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Research Article
Yvonne Welte1,2, Cathrin Davies1,3, Reinhold Schäfer1,4, Christian R.A. Regenbrecht1,3,4
1Institute of Pathology, Laboratory of Molecular Tumor Pathology,Charité - Universitätsmedizin Berlin, 2Institute for Chemistry and Biochemistry,Free University Berlin, 3Laboratory for Functional Genomics Charité (LFGC),Charité - Universitätsmedizin Berlin, 4Comprehensive Cancer Center Charité,Charité - Universitätsmedizin Berlin
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
この記事では、初代培養細胞に新たに取得したメラノーマ組織の調製を記述する方法、および腫瘍細胞から赤血球および線維芽細胞の汚染物を除去する。最後に、我々はどのように説明したCD133
利用できるメラノーマ今日のための改良さ治療オプションにもかかわらず、高度な悪性黒色腫の患者は、まだ無増悪生存期間および全生存期間のため予後不良である。したがって、トランスレーショナルリサーチは、悪性黒色腫のための標的療法を改善するためのさらなる分子の証拠を提供する必要があります。過去には、黒色腫に関連する発癌メカニズムが広く確立された細胞株を用いて検討した。個々の遺伝的プロファイルに基づいて、よりパーソナライズされた治療法への道に、私たちは、患者由来の細胞株の代わりに、汎用的な細胞株を使用することを提案する。特に患者のフォローアップ一緒に高品質の臨床データと、これらの細胞は、より良いメラノーマの進行の背後にある分子メカニズムを理解する手段になるでしょう。
ここでは、解剖した新鮮な腫瘍組織からの原発性メラノーマ培養の設立を報告している。この手順は、単一細胞にミンチと組織の解離、再を含む赤血球と線維芽細胞と同様に細胞の悪性黒色腫由来の初代培養で信頼性の検証と汚染のmoval。
最近の報告では、腫瘍の大部分のようなメラノーマ、港もっぱら転移状態に向かって腫瘍の発生と進行を煽るように見える癌幹細胞(CSCが)、少量の亜集団が明らかになった。黒色腫におけるCSCの同定および単離するための重要なマーカーの一つはCD133です。バルク、栽培と機能的に分析することができます-原発性黒色腫の培養液から、CD133 + CSCを単離するために、我々は、CD133の高い選別純度および生存率で+ CSCおよびCD133を生じMiltenyi社からの磁気活性化細胞選別(MACS)の手順を変更し、最適化したその後。
皮膚の悪性黒色腫は皮膚癌の最も一般的でない、まだ最も致命的なタイプです。増加率、死亡の1,2に関連悪性皮膚腫瘍の75%は悪性腫瘍であり、急速な普及のハイグレード、今やメラノーマアカウントが原因。原発腫瘍の外科的切除、化学療法、放射線療法、免疫療法と組み合わせた化学療法と転移性黒色腫の免疫療法に加えメラノーマ治療3,4の最先端の戦略があります。しかし、悪性黒色腫は化学療法への反応が不良(5-12%)、5,6、およびのみvemurafenib 7〜による治療などの新しい標的治療に有望からBRAF V600E遺伝子変異の利益を運ぶメラノーマ患者のものと50から70パーセントによって特徴付けられる全生存期間を改善し、メラノーマ腫瘍形成のメカニズムのより良い理解が必要である。
過去には、十分に確立された商業でそれらのメカニズムを研究するために、cially可能な細胞株を用いた。がんの発生と進行の分子事象を研究するための、より最近のアプローチは、腫瘍組織に直接由来初代培養活用 - 戦略ベアリングマニホールドの利点を:研究者は、患者と組織選択の完全なコントロールを持っています。サンプリングされた細胞は巧妙に選ば腫瘍組織から得られた、そのすべての異質性腫瘍に似ているとフォローアップの患者のデータと詳細な病理学は、文化の特性は元の腫瘍8のものと比較することを許容するために利用可能です。
これとは対照的に、がん研究における関連モデルシステムとして確立された細胞株の使用は論争議論されている。すでに1987年にオズボーンらは異なる研究室9からMCF-7ヒト乳癌細胞株の間に有意な生物学的な違いについて説明しました。継代中のRNA発現のこの大規模なゲノム不安定性とバリエーションが共同であったHiorns らによるnfirmed。および細胞株は、それによってヒト癌10のモデルのような確立された文化の直接の関連性を弱める、文化の中で進化しないという証拠のための支援データを提供した。
大部分は長年にわたって無視されてきたもう一つの重要な考慮事項は、最初の細胞株の多数がHeLaによって汚染されたことを実証することによって、20年以上前に強調表示されていた無関係の 'false'細胞と培養液の汚染や増殖のリスクである細胞8,11。 'false'の細胞株からのデータの誤った解釈は、最近になって再び文学で明るみになってきた。 DNAプロファイリングと分子細胞遺伝学の組み合わせを使用して、マクラウドらは 252の新しい腫瘍由来のヒト細胞株の、微生物や培養細胞(DSMZ)のドイツCollectionに寄託ほぼ18%が種内であることが判明したまたはクロス種差ことを明らかにした·汚染物質12,13。
これらの問題を回避するためと、上記の利点を活用するために、我々は新たに摘出転移からの低通路メラノーマ細胞株を樹立することを決めた。
強固な細胞分離·解析技術は、同時に特徴的な表面のタンパク質の細胞死と破壊を制限しながら、単一セルの準備が生成する必要があります。単細胞懸濁液中に組織の解離のための自動化されたベンチトップ測定器は、ミルテニー製gentleMACSの解離です。抗原エピトープを維持し、セル損失を低減しつつ、gentleMACS Cチューブ、最適化された解離ソリューションと組み合わせて使用すると、クローズドシステム内の腫瘍組織の効果的かつ穏やかな解離が達成される。楽器は、特定のアプリケーションや保証で即時メラノーマ組織14から単細胞懸濁液の標準製剤の様々な最適化され、あらかじめ設定されたプログラムを提供しています。
<Pクラス= "jove_content">最近の報告では、腫瘍の大部分が専ら腫瘍の開始と自己再生能力発揮いわゆる癌幹細胞(CSCが)の小集団を抱いていることを明らかにした。皮膚の真皮にメラノサイト産生幹細胞の同定はUVA放射への曝露が悪性形質転換15のためにこれらの細胞を準備することができるので、これらの細胞がメラノーマにおける癌幹細胞(CSCが)の原点かもしれないという仮説につながった。このような遺伝的病変の結果は、腫瘍と幹細胞の特性の組み合わせを抱い細胞であろう。メラノーマでCSCの亜集団を表現するために提案された重要なマーカーの一つは、CD133の16から20です。 CD133(またプロミニン1とも呼ばれます)、pentaspan膜貫通糖タンパク質のメンバーは、造血幹細胞、内皮前駆細胞、ニューロンおよびグリア幹細胞21から23で表されます。 CD133の発現と相関している非対称細胞分裂24、CD133のグリコシル化エピトープが細胞分化25時にダウンレギュレートすることが示された。最近では、CD133 +メラノーマ細胞は自己複製および腫瘍イニシエーション容量19,20を有することが示された。
細胞- CD133の機能+推定メラノーマCSCを勉強するために、我々は、CD133 +およびCD133の高濃縮および生存個体を得るためにミルテニーバイオテクから磁気活性化細胞選別(MACS)システムを変更し、最適化しました。
Matheu らによって示されているように磁気ビーズベースの細胞分離はどちら負の選択が可能になります26、または正の選択我々がここで示しているよう。正の選択中に特定の標的細胞型、 例えば CD133発現する細胞は、磁気に対して非常に特異的な抗体に結合しているMicroBeadsは、50 nmの超常磁性粒子で標識されている特定の細胞表面抗原。非標識細胞が通って流れるのに対し分離中、磁気標識した細胞は、セパレータの磁場中でカラム内に保持されています。洗浄工程の後、カラムセパレータの磁場から削除され、標的細胞をカラムから溶出される。 LSまたはMSカラムは、高純度の標識および非標識細胞の分画における正の選択の結果の間に使用。一方、負の選択に使用されるLDの列、、標識された画分の純度が若干低い結果。その行列のパッキング密度が高いのために、これらの列の流量は、カラムの中に閉じ込められる非標識細胞のリスクが高い低いに起因している。 LDの列は、望ましくない細胞亜集団の厳しいプリーションするためにのみ使用する必要があります。ポジティブ選択incubatio以下MicroBeadsで直接(MicroBeadsに結合した抗体)または間接磁気標識(インキュベーションによって行うことができるn個の一次抗体を使用)。特定のMACS MicroBeadsは前立腺または黒色腫27のような原発腫瘍細胞の多くの種類の細胞の正の選択のために用意されています。
初代培養細胞、線維芽細胞の枯渇とCD133の磁気細胞選別の腫瘍組織、特性評価からの主なシングル細胞の調製を含む実験の全体的なスキームは、+およびCD133 -メラノーマ細胞を図1に示します。
1。サンプル取得
2。腫瘍組織から原発性黒色腫シングルセルを調製し
3。初代培養細胞および線維芽細胞枯渇のキャラクタリゼーション
4。磁気細胞はCD133 +およびCD133のソート- LS列を使用したメラノーマ細胞を
腫瘍組織からの単一細胞の調製
図2(B)は、機械的解離は2-4 mmの小片にする前に、(A)と後の後期メラノーマ患者の切除リンパ節転移を例示している。 70μmのナイロンメッシュを通して組織とろ過の酵素的解離の後、細胞をペレットにし、上清を捨てる。このステップでは、我々は、 図2Cの細胞ペレットの赤みを帯びた色で示されるように赤血球と高い汚染を観測しました。その後、我々は、ライトブラウン色( 図2D)の細胞ペレットをもたらした赤血球を、枯渇。これらの細胞は、℃、5%CO 2、37℃クアンタム263培地で再懸濁し、培養した。
初代培養細胞のキャラクタリゼーション
細胞が腫瘍からではなく、周囲間質に由来するかどうかを検証するために、我々は、RT-PCRを行ったmelanocyte/melanoma-の、線維芽細胞、樹状突起と、幹細胞マーカー遺伝子。アダルトメラノサイトは 、Tyrおよび幹細胞マーカーCD133の陽性コントロールとして、胚性癌細胞株のNCCITのための正常なコントロール細胞を務めていました。 図3に示されているPCRの結果は、いくつかの主要な細胞がメラノサイトの起源確かにある(TYR用正)及び成熟樹状細胞(CD83)のマーカーが陰性であることを明らかにした。また、メラノーマ細胞株は急行CD133、非対称細胞分裂と既知の癌幹細胞マーカーのための重要な遺伝子を発見された。HPRTがローディングコントロールとして使用した。
CD90高発現( 図3左、上のパネル)によって示されるように、当初、初代培養細胞はまた、線維芽細胞で高い汚染が含まれていました。
線維芽細胞の枯渇後、この細胞培養のみTYR +メラノーマ細胞が含まれていたsともう芽細胞(CD90 - )( 図3左、下のパネル)。 図4に示すように、線維芽細胞の不在は、明視野顕微鏡で確認することができた。
CD133 +およびCD133の磁気細胞選別-メラノーマ細胞
-細胞RT-PCR法によって示されるように、CD133発現を示す原発性黒色腫細胞は、CD133 +およびCD133に並べ替えることができます。間接CD133マイクロビーズキット、高純度(> 99.75パーセント)から変更されたプロトコルや、CD133 +およびCD133-フラクションと同様、ソート後の両方の画分の高い生存率、収率が達成される。 図5AおよびBに示すように、ソートの有効性と純度は常に免疫蛍光染色またはウェスタンブロット分析によって検証する必要があります。
図1。実験の全体的なスキームはプライマリメラノーマ細胞培養及びCD133 +推定癌幹細胞の単離はDNase IおよびコラゲナーゼIVおよびgentleMACSのDissociatorと解離ミックスを用いて腫瘍細胞の機械的および酵素的解離続く腫瘍の切除が含まれています。腫瘍細胞は非常に赤血球で汚染されている場合には、赤血球枯渇ステップが推奨されます。初代培養細胞は、その後、彼らはメラノーマ細胞であるかどうか確認するために顕微鏡およびRT-PCR解析によって特徴づけされなければならない。 CD90の発現によって示される線維芽細胞で高い汚染がMiltenyi社の抗線維芽細胞のマイクロビーズを用いた線維芽細胞の枯渇によって除去することができる。最後に、CD133 +およびCD133-メラノーマ細胞はミルテニーから人間の間接CD133マイクロビーズキットを用いて分画することができる。ソート後、純度が確認され、CD133 +D CD133-メラノーマ画分を並べて分析することができます。

図2。腫瘍組織からの単一細胞の調製。 :単一細胞に解離する前に切除した悪性黒色腫の転移のサンプルB:2つの滅菌外科用メスを使用して2〜4ミリメートル片に腫瘍組織の機械的解離後のメラノーマ転移C:。非常に赤血球Dで汚染された単一細胞のペレット:赤血球枯渇続く単一細胞のペレット。

図3。初代培養細胞の発現解析。メラニン産生に関与する遺伝子のRT-PCR分析(TYR)、線維芽細胞マーカー(CD90)、樹状細胞マーカー( CD83)と非対称細胞分裂(CD133)のための重要な遺伝子は当初、初代培養細胞は、CD133 +メラノーマ細胞(TYR +)と無樹状細胞(CD83-)を含有していたが、非常に繊維芽細胞(CD90 +)(左上段)で汚染されたことを示した。以下の線維芽細胞の枯渇この細胞培養のみTYR +およびCD90-メラノーマ細胞(左、下のパネル)が含まれていました。 HPRTはローディングコントロールとして使用した。 NCCITと大人のメラノサイトは、それぞれ、CD133とTYRのポジティブコントロールとして役立った。

図4。線維芽細胞の枯渇前後の初代培養細胞の顕微鏡写真。 :高度に汚染された線維芽細胞と初代培養細胞の明視野顕微鏡写真B:線維芽細胞が枯渇した後、同じプライマリメラノーマ細胞培養の明視野顕微鏡写真。

著者らは、彼らが競合する経済的利益を持っていないことを宣言します。
この記事では、初代培養細胞に新たに取得したメラノーマ組織の調製を記述する方法、および腫瘍細胞から赤血球および線維芽細胞の汚染物を除去する。最後に、我々はどのように説明したCD133
作者はこの仕事をサポートし、批判的に原稿を読み取るための教授M. Dietelとディルク·シューマッハに感謝します。
これらの結果につながる研究は助成合意nは下革新的医薬品イニシアティブの共同事業からの支持を受けています°の115234は、リソースは、欧州連合(EU)の第7次フレームワークプログラム(FP7/2007-2013)とEFPIA会社の中から拠出金で構成されています現物出資。この作品はまた、ベルリンKrebsgesellschaft(BKG)によってサポートされていました。
| 試薬 | |||
| Accutase | PAAラボラトリーズ社 | L11-007 | |
| 脱イオン水でアムホテリシンB液250μg/ mLの | シグマアルドリッチ社 | A2942-50ミリリットル | |
| 抗線維芽細胞のマイクロビーズ | ミルテニーバイオテク社 | 130-050-601 | |
| CD133 / 1(W6B3C1) | ミルテニーバイオテク社 | 130-092-395 | |
| コラゲナーゼIV | シグマアルドリッチ社 | C5138 | |
| DNase Iを | Applichem社 | A3778.0050 | |
| は、Ca、Mgを含まないD-PBS | PAAラボラトリーズ社 | H15-002 | エチレンジアミン四酢酸二ナトリウム塩二水和物エチレンジアミン四酢酸(EDTA) | シグマアルドリッチ社 | E-7889 |
| FBSスペリオル | Biochrom | S0615 | |
| 間接CD133マイクロビーズキット人間 | ミルテニーバイオテク社 | 130-091-895 | 含まれています:CD133 / 1(AC133)-ビオチン、Anti-Biotin MicroBeadsはとFcRブロッキング試薬 |
| ペニシリン - ストレプトマイシン、液体(100倍) | インビトロジェン社 | 15140-122 | |
| 量子263 | PAAラボラトリーズ社 | U15-815 | |
| 赤血球溶解液(10倍) | ミルテニーバイオテク社 | 130-094-183 | |
| 機器 | |||
| BD Biosciences社 | 352350 | ||
| gentleMACS Cチューブ | ミルテニーバイオテク社 | 130-093-237 | |
| gentleMACS解離 | ミルテニーバイオテク社 | 130-093-235 | |
| MACSセパレーターマルチスタンド | ミルテニーバイオテク社 | 130-042-303 | |
| MACS Seperation柱25のLSカラム | ミルテニーバイオテク社 | 130-042-401 | |
| MACSmixチューブローテーター | ミルテニーバイオテク社 | 130-090-753 | |
| Natriumchloride | メルク | 567440-1KG | |
| プレセパレーションフィルター | ミルテニーバイオテク社 | 130-041-407 | |
| QuadroMACSセパレータ | ミルテニーバイオテク社 | 130-090-976 | |
| Rotilabo·シリンジフィルター(0.22μmで、PES) | カール·ロート社&Co KG | P668.1 | |
| Steritop-GPフィルターユニット500ミリリットル | ミルテニーバイオテク社 | SCGPS05RE |