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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
マイクロタイタープレートからの培地の不均一な損失は、均一な多細胞腫瘍スフェロイド形成の再現性に影響を与えます。重要な媒体の損失を低減するために培養条件を改善するスフェロイド形成の再現性及び液体オーバーレイ技術を使用して回転楕円体に基づくアッセイの結果を改善します。
密接にインビボ条件で模倣する腫瘍モデルは、潜在的な抗癌薬のスクリーニングのための薬物発見および開発にますます普及しつつあります。多腫瘍スフェロイド(MCTSes)を効果的にリード最適化および標的バリデーションのためのインビトロモデルにおけるそれらの優れた製造、固形腫瘍の生理学的条件を模倣します。 MCTS培養のための利用可能な様々な技術のうち、アガロース上に液体オーバーレイ方式は、MCTSの世代のための最も安価な方法の一つです。しかし、ハイスループットスクリーニングのための液体オーバーレイを使用してMCTS培養の信頼できる転送をアガロースウェルにわたって均一MCTS形成の非再現性を有するマイクロタイタープレート(MPS)のコーティングを含む多くの制限によって妥協されてもよいです。国会議員は、薬物のためのプレート全体の使用を防止する、プレートの外部から媒体の過度の蒸発に起因するエッジ効果に有意傾向がありますテスト。この原稿は、均一なMCTS形成の拡張性と再現性を高めるために液体オーバーレイ技術に詳細な技術改良を提供します。薬物治療が提示された後に加えて、MCTSの評価のためのシンプルな、半自動、および普遍的に適用するソフトウェア・ツールの詳細については備えています。
腫瘍中の癌細胞は、生理学的に細胞外マトリックスと相互作用する細胞に囲ま複雑な3次元(3D)構造に配置されています。ほぼ組織内のすべてのセルは、3D環境内に存在する、より生理学的に関連する腫瘍の特性を模倣するインビトロ腫瘍モデルでの必要性は、いくつかの3次元培養技術1、2、3の開発をもたらしました。これらのモデルは、現在、3D 2の治療薬への転移および細胞応答に腫瘍微小環境の役割を研究するための基礎的な研究ツールになってきています。また、2次元(2D)細胞培養物4と比較して、3Dモデルは、細胞シグナル伝達経路に影響を与える、腫瘍-間質相互作用のよりよい理解を可能にします。
癌細胞株の多腫瘍スフェロイド(MCTSes)は、しばしば、3DセルCで使用されていますin vivoでの腫瘍に対するそれらの相対的な近さに起因するultureモデル。使用中のいくつかの技術のうち、アガロースでコーティングされたプレート上でMCTS生成の液体オーバーレイ技術(LOT)は、リード最適化とターゲットバリデーション5、6、7、8、9、10、11のために大きな関心を集めています。これが成功しLOT 6、7を使用してMCTS培養における化合物ライブラリーのパイロットの画面を実行することができました最近の研究から明らかです。しかし、媒体の蒸発によって誘導される不均一な損失にMCTSの形態と成長のウェル間の変動は、マイクロタイタープレートを使用して、LOT(MPS)を伴う一般的なハードルがあります。その結果、不均一なMCTSesの形成は有意との関連性を損ないます薬理学的アッセイ8、12、13からのデータ。自動液体分注装置を使用する際の再現性の問題に加えて、LOTベースのハイスループットアッセイに影響を与える別の実用的な問題は、アガロースでMPのコーティングです。分配ユニットは、アガロースのゲル化を防ぐために加熱保持することができるが、分注カセットおよび管の目詰まりは、ロボットシステム6のための潜在的な問題です。
これらの課題のいくつかを克服するために、我々は最近、MCTS文化8用のLOTでいくつかの変更を考案しました。これらの修飾は、主に一般的ハイスループットスクリーニング実験室で発見された機器を用いたMPから不均一媒体の損失を防止することができる方法に基づいています。 3に均一なサイズで再現性のMCTSesの世代のために修正されたLOTの詳細な手順84ウェルプレート(WPS)は、ここに提示されています。原稿は、特に断面積の測定のために明確に定義された境界を持っていない、部分的に崩壊し、薬剤処理MCTSesで、MCTSサイズの評価のための半自動化ルーチンを示しています。
アガロースでコーティングされたプレートの調製
2.細胞培養およびMCTSの形成
3.培地交換ロボットシステムを使用して
4. MCTSの高コンテンツイメージングと半自動画像解析

図1:環境蓋の調製と半自動ルーチンのフローチャート。正しい(左)および過剰の液体を充填する(右)の量(ここでは、5%DMSO)で充填された蒸発還元環境蓋の(A)画像。矢印は、液体を追加するための短辺のトラフを示します。アスタリスクは、DMSOの正しいボリュームの添加後、蓋の中央にあるギャップを示しています。 (B)半自動画像解析ルーチンに必要な手順を示すワークフロー。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
特に、周辺井戸からの媒体の不均一な損失は、小さな培養容量を持つ国会議員で頻繁に遭遇する問題です。このような、よく制御された温度/加湿システムと蒸発低減国会議員とプレートの蓋付きインキュベーターと実質的に改善された培養条件は、井戸8を横切る媒体の重大な損失を低減します。相対蒸発を測定するために、オレンジG(OG)の等容積を各ウェルに添加し、3日間のOGの吸光度の変化は、標準、ロータリーインキュベーターで定期的かつ環境ふたを有するプレートに記録しました。プレートウェルプレート( 図2A)の端からの距離に基づいて6つのグループに分けました。グループ1-4では、標準のインキュベータ( 図2B)で定期的にふたを有するプレートの経時OGの吸光度に大きな変化がありました。 OGの吸光度の変化からもありましたが、グループ環境蓋/回転式インキュベーターの組み合わせ( 図2C)の下のプレート中の1ウェルは、変動係数(CVが)標準インキュベータ( 図2D)での定期的な蓋つきのプレートに比べてはるかに低かったです。
媒体の蒸発によって誘導される不均一な損失は、国会議員8でMCTSサイズおよびアッセイ読み出しにおけるウェル間の変動の潜在的な理由の一つです。しかしながら、環境蓋/ロータリーインキュベーターの組み合わせで384ウェルTCプレートウェルの6つの群( 図2E)にわたって均一MCTSesの形成をもたらしました。これとは対照的に、定期的な蓋/標準インキュベーターの組み合わせを有するプレートでMCTSesは、大きさや堅( 図3F)で大幅に変化します。ソリディティはMCTSの真球度の尺度であり、MCTSの崩壊の度合いを与えます。 2D領域の堅牢性は、共同での画素の割合でありますnvex関心領域(ROI)の船体およびROIの凸包の面積によりROIの領域を分割することによって決定されます。円形や楕円両領域1の堅さを持っている、とMCTSは崩壊として、堅牢は減少します。面積の差は、既にダスらに報告されています。 (2016年)8。ボリュームはMCTSesの長軸と短軸から計算しました。

図2:増加MCTS再現性の最小限の蒸発結果にプレート。 (A)のプレートマップは6グループに井戸の区分を示すために提示されています。 (BおよびC)正規の蓋(B)と標準的なインキュベーターで培養プレート内のグループ1-4のウェルからOGの相対的な吸光度の大幅な時間依存性のばらつきがあり、グループ1、私たちからロータリーインキュベーター(C)の環境ふたを有するプレートでLLS。日3-5 OGの吸光度は、0日目(D)に正規化グループのOGの吸光度のCVの日3-5から1ウェルが2板蓋/インキュベーターの組み合わせのために示されているが平均化されます。 CVが3つの独立した実験の平均です。環境蓋/回転式インキュベーターの組み合わせでプレートに形成された(E)MCTSesウェルの6グループ間で有意差は認められませんでした。 (B)ただし、標準のインキュベータ内で定期的にふたを有するプレートは、可変サイズのMCTSesが形成されました。データは1群につきn>は60 MCTSesのために示されています。箱と箱ひげ図でボックス内の水平バーは、それぞれ、25 番目と75 番目のパーセンタイル値と中央値を表します。ウィスカは5 番目と95 番目のパーセンタイルを表し、外れ値は、箱ひげ図で整列黒丸で示されています。クラスカル・ワリス分析のp値は、EACの下に提示されます時間箱ひげ図。データは、プレート蓋/インキュベーターの組み合わせごとに少なくとも3つの独立した実験からのものです。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
ルーチンの適用可能性を判断するには、7日齢MCTSesは、3つの異なる濃度でパクリタキセル(PTX)、ビンクリスチン(VCR)、オキサリプラチン(OXA)、ドキソルビシン(DOX)、および5-フルオロウラシル(5-FU)で処理しました4日間。薬は大学病院オロモウツ、パラツキー大学から入手しました。 MCTSの画像は分析された、面積、長軸と短軸、周囲、および処理されたMCTSesの堅牢性は、対照(CTL)を比較しました。長軸と短軸は、幾何学的体積を計算するために使用しました。薬物治療( 図3)後の濃度依存性のMCTS面積の減少とボリュームがありました。 0.001 / mlのVが、CRおよび0.4 / mlのDOXおよび5-FUは、MCTS面積の増大をもたらし、体積が大きく0.001 / mlのVCR以下だけ増加しました。 MCTSの周囲にのみ完全にMCTSのサイズに影響を与えPTX、DOX、及び5-FUの最高濃度で有意差がありました。 PTXおよび0.25μgの/ mLおよび0.06μgの/ mLおよびDOXおよび100μg/ mLの5-FUでVCRがMCTSes( 図3)の完全な対の部分的崩壊を示し、堅牢性の有意な減少をもたらしました。

図3:半自動化ルーチンによってMCTSesにおける薬物効果の測定。 CTLおよび薬物処理MCTSesの(A)の画像が提示されています。 =10μmのスケールバー。 / mlの中の濃度は、画像ごとに与えられています。 (B)棒グラフは、上のPTX、VCR、OXA、DOX、5-FUの用量依存効果を示します地域と治療の4日後7日齢MCTSesのボリューム。 MCTSの周囲はかなりの0.25μg/ mLのPTXおよび100μg/ mLのDOXと5-FU以下に減少しました。 MCTSesの完全なツー部分的崩壊をもたらした薬物濃度が有意CTLに比べMCTSの堅牢性を減少させました。データは3つの独立したプレートから少なくとも5 MCTSesの平均±SDです。 * P <0.001、#の P <0.01、φて p <0.05 CTL対薬物処理、Dunnettの多重比較検定で一方向ANOVA。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
著者らは、開示することは何もありません。
マイクロタイタープレートからの培地の不均一な損失は、均一な多細胞腫瘍スフェロイド形成の再現性に影響を与えます。重要な媒体の損失を低減するために培養条件を改善するスフェロイド形成の再現性及び液体オーバーレイ技術を使用して回転楕円体に基づくアッセイの結果を改善します。
この作品は、チェコ教育省、青年、およびスポーツ(LO1304)、チェコ共和国の科学技術振興機構(TE01020028)からの助成金によってサポートされていました。著者は、環境蓋の静止画を撮影するための博士ラクシュマンバラナシに感謝したいと思います。
| アガロース | シグマ アルドリッチ | A9414 | 低融点 |
| マッコイズ 5A ミディアム | シグマ アルドリッチ | M8403 | |
| インチラピッド"FiltermaxフィルターTPP | 99505 | 0.22 μm、500 mL | |
| マルチドロップ&トレード;Combi試薬ディスペンサー | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 5840300 | |
| スモールチューブディスペンシングカセット | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 24073295 | メタルチップ |
| 384ウェルTCプレート | PerkinElmer | 6057308 | プレートタイプ - CellCarrier |
| スタンダードチューブ分注カセット | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 24072670 | |
| MicroClime 環境蓋 | Labcyte | LLS-0310 | |
| DMSO | Sigma | D4540 | |
| ロータリーインキュベーター (SteriStore) | HighRes Biosolutions | 23641 | シリアル番号:D00384 |
| マイクロプレートウォッシャーディスペンサー | BioTek | 不特定の | モデル: EL406 |
| ハイコンテントイメージングシステム(CellVoyager) | 横河電機株式会社 | 詳細不明 | Model:CV7000 |
| Orange G | New England Biolabs | B7022S | |
| TrypLE™Express recombinant cell dissociation reagent | サーモフィッシャーサイエンティフィック | 12604021 | フェノールレッドフリー |