3 luglio 2025
In questo studio, descriviamo un protocollo passo-passo e sottolineiamo i dettagli chiave per determinare le caratteristiche morfologiche dei mitocondri nelle cellule vive, tra cui la preparazione del campione, l'acquisizione di immagini e l'analisi dei dati. Questo metodo è comunemente usato per esaminare la morfologia mitocondriale per studiare varie condizioni.
La nostra ricerca si concentra sulla neurofarmacologia di base. In particolare, studiamo come funzionano le molecole dei farmaci. Il nostro obiettivo è comprendere la relazione tra potenziali composti farmacologici e funzione mitocondriale nella malattia di Parkinson.
Studi precedenti esaminano le sfide di lunga data dell'analisi delle cellule di laboratorio, anche con le linee guida del produttore. Per risolvere questo problema, abbiamo delineato un protocollo dettagliato passo dopo passo per valutare la morfologia mitocondriale nelle cellule di laboratorio. Il nostro protocollo utilizza una semplice colorazione mitocondriale, imaging a fluorescenza e software open source.
Ciò riduce i costi, aumenta l'accessibilità e lo rende più facile da usare rispetto ad alternative complesse come la microscopia elettronica. Per iniziare, ottenere colture di cellule SH-SY5Y coltivate in fiasche contenenti DMEM/F12, integrate con il 10% di FBS. Staccare le cellule per un minuto utilizzando una soluzione di tripsina allo 0,05%.
Quindi centrifugare le celle a 100 G per tre minuti prima di passarle. Quindi, sospendere le cellule SH-SY5Y in terreno DMEM/F12 integrato con l'1% di FBS. Quindi seminare le cellule su piastre confocali con fondo di vetro e mantenerle per una notte.
Per la stimolazione MPP+, sostituire il terreno di coltura con terreno fresco con o senza 1-metil-4-fenilpiridinio per 24 ore. Per la colorazione MitoTracker, diluire la soluzione madre MitoTracker con terreno DMEM/F12 preriscaldato per ottenere una concentrazione di lavoro di 50 nanomolari. Mantenere la soluzione colorante al riparo dalla luce durante tutta la procedura.
Rimuovere il terreno di coltura dalle piastre confocali. Lavare le celle due volte con DMEM/F12 fresco. Quindi pipettare un millilitro della soluzione di lavoro MitoTracker nel piatto.
Incubare per 15 minuti a 37 gradi Celsius al buio. Ora rimuovi la soluzione di lavoro MitoTracker e lava i piatti due volte con DMEM/F12. Dopo l'ultimo lavaggio, aggiungere un millilitro di DMEM/F12 a ogni piatto.
Incubare nell'incubatore cellulare prima dell'imaging. Per pre-equilibrare il microscopio confocale per l'imaging, sotto il pannello di acquisizione, regolare i parametri del percorso della luce impostando le lunghezze d'onda di eccitazione ed emissione. Imposta la dimensione del foro stenopeico su 1,2 unità ariose, la dimensione della scansione dei pixel su 1024 per 1024, il tempo di permanenza dei pixel su 2,4 microsecondi con una media di due.
Ora usa la luce alogena per mettere a fuoco le cellule utilizzando una lente obiettivo apocromatica 60X con un'apertura numerica di 1,4, riducendo al minimo la fototossicità. Regolare la potenza del laser e l'alta tensione appena al di sotto del livello di saturazione. Quindi imposta il fattore di zoom su tre e cattura le immagini.
Sposta la regione di interesse per mettere a fuoco altre cellule al microscopio. Quindi acquisisci le immagini senza modificare le impostazioni. Per migliorare la qualità dell'immagine prima della trasformazione binaria e dell'ossatura, aprire prima l'immagine.
Seleziona un'area di una singola cella utilizzando lo strumento ROI. Ora, fai clic in sequenza su processo, filtri, funzione maschera di contrasto per migliorare la nitidezza. Quindi utilizzare il processo e migliorare il contrasto per ridurre l'amplificazione del rumore.
Fare clic su processo, filtri e l'opzione mediana per rimuovere il rumore di sale e pepe. Per convertire l'immagine in binario, fai clic su processo seguito da binario e scegli l'opzione crea binario. Scheletrare l'immagine binaria facendo clic su elabora, binario e scheletra.
Quindi raggruppa tutti i pixel dello scheletro selezionando Analizza, seguito da Scheletro e analizza la funzione 2D 3D dello scheletro. Semplifica l'analisi utilizzando lo strumento MiNA per calcolare nove parametri descrittivi nell'immagine scheletrata. L'intensità della fluorescenza della colorazione mitocondriale è aumentata progressivamente con la concentrazione di CMXRos rosso MitoTracker da 25 nanomolari a 200 nanomolari.
Ma a 200 nanomolari, è stata osservata una sostanziale colorazione del fondo citoplasmatico. La morfologia mitocondriale è stata preservata meglio nel terreno DMEM/F12 rispetto al PBS a un'ora dopo la colorazione, sebbene DMEM/F12 abbia anche mostrato una maggiore fluorescenza di fondo. La media a doppio frame ha migliorato significativamente il rapporto segnale/rumore nell'imaging mitocondriale rispetto alla modalità a scansione singola.
E l'aumento del tempo di permanenza dei pixel da 2,4 a 10,8 microsecondi ha portato a immagini più luminose, ma ha causato il photobleaching. L'aumento dell'alta tensione ha intensificato il rumore di fondo, mentre l'aumento della potenza del laser ha portato al fotosbiancamento. Lo strumento MiNA ha prodotto output di scheletratura coerenti sia per le immagini scure che per quelle luminose, indicando una segmentazione robusta tra diverse intensità di fluorescenza, con l'immagine luminosa che mostra un'intensità 5,5 volte superiore rispetto all'immagine fioca.
Il trattamento MPP+ a 500 micromolari ha alterato la morfologia mitocondriale nelle cellule SH-SY5Y rispetto al controllo non trattato, con conseguente riduzione significativa dell'impronta mitocondriale.
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Questo studio presenta un protocollo dettagliato per valutare la morfologia mitocondriale in cellule SH-SY5Y vive, rilevante per studi farmacologici, specialmente nella malattia di Parkinson. Il metodo enfatizza l'accessibilità e i costi ridotti attraverso l'uso dell'imaging a fluorescenza con colorazione MitoTracker, evitando tecniche complesse come la microscopia elettronica.
Quantitative assessment of mitochondrial morphology in live cells is critical for mechanistic de-risking and target validation in neurodegenerative disease research. This confocal microscopy protocol enables reproducible, cost-effective evaluation of mitochondrial dynamics, supporting predictive confidence in early discovery and translational workflows. The approach facilitates robust comparison of compound effects on mitochondrial structure, directly informing portfolio triage and advancement decisions.
This protocol integrates into the discovery continuum from early mechanistic studies through lead identification and preclinical validation, supporting iterative hypothesis testing and data-driven decision-making.