サンプル採取を含むすべての手順は、研究所のIRBガイドラインに従って実行されています。
滅菌プラスチック容器に90mlの10x PBSを264mlの超純脱イオン水(3.93x)に入れて、密度遠心分離培地混合溶液を調製します。HClでpH 7.0-7.2に滴定し、0.22μmのフィルターでフィルター滅菌します。4°Cで保存してください。
18 mLの密度遠心分離培地混合溶液と30 mlの密度遠心分離培地(詳細については材料リストを参照)を50 mLのポリプロピレン遠心チューブに組み合わせて、70%密度の遠心分離培地を準備します。4°Cで保存しますが、使用前にRTに持参してください。
50 mLの遠心チューブに9.6 mlのDPBSと10.4 mLの70%密度遠心培地を組み合わせて、37%密度の遠心分離培地を準備します。4°Cで保存しますが、使用前にRTに持参してください。
1. 神経膠腫浸潤PBMCの分離
- 清潔な片刃のカミソリの刃を使用して、脳の中心を矢状に切り込み、2つの半球を二等分することにより、腫瘍を含む脳の領域を分離します。同側半球の内側を下にして、小脳と嗅球のレベルで2つの冠状切開を行い、腫瘍インプラントを含む標的組織を分離します(図1A)。対側半球の同等の部分も分離され、ネガティブコントロールとして使用できます。
- ターゲット組織を、1 mlのDPBSを含むそれぞれラベル付けされたガラス製Dounceティッシュグラインダーに入れ、プランジャーを完全に押し下げ、7回ひねって最初に組織を破壊します。プランジャーを持ち上げて、液体がティッシュグラインダーの底に戻るようにします。この手順を 3 回繰り返します。ただし、プランジャーをひねるのは、次の2回の繰り返しで4回、最後の繰り返しで3回だけひねって、組織の過度の粉砕を避けてください。
- P-1000マイクロピペットを使用して、プランジャーの側面に沿って氷冷したDPBSを1mlの量3つを順次塗布し、ティッシュグラインダーですすぎます。
- 粉砕された脳内物質をピペッティングで上下させ、氷上の標識された15 mL遠心チューブに入れて再懸濁します。Dounceティッシュグラインダーの側面を氷冷DPBS1 mlで洗い流し、同じ15 ml遠心分離チューブに追加します。すべてのサンプルが処理されるまで、粉砕された脳内物質を含むすべてのチューブを氷上に置いておきます。
- すべてのサンプルを処理したら、15 mLの遠心分離チューブ内で粉砕された脳内物質を740 x g(最大RCF)で4°Cで20分間スピンダウンします。
- 10 mLの血清ピペットとピペットガンで上清を取り除き、P-1000を使用して、以前に調製したコラゲナーゼ/ DNase-I消化酵素1 mLにペレット化された脳物質を再懸濁します。.15 mLの遠心分離チューブを試験管ラックに入れ、37°Cのウォーターバスに15分間入れます。
- インキュベーション期間中、チューブをフリックしてサンプルを2回穏やかに攪拌し、組織の解凝集を促進します。
- 10 mLの血清学的ピペットを使用して6 mlの氷冷DPBSを各チューブに加え、消化酵素を希釈します。.ピペットで上下させて再懸濁し、滅菌済みの70μmナイロンメッシュフィルターで総容量をろ過し、氷上の新しいラベル付き15ml遠心分離チューブに入れます。
- 脳細胞懸濁液を740 x g(最大RCF)で4°Cで20分間回転させ、シングルセルペレットを作製します(図1B)。遠心分離機から15 mLチューブを取り出した後、氷の上に置き、遠心分離機の温度設定を約21°Cに上げて、次のステップに備えます。
- 脳細胞を含む各チューブから上清を完全に除去し、最初にP-1000マイクロピペットを使用してペレットを70%密度遠心培地1 mLに再懸濁します。次に、10 mLの血清ピペットを使用して、各チューブに70%密度の遠心分離培地を4ミリリットル追加します。キャップをしっかりとねじ込み、チューブに数回静かに反転させて細胞懸濁液を均質化します。
- 70%密度の遠心分離培地に再懸濁した脳細胞が入った15 mLの遠心分離チューブを氷から取り出し、RTの試験管ラックに入れます。一度に1つずつ、2 mLの37%密度遠心分離培地溶液を5 mLの70%遠心分離培地にP-1000マイクロピペットで慎重に重ねて、2つの密度遠心分離培地層間にクリーンな界面を形成します(図1C)。
- 先端の細いマーカーを使用して界面の位置を示すと、遠心分離後に区別がわからなくなったときに簡単に識別できます。
- 15 mLの遠心分離チューブを740 x g(最大RCF)でRTで20分間スピンダウンし、界面の破壊を避けるために休憩なしで回転させます。
- 遠心分離後、2つの密度遠心分離培地層(図1D)間の界面に蓄積したPBMCを、P-200マイクロピペットをその側面に沿ってチューブに導入し、脂質層を慎重にバイパスして収集します。
- PBMCバンドのレベルに達したら、密度70%の遠心分離培地層の表面から200 μlをゆっくりと抽出し、氷上のそれぞれにラベル付けされたポリプロピレンFACSチューブに入れます。サンプルあたり合計容量400μlに対して1回繰り返します。
- 400 μlのPBMCを含む各FACSチューブに3 mLのフローバッファーを加えて、密度遠心分離培地を十分に希釈し、細胞を660 x g(最大RCF)で4°Cで20分間スピンダウンします。