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Neuroscience
Programma spettrogramma multitaper basato su computer per dati elettroencefalografici
Programma spettrogramma multitaper basato su computer per dati elettroencefalografici
JoVE Journal
Neuroscience
This content is Free Access.
JoVE Journal Neuroscience
Computer-based Multitaper Spectrogram Program for Electroencephalographic Data

Programma spettrogramma multitaper basato su computer per dati elettroencefalografici

Full Text
12,872 Views
04:13 min
November 13, 2019

DOI: 10.3791/60333-v

Christopher B. O'Brien1, Helen A. Baghdoyan1,2,3, Ralph Lydic1,2,3

1Department of Psychology,University of Tennessee, 2Department of Anesthesiology,University of Tennessee, 3Oak Ridge National Laboratory

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Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

Overview

This protocol describes an open-source MATLAB program that generates multitaper spectrograms for analyzing electroencephalographic (EEG) data. It enables users to create customizable spectrograms without requiring prior knowledge of signal processing.

Key Study Components

Area of Science

  • Electrophysiology
  • Signal processing
  • Neuroscience

Background

  • Electroencephalography (EEG) is used to monitor brain activity.
  • Multitaper techniques enhance spectral analysis of EEG data.
  • Understanding the effects of various substances on EEG dynamics is crucial.
  • Common opiates show significant impacts on cortical EEG patterns.

Purpose of Study

  • To provide a user-friendly method for generating multitaper spectrograms.
  • To analyze the dynamic changes in EEG frequency and power.
  • To visualize the effects of different opiates on cortical EEG power.

Methods Used

  • The study employs a compiled MATLAB program for spectrogram computation.
  • The biological model involves chronic implantation of EEG and EMG electrodes in mice.
  • EEG data must be collected in millivolts approximately 7-10 days post-surgery.
  • Participants score EEG data using appropriate software to categorize sleep states.
  • Important files must be in EDF or CSV format for compatibility with the program.

Main Results

  • The program successfully visualizes EEG dynamics and compares effects of various opiates.
  • Notable spectral power changes were observed following morphine and buprenorphine administration.
  • EEG power levels were higher with saline treatment compared to buprenorphine in the 0.5 to 4 Hz frequency range.
  • Chronic electrode implantation facilitated long-term studies on substance effects.

Conclusions

  • This study demonstrates the utility of the MATLAB program for EEG data analysis.
  • The program’s open-source nature allows for broader accessibility in neuroscience research.
  • Insights gained may elucidate the impacts of opiates on brain activity, aiding in drug-related research.

Frequently Asked Questions

What are the advantages of using the MATLAB program?
The program is open source and user-friendly, requiring no prior signal processing knowledge, making it accessible for various research applications.
How is the EEG data collected?
EEG data is collected from mice with implanted electrodes, typically 7-10 days after surgery, recording signals in millivolts over the desired experimental period.
What type of data can be obtained using this method?
Users can obtain detailed spectrograms that illustrate EEG frequency and power dynamics, allowing for the study of the effects of substances on brain activity.
Can the method be adapted for different research needs?
Yes, the program allows customization of spectrogram parameters, enabling researchers to tailor the analysis to their specific experimental designs.
Are there any limitations to this protocol?
The main limitation is that it requires some familiarity with managing file formats and basic understanding of EEG data interpretation.
What type of scoring is done on the EEG data?
Each 10-second bin of the EEG data is independently scored for wakefulness, REM sleep, or non-REM sleep using specialized software.

Questo protocollo fornisce un programma MATLAB compilato open source che genera spettrogrammi multitaper per dati elettroencefalografici.

Questo protocollo è significativo perché consente agli utenti di sviluppare spettrogrammi multitaper personalizzabili senza previa conoscenza dell'elaborazione del segnale. Il principale vantaggio tecnico del programma è il design intuitivo del programma e la possibilità di creare spettrogrammi multitaper utilizzando computer senza licenza MATLAB. Da sette a 10 giorni dopo l'intervento chirurgico di impianto dell'elettrodo, configurare il sistema di acquisizione dati per registrare tutti i segnali in millivolt e ottenere registrazioni EEG per la durata sperimentale desiderata.

Amplificare e digitalizzare i segnali EEG non filtrati utilizzando la strumentazione e il software di acquisizione dati appropriati. Quindi avere due individui diversi che ottengono un punteggio indipendente ogni cestino di 10 secondi dell'EEG digitale, della traccia blu e dell'EMG, traccia nera, registrazioni come veglia, sonno REM o sonno non REM in un programma software di punteggio del sonno appropriato. Scarica il programma di spettrogramma multitaper compilato.

Per il calcolo degli spettrogrammi, ottenere dati EEG non elaborati e non elaborati in formato EDF o CSV e inserire il file nella stessa posizione del file di programma compilato e avviare il programma Spectrogram. Seguire le istruzioni popup e selezionare il formato di file appropriato. Immettere l'intero nome del file EEG e selezionare i parametri per il calcolo dello spettrogramma.

Immettere i titoli sia per lo spettrogramma che per l'EEG. Quindi, fare clic su File e salva per salvare lo spettrogramma risultante e la traccia EEG nel formato di file desiderato. Questa figura mostra somiglianze rappresentative e differenze nell'EEG corticale durante la veglia, il sonno non REM e il sonno REM.

Questo ipnogramma è stato utilizzato per tracciare l'organizzazione temporale degli stati di sonno e veglia sulla base delle valutazioni delle registrazioni EEG ed EMG. In contrasto con l'ipnogramma discretizzato, uno spettrogramma può essere utilizzato per illustrare cambiamenti altamente dinamici nella frequenza e nella potenza EEG in funzione del tempo e per evidenziare le somiglianze tra il segnale EEG corticale durante la veglia e il sonno REM. Questi spettrogrammi multitaper riassumono ciascuno quattro ore di registrazioni EEG dopo somministrazione sistemica di soluzione salina, morfina, buprenorfina o fentanil.

Questa figura mostra l'uso di spettrogrammi per visualizzare gli effetti dei diversi oppiacei sulla potenza corticale EEG. L'attività ad onde lente presente nella condizione salina viene eliminata dalla morfina e dalla buprenorfina. Dopo la somministrazione del fentanil, si può osservare la potenza del delta ad onde lente.

I cambiamenti EEG illustrati dagli spettrogrammi possono essere ulteriormente quantificati ed espressi come la potenza spettrale domina media di ogni mezza frequenza. Ad esempio, come illustrato in questo grafico, la media della potenza spettrale all'interno di specifiche bande di frequenza EEG ha rivelato che nella gamma di frequenza da 0,5 a quattro hertz, la potenza EEG era molto più alta con il trattamento salino che con la buprenorfina. I topi con elettrodi EEG ed EMG impiantati cronicamente rimangono sani per molti mesi, consentendo nuovi studi sulle interazioni farmaco-farmaco e sulla somministrazione cronica di farmaci.

Inoltre, queste tecniche possono fornire nuove intuizioni sugli sforzi per sviluppare contromisure chimiche alla depressione respiratoria indotta da opati.

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Neuroscienze Numero 153 Neuroscienze fentanil morfina buprenorfina sonno minacce chimiche

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