タンパク質は、多くの場合、異なる細胞機能を発揮することができ、複数のドメインを含みます。遺伝子ノックアウト(KO)は、この機能的多様性を考慮していません。ここでは、様々な機能ドメインまたはタンパク質の変異体の分子解剖を可能KO胚性幹細胞における組み換え媒介カセット交換(RMCE)ベースの構造と機能のアプローチを報告しています。
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| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| ROSALUC | 自家製 | 冷凍精子 ご要望に応じて利用可能 | |
| R26-iPSCマウス | 自家製 | 冷凍精子 ご要望に応じて利用可能 | |
| 容器プローブ | ファインサイエンスツール | 10160-13 | 交尾プラグを確認するために |
| M2 medium | Sigma-Aldrich | M7167 | アリコートを作成し、-20 °Cで保存します。C |
| ファイン鉗子 (Dumont #5 Standard tip Student Forceps) | Fine Science Tools | 11251-10 | 使用前に 70% EtOH をスプレー (オートクレーブしないでください) |
| 23 G 針 | Fine-ject | 8697 | |
| 1 mL シリンジ | Soft-ject | 6680 | |
| 60-mm バクテリア グレード プレート (フラッシング用) | ゴセリン | BB60-01 | |
| マウス | ピペット | 社内製 ディスカッションを参照 | |
| マウス胚性線維芽細胞 (MEFs, TgN (DR4)1 Jae strain) | ATTC | SCRC-1045 | |
| TgN (DR4)1 Jae マウス | ジャクソン研究所 | 3208 | |
| マイトマイシン C | Sigma-Aldrich | M0503 | |
| カルシウムまたはマグネシウムを含まないリン酸緩衝生理食塩水 (PBS) | Gibco | 14190-094 | |
| Tg(DR4)1Jae/J マウス | JAX | 3208 | マウス ネオマイシン、ピューロマイシン、ハイグロマイシン、6-チオグアニン |
| 0.1% ゼラチン | に対する耐性を付与0.5 gを500 mLの蒸留水に溶解し、オートクレーブで保存し、4°Cで保存します。 | ||
| トリプシン(0.25%) | ギブコ | 25200-056 | |
| 2 μM pluripotin | Cayman Chemical | 10009557 | |
| pRMCE-DV1 | BCCM/LMBPコレクション | BCCM/LMBPコレクション(http://bccm.belspo.be)から入手可能な | LMBP 08870 |
| cre-emlicised pRMCE-DV1 | BCCM/LMBPコレクション | BCCM/LMBPコレクションから入手可能な | LMBP 08195 |
| pCAG-FlpE-IRES-プロ-pA | Addgene | 20733 | |
| ヒートショックコンピテント DH5α バクテリア | 社内 | ||
| ゲートウェイ pDONR221 ベクター | サーモフィッシャー | 12536-017 | カナマイシン耐性遺伝子 |
| BP クローナーゼ II ミックス | サーモフィッシャー | 11789-020 | |
| LR クローナーゼ II ミックス | サーモフィッシャー | 11791-020 | |
| ルリアブロス(LB) | |||
| アンピシリン | |||
| Applied Biosystems 3730XL DNA Analyzer | Thermo Fisher | 3730XL | |
| G418 | Thermo Fisher | 11811-023 | |
| Lipofectamine 2000 トランスフェクション試薬 | Thermo Fisher | 11668027 | |
| Lipofectamine LTX トランスフェクション試薬 | Thermo Fisher | 15338100 | |
| Effectene トランスフェクション試薬 | Qiagen | 301425 | |
| GATEWAY pENTR 1A ベクター | サーモフィッシャー | A10462 | 組換え適合ベクター |
| マウスモノクローナル抗p120ctn抗体 | BDトランスダクションラボラトリーズ | 610134 | |
| マウスモノクローナル抗エカドヘリン抗体 | BDトランスダクションラボラトリ | 610181 | |
| <ストロング>ジェネラル機器<ストロング> | |||
| 滅菌解剖ツール | 子宮を解剖するための細かいハサミと鉗子 | ||
| 滅菌ピペット:5 mL、10 mL、25 mL | |||
| 15 mLおよび50 mL、円錐形遠心チューブ、 | |||
| 96ウェル培養プレート、V字型底部と平底部) | |||
| 培養皿:24ウェル、12ウェル、6ウェルマルチ | |||
| チャンネルピペット(ピペット30、50、100、200μL) | |||
| 滅菌マルチチャンネルリザーバー | |||
| 層流 | |||
| 37°Cのインキュベーターへのアクセス。5%CO<サブ>2 | |||
| C逆さま顕微鏡 | |||
| ベンチトップ遠心分離機 | |||
| 透過光付き実体顕微鏡へのアクセス | |||
| Culture Media< | |||
| strong>MEF Medium | 4°Cで保管されています。C;37°Cで30分間温めます。C使用前の | ||
| ダルベッコ '修正されたイーグル」S medium (DMEM) | Gibco | 41965-062 | |
| 10% ウシ胎児血清 (FBS) | Sigma-Aldrich | F-7524 | |
| L-グルタミン (2 mM) | Gibco | 25030-024 | |
| ピルビン酸ナトリウム (0.4 mM) | ギブコ | 11360-039 | |
| ペニシリン (100 U/mL) | Gibco | 15140-122 | |
| ストレプトマイシン(100 µg/mL) | ギブコ | 15140-122 | |
| SRベースのmESC中 | 4°Cで保存。C;37°Cで30分間温めます。使用前のC | ||
| DMEM/F12 | Gibco | 31330-038 | 1:1 の比率で混合 |
| 15% ノックアウト血清補充 (SR) | Gibco | 10828–028 | |
| L-グルタミン (2 mM) | Gibco | 25030-024 | |
| 0.1 mM 非必須アミノ酸 | Gibco | 11140-050 | |
| ペニシリン (100 U/mL) | Gibco | 15140-122 | |
| ストレプトマイシン(100 µg/mL) | ギブコ | 15140-122 | |
| &β;-メルカプトエタノール(0.1 mM) | シグマ・アルドリッチ | M 3148 | |
| 2,000 U/mL 組換えマウス LIF | (IRC/VIB Protein Service facility) | ||
| FBS ベースの mESC 培地 (SR ベースの mESC 培地と同様) | 4°Cで保存;C;37°Cで30分間温めます。C 使用前の | ||
| C ノックアウト DMEM | Gibco | 10829-018 | |
| 15% FBS | Hyclone | SH30070.03E | |
| Differention Medium | °C;37°Cで30分間温めます。C | ||
| IscoveのModified Dulbecco's Medium(IMDM) | Gibco | 21980-032 | |
| 15% FBS | Hyclone | SH30070.03E | |
| 5% CD ハイブリドーマ ミディアム(1x) リキッド | ギブコ | 11279-023 | |
| 2 mM L-グルタミン | Gibco | 25030-024 | |
| 0.4 mM 1-チオグリセロール | Sigma-Aldrich | M-6145 | |
| 50 μg/mL アスコルビン酸 | Sigma-Aldrich | A-4544 | |
| ペニシリン (100 U/mL) | Gibco | 15140-122 | |
| ストレプトマイシン(100 µg/mL) | ギブコ | 15140-122 | |
| 2i | |||
| 1 μM Erk阻害剤 PD0325901 | 軸索 Medchem | Axon 1408 | |
| 3 μM Gsk3阻害剤 CHIR99021 | Axon Medchem | Axon 1386 |
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