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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
ヒト免疫不全ウイルス(HIV)1型に感染した、または感染していない生細胞の細胞中心に向かって移動するファゴソームの速度を測定する方法を、蛍光感染細胞を特定するためのスピニングディスク共焦点蛍光顕微鏡とファゴソームを検出するための明視野顕微鏡を用いて説明します。
マクロファージは、自然免疫と特異的免疫の交差点で主要な役割を果たす食細胞です。それらはヒト免疫不全ウイルス(HIV)-1に感染する可能性があり、その細胞変性効果に対する耐性のために、持続的なウイルス貯蔵庫と見なすことができます。さらに、HIVに感染したマクロファージは、日和見疾患の発症に寄与する欠陥のある機能を示します。
HIV-1がマクロファージの食作用反応を損なう正確なメカニズムは不明でした。私たちは以前に、マクロファージがHIV-1に感染すると、マクロファージによるさまざまな粒子状物質の取り込みが阻害されることを示しました。この阻害は部分的なものに過ぎず、HIVに感染したマクロファージ内でファゴソームが形成されました。そこで、これらのファゴソームの運命を解析することに着目しました。ファゴソームの成熟は、これらのコンパートメントの細胞中心への移動を伴い、そこでリソソームと融合してファゴリソソームを生成し、摂取された物質の分解に関与します。私たちは、食作用の標的としてIgGオプソニン化ヒツジ赤血球を使用しました。個々のHIV感染マクロファージにおけるファゴソームの求心運動の速度を測定するために、明視野と蛍光共焦点顕微鏡の組み合わせを使用しました。私たちは、ファゴソームが核に向かう距離を計算し、次にファゴソームの速度を計算する方法を確立しました。HIV感染細胞はGFP発現ウイルスによって同定されましたが、この方法は非感染細胞やあらゆる種類の感染や治療に適用できます。
マクロファージは、自然免疫系と恒常性において主要な役割を果たします。それらは、食作用1,2と呼ばれるプロセスによって病原体や破片を内在化して排除するプロの食細胞です。ファゴソームは、粒子状物質の飲み込み後に形成される閉じたコンパートメントであり、エンドサイトーシスコンパートメントとの一連の融合および分裂イベントを経験し、ファゴリソソームと呼ばれる分解コンパートメントにつながります。このコンパートメントは、プロトンポンピングv-ATPアーゼの獲得により酸性のpHを持ち、加水分解酵素を含み、リソソーム関連膜タンパク質(LAMP)が豊富です。ファゴソームの成熟は、微小管3,4上を細胞中心に向かって移動し、リソソームが蓄積する核周囲の位置に到達することを伴います。
多くの病原体がファゴソームの成熟を乗っ取ると報告されており、その中には、彼らが居住する液胞環境を変化させる細胞内生活様式を持つ細菌も含まれます5。ヒト免疫不全ウイルス(HIV)-1は、T細胞に加えてマクロファージを標的としています。マクロファージは、T細胞とは異なり、ウイルスの細胞変性作用に耐性があるため、ウイルスの貯蔵庫と見なすことができます。さらに、HIV-1に感染したマクロファージは食作用機能に欠陥があり、日和見性疾患の出現に寄与します。特に、サルモネラ菌Typhimurium ST313によって引き起こされる重篤な侵襲性非腸チフス性サルモネラ症は、過去30年間、HIV6に感染したサハラ以南のアフリカの子供または成人に蔓延しています。結核を発症するリスクは、HIV感染者の方がHIV感染者よりも20倍以上高いと推定されています。
これらすべての理由から、HIV感染マクロファージの食作用欠陥の根底にある分子メカニズムをより明確に定義することが重要です。我々は、粒子状物質、オプソニン化粒子、細菌または真菌の取り込みが、HIV感染マクロファージにおいて阻害されることを示した7。この阻害が部分的であることを考えると、HIVに感染したヒトマクロファージ8の内在化ファゴソームの運命の解析に着手した。ファゴソームの成熟は、細胞中心への移動およびリソソームとの融合と密接に関連しているため、ファゴソームの成熟の欠陥は、感染細胞内の輸送モダリティの変更が原因である可能性があります。ここで説明する方法は、受容体介在性食作用、特に免疫グロブリン(FcR)のFc部分の受容体を標的とするモデルとして、IgGオプソニン化ヒツジ赤血球(IgG-SRBC)を使用します。これらの粒子は、細胞外SRBCと細胞内SRBCが異なる屈折特性を示すため、ラテックスビーズよりも明視野(BF)でイメージングが容易です9。HIV感染マクロファージにおいて核に向かって移動するファゴソームの速度を測定するために、我々は蛍光ウイルス10を使用し、ここで説明する簡単な手動追跡法を設定した。この方法は高度なプログラミングを必要とせず、ImageJを使用するだけです。付着細胞や、明視野顕微鏡や蛍光イメージングで視覚化できるあらゆるタイプの粒子や病原体に適しています。
プロトコルは、国内および国際的な法律や地方条例に厳密に従って行わなければなりません。研究目的のために献血をする彼らの同意を与えた健康なドナーからの血液は、機関が契約を締結していると輸血センターから得られています。ヒトの血液を使用した場合には、特別な保護がとられなければなりません。 HIV-1を用いた実験では現地の法律に従って、バイオセーフティーレベル3または2(BSL-3または2)実験室で行われなければなりません。
接着によって密度勾配遠心と選択によるヒト単球由来マクロファージ(hMDMs)の調製
HIV-1ウイルスストックの2生産および定量
注:M. SchindlからR5向性エンベロープを運ぶNLR4.3 HIV-1のGag-iGFP(緑色蛍光タンパク質)、ギフトER 10は、マクロファージを感染させるために、リアルタイムで感染細胞を見るために使用されます。
HIV-1とhMDMs 3.感染
ヒツジ赤血球の4オプソニン
5.ライブセルビデオ顕微鏡食作用アッセイ
タイムラプスビデオの6.分析


HIV-1感染および非感染hMDMsによる食作用をのFcR媒介性は、モデル標的としてのIgGオプソニン化SRBCを( 図1)を使用してここで説明されています。このプロトコルの重要なステップは、hMDMsの準備とHIV-1の感染です。確かに、分化したマクロファージの収量と品質は、ドナーの間で変化するだけでなく、10から40%の範囲の効率で感染率。これは破片としての代わりに、FcRを媒介食作用によってそれらの認識および取り込みを誘導する可能性があるためまた、IgGのオプソニン化-SRBCをの製造は、赤血球の損傷を避けるためにも重要です。最適なオプソニンは、効率的な食作用を保証します。
HIVに感染したマクロファージの生活におけるファゴソームの動きは、BSL-3実験室でのスピニングディスク共焦点顕微鏡上のBFチャネルとリアルタイムで分析されます。 BFチャネルの設定は重要なトンですO核( 図2、青い円)を参照し、内在化SRBCを( 図2、赤い丸)から外部( 図2、赤矢じり)を識別するため。 BF顕微鏡は、外部SRBCをより小さい屈折性であるファゴソームを参照するのに十分な最も単純な光学顕微鏡の照明技術として考えられています。
画像シーケンスの取得後の最初のステップは、ImageJソフトウェア( 図3)での手動トラッキングです。この点は、各ファゴソームを追跡することが好ましいので、特に長くて面倒なすべての画像シーケンスに対して1つずつ、それは実験がために十分に大きなサンプルサイズに到達する条件あたり少なくとも3人のドナーで繰り返す必要があると考えられることができます統計分析(3人の異なるドナーを有する少なくとも30ファゴソーム)。
第二段階は、分析であります表計算ソフトの各内在SRBCを( 図4)のための内在化後の最初の5分間、ファゴソームの速度を算出します。このために、我々は、距離は、時間に対する最初の5分の間に移動し、各ファゴソームのためにプロットします。代表的な例は 、 図5Aの非感染hMDMsに示されています。次に、線形回帰曲線の傾きであるファゴソームの速度を求めます。 0.5384ミクロン/分の速度は、このファゴソームが見つかりました。
注目すべきは、ここまたはデュマら 8に記載されているように、または後でより長い時間スケールにわたって速度を分析することによって、内部移行後の最初の数分の間ファゴソーム速度を分析することが可能です。私たちの研究では、HIV感染hMDMsで内在化後の最初の5分の間にファゴソーム速度は非感染hMDMs( 図5B)に比べて低くなっていることを観察しました。

中図2のリアルタイム取得図1で説明したように代表的な制御およびHIV感染hMDMsによる食作用。hMDMsを調製し、感染している。NLR4.3 HIV-1Gag-iGFP感染した細胞は、491 nmレーザーを用いて検出されます。スピニングディスク共焦点画像のZスタックを取得し、顕微鏡取得ソフトウェア及びImageJの(左のパネル)の両方を用いて分析します。 BF画像のギャラリーは、HHとして示さ非感染(映画1に対応する上部パネル)及び(45分の取得時にセル時間で46画像をNLR4.3 HIV-1Gag-iGFP感染(動画2に対応する下のパネル)を表します:ミリメートル)。細胞膜(黒の点線)、核(青丸)、外部SRBCを(そのうちのいくつかは赤矢頭で示す)と内部SRBCをは(そのうちのいくつかは赤い丸で示される)BF画像上で検出可能です。バー=10μmである。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

ImageJの上のマニュアルトラッキングプラグインを用いて画像解析図 3. 命令の手順は、「マニュアルトラッキング」プラグイン(1)を開き、BFチャネルにタイムラプスビデオをロードした後、(2)、買収のパラメータを入力します(3)。 「トラックを追加」(4)と、選択されたファゴソーム(6、赤いボックス)のXとYの位置と新しいウィンドウを得るために、1ファゴソーム(5)をクリックすることで、追跡の測定を開始をクリックします。利便性のための時系列上のファゴソームに従うために、(5 ')明るさとコントラストを変化させる。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

フィギュア表計算ソフトでのファゴソームの移動速度のデータ解析のための4命令の手順を実行します。(A)は 、スプレッドシートテーブルに核のXとYの位置と各ファゴソーム(赤いボックス)を組み立てます。別の列(紫色のボックス)で、(cは核とSRBCとAとの間の長さを表しピタゴラスの定理とし、直角三角形の他の2辺の長さbはファゴソームと核との間の距離を計算しますB)。 (C)最後に、時刻0で初期距離から与えられた時間にSRBCと核の間の距離を差し引くことにより、各時間(緑色のボックス)でファゴソームの移動距離を計算の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。この図。
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ファゴソームマイグレーション制御の速度およびHIV感染hMDMsの 図5. 定量化。(A)各SRBCについて、ちょうどSRBC内在化した後、核に向かって移動した距離を測定し、時間に対してプロットされています。最初の5分の間の速度は、表計算ソフトで線形回帰を用いて計算されます。代表的な実験は、( 図3-4の内部SRBC)に示されています。 (B)最初の5分の間に全ての速度がHIV感染細胞における非感染(5ドナー)で66ファゴソームと60ファゴソーム(4ドナー)を測定します。 (ウェルチの補正で対応のないスチューデントのt検定; **、P <0.01)データは、平均±SEMを表す。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。

映画2:代表的なHIV感染マクロファージにおけるファゴソームの動き。 (右クリックしてダウンロード)。 HIV-1(NLR4.3 HIV-1のGag iGFP)はマクロファージを491レーザーを照射した後に同定されたに感染し。オプソニン化赤血球の移動は、45時BFチャネルで検出されました1分間に1画像(HH:MMとして示された時間での46画像)との食作用の分。バー=10μmです。
著者らは開示するものは何もない。
ヒト免疫不全ウイルス(HIV)1型に感染した、または感染していない生細胞の細胞中心に向かって移動するファゴソームの速度を測定する方法を、蛍光感染細胞を特定するためのスピニングディスク共焦点蛍光顕微鏡とファゴソームを検出するための明視野顕微鏡を用いて説明します。
原稿を読んでくださったジャミル・ジュブレール博士に感謝します。本研究は、CNRS、Inserm、パリ・デカルト大学、Agence Nationale de la Recherche (2011 BSV3 025 02)、Fondation pour la Recherche Médicale (FRM DEQ20130326518、GLBの博士フェローシップを含む)、Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales (ANRS、CDのポスドクフェローシップを含む)からの助成金を受けて行われました。
| ファルコン 100 mm TC処理細胞培養ディッシュ | コーニング | 353003 | ウイルス生産用 |
| ガラスボトムディッシュ 35 mm コーティングなし 1.5 | MatTek corporation | P35G-1.5-14-C ケース | 取得用 |
| ファルコン組織培養プレート 6ウェル | サーモフィッシャー サイエンティフィ | ックコーニング 353934 | ヒト単球由来マクロファージ用 |
| フィコールプラーク PLUS | ドミニクDutscher | 17-1440-03 | 密度遠心分離用溶液中の中性、高分岐、高質量、親水性多糖類 |
| DPBS、カルシウムなし、マグネシウムなし | Thermo Fischer Scientific | 14190-094 | RT |
| Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) 1x, liquid (High Glucose) | GIBCO, Molecular probes | 31966-021 | Conserved at 4 °C ;HEK細胞培養 |
| 用RPMI 1640培地GLUTAMAX Supplement | Life technologies | 61870-010 | 4°Cで保存。C;hMDMsの文化 |
| Fœタルカーフセラム(FCS) | Eurobio | CVFSVF0001 | -20 °C ;非補完ペ |
| ニシリン-ストレプトマイシン (10,000 U/ml) | Thermo Fischer Scientific | 15140-122 | -20 °Cで保存;C ;hMDMsの文化 |
| RPMI 1640媒体、フェノール赤無し(10x 500 ml) | 生命技術 | 11835-105 | 37 >Cウォーターバス使用前;食作用アッセイ用 |
| FuGENE6 トランスフェクション試薬 | Promega | E2692 | 4 °C で保存;C ;ウイルス産生用 |
| ヒツジ赤血球 (SRBC) | Eurobio | DSGMTN00-0Q | Alsever バッファーに 4 °C で保存;C 使用前の |
| 抗羊赤血球 IgG | MP Biomedicals | 55806 | 4 °C で保存;C |
| ウシ血清アルブミン熱ショック画分、pH 7、≥98% | シグマ | A7906 | は -20 °C で保存。C |
| 倒立顕微鏡 DMI600 | ライカ | ||
| 共焦点スピニングディスクユニット CSU-X1M1 | 横河 | ||
| 491 nm 50 mW レーザー | COBOLT CALYPSO | ||
| HCX PL APO CS Objectif | ライカ | 対物レンズ ;倍率100倍。開口数1.40;イマージョンオイル | |
| CoolSnap HQ2 (FireWire) カメラ | フォトメトリクス | ピクセルサイズ 6.45 & マイクロ;メートル x 6.45 & マイクロ;m ;定義 1,392 x 1,040 ;14ビット | |
| メタモルフ7.7.5ソフトウェア | での画像のエンコード分子デバイス | 顕微鏡GraphPad | |
| プリズムソフトウェアの | 制御用 | 統計分析用 |