barattolo. </li><li> Riempire il contenitore con il liquido bersaglio o una sostanza simile sterili. NOTA: per esempio, nel proce fetoscopicdure, il fluido obiettivo è liquido amniotico. Poiché le proprietà ottiche di liquido amniotico sono simili all&#39;acqua salina 18, 19, acqua salina sterile può essere utilizzato per la calibrazione del fetoscope. </li><li> Regolare lo zoom e la nitidezza dell&#39;endoscopio, se lo desideri. </li><li> Immergere l&#39;endoscopio nel fluido e tenerlo ad una distanza dalla calibrazione simile alla distanza dal anatomica che l&#39;endoscopio sarà successivamente utilizzato a. </li><li> Avviare l&#39;applicazione di calibrazione e avviare l&#39;acquisizione della fotocamera. </li><li> Spostare la punta dell&#39;endoscopio leggermente per diverse visualizzazioni mantenendo l&#39;intero modello di calibrazione in vista della telecamera. Per ottenere prestazioni ottimali, tenere la leggenda ellittica intorno al motivo di calibrazione all&#39;interno della vista circolare dell&#39;endoscopio. NOTA: Il video frame che sono utilizzabili per la calibrazione sono indicate da un modello di sovrapposizione virtuale, come si vede in figura 3. </li><li> acquire almeno il numero minimo di visualizzazioni endoscopiche fotocamera necessarie per la calibrazione (come indicato nella finestra endocal). NOTA: La versione corrente di endocal richiede almeno 10 visualizzazioni delle telecamere endoscopiche per la calibrazione, un certo numero di punti di vista euristico selezionato dove l&#39;errore di calibrazione sembra essere minima e seguire uno schema stabile 20. </li><li> Premere il tasto di calibrazione, come indicato sulla finestra endocal, per avviare il processo di calibrazione utilizzando le immagini acquisite finora. </li></ol></li><li> Salvataggio e utilizzando i parametri di calibrazione <ol><li> Premere il tasto di taratura indicata per salvare i parametri di calibrazione con un conseguente YAML ( &quot;YAML Non è Markup Language&quot;) file 21. </li><li> Gruppo i parametri di calibrazione in i coefficienti di matrice fotocamera e distorsione, come spiegato nel modulo di calibrazione della fotocamera OpenCV 17. NOTA: Dopo aver eseguito la calibrazione, la calibrazioneapplicazione visualizza automaticamente l&#39;immagine di distorsione corretta alla destra dell&#39;immagine dell&#39;endoscopio originale. </li><li> Utilizzare il feed video distorsione corretta nel corso di una procedura di fetoscopic per la visualizzazione puro o in tempo reale placentare mosaicatura 11. </li></ol></li></ol>

<ol><li>Zhang, Z., Matsushita, Y., Ma, Y. Camera calibration with lens distortion from low-rank textures. CVPR 2011 IEEE Conference on Computer Vision and Pattern Recognition, Washington, D.C., USA, , IEEE Computer Society. 2321-2328 (2011).</li>
<li>Devernay, F., Faugeras, O. D. Automatic calibration and removal of distortion from scenes of structured environments. SPIE's 1995 International Symposium on Optical Science, Engineering, and Instrumentation. 62-72 International Society for Optics and Photonics, , International Society for Optics and Photonics. 62-72 (1995).</li>
<li>Duane, C. B. <a target="_blank" href="https://www.researchgate.net/publication/2478035_Close-Range_Camera_Calibration">Close-range camera calibration.</a> Photogramm. Eng. 37 (8), 855-866 (1971).</li>
<li>Mallon, J., Whelan, P. F. <a target="_blank" href="http://doras.dcu.ie/18667/">Which pattern? biasing aspects of planar calibration patterns and detection methods.</a> Pattern recognition letters. 28 (8), 921-930 (2007).</li>
<li>Balletti, C., Guerra, F., Tsioukas, V., Vernier, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Calibration+of+Action+Cameras+for+Photogrammetric+Purposes%5BTitle%5D)+AND+%22Sensors%22%5BJournal%5D)">Calibration of Action Cameras for Photogrammetric Purposes.</a> Sensors. 14 (9), 17471-17490 (2014).</li>
<li>Heikkila, J. <a target="_blank" href="http://ieeexplore.ieee.org/document/879788/">Geometric camera calibration using circular control points.</a> IEEE Transactions on pattern analysis and machine intelligence. 22 (10), 1066-1077 (2000).</li>
<li>Deprest, J. A., et al. Fetal surgery is a clinical reality. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aDeprest%2C+JA+%22Seminars+in+fetal+and+neonatal+medicine%22">Seminars in fetal and neonatal medicine</a>. 15 (1), Elsevier. 58-67 (2009).</li>
<li>Watanabe, M., Flake, A. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fetal+surgery%3A+Progress+and+perspectives%5BTitle%5D)+AND+%22Advances+in+pediatrics%22%5BJournal%5D)">Fetal surgery: Progress and perspectives.</a> Advances in pediatrics. 57 (1), 353-372 (2010).</li>
<li>Lewi, L., Deprest, J., Hecher, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+vascular+anastomoses+in+monochorionic+twin+pregnancies+and+their+clinical+consequences%5BTitle%5D)+AND+%22American+journal+of+obstetrics+and+gynecology%22%5BJournal%5D)">The vascular anastomoses in monochorionic twin pregnancies and their clinical consequences.</a> American journal of obstetrics and gynecology. 208 (1), 19-30 (2013).</li>
<li>Yamashita, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Miniature+bending+manipulator+for+fetoscopic+intrauterine+laser+therapy+to+treat+twin-to-twin+transfusion+syndrome%5BTitle%5D)+AND+%22Surgical+Endoscopy%22%5BJournal%5D)">Miniature bending manipulator for fetoscopic intrauterine laser therapy to treat twin-to-twin transfusion syndrome.</a> Surgical Endoscopy. 22 (2), 430-435 (2008).</li>
<li>Daga, P., et al. <a target="_blank" href="http://proceedings.spiedigitallibrary.org/proceeding.aspx?articleid=2505941">Real-time mosaicing of fetoscopic videos using SIFT.</a> Proc. SPIE 9786, Medical Imaging 2016: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. 97861R. , International Society for Optics and Photonics. (2016).</li>
<li>Yang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Image+mapping+of+untracked+free-hand+endoscopic+views+to+an+ultrasound+image-constructed+3D+placenta+model%5BTitle%5D)+AND+%22The+International+Journal+of+Medical+Robotics+and+Computer+Assisted+Surgery%22%5BJournal%5D)">Image mapping of untracked free-hand endoscopic views to an ultrasound image-constructed 3D placenta model.</a> The International Journal of Medical Robotics and Computer Assisted Surgery. 11 (2), 223-234 (2015).</li>
<li>Liao, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fast+image+mapping+of+endoscopic+image+mosaics+with+three-dimensional+ultrasound+image+for+intrauterine+fetal+surgery%5BTitle%5D)+AND+%22Minimally+invasive+therapy+%26+allied+technologies%22%5BJournal%5D)">Fast image mapping of endoscopic image mosaics with three-dimensional ultrasound image for intrauterine fetal surgery.</a> Minimally invasive therapy & allied technologies. 18 (6), 332-340 (2009).</li>
<li>Chadebecq, F., et al. Practical Dry Calibration With Medium Adaptation For Fluid-Immersed Endoscopy. Hamlyn Symposium on Medical Robotics, , (2015).</li>
<li>Wengert, C., Reeff, M., Cattin, P. C., Székely, G., et al. Bildverarbeitung für die Medizin 2006: Algorithmen Systeme Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 19. - 21. März 2006 in Hamburg. Handels, H., et al. , Springer. Berlin Heidelberg. 419-423 (2006).</li>
<li>Shakir, D. I. Compact GUI application for optical distortion calibration of endoscopes. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://github.com/gift-surg/endocal">https://github.com/gift-surg/endocal</a> (2016).</li>
<li>Camera calibration With OpenCV. , Available from:
 <a target="_blank" href="http://docs.opencv.org/2.4/doc/tutorials/calib3d/camera_calibration/camera_calibration.html">http://docs.opencv.org/2.4/doc/tutorials/calib3d/camera_calibration/camera_calibration.html</a> (2016).</li>
<li>Reeff, M., Gerhard, F., Cattin, P. C., Székely, G. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aReeff%2C+M+%22Mosaicing+of+endoscopic+placenta+images%22">Mosaicing of endoscopic placenta images</a>. , Citeseer. (2011).</li>
<li>Steigman, S. A., Kunisaki, S. M., Wilkins-Haug, L., Takoudes, T. C., Fauza, D. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optical+properties+of+human+amniotic+fluid%3A+implications+for+videofetoscopic+surgery%5BTitle%5D)+AND+%22Fetal+diagnosis+and+therapy%22%5BJournal%5D)">Optical properties of human amniotic fluid: implications for videofetoscopic surgery.</a> Fetal diagnosis and therapy. 27 (2), 87-90 (2009).</li>
<li>Zhang, Z. <a target="_blank" href="http://ieeexplore.ieee.org/document/888718/">A flexible new technique for camera calibration.</a> IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 22 (11), 1330-1334 (2000).</li>
<li>Evans, C. C. The Official YAML Web Site. , Available from:
 <a target="_blank" href="http://yaml.org">http://yaml.org</a> (2016).</li>
<li>Bouguet, J. -Y. Camera Calibration Toolbox for Matlab. , Available from:
 <a target="_blank" href="http://www.vision.caltech.edu/bouguetj/calib_doc/">http://www.vision.caltech.edu/bouguetj/calib_doc/</a> (2015).</li>
<li>Common Interfaces of Feature Detectors. , Available from:
	 <a target="_blank" href="http://docs.opencv.org/2.4/modules/features2d/doc/common_interfaces_of_feature_detectors.html">http://docs.opencv.org/2.4/modules/features2d/doc/common_interfaces_of_feature_detectors.html</a> (2016).</li>
<li>Open Source Computer Vision Library. , Available from:
 <a target="_blank" href="https://github.com/opencv/opencv">https://github.com/opencv/opencv</a> (2016).</li>
</ol>

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

La sabbiatura è un passo importante nel processo di fabbricazione in quanto la superficie del metallo grezzo riflette la luce visibile dell&#39;endoscopio, rendendo impossibile per i cerchi da rilevare. È difficile distinguere i cerchi anche ad occhio nudo (vedi Figura 5). Si noti che la superficie del bersaglio mostrata era già incisa con un laser. Tuttavia, ciò non diminuisce la riflessione della luce. <img alt="Figura 5" src="/files/ftp_upload/55298/55298fig5.jpg" /> Figura 5: calibrazione senza sabbiatura applicata. Come si vede dalla vista dell&#39;endoscopio sulla sinistra, il riflesso dalla luce dell&#39;endoscopio sulla superficie del materiale rende difficile anche per occhio nudo per distinguere i cerchi (c&#39;è un cerchio appena a est del grande riflessione). Si noti che la superficie di tale obiettivo (cioè, il &quot;bianco&quot;) è stato già attaccato, ma questo non è<html> utile in assenza di sabbiatura. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55298/55298fig5large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> Prima del profilo di mordenzatura, è anche importante per incidere la superficie dell&#39;intero campione. Ciò è necessario perché la superficie sabbiata ha molte riflessioni speculari (vedere Figura 6), che interferiscono con riconoscimento di regioni. <img alt="Figura 6" src="/files/ftp_upload/55298/55298fig6.jpg" /> Figura 6: superficie sabbiata senza incisione. Anche se non è di primo piano come la superficie del metallo grezzo, le relativamente piccole riflessioni speculari (alcuni dei quali sono evidenziati con frecce gialle) sono ancora sufficienti per impedire il rilevamento blob da riuscire, in modo che nessuno di taratura possono essere eseguite con questo obiettivo.Arget = &quot;_ blank&quot;&gt; Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura. Applicando il laser a diverse velocità dà diversi colori di sfondo. Il colore di sfondo gioca un ruolo significativo nel contrasto tra i cerchi e lo sfondo. Quindi, è importante per determinare il colore di sfondo ottimale. A tal fine, un piatto con cerchi inciso contro un insieme di diverse provenienze stato creato (vedi Figura 7). Gli sfondi sono stati testati utilizzando il modulo di rilevamento caratteristica di OpenCV 23, che viene utilizzato nel modulo di calibrazione fotocamera OpenCV 17. In questo lavoro, l&#39;obiettivo è stato fatto di acciaio inossidabile, in quanto è il materiale più comune e affidabile utilizzato in cliniche per dispositivi medici. Questo materiale è liberamente disponibile, non costoso, robusto e facile da sterilizzare. Altri materiali possono potenzialmente essere utilizzati per la calibrazione, come ad esempio alluminio o iodato metalli, ma questo è il scope del lavoro futuro. <img alt="Figura 7" src="/files/ftp_upload/55298/55298fig7.jpg" /> Figura 7: Piastra in acciaio inox con una tavolozza di diversi colori di sfondo incise con il laser. Esperimenti pratici sono stati condotti in combinazione con il modulo di rilevamento funzione OpenCV per determinare quale colore di sfondo fornisce il risultato ottimale in termini di blob-to-contrasto di fondo 23. La vista endoscopio a sinistra mostra la piastra. I colori di sfondo moderati (cioè, quelle altre che le scuri e più chiari quelli) in questa palette resa migliore riconoscimento di regioni. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55298/55298fig7large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> Uno dei vantaggi di questo lavoro è che l&#39;esecuzione di una calibrazione usando la porta fabbricato prende 2-3 min. La maggior parte dello sforzo goES a stabilizzare manualmente l&#39;endoscopio per ottenere una vista decente del motivo di calibrazione. Usando un supporto endoscopio fuoriserie potrebbe eliminare la necessità di stabilizzazione manuale, che a sua volta potrebbe ridurre significativamente i tempi di calibrazione. <img alt="Video 1" src="/files/ftp_upload/55298/55298video1.jpg" /> Video 1: Video che mostra come ottica di calibrazione distorsione può essere eseguita utilizzando il target di calibrazione sviluppato in collaborazione con la software endocal. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55298/fetoscope-calibration-480.mov" target="_blank">Clicca qui per visualizzare questo video. (Tasto destro del mouse per scaricare).</a> Un vantaggio del nostro lavoro rispetto al lavoro di Wengert et al. 15 è che il modulo di calibrazione fotocamera OpenCV 17 può essere utilizzato come è per la calibrazione, senza richiedere alcuna modifica o personalizzata paramezazione. Perché OpenCV è un pacchetto software ben consolidata e ben curato ed è molto popolare nella comunità visione artificiale, utilizzando elimina la necessità per la scrittura e il mantenimento di software personalizzato. Per comodità del lettore, un&#39;applicazione GUI compatta è previsto 16, che il lettore può facilmente installare e utilizzare per testare nuovi target di calibrazione. Uno svantaggio del nostro metodo rispetto a Wengert et al. 15 è che il loro metodo è più robusto per occlusioni del modello, in quanto non richiede il rilevamento di tutti i blob. Inizialmente, un target di calibrazione con un motivo a scacchi è stato fabbricato per questo lavoro. Tuttavia, questo tipo di calibrazione è rivelata inadatta in esperimenti a causa della difficoltà di rilevare gli angoli dei quadrati scacchiera. Rilevamento d&#39;angolo si basa su binarizzazione immagine istogramma-based (vedere il codice sorgente OpenCV 24). Questo impsi trova la necessità di un chiaro contrasto cromatico tra i chiari e scuri piazze, che non poteva essere garantita con il nostro schema a scacchiera, in parte a causa dei riflessi speculari, come quelli illustrati nella Figura 6. Tali riflessioni speculari sono presenti anche dopo sfondo incisione; tuttavia, la rilevazione dei cerchi sembra essere meno sensibili a questo inconveniente. Nella configurazione attuale, solo una vista perpendicolari del profilo di calibrazione consentono il rilevamento blob di successo. Ciò è dovuto alle riflessioni speculari dalla superficie del bersaglio ostacolando riconoscimento di regioni ad angoli obliqui. Siamo lavorando per migliorare ulteriormente il bersaglio in modo da consentire l&#39;acquisizione di vista ad una più ampia gamma di angoli, che potrebbero migliorare la qualità di calibrature effettuate 20. In tempo reale placentare mosaicing conduttura precedentemente proposto 11, il calcolo del transformazione che mappa coppie di immagini si basa sul rilevamento e il raggruppamento delle caratteristiche di successo. distorsioni ottiche, invece, provocano un gruppo di caratteristiche con una geometria rigida appaia diversa attraverso immagini. Di conseguenza, questa differenza comporta imprecisioni nelle trasformazioni calcolati, che provocano derive dei mosaici immagine risultanti. Perché le distorsioni ottiche più importanti sono presenti verso i bordi, immagini endoscopiche sono attualmente tagliate per le loro regioni più interne. Una buona correzione per le distorsioni ottiche potrebbe potenzialmente consentire l&#39;incorporazione di una parte più grande di ogni immagine nel processo di mosaicatura. Il vantaggio di questo metodo è duplice. Innanzitutto, aumenterebbe il numero di caratteristiche rilevate in ogni immagine, migliorando potenzialmente il calcolo delle trasformazioni di immagine. In secondo luogo, permetterebbe l&#39;intera superficie anatomica bersaglio essere ricostruito in un tempo più breve.

<html> Calibrazione obiettivo è un problema ben noto nel campo visivo computer che è stato studiato intensamente negli anni 1, 2, 3. Un passaggio chiave di procedure di calibrazione della telecamera è di stimare i parametri di un modello di distorsione, nonché i parametri della telecamera intrinseci, estraendo una griglia di punti con una geometria nota dalle immagini della telecamera con precisione sub-pixel. bersagli di calibrazione con uno schema a scacchiera con quadrati bianchi e neri sono comunemente usati per questo scopo. Chiazze circolari offrono un modello alternativo 4, 5, 6. Negli ultimi anni, c&#39;è stato un crescente interesse nello sviluppo della tecnologia di navigazione chirurgica per procedure di chirurgia fetale, come il trattamento di sindrome da trasfusione feto-fetale (TTTS) su feti&gt; 7, 8, 9, 10. Poiché il campo di vista del fetoscope (cioè, un endoscopio utilizzato in procedure chirurgiche fetali) è molto limitata, sono stati proposti metodi per la mappatura della vascolarizzazione placentare senza l&#39;utilizzo di inseguitori esterni per aiutare la chirurgia TTTS 11, 12, 13. Distorsioni ottiche all&#39;interno di immagini fetoscopic avere effetti negativi sulle questi metodi di mosaicatura di calcolo che si basano su estrazione di informazioni visive 11. Pertanto, vi è una necessità non soddisfatta di uno strumento economicamente efficiente e veloce per peri-operatorio calibrazione fetoscopes modo che compensazione della distorsione ottica può essere effettuata in tempo reale durante l&#39;intervento. A causa del fatto che il fetoscope è immerso nel liquido amniotico durante l&#39;intervento, la differenza di indice di rifrazione tra undel liquido amniotico e ir rende classici metodi di calibrazione della fotocamera in aria non idonei per le procedure di chirurgia fetale. Stima parametri della telecamera di liquido immerso da parametri della telecamera in-aria è un compito difficile e richiede almeno un&#39;immagine del fluido immersi target di calibrazione 14. Inoltre, peri-operatorio, la calibrazione fotocamera fetoscopic fluido immerso è attualmente impraticabile a causa dei requisiti di sterilizzazione e le restrizioni sui materiali ammessi in sala operatoria. Per questi motivi, calibrando endoscopi per distorsioni ottiche non è tipicamente parte della corrente workflow clinico. Il lavoro in questo manoscritto è un tentativo di colmare questa lacuna calibrazione fotocamera progettando e producendo un profilo di calibrazione distorsione ottica sterilizzabile e pratico con un modello di cerchi asimmetrici. In precedenza, Wengert et al. fabbricato un dispositivo di calibrazione personalizzata con una piastra di alluminio ossidato come la calibrazione. Il loro method, però, funziona solo in combinazione con l&#39;algoritmo di calibrazione personalizzata si sono sviluppati 15.

<table><tbody><tr><td>Lamiera da 1,2 mm Grado 316, 40 mm per 40 mm</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Contenitore dell'acqua almeno 50 mm per 50 mm per 30 mm</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Un pacchetto</td><td></td><td></td><td></td>di sterilizzazione</tr><tr><td>Acqua</td><td></td><td></td><td></td>salina</tr><tr><td>Taglierina</td><td></td><td></td><td></td>manuale in metallo</tr><tr><td>Una lima per arrotondare gli angoli</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Un blocco di legno o metallo di 50 mm per 50 mm di almeno 10 mm di spessore</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Una morsa (desiderabile ma non necessaria)</td><td></td><td></td><td></td></tr> <tr><td></td><td>Applicazione GUI della</td> sabbiatrice per creare un file .dxf con il modello <td></td><td></td> https://github.com/gift-surg/endocal</tr><tr><td>PC</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Laser Cutter</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td></td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Autoclave</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Un software</td><td></td><td></td><td>di calibrazione dell'endoscopio da GitHub: https://github.com/gift-surg/endocal</td></tr><tr>Modulo <td></td><td></td><td></td>di<td>calibrazione della telecamera OpenCV</td></tr><tr><td>per endoscopio</td><td></td><td></td><td></td></tr> http://docs.opencv.org/2.4/doc/tutorials/calib3d/camera_calibration/camera_calibration.html <tr><td>Occhiali di</td><td></td><td></td><td></td> sicurezza</tr><tr><td>Un camice da</td><td></td><td></td><td></td>laboratorio</tr><tr><td>Un righello e un pennarello</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Alcool (preferibilmente etanolo) per la rimozione della polvere e la pulizia</td><td></td><td></td><td></td></tr></tbody></table>

medico-grade di destinazione sterilizzabile per fetoscope ottico distortion calibrazione fluid-immersi

Medical-grade Sterilizable Target for Fluid-immersed Fetoscope Optical Distortion Calibration

Abbiamo sviluppato un target di calibrazione per l'uso con endoscopi immersi in fluido nel contesto del progetto GIFT-Surg (Guided Instrumentation for Fetal Therapy and Surgery). Uno degli obiettivi di questo progetto è quello di ingegnerizzare nuovi metodi di elaborazione delle immagini in tempo reale per l'uso intraoperatorio nel trattamento di difetti congeniti alla nascita, come la spina bifida e la sindrome trasfusionale da gemello a gemello. Il target sviluppato consente la calibrazione della distorsione ottica degli endoscopi con preservazione della sterilità in pochi minuti. Una buona calibrazione e compensazione della distorsione ottica è importante per mitigare effetti indesiderati come le distorsioni radiali, che non solo ostacolano l'accuratezza dell'imaging utilizzando la tecnologia endoscopica esistente durante la chirurgia fetale, ma rendono anche le immagini acquisite meno adatte per applicazioni di elaborazione delle immagini potenzialmente molto utili, come la mosaicatura in tempo reale. In questo articolo viene proposto un nuovo metodo di fabbricazione per creare un target di calibrazione economico e sterilizzabile, adatto all'uso in una configurazione clinica. Questo metodo prevede l'incisione di un modello di calibrazione mediante taglio laser di una lamiera di acciaio inossidabile sabbiata. Questo obiettivo è stato convalidato utilizzando il modulo di calibrazione della fotocamera fornito da OpenCV, una libreria software all'avanguardia popolare nella comunità della visione artificiale.

Abbiamo creato un profilo di calibrazione sterilizzabile mediante attacco un modello di cerchio asimmetrica su un foglio di metallo sabbiato acciaio, il cui disegno è mostrato in Figura 1. Un&#39;installazione esemplare che mostra la calibrazione in azione insieme ad un fetoscope è mostrato in figura 2. Per alimentare questo disegno nel software incisione laser, un&#39;applicazione personalizzata è stato implementato nel linguaggio di programmazione Python 16. Creare il modello di progettazione comporta in modo iterativo incisione linee parallele su un foglio di metallo. Per il modello di avere un colore uniforme, alla fine, la distanza tra queste linee dovrebbe essere inferiore alla larghezza del fascio laser (vedere il riquadro di figura 1): questo valore è 45 micron per il cutter laser Violino (Laservall). <img alt="Figura 1" src="/files/ftp_upload/55298/55298fig1.jpg" /> <st<html> rong&gt; Figura 1: Progettazione del modello inciso con una griglia 3-by-11 di cerchi asimmetrici. Inserto: vista ingrandita della griglia di cerchi asimmetrici. La distanza tra le linee è 45 micron (pari alla larghezza del fascio laser), e ogni cerchio ha un diametro di 1 mm. Altre misure potrebbero essere utilizzati per la griglia pure, ma questo è risultato essere ottimale rispetto al campo fetoscope di vista. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55298/55298fig1large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> <img alt="figura 2" src="/files/ftp_upload/55298/55298fig2.jpg" /> Figura 2: configurazione Exemplar con il target di calibrazione in uso. La punta del fetoscope immersi acqua è diretta alla calibrazione sulla destra. Sulla sinistra è un soldo britannico per fornire informazioni di scala.&quot;Target =&quot; _ blank &quot;&gt; Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura. Il target di calibrazione fabbricato consente la rilevazione della sagoma circolare nel flusso video endoscopica con OpenCV 17, le cui posizioni vengono poi ordinati in griglia circolare asimmetrica predefinito (vedi figura 3). Usando questa informazione, in cooperazione con il già noto geometry griglia, parametri della telecamera interni possono essere stimati. Questi includono la matrice telecamera ed i coefficienti di distorsione. La matrice fotocamera consiste delle lunghezze focali e centri ottici lungo gli assi X e Y del piano dell&#39;immagine 2D. I coefficienti di distorsione sono basati sul modello Brown-Conrady 3. Si noti che per questo lavoro, solo i parametri di distorsione radiale sono stati stimati. Per una breve discussione della teoria, con esempi pratici, consultare la pagina web del modulo di calibrazione fotocamera OpenCV &lt;sup class = &quot;xref&quot;&gt; 17 e la casella degli strumenti di calibrazione fotocamera MATLAB 22. Maggiori dettagli sulla procedura di calibrazione della fotocamera sono disponibili nel lavoro di Zhang 20. Il repository software endocal dispone di un set di dati campione di 10 viste endoscopiche del profilo di calibrazione fabbricato 16. Utilizzando questo insieme di dati, una calibrazione con un errore medio ri-proiezione di 0,28 pixel (min: 0,16, max: 0,45) è stato ottenuto. Questo è paragonabile ai 0,25 pixel riportati da Wengert et al. usando il loro algoritmo di calibrazione personalizzata 15. Lo stesso gruppo di ricerca, tuttavia, ha segnalato un errore di ri-proiezione di 0,6 pixel in un più recente carta quando si utilizza il metodo a 15 per la calibrazione di una telecamera endoscopica utilizzata per placentare mosaicatura 18. <img alt="Figura 3" src="/files/ftp_upload/55298/55298fig3.jpg" /> <strong&gt; Figura 3: il rilevamento in tempo reale del motivo di calibrazione. Uno screenshot dall&#39;applicazione calibrazione 16 con il motivo di calibrazione rilevato sovrapposto il flusso video in diretta utilizzando la visualizzazione di realtà virtuale da OpenCV 17. Si noti che ogni colonna rilevata del motivo di calibrazione è sottolineata da un colore diverso. I cerchi rilevati, in combinazione con la geometria nota, vengono utilizzati per calcolare i parametri della telecamera. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55298/55298fig3large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a> I parametri della telecamera stimati sono utilizzati per la correzione di distorsione ottica. La figura 4 mostra uno schema a scacchiera rettangolare, come visto con un fetoscope, dove distorsioni ottiche rendono le linee appaiono come curve. Si noti che le linee appaiono normali in distortiimmagine sullo corretta. <img alt="Figura 4" src="/files/ftp_upload/55298/55298fig4.jpg" /> Figura 4: correzione della distorsione ottica. Uno screenshot dall&#39;applicazione calibrazione 16 con l&#39;immagine video in diretta da una registrazione fetoscope dalla scacchiera (a sinistra) con l&#39;immagine di distorsione corretta (a destra). Tre linee esemplari sono disegnate in entrambe le immagini, ciascuna da un angolo all&#39;altro, dove la traiettoria è lineare. A causa delle distorsioni ottiche, queste linee appaiono come curve nelle immagini fetoscope originali. <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55298/55298fig4large.jpg" target="_blank">Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.</a>

Questo articolo descrive la progettazione e lo sviluppo di un target di calibrazione della distorsione ottica della telecamera personalizzato sterilizzabile per la calibrazione perioperatoria e immersa in fluido di endoscopi durante gli interventi endoscopici.

Medico-grade di destinazione sterilizzabile per fetoscope ottico Distortion calibrazione Fluid-immersi

We have developed a calibration target for use with fluid-immersed endoscopes within the context of the GIFT-Surg (Guided Instrumentation for Fetal ...

Lo scopo del progetto è sviluppare un dispositivo sterilizzabile per la calibrazione di telecamere endoscopiche che possa essere utilizzato in sale operatorie da parte di clinici. I metodi di imaging medico, come il tracciamento in tempo reale del sistema cardiovascolare umano, attualmente soffrono di effetti di distorsione ottica che potrebbero essere ridotti mediante un processo standardizzato di calibrazione. Questo dispositivo può fungere da strumento rapido e pratico per la calibrazione intra-operatoria di endoscopi utilizzati in procedure di chirurgia fetale, come nella sindrome da transfusione feto-fetale.Prima della sabbiatura, utilizzare un righello per disegnare un quadrato di 40 per 40 millimetri su un foglio di acciaio inossidabile 316 spesso 1,2 millimetri. Quindi utilizzare un tagliametallo manuale per ritagliare il quadrato e una lima per arrotondare gli angoli e i lati del campione. Successivamente, posizionare l'acciaio su un blocco di spessore da uno a due centimetri, leggermente più grande del campione quadrato.Utilizzare una morsa per fissare il campione sul blocco e un'altra per bloccarlo saldamente lungo il bordo del blocco durante la levigatura. Successivamente, spostare l'intero apparato all'interno di una camera di sabbiatura, accendere il flusso d'aria compressa e sigillare ermeticamente la camera. Indossare quindi un paio di occhiali di protezione e posizionare la pistola di sabbiatura perpendicolarmente e a una distanza di almeno quattro-cinque centimetri dalla superficie metallica.Applicare successivamente il controllo a pedale per sabbiare il campione. Quindi sabbiare l'altro lato come appena dimostrato, secondo necessità. Per la creazione del pattern laser del campione, progettare innanzitutto un modello di cerchi asimmetrici e utilizzare un software di progettazione adeguato per preparare un file in formato di scambio per il disegno.Importare il file nel software di taglio laser e impostare la marcatura di sfondo e i perimetri del modello di incisione. Andare alla scheda laser del software più avanzato. Quando si seleziona l'acciaio inossidabile come materiale, verranno visualizzati automaticamente i perimetri predefiniti.Regolare la potenza, la frequenza degli impulsi, la velocità di scansione e il numero di passaggi dei perimetri in modo appropriato. Regolare la posizione X e Y del modello da incidere, se necessario. Per riconoscere il modello utilizzando le estremità dei quadrati, il colore del blocco e dello sfondo deve essere ottimizzato.Prima di iniziare il patterning, è necessario verificare anche il corretto funzionamento e l'impostazione del perimetro del laser. Successivamente, posizionare il campione sulla piattaforma di lavoro e mettere a fuoco la superficie del campione utilizzando la finestra di comando dell'asse Z per regolare l'altezza del laser. Verificare che l'opzione di prova iniziale sia attivata nel software, accendere il diodo laser sul pannello del laser e quindi regolare l'altezza del laser.Quando il punto di prova coincide con il punto del laser a diodo, il fuoco del laser è esattamente sulla superficie. Utilizzare il software per allineare il modello di taglio. Immergere il campione del modello nell'alcol per pulire la superficie.Quindi avvolgere il campione in un pacchetto per sterilizzazione da autoclave. Per calibrare l'endoscopio, installare prima il pacchetto software di calibrazione Endocal per endoscopi disponibile su GitHub. Successivamente, posizionare il bersaglio di calibrazione in un contenitore sterile per liquidi, ad esempio un gallipot.Riempire il contenitore con il fluido desiderato e regolare lo zoom e la nitidezza dell'endoscopio secondo necessità. Successivamente immergere l'endoscopio nel fluido, tenendolo a una distanza dal bersaglio di calibrazione simile a quella a cui verrà utilizzato in seguito. Avviare ora l'applicazione di calibrazione e iniziare l'acquisizione della telecamera, muovendo leggermente la punta dell'endoscopio per ottenere diverse visuali, mantenendo sempre l'intero modello di calibrazione all'interno del campo visivo della telecamera.Acquisire il numero minimo di viste della telecamera endoscopica necessarie per la calibrazione, come indicato nella finestra Endocal. Questo target di calibrazione sterilizzabile è stato realizzato utilizzando un modello asimmetrico di cerchi su una lamina di acciaio inossidabile sabbiata, come illustrato in queste immagini. Affinché il modello presenti un colore uniforme alla fine, la distanza tra le linee deve essere inferiore alla larghezza del fascio laser.Qui viene mostrato un esempio di utilizzo di questo target di calibrazione in azione con un endoscopio. Il target di calibrazione realizzato consente il rilevamento dei blob circolari nel flusso video endoscopico mediante open CV. Le posizioni rilevate vengono quindi ordinate secondo una geometria predefinita a griglia circolare asimmetrica e successivamente utilizzate per stimare i parametri di distorsione ottica. Le distorsioni ottiche possono essere corrette utilizzando i parametri stimati.Ad esempio, in questa vista endoscopica rappresentativa di un modello a scacchiera rettangolare, le distorsioni ottiche fanno apparire le linee come curve. Tuttavia, dopo la correzione della distorsione, le linee appaiono normali. Questa tecnica consente la fabbricazione economica di un dispositivo sterilizzabile per la calibrazione della telecamera endoscopica a partire da materiali medici facilmente disponibili.Sulla base dei risultati positivi ottenuti in questo studio, stiamo procedendo verso lo sviluppo di un dispositivo ergonomico completo per la calibrazione che richiederà un'interazione minima da parte dell'utente. Questo metodo produttivo può contribuire a rispondere a domande fondamentali nel campo dell'interpretazione delle immagini mediche, come ad esempio: come può essere mantenuta la sterilizzabilità della telecamera endoscopica durante il processo di calibrazione? Il nostro dispositivo di calibrazione è compatibile con software avanzati per la calibrazione delle telecamere, come Open CV, riducendo ulteriormente la complessità dell'integrazione del dispositivo con numerose potenziali applicazioni software cliniche.

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