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方法論記事

多発性硬化症の再発のデータを用いて実証季節変動の三角モデリングの方法

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DOI:

10.3791/53169

2015年12月9日

この記事について

サマリー

プロット分析と三角回帰を組み合わせることは、多発性硬化症(MS)における再発発症タイミングのような複雑で周期的な現象を探索するための堅牢な方法です。この方法により、再発発症の季節的傾向を偏りなく特徴付けることができ、季節変動、紫外線(UVR)、および緯度の影響に関する新しい推論が可能になりました。

要約

このレポートは、両半球に位置する20カ国の46の臨床センターからの55年間の多発性硬化症再発データに対する三角回帰モデリングの新たなStataベースの適用について説明しています。この方法の成功の中心は、統計回帰モデリングを導き、裏付けるためのプロット分析の戦略的な使用でした。初期プロット分析は、再発確率に対する季節的および緯度的影響の存在と構造形態に関する現実的な仮説を確立し、結果として得られるモデルのパフォーマンスをテストするために必要でした。その後、三角関数回帰は、これらの関係を定量化し、重要な交絡因子を調整し、これらの関連性がどれほど妥当であるかについての確実性の尺度を提供するために必要でした。グラフ化技術と回帰モデリングの同期により、最適な収束が達成されるまでモデルを体系的に改良することができ、MSの再発発症タイミングを予測する際の季節と緯度の両方の独立した影響について新しい推論を行うことができました。これらの方法は、季節や地理的な場所によって系統的に異なることが疑われる、または知られている他の複雑な疾患や疫学的現象にも適用できる可能性があります。

概要

多発性硬化症(MS)の最も一般的な形態は、多発性硬化症(RRMS)の再発寛解型されます。 RRMSは、部分的または完全な回復が続く神経学的機能のエピソード劣化、ことを特徴としています。世界的には、MSの発症率と罹患率は、RRMSに特異的に発生する再発事象の頻度も緯度によって変化しているかどうか。両半球で、赤道から離れた距離の増加に伴って1-3を増加させ、そのような中で、任意の基になる季節変動があるかどうか関連は、依然として不明です。再発時期に季節性を模索し、日付の研究に広い緯度の影響を探索することができないので、孤独な地理的位置とに再発時期の旬のトレンドに関するいかなる推論を制限し、単一の臨床センターに限られていた。4-14これらの研究は、さらに少量の試料によって制限されていますサイズとスパース再発データ。ユーロでの臨床センターから10の研究のメタ分析2000OPE、各研究は、シーズンの発症再発のを報告30例最小を含め、米国とカナダでは、春をピーク再発で、冬トラフ4と、再発発症の時期に明確な季節の傾向を説明しました。発症における同様の周期的な年間の傾向は、日本15、スペイン16の両方が小さく、研究にもかかわらず、その後の中で観察されています。しかし、同等の米国の研究では、このパターン 17 裏付けることができませんでした。現在までに、これらの研究や観察は北半球に限られていました....

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プロトコル

注:説明した各ステップが提供されているコード・ファイル内の同じ番号のStataのコードのセクションに対応しています。 Stataのコマンド名は、以下のプロトコルにイタリック体されています。

1.観測再発発症データの準備とプロット

  1. 「新しいDO-ファイルエディタ」をクリックしてファイルを実行し、ボタンを開き、モデル化することには、3つの地理的レベルのそれぞれのための12暦月のそれぞれに日付再発発症の数を計算するために生成するコマンドを使用します。場所、半球グローバル。 DO-ファイルの「(実行)を実行し、「実行ファイルをアクションボタンをクリックしてアクションコマンドを実行します。
  2. 場所集計再発データのシャピロ・ウィルクまたは変更ジャック-ベラ検定を使用して正規性再発カウントの基本的な分布をテストしたり、それぞれの患者レベルの再発データを脱凝集するswilkまたはsktestコマンドを使用します。コー​​ドを選択し、クリックして「実行(DO)」。
    注:重要なスキューの存在下では、自然対数変換を適用し、その後シャピロ・ウィルクまたは、必要に応じて変更されたジャック-ベラ検定を再適用することで、おおよその正規の対数変換された再発カウント変数をテスト38,39を
  3. 同じ水平軸に沿って季節によって両方の北部と南半球の再発のプロットを可能にするた....

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結果

20カ国の46の臨床センターから供給32762再発イベントに三角回帰のアプリケーションは、MSにおける再発発症のタイミングは両半球間や季節の間の期間、その環状および季節である観察用の防御統計引数を提供するための基礎となりましたUVRトラフとその後の再発のピークは、緯度と相関します。これに重要なモデルの開発、評価と洗練の必ずしも反復プロセスを導くためにプロット分析に依拠しました。

観測データのカレンダー月の散布により再発頻度の分析は、すべての地理的なレベルにわたって春のピークと秋トラフとの年次サイクルを提案しました。グローバル再発データのレーダープロットは、北部の半球再発が(図1A)月にピークに達したことが確認されました。南半球再発発症データが北部のデータ<と一緒にしたときに、この春のピークは持続しました南部の場所は11月のピークを示すことで、強い>(図1B)。秋の谷は、それぞれ11月と月に観察北部と南部の半球再発の最低周波数と両半球で記録しました。エドワードのテストはさらに再発発症が均一で、非季節の分布から大きく逸脱を示したことを確認.......

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ディスカッション

本明細書に記載されたプロトコルは、グローバルMS再発の発症データの視覚的プロット分析によって導か系統的、回帰ベースの技術を、詳述します。これは、ユーザーがMSにおける再発発症時期の一時的に関する三角モデルを使用して正式にこれらの理論をテスト理論を探求することができ、出発点として、両半球全体で20カ国からの再発データの比較的単純な記述的な分析を要します。最初のグローバル再発発症データをプロットして、体系的に観測されたデータの候補幾何学的適合をグラフ化し、評価する段階的なプロセスを経て、季節トラフUVRとその後のピーク再発発症確率との緯度依存関係は、でこれまで前例のない相関が観察されましたMSの疫学。また、正式な統計的モデリングとトレンドの可視化を組み合わせることによって、この分析も確認前にメタ分析を示唆している季節には、再発発症時期の要因でした北半球ではと、また初めて、南半球にこの観察を拡張しました。

三角関数の回帰モデルは、そのような探求再発発症時期とUVRデータの両方で観察された毎年恒例の周期的な正弦波曲線として幾何学的形状に適合したトレンドデ​​ータの統計的な特性評価を可能にし.......

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開示事項

ティム・スペルマンは、コンサルティング、バイオジェン・アイデック社からの旅行のための資金調達のための謝礼金を受け取りました。オーラグレイはバイオジェン・アイデック、メルクセローノおよびノバルティスから走行支援を受けました。バイオジェン・アイデック、ジェンザイム社、ノバルティス社とメルクセローノの科学諮問委員会に提供するための補償。ロビン・ルーカスは、任意の競合する利益を開示しなかったとヘルムートButzkuevenは、科学諮問委員会にし、バイオジェン・アイデックとノバルティスのコンサルタントとしての補償を受けました。バイオジェン・アイデックオーストラリア、メルクセローノオーストラリア、ノバルティスオーストラリアからスピーカー謝礼。バイオジェン・アイデックオーストラリアとメルクセローノオーストラリアからの旅行支援。 CASS財団(オーストラリア)、メルクセローノオーストラリア、神経科学財団のロイヤル・メルボルン病院友人、メルボルン大学の研究支援。

謝辞

著者は、紫外線放射衛星データの抽出と解釈を支援してくださったIvan Haniganに感謝したいと思います。この研究は、HB [ID628856]、NHMRC Project Grant [1032484]、NHMRC Center for Research Excellence [Grant ID 1001216]、および MSBase Foundation に対する NHMRC Career Development Award (Clinical) の支援を受けました。MSBase Foundationは、メルク・セローノ、バイオジェン・アイデック、ノバルティス・ファーマ、バイエル・シェリング、サノフィ・アベンティス、バイオCSLの支援を受けている非営利団体です。RLは、NHMRC Career Development Award[ID 1004898]によってサポートされています。

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材料

この記事で使用された材料の一覧
名前会社カタログ番号コメント
Stata SE バージョン 13StataCorp、カレッジステーション、テキサスバージョン 13分析に使用される統計分析ソフトウェア
Microsoft Excel 2010Microsoft2010カレンダーの日付検索用スプレッドシート プログラム

参考文献

  1. Simpson, S. Jr, Blizzard, L., Otahal, P., Van der Mei, I., Taylor, B. Latitude is significantly associated with the prevalence of multiple sclerosis: a meta-analysis. J Neurol Neurosurg Psychiatry. 82 (10), 1132-1141 (2011).
  2. Risco, J., et al.

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再版と許可

タグ

三角関数回帰緯度分析再発時期StataソフトウェアUVRモデリング調和モデル位相差データの可視化