細菌の増殖と手法

出典:Cian、MB et al.、アシネトバクターバウマンニの技術的調整によるグラム陰性菌の細胞エンベロープの内膜画分と外膜画分の分離。J. Vis.

出典:Mercier、N.、et al.グラム陽性菌におけるRNAシーケンシングと結合したMS2アフィニティー精製J. Vis. Exp.

出典:Mercier, N., et al.、グラム陽性菌におけるRNAシーケンシングと組み合わせたMS2-Affinity Purification。J. Vis. 経験。...

出典: Feltwell, T., et.al.不連続密度勾配を用いたカプセル量による細菌の分離J. Vis.

出典: Gupta、S.、Marcela Rodriguez、G.鉄限定抗酸菌によって産生される細胞外小胞の単離と特性評価。 J. Vis. 経験。 (2019年)このビデオは、宿主環境を模倣した鉄制限条件下で培養された 結核菌 からの細胞外小胞(EV)の段階的な単離を示しています。EV...

出典: ワトソン、DC、 et.al。大腸菌と他の細菌からの細胞外小胞のスケーラブルな単離と精製 J. Vis. 経験。 (2021年)このビデオは、遺伝子組み換え細菌の外膜に由来する細胞外小胞(EV)の単離と濃縮を示しています。このプロセスには、細菌を培養して EV...

出典: ワトソン、DC 他。大腸菌と他の細菌からの細胞外小胞のスケーラブルな単離と精製 J. Vis. 経験。...

出典: Fattahi、N.、 et al. 細菌のスクリーニング,選択及び単離のための光分解性ヒドロゲル界面 J. Vis.

出典: Ghadigaonkar、D.およびRath、A.水系抗生物質耐性菌の単離と同定、およびそれらの抗生物質耐性遺伝子の分子特性評価。 J. Vis. 経験。...

出典: Kazi、MI、 他、 ハイスループットシーケンシングのためのグラム陰性菌におけるトランスポゾン挿入ライブラリの生成。 J.ビス。...

出典:Fernández-Coll、L.およびCashel、M.大腸菌(p)ppGppの複数のin vivo測定にマイクロタイターディッシュ放射性標識を使用し、それに続く薄層クロマトグラフィー。J. Vis. 経験。(2019年)このビデオでは、薄層クロマトグラフィー(TLC)を使用して、細菌のストレス応答ヌクレオチドppGppおよびpppGppのレベルとダイナミクスを測定するためのハイスループットプロトコルを紹介します。この方法は、さまざまなストレス条件下で細菌培養中の (p)ppGpp...

出典: Streather、BR、 et al。 大腸菌からの組換蛋白質充填小胞の最適化された生産と分析 J. Vis. 経験。...

出典: Shivaiah、K.、 et al。 植物葉組織とシアノバクテリアからのプラストグロブ脂滴の単離 J. Vis. 経験。...

出典: Armbruster、KM、Meredith、TC質量分析による構造決定のための細菌リポタンパク質の濃縮とN末端リポペプチドの調製。 J. Vis. 経験。...

出典: Leuthold、MM、 et al. X線結晶学のための大 腸菌 におけるヒトノロウイルス突出ドメインの産生 J. Vis. 経験。...

出典:Kuo、T.、et al.大腸菌で過剰発現したHelicobacter pylori好中球活性化蛋白質のバッチモードでのワンステップネガティブクロマトグラフィー精製J. Vis.

出典: Murata, T., et al. Streptococcus mutans. J. Vis. Exp. (2019)このビデオでは、...

出典: Venuprasad、K.、 et al。 気道炎症を研究するためのマウスモデルにおけるイン フルエンザ菌 の気管内投与。 J. Vis. 経験。 (2016年)このビデオは、下流分析のために、型付け不可能な インフルエンザ菌...

出典:Ginies、C.、et al. Bacillus cereusにおける脂肪酸の同定J. Vis.

出典: Shivaiah、K.、 et al。植物葉組織とシアノバクテリアからのプラストグロブ脂滴の単離 J. Vis. 経験。...

グラム陰性菌属および非エルシニア腸内細菌科の培養から始めます。滅菌針接種器を使用して、従来のセフスロジン-イルガサン-ノボビオシンまたはCIN寒天培地と改変CIN寒天培地の両方に培養物を点在させます。プレートをインキュベートして細菌の増殖を促進します。従来のCIN寒天培地と改変CIN寒天培地の両方が、マンニトールを発酵させて酸性副産物を生成するエル シニアおよび 非エルシニア腸 内細菌科 の成長をサポートします。酸の生成によりpHが低下し、色の変化が引き起こされ、特徴的な赤中心のコロニー形態が生じます。改変CIN寒天培地には、非エルシニア腸内細菌科によって発現される特定の酵素活性を検出する追加の基質が含まれています。これらの細菌は基質を代謝し、その結果、コロニーの形態を変化させる pH 変化や色素生成が起こります。対照的に、 エルシニア 種は特徴的な赤中心の外観を保持しています。その結果、改変されたCIN寒天培地は、異なる代謝活性に基づいて、 エルシニア 種と非エルシニア腸内細菌科...

細菌群集を含む湿地土壌由来の濃縮培養から始めます。この培養物は、第二鉄還元と結合したアンモニウム酸化であるFeammox活性を示し、この代謝プロセスが可能な細菌の濃縮を示しています。培地を使用して培養物を連続的に希釈します。希釈したサンプルを、第二鉄とアンモニウムを添加した試験寒天プレートにストリークします。第二鉄またはアンモニウムを欠いているコントロールプレート、またはアンモニウムの代わりに有機炭素を含む第二鉄を含むコントロールプレートを使用して、非Feammox経路による鉄の還元を除外します。窒素 -...

出典: Becker, B., 他リシン毒素A連鎖(RTA)輸送に必要な細胞成分を特定するための簡易蛍光基レポーターアッセイ。 J. Vis. Exp.

出典: Wunderlin, T., 他環境サンプルから内胞子を物理的に分離し、栄養細胞の標的溶解。 J. Vis. Exp.

出典: Gulla, S. ほか。 魚類病原性細菌 Yersinia ruckeri の多遺伝子座可変数タンデムリピート解析(多重PCRおよび毛細管電気泳動による解析)。 J. Vis. Exp. (2019年)。このプロトコルは、超純水に単離されたコロニーを懸浮させ、熱を加えて細胞を溶解することで Yersinia ruckeri...

出典: Gulla, S. ほか。 魚類病原性細菌 Yersinia ruckeri の多遺伝子座可変数タンデムリピート解析(多重PCRおよび毛細管電気泳動による解析)。 J. Vis. Exp. (2019年)。このプロトコルは、超純水に単離されたコロニーを懸浮させ、熱を加えて細胞を溶解することで Yersinia ruckeri...

出典: Stones, DH, et al.細菌と宿主の相互作用を特徴付けるためのバイオミメティック材料。J. Vis.

出典: Jung, A. L. et al., Legionella pneumophila 外膜小胞: マクロファージにおける炎症誘発性の分離と分析。J. Vis.

出典: Jagau、H. 他。定流における初代ヒト内皮細胞の肺炎球菌感染 J. Vis. 経験。(2019年)このビデオは、一定の培地流条件下で、内皮細胞上のフォン・ヴィレブランド因子(VWF)ストリングへの肺炎球菌の付着をリアルタイムで視覚化する方法を示しています。VWF...

出典: Morrill、SR、 et al。 嫌気性増殖細菌によるマウス膣コロニー形成のモデル J. Vis. 経験。...

出典:Li、J.他。Clostridioides difficileのゼブラフィッシュ幼虫感染モデルの開発J. Vis. 経験。(2020年)このビデオは、麻酔をかけたゼブラフィッシュ幼虫の腸管腔への蛍光標識クロス トリジオイデス・ディフィシル...

出典: Cruz-Adalia、A.、 et al. T細胞は樹状細胞からのトランス感染により細菌を捕捉する J. Vis.

出典:Balczon、R.、et al。緑膿菌による肺内皮細胞感染後の細胞傷害性アミロイドの検出法J. Vis. Exp. (2018年)このビデオは、...

出典: Lee、H. ら、 感染中に細菌から送達されるエフェクターを視覚化するための緑色蛍光タンパク質システムの分割。 J. Vis. 経験。...

出典: Islam、A.、 et al.、 新生児大 腸菌 菌血症分離株の腸経サイトーシスの評価。 J. Vis. 経験。 (2023年)このビデオでは、トランスウェルインサート、電気抵抗測定、および細菌定量化を使用して、腸上皮単層にわたる新生児大 腸菌...

出典: アンダーソン、Q.L.、 他。ハイスループット,高含有量,液体ベースの C.エレガンス 病態系 J. Vis. 経験。 (2018年)このビデオは、遺伝子組み換えされた C.エレガンスの...

出典: Yarringto、K.D.、 et al. 単一細胞種間細菌相互作用の速度論的可視化 J. Vis. 経験。...

出典: Sorokulova、I.、 et al。 Bacillus subtilis 株によるラットにおける熱ストレス悪影響の予防 J. Vis. 経験。...

出典: Yi、Y.、 et al.植物と微生物の相互作用 ジャガイモの根の滲出液に対するBacillus mycoidesの転写応答 J. Vis. 経験。 (2018年)このビデオでは、植物と微生物の相互作用を研究するためのBacillus...

出典: Venuprasad、K.、 et al。気道炎症を研究するためのマウスモデルにおけるイン フルエンザ菌 の気管内投与。 J. Vis. 経験。...

出典:テイラー、MN、et.al。Caenorhabditis elegansと細菌の相互作用における不均一性を定量化するための単一ワームデータを用いたJ. Vis. 経験。(2022年)このビデオは、無菌で年齢が一致した Caenorhabditis elegans...

出典:テイラー、MN他。Caenorhabditis elegansと細菌の相互作用における不均一性を定量化するための単一ワームデータを用いたJ. Vis. 経験。(2022年)このビデオは、機械的破壊による個々の Caenorhabditis elegans...

内生菌は植物組織にコロニーを形成し、植物の成長を促進します。塩分ストレス下でのトマト植物の成長への影響を研究するには、葉と根が発達している無菌苗木から始めます。実験苗の根を内生細菌の懸濁液に浸します。コントロールは接種しないままにしておきます。両方のグループを滅菌土壌に移して外部の微生物の干渉を防ぎ、成長チャンバーでインキュベートします。土壌から、細菌は一時的な根の開口部から侵入し、内部組織に定着し、他の植物の部分に広がります。細菌懸濁液を再塗布してコロニー形成を強化します。塩化ナトリウム溶液を隔日で適用して、両方のグループで進行性の塩ストレスを誘発します。塩ストレスは活性酸素種(ROS)の生成を引き起こし、植物細胞に損傷を与えます。内生菌は、ROS除去酵素を生成し、植物の成長に植物ホルモンと微量栄養素を供給することにより、ストレスを軽減します。インキュベーション後、実験苗は成長を維持しますが、対照は発育の停止を示します。...

リン酸可溶性細菌(PSB)と紫色の非硫黄細菌(PNSB)の接種混合物を取ります。肥料と牛糞を混ぜた土壌に混合物をスプレーします。種を蒔き、土で覆います。植物を成長させます。細菌は根圏と呼ばれるゾーンの根の近くに局在します。PSBは、不溶性土壌リン酸塩を可溶性の形に変換します。一方、PNSBは大気中の窒素ガスをアンモニアに変換することで窒素を固定します。植物は可溶性リン酸塩とアンモニアを吸収し、その成長を促進します。さらに、PNSB...

均一な発芽を確保するために、暗い無菌条件下で事前に発芽した稲の苗木から始めます。これらの苗木を、試験細菌を事前に接種した栄養豊富な半固体培地を含むフラスコに移します。植物が成長するにつれて、根は走化性化合物を周囲の培地に放出します。これらの化合物は細菌の増殖を刺激し、根の表面に接着、増殖、コロニー形成を引き起こします。根が発達すると、細菌は自然な開口部や細胞間空間を通って植物に侵入します。細菌は中に入ると、植物の根と新芽内に内生コロニーを形成します。時間が経つにつれて、これらのコロニーは植物組織と安定した関係を形成し、抗菌化合物の生成を開始します。次に、苗木を自然環境条件を模倣した温室に移します。植物が成長するにつれて、内生菌によって生成される抗菌化合物が生物防除剤として作用し、環境中の有害な微生物から苗木を保護します。...

源：オーシャン・E・クラーク1、ロミー・A・ドップ1、トム・ハッセル1、ジョアン・L・フォザーギル1、ダニエル・R・ニール21リバプール大学、 2 ダンディー大学このビデオでは、尿道カテーテルの内面を模倣して、カテーテル関連尿路感染症をシミュレートする 3D...

出典: アロヨ、M. C.、 他 In vitro 腸内宿主-微生物界面における合成細菌コンソーシアムの存続可能性の評価。 J. Vis. Exp.

出典:岡本A.他 現地で陽極呼吸細菌を濃縮するための自立電気化学装置。J. Vis.

出典: アフマディ、S. ら。介入療法がヒト糞便マイクロバイオータに与える影響を推定するためのin vitroバッチ培養モデル。 J. Vis. Exp.

出典: Biller, SJ, et al.シアノバクテリア細胞外小胞の単離と特性化J. Vis.

出典: Zhang, Y., et al.細胞内細菌によるエンドリソソーム系のリモデリング研究への蛍光ナノ粒子の応用J. Vis.

出典:バレンタイン、ME、他。Pseudomonas aeruginosaにおけるインフレーム遺伝子欠失変異株の作製と感染の単純なマウスモデルにおける病原性減衰の試験J. Vis. 経験。(2020年)このビデオでは、生物発光を使用して、マウスにおける毒性細菌株と弱毒菌株のin...

出典: Guo、S.、 et al。誘導勾配板上の細菌表面群がる運動性の定量化 J. Vis.

出典: Zhang、X.、 et al.生体材料関連 黄色ブドウ球菌 感染のin vivo可視化と生体内分析のためのゼブラフィッシュはいモデル J. Vis. 経験。 (2019年)このビデオでは、 黄色ブドウ球菌を注射したゼブラフィッシュ胚の蛍光イメージングを示しており、感染の進行と細菌の分布を定量化して、生体材料の微小球が in vivo...

出典: Schlimpert, S. et al. マイクロ流体デバイスを使用した完全な S. venezuelae ライフサイクルの蛍光タイムラプス イメージング。J. Vis. Exp. (2016)このビデオでは、細菌の完全なライフサイクルの蛍光タイムラプスイメージングをデモンストレーションします Streptomyces venezuelae...

出典: Bru、J.、 et.al。細菌群のタイムラプスイメージングと集団的ストレス応答 J. Vis. 経験。 (2020年)このビデオでは、群がる寒天プレートアッセイを使用して、 緑膿菌...

源： ヒーリング、J.、 他。、細胞分化の誘導とビ ブリオパラ溶血性 スイマー細胞およびスウォーマー細胞の単一細胞イメージング。 J. Vis. 経験。 (2017).このビデオは、蛍光イメージング用のビ ブリオパラ溶血性菌...

出典:Bennett、JA他。Streptomyces発生変異株の視覚的および顕微鏡的評価J. Vis. 経験。(2018年)このビデオでは、位相差顕微鏡を使用して、野生型と変異型の Streptomyces coelicolor...

出典: Chu、W.、およびZhuang、X.色反応に基づく細菌の運動性の視覚化。 J. Vis. 経験。...

出典: Pioli、R.、 et al.、 シーケンシャルキャピラリティアシストアセンブリによる微生物と微粒子のパターニング。 J. Vis. 経験。 (2021年)このビデオでは、カーボンフリー懸濁液と制御されたフローを使用して、マイクロ流体トラップで単一の蛍光タグ付き 大腸菌(大腸菌)...

出典: Wen、J.、Pasman、 他、 枯 草菌 胞子におけるゲルミノソームと内膜の視覚化。 J.Vis.エクスプション。...

出典: Oms、T.、 et al。大 腸菌における抗生物質持続性の集団および単一細胞解析 J. Vis.

出典: Murata, K. et al., Visualization of DNA Compaction in Cyanobacteria by High-voltage Cryo-electron Tomography. J. Vis. 経験。...

出典: Chetrit、D.、 et al。 Legionella pneumophila ドット/ICM分泌系の時空間的特徴を解消するための生細胞イメージングとクライオ電子断層撮影法の適用 J. Vis. 経験。 (2020年)このビデオでは、生細胞蛍光イメージングを使用して、...

出典: Chetrit、D.、 et al。 Legionella pneumophila ドット/ICM分泌系の時空間的特徴を解消するための生細胞イメージングとクライオ電子断層撮影法の適用 J. Vis. 経験。(2020年)このビデオでは、細菌培養、金ナノ粒子マーキング、およびガラス化技術を組み合わせて、クライオ電子断層撮影用の レジオネラ・ニューモフィラ...

出典: Weber、N.、 et al.、 糸状シアノバクテリウム Phormidium lacunaの自然な形質転換、タンパク質発現、および凍結保存。 J. Vis. 経験。 (2022年)このビデオでは、フィラメント培養物を均質化して均一な懸濁液を作成し、顕微鏡スライド上でペトリプレートアッセイセットアップを準備し、フィラメントの動きを視覚化することにより、 Phormidium lacuna...

出典:ソロクロワ、I.ら。Bacillus subtilis Strainによるラットにおける熱ストレスの有害影響予防。J. Vis. Exp. (2016)このビデオでは、熱ストレスにさらされたラットにおける バチルス・サブティリス...

出典: Chaimovitz, E. A., 他 タイムラプス顕微鏡を用いた大 腸菌 の生物学的ノイズの連続測定。 J. Vis. Exp.(2021年)このビデオは、タイムラプス顕微鏡を用いて細菌の成長と分裂中のGFP蛍光の変動を追跡することで、 大腸菌...

出典: Fattahi, N., et al.細菌のスクリーニング,選択及び単離のための光分解性ヒドロゲル界面J. Vis.

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出典: Le Nagard, L., et al.マグネトスピリルム属の増殖する走磁性細菌 MSR‐1,AMB‐1,MS‐1株J. Vis.

出典:バレンタイン、ME、他。Pseudomonas aeruginosaにおけるインフレーム遺伝子欠失変異株の作製と感染の単純なマウスモデルにおける病原性減衰の試験J. Vis. 経験。 (2020)。このビデオでは、プラスミドベースの遺伝子欠失戦略を使用した緑 膿...

出典: Schlimpert、S.、 et al。 マイクロ流体装置を用いたS .ベネズエラ の全ライフサイクルの蛍光タイムラプスイメージング J. Vis. 経験。 (2016年)このビデオは、 Streptomyces...

出典: Heering、J.、 et al. Vibrio parahaemolyticus スイマー細胞とスウォーマー細胞の細胞分化と単一細胞イメージングの誘導 J. Vis. 経験。 (2017年)このビデオは、特別に調製された寒天培地を使用して、ビ ブリオパラ溶血性ビブリオ...

出典: Li、J.、 他、 クロストリディオイデスディフィシルの幼虫ゼブラフィッシュ感染モデルの開発。 J. Vis. 経験。 (2020年)このビデオは、ゼブラフィッシュの幼虫の腸からの クロストリディオイデス・ディフィシル...

出典: Ayivi, R. et al., The Cultivation, Growth, and Viability of Lactic Acid Bacteria: A Quality Management Perspective. J. Vis. 経験。...

出典:Kuo、C.、et al。非侵襲的in vivo生物ルミネセンスシステムによるマウス宿主における腸出血性大腸菌コロニー形成の検出J. Vis. 経験。(2018年)このビデオは、動物モデルの経口接種物として使用するために、冷凍ストックからルシフェラーゼを発現する腸出血性 大腸菌 懸濁液を調製する方法を示しています。これにより、in...

出典: Nathoo、N.、 et al.植物/微生物の分子相互作用とシグナル伝達の同時かつ体系的な解析のための水耕共栽培システム J. Vis. 経験。 (2017)。このビデオは、無菌条件下での植物と細菌の相互作用を研究するための水耕栽培共栽培システムを示しています。植物の苗木は、...

出典: Figueroa、DM、 et al. 抗菌ペプチド局在を特徴付けるための細菌スフェロプラストとプロトプラストの生産と可視化 J. Vis. 経験。 (2018年)このビデオでは、グラム陽性菌Bacillus...

出典: Eggers、CHライム病スピロヘータボ レリアブルグドルフェリのファージ媒介遺伝子操作。 J. Vis. 経験。 (2022年)このビデオでは、抗生物質耐性遺伝子を保有する休眠バクテリオファージDNAで操作された遺伝子組み換えボ レリア・ブルグドルフェリ...

出典: Morales-Soto、N. et al.、 細菌表面運動性アッセイの調製、イメージング、および定量化。 J. Vis. 経験。...

出典: Anwar、Z.、 et al.小売食品試料中の Clostridium perfringens 毒素型の濃縮と検出 J. Vis.

出典: 森田正氏 他巨大小胞内の単細胞レベルでの細菌細胞培養 J. Vis. 経験。...

出典:Tomás、 JM、 et al。細菌の運動性における細菌グリコシルトランスフェラーゼの役割を解明するためのヌル変異体の生成 J. Vis. 経験。(2022)。このビデオは、 大腸菌...

出典: Cafini、F.、 et.al。 黄色ブドウ球菌における水平遺伝子導入の研究のための方法論 J. Vis. 経験。 (2017年)このビデオは、自然な形質転換による黄色 ブドウ球菌...

出典: Anderson、Q.L.、 et al.、 ハイスループット、ハイコンテント、液体ベースの C.エレガンス 病原システム。 J. Vis. 経験。...

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出典: Gilmore、SF、 et al。ワクチン開発のための Chlamydia muridarum 由来の組換え主要外膜蛋白質への無細胞スケール生産とアジュバント添加 J. Vis.

出典: Bru、J.、 et al.、 細菌群のタイムラプスイメージングと集団ストレス反応。 J. Vis. 経験。 (2020年)このビデオは、寒天プレートのセットアップとタイムラプスイメージングを使用して、抗生物質を混合した同じ培養物を含む中央培養物からサテライトスポットへの細菌の増殖を観察することにより、 緑膿...

出典: Liu、PC 他。 抗生物質薬剤選択下における細菌の適応進化のための低コスト自動モルビドスタットの設計と利用 J. Vis. 経験。 (2016年)このビデオでは、マイクロ流体チップを使用して、トリメトプリム抗生物質ストレス下での野生型およびトリメトプリム耐性 大腸菌...

出典:Bhaduri、S.、et al.、Sporosarcina pasteuriiによって媒介される微生物学的に誘発された方解石沈殿。J. Vis。 (2016年)このビデオでは、 スポロサルシナ・パスツリを...

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出典: Niu、L.、 et al.、 生体内顕微鏡によるゼブラフィッシュ胚におけるマイコバクテリア感染中のマクロファージ溶解細胞死の視覚化。 J. Vis. 経験。 (2019年)このビデオでは、感染アッセイや下流アプリケーションで一貫して使用するために、後期対数期培養物から Mycobacterium marinum...

出典:Paschke、P.、 et al. 細菌の選択と増殖に基づく Dictyostelium discoideum 細胞の遺伝子工学。J. Vis. Exp.

出典: Gutiérrez, S., et al., Isolation of Salmonella typhimurium-containing Phagosomes from Macrophages.J . Vis. Exp. (2017)このビデオでは、実験用途に適したクリーンで代謝活性な細菌懸濁液を得るためのネ ズミチフス...

出典: Lin、P.、 et al. 細菌の鉱物排泄によるタングステン酸ナトリウムとモリブデン酸ナトリウムのマイクロカプセルの合成 J. Vis. 経験。...

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出典: Fuchs、FM、 et al.生細胞顕微鏡を用いた枯 草菌 胞子の生存に対する低圧プラズマ滅菌の有害な影響の調査 J. Vis. 経験。 (2017年)このビデオでは、 枯草菌...

出典: Vieira、J.、 et al。 嚢胞性線維症気道マイクロバイオームに対する酸素補給の影響を研究するためのモデルの設計と開発 J. Vis. 経験。 (2021)。このビデオは、嚢胞性線維症肺の粘度、栄養組成、およびpHを模倣した人工喀留培地の調製を示しています。得られた培地は、ex...

出典: Maurakis、S.、およびCornelissen、CN金属応答性遺伝子の特性評価および宿主リガンドからの金属獲得のための淋 菌 の金属制限成長。 J. Vis. 経験。 (2020年)このビデオは、定義された金属空乏培地を使用して、金属制限条件下で 淋...

出典: Naji、A.、 et al。 Caenorhabditis elegansにおけるMitis群Streptococciによる酸化ストレスの研究 J. Vis. 経験。(2019)。このビデオでは、トッド・ヒューイット酵母エキスまたはTHY寒天培地を使用して、微好気性条件下でスト レプトコッカス...

出典: Venuprasad, K. et al., 気道炎症を研究するためのマウスモデルにおける インフルエンザ菌 の気管内投与。 J. Vis. 経験。 (2016年)このビデオでは、型付け不可能な インフルエンザ菌...

出典: Stefan、A.、 et al.、 大腸菌におけるタンパク質共発現の多面的な利点。 J. Vis. 経験。 (2015年)このビデオでは、抗生物質耐性遺伝子を保有するプラスミドで 大腸...

出典: Jiang, H., Ho, M. シアノバクテリアにおける無傷のフィコビリソームの単離と特性評価。J. Vis.

出典:Wiegand, D. J., Lee, et al., Cell-free Protein Expression Using the Rapidly Growing Bacterium Vibrio natriegens.J. Vis. Exp. (2019)このビデオでは、増殖の早い細菌である...

出典: Wiegand、DJ、 et al。急増細菌 Vibrio natriegensを用いた無細胞タンパク質の発現 J . Vis. Exp.(2019)。このビデオでは、タンパク質合成速度が高いことで知られる急速に増殖する細菌であるビ...

出典: Wiegand、DJ、 et al。 急速に増殖する細菌ビ ブリオナトリゲンを用いた無細胞タンパク質の発現。 J. Vis. Exp. (2019)。このビデオでは、 Vibrio natriegens 粗ライセートに基づく細菌の無細胞タンパク質発現システムを使用して、in...

出典: Jian、X.、 et al.、微生物微小液滴培養システム(MMC)を使用した自動微生物培養と適応進化。 J. Vis. 経験。...

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嫌気性消化槽、廃水から沈殿した固形物を模倣した合成汚泥を播種した密閉された無酸素反応器から始めます。汚泥には、混合微生物群集である中温性嫌気性微生物が含まれています。これらの微生物は適度な温度で繁殖し、汚泥の有機物の消化を促進します。汚泥を連続的に混合して細菌の活動を維持し、消化を促進します。その後、生分解性ポリマーであるバイオプラスチックを汚泥に加えます。インキュベーション中、加水分解細菌がバイオプラスチックに付着し、可溶性化合物に変換します。次に、発酵細菌はこれらの化合物を短鎖有機酸である揮発性脂肪酸に変換します。メタン生成微生物であるメタン生成物質は、これらの酸を利用してメタンガスと二酸化炭素を生成し、バイオガスを形成します。バイオガスは出口から反応器を出て、ガスサンプリングバッグに集められます。この共消化法により、バイオプラスチックと汚泥を再生可能なバイオガスに効率的に消化することができます。...

培養中の細胞密度を一定に維持する装置であるタービドスタットから始めます。この装置には細菌培養物が入った容器が含まれており、撹拌によって連続的に曝気され、一定の温度に維持されます。レーザーダイオードは、2 つの経路に分割された光線を放射します。一方の経路はレーザー強度の変動を監視するために基準センサーに向けられ、もう一方の経路は培養物を通過します。細菌細胞は光を散乱して吸収し、2番目のセンサーによって検出される透過強度を低下させます。この強度の低下は細菌濃度を反映し、光学密度 (OD)...

油で汚染された土壌から分離された 緑膿菌 の菌株を、窒素源と炭素源として過剰な食用油を含む培地で開始します。この菌株は、バイオプラスチックの製造に役立つ長鎖ポリマーであるポリヒドロキシアルカノエート (PHA) を合成します。曝気を促進し、細菌の増殖を促進するために攪拌下でインキュベートします。当初、培地は炭素源と窒素源の両方を供給して、細菌の増殖をサポートし、高いバイオマスを生成します。大幅な増殖後、培地中の窒素が枯渇すると、さらなる細胞分裂が停止し、過剰な炭素源がPHA生合成に向け直されます。細菌は油を脂肪酸に分解するリパーゼを分泌し、脂肪酸は細胞内酵素によって PHA 前駆体に代謝されます。PHAシンターゼ酵素は、これらの前駆体をPHAに重合させます。PHA...

グラム陰性菌、耐塩性細菌である...

出典:アリアス、S. L.、他酸化鉄ナノ粒子を用いた機能化磁性細菌ナノセルロースの製造。 J. Vis.

出典: Brumfield, K. D. ら、 ビ ブリオ・コレラ 菌のバイオタイプの維持および区別に用いられる臨床および環境分離株の実験技術。 J. Vis. Exp.

出典: Schumacher, D. ほか。成長遅い社会細菌 ミクソコッカス・ザンサスの 完全な栄養細胞サイクルの蛍光生細胞イメージング。ジャーナル・ヴィジョンズ報告(2018年)このビデオでは、成長の遅い土壌細菌である ミクソコッカス・ザンサスの...

出典:Yang, Z., 他サルモネラ属/シゲラ属のスクリーニングのための高スループットプラットフォーム。J. Vis. Exp.(2018年)この動画では、キシロースリシンデオキシコール酸(XLD)と染色性寒天を用いた サルモネラ の選択的濃縮と同定を示しています。セレナイトブロスは サルモネラ...

出典: Jeong, H. ほかケモスタットを用いた微生物の適応的実験室進化の手順。 J. Vis.

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出典: Al Ahmar、R.、 et al。 Pseudomonas aeruginosa の小コロニー変異体の培養とそのアルギン酸の定量 J. Vis. 経験。 (2020年)このビデオでは、カルバゾールを使用して酸加水分解後のウロン酸を検出 し、緑膿...

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出典: Sarathy、JP 他。 結核病変における薬物浸透を予測する in vitro カゼウム結合試験 J. Vis. 経験。 (2017年)このビデオは、急速平衡透析を使用して結核病変からのカゼウムへの薬物結合を測定するための in vitro...

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出典:Dodge、R.、et al.ショウジョウバエマイクロバイオームに適用した96ウェルプレートフォーマットでの高速コロニー形成ユニット計数J. Vis. 経験。(2023年)このビデオは、ショ ウジョウバエ...

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出典: Chen、Y.、 et al.、機能獲得レポーターシステムによる特定のマイコバクテリア誤翻訳率の測定。 J. Vis. 経験。 (2019年)このビデオでは、誘導性GFPと分泌変異ルシフェラーゼレポーターシステムを使用して、 Mycobacterium smegmatis...

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リボ核酸抗ターミネーターまたはRAT配列の下流に蛍光レポーター遺伝子を運ぶプラスミドで形質転換した コリネバクテリウムグルタミカム...

エキソ多糖マトリックスに懸濁された銀ナノ粒子で処理された細菌細胞を含むスラリーから始めます。安定したpHを維持するために、スラリーにリン酸緩衝液を追加します。次に、グルコースと可溶性酸化還元指示薬を含む溶液を導入し、混合物をインキュベートします。酸化還元インジケーターは電子受容体として機能します。インキュベーション中、グルコースと酸化還元指示薬は代謝活性な細菌細胞に入ります。細胞は呼吸中にブドウ糖を利用し、電子を生成します。これらの電子は酸化還元指示薬を不溶性の赤色沈殿物に還元し、細菌に蓄積します。混合物を遠心分離して細菌細胞を分離し、上清を廃棄します。メタノールを加え、軽く振って膜に蓄積した沈殿物を溶解し、着色溶液を形成します。溶液の色の濃さを測定します。測定された強度を標準曲線と比較して、細胞呼吸のレベルと相関する可溶化沈殿物の濃度を決定します。...

細菌培養物を連続希釈し、増殖培地を含む熱量測定バイアルにアリコートを加えます。密閉されたバイアルを等温マイクロカロリメーターのマルチウェルプレートにロードして、代謝熱の生成を測定します。この装置は一定の温度に保たれ、検出された熱が細菌の代謝のみに由来することを保証します。細菌が栄養素を代謝して増殖すると、センサーがリアルタイムで検出する熱を放出します。並行して、同一のバイアルをインキュベーターでインキュベートします。分光光度計を使用して、光学密度 (OD)...

出典: アリ、I.、 他 カ エノラブディティス・エレガン スの健康に影響を与える微生物分離株のハイスループットスクリーニング。 J. Vis. Exp. (2022年)このビデオでは、 Caenorhabditis elegans...

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出典: Brumfield, K. D. ほか。ビ ブリオ・コレラ 菌のバイオタイプを維持・区別するための実験技術、臨床的および環境的分離株。 J. Vis. Exp. (2017年)このビデオでは、トリフェニルテトラゾリウム塩化物を用いた軟性寒天アッセイを実演し、活発に移動する細胞周囲の赤ゾーン形成を通じて代謝活動を可視化することで、 ビブリオ・コレラ...

出典: Brumfield, K. D. ら、臨床および環境分離株のビ ブリオ・コレラ 菌バイオタイプの維持および鑑別に用いられる実験技術。 J. Vis. Exp. (2017年)。このビデオでは、 Vibrio cholerae の3つの生物型、古典型、野生型El Tor、El...

出典: Mettrick, K. A., Lawrence ら、 蛍光抑制子オペレーターシステムを用いて 大腸菌 における部位特異的複製遮断の誘導。 J. Vis. Exp. (2016年)この動画では、アラビノース誘導による黄色蛍光色標識タンパク質TetRの発現を用いて、大 腸...

出典: Domesle, K. J. ほか。ループ媒介の等温増幅による動物性食品中の サルモネラ のスクリーニングおよび培養分離による サルモネラ の確認。 J. Vis.

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出典:Dahl, J.ら。大腸菌シャペロンHdeBのpH依存活性の検出 in vitroおよびin vivo。J. Vis. Exp.(2016年)このビデオは、組換え大 腸菌...

出典: Stenum, T. S. ら。 大 腸菌におけるトランスファーRNAの存在比および荷射レベルの定量化。 J. Vis. Exp. (2017年)このビデオでは、ゲル電気泳動とノーザンブロッティングを用いて、アミノアシル化型と脱アシル化型を分離することで大 腸菌...

出典: Gulla, S. ほか。魚類病原性細菌 Yersinia ruckeri の多遺伝子座可変数タンデムリピート解析(多重PCRおよび毛細管電気泳動による解析)。 J. Vis.

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