Name: Metagenomica della frazione della dimensione virale del DNA per campioni di feci umane (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-03-24T13:00:00.000+00:00
Duration: 5 min 15 s
Description: Scopri un protocollo flessibile per arricchire ed estrarre DNA virale da campioni fecali umani. Questo metodo consente di generare viromi di alta qualità per analisi metagenomiche accurate.

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<ol><li>Breitbart, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metagenomic+Analyses+of+an+Uncultured+Viral+Community+from+Human+Feces%5BTitle%5D)+AND+%22J+Bacteriol%22%5BJournal%5D)">Metagenomic Analyses of an Uncultured Viral Community from Human Feces.</a> J Bacteriol. 185 (20), 6220-6223 (2003).</li>
<li>Liang, G., Bushman, F. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+human+virome%3A+assembly%2C+composition+and+host+interactions%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Rev+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The human virome: assembly, composition and host interactions.</a> Nat Rev Microbiol. 19 (8), 514-527 (2021).</li>
<li>Callanan, J., Stockdale, S. R., Shkoporov, A., Draper, L. A., Ross, R. P., Hill, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Biases+in+Viral+Metagenomics-Based+Detection%2C+Cataloguing+and+Quantification+of+Bacteriophage+Genomes+in+Human+Faeces%2C+a+Review%5BTitle%5D)+AND+%22Microorganisms%22%5BJournal%5D)">Biases in Viral Metagenomics-Based Detection, Cataloguing and Quantification of Bacteriophage Genomes in Human Faeces, a Review.</a> Microorganisms. 9 (3), 524(2021).</li>
<li>Garmaeva, S., Sinha, T., Kurilshikov, A., Fu, J., Wijmenga, C., Zhernakova, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Studying+the+gut+virome+in+the+metagenomic+era%3A+challenges+and+perspectives%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Biol%22%5BJournal%5D)">Studying the gut virome in the metagenomic era: challenges and perspectives.</a> BMC Biol. 17 (1), 84(2019).</li>
<li>Lewandowska, D. W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+and+validation+of+sample+preparation+for+metagenomic+sequencing+of+viruses+in+clinical+samples%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">Optimization and validation of sample preparation for metagenomic sequencing of viruses in clinical samples.</a> Microbiome. 5 (1), 94(2017).</li>
<li>Conceição-Neto, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Modular+approach+to+customise+sample+preparation+procedures+for+viral+metagenomics%3A+a+reproducible+protocol+for+virome+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">Modular approach to customise sample preparation procedures for viral metagenomics: a reproducible protocol for virome analysis.</a> Sci Rep. 5 (1), 16532(2015).</li>
<li>Palermo, C. N., Shea, D. W., Short, S. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Analysis+of+Different+Size+Fractions+Provides+a+More+Complete+Perspective+of+Viral+Diversity+in+a+Freshwater+Embayment%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Analysis of Different Size Fractions Provides a More Complete Perspective of Viral Diversity in a Freshwater Embayment.</a> Appl Environ Microbiol. 87 (11), e00197-e00221 (2021).</li>
<li>Kleiner, M., Hooper, L. V., Duerkop, B. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Evaluation+of+methods+to+purify+virus-like+particles+for+metagenomic+sequencing+of+intestinal+viromes%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">Evaluation of methods to purify virus-like particles for metagenomic sequencing of intestinal viromes.</a> BMC Genomics. 16 (1), 7(2015).</li>
<li>Fudyma, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Exploring+viral+particle%2C+soil%2C+and+extraction+buffer+physicochemical+characteristics+and+their+impacts+on+extractable+viral+communities%5BTitle%5D)+AND+%22Soil+Biol+Biochem%22%5BJournal%5D)">Exploring viral particle, soil, and extraction buffer physicochemical characteristics and their impacts on extractable viral communities.</a> Soil Biol Biochem. 194, 109419(2024).</li>
<li>Zhai, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+impact+of+storage+buffer+and+storage+conditions+on+fecal+samples+for+bacteriophage+infectivity+and+metavirome+analyses%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">The impact of storage buffer and storage conditions on fecal samples for bacteriophage infectivity and metavirome analyses.</a> Microbiome. 11 (1), 193(2023).</li>
<li>Trubl, G., Solonenko, N., Chittick, L., Solonenko, S. A., Rich, V. I., Sullivan, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+viral+resuspension+methods+for+carbon-rich+soils+along+a+permafrost+thaw+gradient%5BTitle%5D)+AND+%22PeerJ%22%5BJournal%5D)">Optimization of viral resuspension methods for carbon-rich soils along a permafrost thaw gradient.</a> PeerJ. 4, e1999(2016).</li>
<li>Roux, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Towards+quantitative+viromics+for+both+double-stranded+and+single-stranded+DNA+viruses%5BTitle%5D)+AND+%22PeerJ%22%5BJournal%5D)">Towards quantitative viromics for both double-stranded and single-stranded DNA viruses.</a> PeerJ. 4, e2777(2016).</li>
<li>Kim, K. H., Bae, J. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Amplification+methods+bias+metagenomic+libraries+of+uncultured+single-stranded+and+double-stranded+DNA+viruses%5BTitle%5D)+AND+%22Appl+Environ+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Amplification methods bias metagenomic libraries of uncultured single-stranded and double-stranded DNA viruses.</a> Appl Environ Microbiol. 77 (21), 7668(2011).</li>
<li>ter Horst, A. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Minnesota+peat+viromes+reveal+terrestrial+and+aquatic+niche+partitioning+for+local+and+global+viral+populations+%28vol+9%2C+233%2C+2021%29%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">Minnesota peat viromes reveal terrestrial and aquatic niche partitioning for local and global viral populations (vol 9, 233, 2021).</a> Microbiome. 9 (1), (2021).</li>
<li>Sorensen, J., Zinke, L., ter Horst, A., Santos-Medellín, C., Schroeder, A., Emerson, J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNase+Treatment+Improves+Viral+Enrichment+in+Agricultural+Soil+Viromes%5BTitle%5D)+AND+%22mSystems%22%5BJournal%5D)">DNase Treatment Improves Viral Enrichment in Agricultural Soil Viromes.</a> mSystems. 6 (5), e00614-e00621 (2021).</li>
<li>Santos-Medellín, C., Estera-Molina, K., Yuan, M., Pett-Ridge, J., Firestone, M. K., Emerson, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Spatial+turnover+of+soil+viral+populations+and+genotypes+overlain+by+cohesive+responses+to+moisture+in+grasslands%5BTitle%5D)+AND+%22Proc+Natl+Acad+Sci+U+S+A%22%5BJournal%5D)">Spatial turnover of soil viral populations and genotypes overlain by cohesive responses to moisture in grasslands.</a> Proc Natl Acad Sci U S A. 119 (45), e2209132119(2022).</li>
<li>Emerson, J. B., Geonczy, S. E., Santos-Medellín, C., ter Horst, A. M., Fudyma, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soil+Viromics+Protocol+-+Emerson+Lab+v1%5BTitle%5D)+AND+%22Protocols.io%22%5BJournal%5D)">Soil Viromics Protocol - Emerson Lab v1.</a> Protocols.io. , https://protocols.io/view/soil-viromics-protocol-emerson-lab-v1-b7nyrmfw/v1 (2022).</li>
<li>Göller, P. C., Haro-Moreno, J. M., Rodriguez-Valera, F., Loessner, M. J., Gómez-Sanz, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Uncovering+a+hidden+diversity%3A+optimized+protocols+for+the+extraction+of+dsDNA+bacteriophages+from+soil%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">Uncovering a hidden diversity: optimized protocols for the extraction of dsDNA bacteriophages from soil.</a> Microbiome. 8 (1), 17(2020).</li>
<li>Larsen, F. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aLarsen%2C+F+%22SM+buffer%22">SM buffer</a>. , Protocols.io. https://www.protocols.io/view/sm-buffer-8epv5967jg1b/v1 (2021).</li>
<li>Camargo, A. P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Identification+of+mobile+genetic+elements+with+geNomad%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Identification of mobile genetic elements with geNomad.</a> Nat Biotechnol. , (2023).</li>
<li>Santos-Medellín, C., Blazewicz, S. J., Pett-Ridge, J., Firestone, M. K., Emerson, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Viral+but+not+bacterial+community+successional+patterns+reflect+extreme+turnover+shortly+after+rewetting+dry+soils%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Ecol+Evol%22%5BJournal%5D)">Viral but not bacterial community successional patterns reflect extreme turnover shortly after rewetting dry soils.</a> Nat Ecol Evol. 7 (11), 1809-1822 (2023).</li>
<li>Halary, S., Temmam, S., Raoult, D., Desnues, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Viral+metagenomics%3A+are+we+missing+the+giants%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Opin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Viral metagenomics: are we missing the giants.</a> Curr Opin Microbiol. 31, 34-43 (2016).</li>
<li>Williamson, S. J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Metagenomic+exploration+of+viruses+throughout+the+Indian+Ocean%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Metagenomic exploration of viruses throughout the Indian Ocean.</a> PLoS One. 7 (10), e42047(2012).</li>
<li>Liang, G., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+stepwise+assembly+of+the+neonatal+virome+is+modulated+by+breastfeeding%5BTitle%5D)+AND+%22Nature%22%5BJournal%5D)">The stepwise assembly of the neonatal virome is modulated by breastfeeding.</a> Nature. 581 (7809), 470-474 (2020).</li>
<li>Hillary, L. S., Knotts, T. A., Adams, S. H., Ali, M. R., Olm, M. R., Emerson, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+extraction+and+virome+processing+methods+strongly+influence+recovered+human+gut+viral+community+characteristics%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">DNA extraction and virome processing methods strongly influence recovered human gut viral community characteristics.</a> bioRxiv. , (2025).</li>
<li>Santos-Medellín, C., Zinke, L. A., ter Horst, A. M., Gelardi, D. L., Parikh, S. J., Emerson, J. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Viromes+outperform+total+metagenomes+in+revealing+the+spatiotemporal+patterns+of+agricultural+soil+viral+communities%5BTitle%5D)+AND+%22ISME+J%22%5BJournal%5D)">Viromes outperform total metagenomes in revealing the spatiotemporal patterns of agricultural soil viral communities.</a> ISME J. 15 (7), 1956-1970 (2021).</li>
<li>Gregory, A. C., Zablocki, O., Zayed, A. A., Howell, A., Bolduc, B., Sullivan, M. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+Gut+Virome+Database+Reveals+Age-Dependent+Patterns+of+Virome+Diversity+in+the+Human+Gut%5BTitle%5D)+AND+%22Cell+Host+Microbe%22%5BJournal%5D)">The Gut Virome Database Reveals Age-Dependent Patterns of Virome Diversity in the Human Gut.</a> Cell Host Microbe. 28 (5), 724-740 (2020).</li>
<li>Yilmaz, S., Allgaier, M., Hugenholtz, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiple+displacement+amplification+compromises+quantitative+analysis+of+metagenomes%5BTitle%5D)+AND+%22Nat+Methods%22%5BJournal%5D)">Multiple displacement amplification compromises quantitative analysis of metagenomes.</a> Nat Methods. 7 (12), 943-944 (2010).</li>
<li>Kosmopoulos, J. C., Klier, K. M., Langwig, M. V., Tran, P. Q., Anantharaman, K. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Viromes+vs.+mixed+community+metagenomes%3A+choice+of+method+dictates+interpretation+of+viral+community+ecology%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">Viromes vs. mixed community metagenomes: choice of method dictates interpretation of viral community ecology.</a> Microbiome. 12 (1), 195(2024).</li>
<li>Zhai, X., Gobbi, A., Kot, W., Krych, L., Nielsen, D. S., Deng, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+single-stranded+based+library+preparation+method+for+virome+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22Microbiome%22%5BJournal%5D)">A single-stranded based library preparation method for virome characterization.</a> Microbiome. 12 (1), 219(2024).</li>
<li>Hillary, L. S., Adriaenssens, E. M., Jones, D. L., McDonald, J. E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((RNA-viromics+reveals+diverse+communities+of+soil+RNA+viruses+with+the+potential+to+affect+grassland+ecosystems+across+multiple+trophic+levels%5BTitle%5D)+AND+%22ISME+Commun%22%5BJournal%5D)">RNA-viromics reveals diverse communities of soil RNA viruses with the potential to affect grassland ecosystems across multiple trophic levels.</a> ISME Commun. 2, 34(2022).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Albumina Sirica Bovina (BSA) Polvere Priva di DNasi e Proteasi</td><td>BioReagenti Fisher</td><td>BP9706100</td><td>Per la ricetta PPBS (Passo 1.1)</td></tr><tr><td>DNeasy PowerSoil Pro Kit</td><td>QIAGEN</td><td>47016</td><td>Kit di estrazione del DNA (Passo 4.1)</td></tr><tr><td>Kit di libreria KAPA DNA HyperPrep</td><td>Roche</td><td>n/a</td><td>Le librerie generate da questo kit sono state sequenziate utilizzando la piattaforma Illumina NovaSeq 6000 (2 x 150 bp).</td></tr><tr><td>Solfato di magnesio (MgSO4), anidro, &ge; 99.5%</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M7506</td><td>Per la ricetta PPBS (Passo 1.1)</td></tr><tr><td>Soluzione salina tamponata con fosfato (PBS), 10x, pH 7,4, senza RNasi</td><td>Invitrogen</td><td>AM9624</td><td>Per la ricetta PPBS (Passo 1.1)</td></tr><tr><td>Filtri a siringa a membrana di polietersolfone (PES), sterili, 28 mm, 0,2 & mu; m</td><td>Corning</td><td>431229</td><td>Per la filtrazione con siringa (Passo 2.9)</td></tr><tr><td>Tubi centrifughe conici in polipropilene, sterili, 50 mL</td><td>Olympus Plastics</td><td>28-108</td><td></td></tr><tr><td>Monoidrato di Citrato di Potassio (Cristallino/Certificato)</td><td>Fisher Chemical</td><td>P222</td><td>Per la ricetta PPBS (Passo 1.1)</td></tr><tr><td>Qubit&nbsp; Tubi per il test</td><td>Invitrogen</td><td>Q32856</td><td>Per la quantificazione del DNA (Passo 5.1)</td></tr><tr><td>Fluorometro Qubit 4</td><td>Invitrogen</td><td>Q33238</td><td>Per la quantificazione del DNA (Passo 5.1)</td></tr><tr><td>Kit di quantificazione del dsDNA per qubit</td><td>Invitrogen</td><td>Q32850</td><td>Per la quantificazione del DNA (Passo 5.1)</td></tr><tr><td>RNasi RNasi RQ1 DNasi</td><td>Promega</td><td>PR-M6101</td><td>Include il buffer di reazione, la DNasi e la soluzione di stop</td></tr><tr><td>Supor polietersolfone idrofilo (PES) filtri a membrana sterili, 32 mm, 5,00 e micro; m&nbsp;</td><td>Cytiva (precedentemente Pall Lab)</td><td>28150-956</td><td>Per la filtrazione con siringa (Passo 2.9)</td></tr><tr><td>Rotore ultracentrifuga: Rotore ad angolo fisso Type 50.2 Ti, 50.000 giri/min, 302.000 x g, 12 x 39 m</td><td>Beckman Coulter</td><td>337901</td><td>Utilizziamo anche il Beckman Coulter Type 70 Ti Fixed Angle Titanium Rotor (Cat. 337922). Centrifuga per 3 ore se usi la 70 Ti.</td></tr><tr><td>Tubi ultracentrifughe: 26,3 mL Bottiglia di policarbonato con assemblaggio tappo, 25 x 89mm</td><td>Beckman Coulter</td><td>355618</td><td>Compatibile con i rotori Beckman Coulter Type 50.2 Ti (Cat. 337901) e Type 70 Ti (Cat. 337922)</td></tr><tr><td>Ultracentrifuga: Beckman Instruments Optima LE-80K Ultracentrifuga a pavimento</td><td>Beckman Coulter</td><td>365668</td><td>Utilizziamo anche la Beckman Coulter L8-70M Ultracentrifuga Refrigerata (Cat. 344196)</td></tr></tbody></table>

metagenomica della frazione della dimensione virale del dna per campioni di feci umane

DNA Viral Size Fraction Metagenomics for Human Stool Samples

Metagenomica della frazione della dimensione virale del DNA per campioni di feci umane

Understanding the healthy human virosphere (the viral component of the microbiome) requires accurate measurements of viral community composition across a ...

dna-viral-size-fraction-metagenomics-for-human-stool-samples

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Un One-Step RT-PCR per il rilevamento e l'identificazione genogruppo di isolati Norovirus da feci bambini, che utilizza primer e sonde TaqMan specifiche al telaio di lettura aperta 1 (ORF1)-ORF2 regione di giunzione, la regione più conservata del genoma Norovirus è descritto. Un non-commerciale e conveniente metodo di estrazione dell'RNA è dettagliato.

Rilevamento e Genogrouping di Norovirus dalle feci dei bambini By Taqman One-step RT-PCR

Genomica singolo virus (SVG) è un metodo per isolare e amplificare il genoma di singoli virons. Sospensioni virali di un assemblaggio misto sono ordinati mediante citometria a flusso su un vetrino da microscopio con pozzi discrete contenenti agarosio, catturando così il virione e la riduzione del genoma taglio durante la lavorazione a valle. Intero genoma amplificazione viene ottenuta utilizzando multipla di amplificazione dello spostamento (MDA) risultante in materiale genomico che è adatto...

Isolamento e analisi del genoma di virioni singole utilizzando &quot;Genomica singolo virus &#39;

Questo video descrive il protocollo di isolamento del DNA da campioni di feci di topi portatori di tumore al colon. Il DNA estratto viene amplificato mediante PCR e il prodotto viene ulteriormente pulito utilizzando un approccio basato su microsfere magnetiche. Questo metodo può essere utilizzato per determinare l'effetto dell'arricchimento ambientale sul microbiota del colon e sulla mortalità animale.

Isolamento del DNA microbico delle feci: studio dell'effetto dell'arricchimento ambientale sulla diversità del microbioma nel modello di tumore murino

Utilizzando fibrosi cistica vie respiratorie come esempio, il manoscritto presenta un flusso di lavoro comprendente una combinazione di approcci metagenomiche e metatranscriptomic per caratterizzare la comunità microbiche e virali in campioni animali-associata.

Purificare l&#39;Impure: sequenziamento metagenomi e Metatranscriptomes da campioni complessi animali associate

Qui, presentiamo un protocollo completo per valutare la disponibilità di nutrienti organici e inorganici e l'abbondanza e la struttura delle comunità microbiche e virali in ambienti marini remoti.

Svelare i giocatori invisibili del Mare - Una guida del campo di Acqua Chimica e microbiologia marina

Qui, presentiamo approcci fenomici per la caratterizzazione funzionale di geni fagici putativi. Le tecniche includono un test sviluppato in grado di monitorare il metabolismo anabolico dell'ospite, le piastre per saggi multifenotipo (MAP), oltre al metodo consolidato della metabolomica, in grado di misurare gli effetti sul metabolismo catabolico.

Fenomica fagi: Approcci fisiologici per caratterizzare Novel virali Proteine

Descriviamo un metodo efficiente, robusto e redditizio per l'estrazione degli acidi nucleici da tamponi per la caratterizzazione delle comunità batteriche che utilizzano 16S rRNA gene amplicone sequenziamento. Il metodo consente un approccio di elaborazione comune per diversi tipi di campioni ed accoglie una serie di processi analitici valle.

Efficiente Nucleic Acid Estrazione e 16S rRNA sequenziamento del gene per batterica Comunità Caratterizzazione

Questo manoscritto descrive un dettagliato protocollo standardizzato di alta-16S rRNA-amplicone sequenziamento. Il protocollo introduce un protocollo integrato, in uniforme, fattibile ed economico a partire dalla raccolta del campione fecale attraverso l'analisi dei dati. Questo protocollo consente l'analisi di un gran numero di campioni con rigorosi standard e diversi controlli.

Protocollo guidata per caratterizzazione microbica fecale mediante sequenziamento del 16S rRNA-amplicone

Questo protocollo isola l'RNA totale di alta qualità da campioni fecali di soggetti animali e umani. Un kit commerciale di isolamento dei miRNA viene utilizzato con un adattamento significativo per isolare l'RNA puro con quantità e qualità ottimizzate. Gli isolati di RNA sono buoni per la maggior parte dei saggi di RNA a valle come sequenziamento, micro-array e RT-PCR.

Isolamento fecale (micro) RNA

La quantificazione precisa delle copie del genoma del vettore del virus adeno-associato (AAV) è fondamentale, ma un protocollo standardizzato deve ancora essere stabilito. Questo protocollo descrive un metodo convalidato per la preparazione di campioni di AAV purificati e per l'esecuzione di una reazione a catena della polimerasi (dd_PCR) digitale per quantificare in modo affidabile il titolo del genoma virale.

Quantificazione dei genomi virali adeno-associati in campioni di vettori purificati mediante reazione a catena della polimerasi a goccioline digitali

Scopri un protocollo flessibile per arricchire ed estrarre DNA virale da campioni fecali umani. Questo metodo consente di generare viromi di alta qualità per analisi metagenomiche accurate.

Metagenomica della frazione della dimensione virale del DNA per campioni di feci umane

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