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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
出典:Grimm, C., et al.チャネルロドプシンのイオン選択性の電気生理学的測定のための全細胞パッチクランプ記録。J. Vis. Exp.(2017年)
この動画では、光依存性のイオンチャネルタンパク質を発現した胚性腎臓細胞培養物を蛍光レポーターと融合させ、イオンの動きに対する光の影響を実演しています。全細胞パッチクランプは、イオンの動きを監視するために使用されます。
1. 録音前の設定
2. 選択性測定
>表1:緩衝液のイオン組成。HEK細胞における塩化物選択性実験のための細胞内(intra.)および細胞外(extra.)緩衝液の組成。使用される略語:エチレングリコール四酢酸(EGTA)、4-(2-ヒドロキシエチル)-1-ピペラジンエタンスルホン酸(HEPES)、アスパラギン酸(ASP)。すべての濃度はmM単位です。
| 内。 | 番外編1 | 番外編2 | |
| 高塩化物 | 低塩化物 | 低塩化物 | |
| c [mM] | c [mM] | c [mM] | |
| NA-ASPの | 0 | 0 | 140 | 名
| NaCl | の110 | 名140 | 名0 |
| KClの | 1 | 1 | 1 |
| セシCl | 1 | 1 | 1 |
| CaCl2 | 2 | 2 | 2 |
| MgCl2 | 2 | 2 | 2 |
| ヘープス | 10 | 名10 | 名10 | 名
| エグタ | 10 | 名0 | 0 |
| pH | の7.2 | 7.2 | 7.2 |
| 浸透圧 | 290 mオスメートル | 320 mオスメートル | 320 mオスメートル |
| HEK293細胞 | シグマ・アルドリッチ | 85120602 | ヒト胚性腎臓細胞 |
| 網膜 | シグマ・アルドリッチ | R2500 | オールトランスレチナール |
| フージーンHD | プロメガ | E2312 | トランスフェクション試薬 |
| DMEM | のバイオクローム | FG 0445 | ダルベッコのモディファイドイーグルミディアム |
| アガロース | ロス | 3810 | 名寒天橋 |
| CaCl2 | ロス | 5239 | 名CaCl2 2H2O |
| セシCl | バイオモール | 2452 | 名|
| エグタ | ロス | 3054 | 名|
| FBSの | バイオクローム | S0615 | シリーズ細胞培養 |
| グルコース | ロス | HN06 | D(+)-グルコース |
| KClの | ロス | 6781 | 名|
| MgCl2 | ロス | 2189 | 名MgCl2 6H2O |
| NaCl | のロス | 3957 | 年|
| NMGの | シグマ・アルドリッチ | M2004 | のN-メチル-D-グルカミン |
| Na-アスパラギン酸 | シグマ・アルドリッチ | A6683の | L-アスパラギン酸ナトリウム塩一水和物 |
| クエン酸 | ロス | 6490 | 名|
| エイジI | サーモフィッシャーサイエンティフィック | ER1462 | 制限酵素 |
| ショイ | サーモフィッシャーサイエンティフィック | ER0695 | 制限酵素 |
| ンヘイ | サーモフィッシャーサイエンティフィック | ER0975 | 制限酵素 |
| XL1Blue 大腸菌/ | アジレント・テクノロジーズ | 200249 | ケモコンピテント大腸菌 |
| カナマイシン | ロス | T832 | |
| リソジェニーブロスミディアム | ロス | X964 | の|
| 寒天 | ロス | 6494 | 名寒天プレート |
| プラスミド精製キット | マルケリー・ナーゲル | 740727年25月 | |
| ペニシリン/ストレプトマイシン | バイオクローム | Aの2213 | 細胞培養 |
| ポリ-D-リジン臭化水素酸塩 | シグマ・アルドリッチ | P6407-5MG | シリーズカバースリップコーティング |
| マイクロフォージ | カスタムメイド | 火磨き | |
| 血清ピペット | TPPとは | さまざまなサイズ | |
| クリーンベンチ | コジャイール | バイオウィザードSL130 | |
| スターラー | イカ | RCTクラシック | |
| シルバーワイヤー | サイエンス製品 | AG-T25;AG-T10 | 電極、0.64 mm(バス)、0.25 mm(電極) |
| pHメーター | 小物 | 765カリメトリック | |
| 浸透圧計 | フォーゲル | OM815 | |
| 顕微鏡 | カールツァイス | ID03 | の火磨き |
| CO2インキュベーター | バインダー | CB150 | |
| 細胞培養皿 | TPPとは | 93040 | 内径34mm |
| カバースリップ | ロス | P232 | の直径15mm |
| 温度計 | Rössel Messtechnik | MTM12 | 型|
| ビームスプリッター | 彩度 | 21011 | 年90/10トランスミッション |
| ピペットホルダー | ALA科学機器 | PPH-1P-AXU-0-1.5 | |
| ヘッドステージ | 分子デバイス | CV203BU | |
| 増幅器 | 分子デバイス | アクソパッチ200B | |
| デジタイザー | 分子デバイス | デジデータ1400 | デジタルアナログコンバータ |
| 光源 | TILL Photonics(ティルフォトニクス) | ポリクロームV | 全輝度540nmに設定 |
| 顕微鏡 | カールツァイス | アクシビボルト100 | |
| シャッター | ヴィンセント・アソシエイツ | VS25 | の|
| シャッタードライバー | ヴィンセント・アソシエイツ | VCM-D1 | の|
| ガラスのキャピラリー | ワーナー・インストゥルメンツ | G150F-3 | ファイヤーポリッシュエンド付きホウケイ酸キャピラリー OD 1.5 mm ID 0.86 mm |
| マイクロピペットプーラー | サッターインストゥルメント | P1000 | |
| バスハンドラー | ローレンツ・メスゲラテバウ | MPCU | の|
| トリプルバンドフィルターセット | 彩度 | 69008 | 蛍光フィルター ECFP/EYFP/mCherry |
| CCDカメラ | ワテック | ワット-221SCCD | |
| オプトメーター | ギガヘルツオプティック | P9710 | 型光強度の測定 |
| 目的 | カールツァイス | 421462から9900から000 | W プランアポクロマート 40X/1.0 DIC |
| マイクロマニピュレーター | サイエンティフィカ | パッチスター | |
| 録音室 | カスタムメイド | ||
| 電源 | マンソン | HCS-3202 | 顕微鏡内蔵電源からの電気ノイズを回避 |
| 防振テーブル | ニューポート | M-VW-3636-OPT-01 | |
| ファラデーケージ | カスタムメイドまたは任意の商用マッチングテーブル | ||
| ホース | 任意の商業施設(例:Roth) | 浴の取り扱いとピペット圧力の適用のためのさまざまなサイズと材料、寒天ブリッジ | |
| リニアシェーカー | サンラボ機器 | SU 1000 | |
| 液路電位計算機 | Molecular DevicesまたはPeter H. Barryから直接 | プログラムはClampex取得ソフトウェアに含まれているか、p.barry@unsw.edu.au から取得できます | |
| データ収集ソフトウェア | 分子デバイス | クランペックス 10.X | |
| データ評価ソフトウェア | 分子デバイス | クランプフィット 10.X | |
| PsACR1 | のGenBankまたはAddgene | KF992074.1 または Addgene plasmid #85465 | PsACR1の遺伝子コード化 |
| アンプガイド | 分子デバイス | 軸索ガイド |