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1. アルギン酸定量のためのELISA
1.マイクロピペットを使用して、収集したサンプル50 μLを未処理の96ウェルプレートに加えます。50 μLのコーティングバッファー(炭酸塩/重炭酸塩バッファーpH 9.6)をウェルに加えます。プレートを37°Cで2時間インキュベートします。
手記: ポジティブコントロールの場合、既知の濃度の D-マンヌロン酸および/または既知の安定なアルギン酸産生株(例: PAO581-PAO1mucA25)を使用できます。ネガティブコントロールの場合は、0.85%NaCl溶液および/またはPAO1ΔalgD を使用します( algD 遺伝子のフレーム内欠失により、細菌はアルギン酸塩を完全に産生できなくなります)。各サンプルから複数のウェルを作成して、統計分析に役立つ技術的リピートの数を増やすことができます。各サンプルの3〜5ウェルを調製します。
2.潮吹きボトルを使用して、ウェルを充填して0.05%トゥイーン20(PBS-T)を含む1xリン酸緩衝生理食塩水(PBS)でプレートウェルを2回洗浄し、プレートを裏返して排出します。
3.マイクロピペットを使用して、200 μLのブロッキングバッファー(PBS-T中の10%スキムミルク)をウェルに加えます。4°Cで一晩インキュベートします。
手記: プレートをパラフィンフィルムまたはシュリンクラップで包み、冷蔵庫での蒸発を防ぎます。
4.スパートボトルを使用して、ウェルを満たしてプレートウェルをPBS-Tで2回洗浄し、プレートを裏返して排出します。
5.マイクロピペットを使用して、100 μLの希釈一次抗体(マウス抗アルギン酸モノクローナル抗体)をウェルに加え、37°Cで1〜2時間インキュベートします。
手記: 一次抗体(マウス抗アルギン酸モノクローナル抗体)を、抗体希釈液(1x PBS中の1%スキムミルク)に0.5 μg/mL(1 mg/mLストックの1:2,000の希釈)の濃度で提供しました。
6.潮吹きボトルを使用して、ウェルを満たしてプレートウェルをPBS-Tで3回洗浄し、プレートを裏返して排水します。
7.マイクロピペットを使用して、100 μLの希釈二次抗体をウェルに加え、37°Cで1〜2時間インキュベートします。
手記: 使用した二次抗体は、抗体希釈液中で濃度0.25 μg/mL(0.5 mg/mLストックの1:2,000希釈)のピアスヤギ抗マウスポリ西洋わさびペルオキシダーゼ(HRP)抗体であった。
8.潮吹きボトルを使用して、ウェルを満たしてプレートウェルをPBS-Tで3回洗浄し、プレートを裏返して排水します。
9.マイクロピペットを使用して、100 μLのTMB(3,3',5,5'-テトラメチルベンジジン)-ELISA(酵素結合免疫吸着アッセイ)溶液(材料表)を加え、室温で暗所で30分間インキュベートします。
手記: 肯定的な反応の色は青の色合いになります。
10.マイクロピペットを使用して、100 μLの停止溶液(2 N硫酸)を加えます。
手記: 停止液を加えると、色が青から黄色に変わります。反応停止後、最大30分間は色が安定します。
11.プレートリーダーを使用して、450 nmでODを読み取ります。
12. 既知の濃度のD-マンヌロン酸(1,024 μg/mL、512 μg/mL、256 μg/mL、128 μg/mL、64 μg/mL、32 μg/mL、16 μg/mL、および8 μg/mL)の連続希釈液のOD450を測定して、標準曲線を作成します。2回繰り返します。これらの読み取り値から、線形方程式を抽出します。
手記: 標準曲線は一度だけ行う必要があります。そこから抽出された線形方程式は、後のテストに使用できます。
1.標準曲線を使用して各サンプル中のアルギン酸塩の濃度を計算し、線形方程式からのアルギン酸塩濃度をOD600 で割って、OD600あたりのアルギン酸塩の総量を求めます。