このプロトコルでは、シロイヌナズナの花と siliques、いくつかの基本的な清算のテクニックの適切な解剖のためのテクニックの説明し、生殖構造の観察を全取り付ける染色を選択しました。
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このプロトコルでは、シロイヌナズナの花と siliques、いくつかの基本的な清算のテクニックの適切な解剖のためのテクニックの説明し、生殖構造の観察を全取り付ける染色を選択しました。
分子遺伝学的研究の素晴らしいツールによるシロイヌナズナは植物生物学で、特に、植物生殖生物学の最も著名なモデル種の一つです。ただし、植物形態学的、解剖学的、および微細構造分析時間のかかる埋め込み、明視野、スキャン、および電子顕微鏡のための手続の区分を含む伝統的。最低限の処理のホール マウント標本に使用される分子技術の継続的な改良、新式の 3次元計算機援用微視的解析、共焦点蛍光顕微鏡の最近の進歩の需要の増加につながっています。効率的かつ最小限のサンプル処理技術を開発します。このプロトコルでは正しく解剖シロイヌナズナの花や siliques、基本的な技術をクリアするための手法について述べるとのいくつかの汚損プロシージャ全体マウント生殖構造の観察。
花は最も重要な被子植物の器官を定義しています。顕花植物登場いくつかの 9000 万年前1、急速な外見だったチャールズ ・ ダーウィン2「忌まわしい謎」として記載されて、非常に高速の多様化。花の開発の植物研究者の関心は多様であります。いくつかの研究は、全体または花3,4,5,6 の特定の解剖学的、構造的・機能的特性の進化として花の進化的起源を理解することに焦点を当ててください。.フローラル フォームの構造と、それらに依存する性および無性生殖様式の高い変化は花に非常に複雑な構造を作る。これは遺伝学的および分子調査7と組み合わせることができる光と電子顕微鏡技術を使用して花の器官の解剖学と構造機能を特徴付けるため多様な活動につながっています。さらに果実や種子のソースとして、花は人間および動物栄養物のため非常に重要です。したがって、花とフルーツの開発の特性、応用研究、増え人口と変化する環境8下で生態系保全戦略のための食料安全保障を含む多くの影響,9,10。
シロイヌナズナの花の開発には花成誘導と花序 (花のグループ) の分裂組織に植物の分裂組織の変容が始まります。花原基は、花序メリステム11の側面に横方向に開始されます。花の器官原基の花の中心に外から同心円状の渦巻き状に徐々 に形し、がく片、花びら、雄しべ、心皮の7に最終的に開発。これらの花器を果たす個別栄養、保護、および機能 (例えば、送粉者魅力) オスとメスの配偶体、それぞれ12の発達を支える性的器官との異なる植物の役割,13配偶体、ターンでは、それぞれを区別する男性 (精子) のペアと雌性の配偶子 (卵と中央のセル) に結合する二重次世代、受精と一次胚乳を形成する受精ターミナル組織支援、。胚14,15の開発。果実や種子の開発は、成長、成熟および胚と、最終的には、その分散の保全をサポートします。シロイヌナズナ7,16,17モデル種を中心に、多様な植物の花と胚の開発を特徴付ける広範な研究を行った。
花の開発の初期の顕微鏡分析は時間のかかるサンプル加工、パラフィンまたは樹脂埋め込み断面などの手法は組み合わせて光または電子顕微鏡の観察に基づいていた。これらの伝統的な顕微鏡の技術は蛋白質の免疫検出の in situハイブリダイゼーションによる RNA の局在や突然変異体の顕微鏡分析などの分子遺伝の調査との組み合わせでよく使用されました。最新の 3次元コンピューター支援画像解析と最低限の処理のホール マウント標本で使用できる分子の方法の継続的な改良の広視野および共焦点蛍光顕微鏡の最近の進歩の必要性をもたらした優先的に定量分析に適している効率的かつ最小限のサンプル処理技術。近年、全体マウント動物標本のクリアリングの技術の開発の重要な進歩をしました。レンダリング サンプル透明水性尿素または砂糖ベースの試薬 (例えばスケール、SeeDB、立方体) を使用して18,19、20、または後の脂質 (洗剤 SDS を使用) の選択的除去安定したゲル; に試料を埋め込む脂質の除去をすることができます受動拡散によっていずれかを達成した (例えば、変更明確プロトコル21, 協定 PARS リム22) または電気泳動 (元明確プロトコル23と法律さきがけ24) によって積極的に。この高速の進歩に励まされて、いくつかの派生技術、プラント用も浮上しています。
シロイヌナズナのモデルに焦点を当てた本のメソッドで花蕾、花、そして若い siliques の適切な郭清と全体マウント多様な染色サンプルのクリアリングの手順と観察の手順について述べる古典的なまたは最近 SDS ベースのクリア方法。澱粉、カロース、クロマチン染色の例のとおりです。ただし、これらの手順は、使用すると他の種の適応の改善とさらに必要があります、彼らは多くの研究プロジェクトの出発点は、これらの単純ですが重要なメソッドのさらなる研究のための段階を設定いただければ幸いです。
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1. 花と Silique 固定
2、実体顕微鏡下で解剖
3. 決済抱水クロラールと組み合わせたクリア染色
注: FPA50 材料を固定抱水クロラール ベース クリアするため最高の結果が得られました。
4. 結合染色アレクサンダーと葯の君の 4 クリア
注: 元のアレクサンダー ・ プロトコルは、染色する前にスライドの花粉を解放に基づいています。効率的でより有益な変更アレクサンダー染色し、プロシージャをクリアは成熟しているが非裂開葯内花粉粒の染色します。
5. 花粉から性物質が外殻を除去
注: DAPI 染色のカルノワの定着剤の使用をお勧めします。
6. ナトリウム Dodecyl 硫酸塩 (SDS) をクリア
注: によって分析される花器と非常に柔らかく、小さな検体を分析する研究者のスキル、SDS の処置でも行えます (経験者) の前にいずれかまたは解剖手順 (少ない経験の後研究者) メタノール酢酸酸材料を固定します。
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シロイヌナズナは花序 (図 1) に配置された両性花で花序を軸受、Brassicacea 家族に属しています。それぞれの花は 4 がく片、花びら、(4 つの長いおよび 2 つの短い)、六つの雄しべ、4 つの同心円状の渦巻き25,26で配置 2 先天性融合心皮 (図 1 階H) から成る syncarpous 雌ずい。シロイヌナズナは tenuinucellate、それぞれ卵巣 (45-80 胚珠の合計) の 2 つの locules の 2 つの行 (各行の 12-20 胚珠) 頭頂の胎盤に配置された倒胚珠 (未発表データおよび参照27,28,...
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シロイヌナズナ、すべて花の発達段階にまたがる単一の花序内の多くの花蕾の存在が治療や発達機能の効果を特徴を目指した研究のユニークな機会を提供しています花の開発のさまざまな段階で同時に異なる個体間の良好な基準点は主要な花序の最初の花の開いています。植物が開花が同期されているような方法で扱われる可能な (例えば、4 ° C で最大同期種子の発芽およびそれ故によりも開花 3 – 4 日) と同じ日に彼らの最初の花を開く植物のみが同じくらいトリートメントや複製; 間に配布するバッチとして撮影バッチ連続した日の準備ができては、実験を再現する使用できます。次のこの手順より堅牢な比較分析、環境と開発のバリエーション内と植物間の制御を実行できます。
最近の報告クラシック クリア ソリューションと比較してクリアのサンプルのコントラストを改善するのみならず、花と胚の開発の間にデンプンのダイナミクスを特徴付けることができました君のクリア ソリューションとルゴール染色を組み合わせて、シロイヌナズナ46. こ...
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著者が明らかに何もありません。
この作品はチューリッヒ大学 IEF マリー キュリーの助成金によって支えられた (付与なし。A. h. に TransEpigen-254797)、欧州研究評議会の高度な許可 (許可なし。U. g. に MEDEA-250358)、および SystemsX.ch、システム生物学のスイスの取り組みから研究・技術開発のプロジェクト (u. g. に MecanX グラント)。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 試薬および材料 | |||
| エタノール | シャーラウ | ET00102500 | |
| 酢酸 | Applichem | A3686,2500 | 100% 分子生物学グレード |
| 氷河酢酸 | Sigma-Aldrich | 320099 | 分子生物学グレード |
| メタノール | シャーラウ | ME03062500 | |
| ホルムアルデヒド溶液 | Sigma-Aldrich | F1635 | |
| プロピオン酸 | Sigma-Aldrich | 81910-250 ml | |
| クロラール水和物 | Sigma-Aldrich | 15307 | |
| グリセロール | ロス | 3783.1 | |
| アラビアガム | フルーカ | 51198 | |
| 乳酸 | フルーカ | 69773 | |
| フェノール | シグマ-アルドリッチ | 77607-250ML | 私たちは液体フェノールを使用しました(密度を使用して、ソリューションに必要なボリュームを見つけます) |
| クローブオイル | シグマアルドリッチ | C8392-100ML | |
| キシレン | ロス | 4436.1 | |
| ウ | フルカ | 57665 | |
| ウ化カリウム | ク | 5043 | |
| カイトグリーン | フルカ | 63160 | |
| フクシン酸 | フルーカ | 84600 | |
| オレンジ G | シグマ | 7252 | |
| ドデシル硫酸ナトリウム | シグマ アルドリッチ | L3771 | 分子生物学グレード |
| 水酸化ナトリウム | シグマ アルドリッチ | 71690 | |
| リン酸二水素ナトリウム | Applichem | A1047,1000 | |
| リン酸二塩基性ナトリウム | Sigma-Aldrich | S9763-1KG | |
| リン酸カリウム | Sigma-Aldrich | 04347 | |
| EDTA | Applichem | A2937,1000 | |
| Calcofluor | Sigma | F6259 | 蛍光増白剤 28 |
| オーラミン | クロマ | 10120 | |
| DAPI | Sigma | D9542 | 有毒 |
| Triton-X-100 | シグマ | T8787 | |
| リンブルーメル | ク | 1275MS | |
| ミディア | ムカロライナ | 19-57030 | |
| 豊富な基質 | Einheitserde | ED73 | |
| メーカーのガラス | 特定のブランドはありません | ||
| 15ミリリットルの鷹の遠心分離管VWR | 62406-200 | ||
| デュモンド鉗子 | Actimed | 0208-5SPSF-PS | |
| 鉗子 | DUMONT BIOLOGY | 0108-5 | |
| シリンジ | BD | BD Plastipak 300013 | 1 ml |
| 準備針 | BD | BD Microlance 304000 | |
| 顕微鏡スライド | Thermo Scientific | 10143562CE | カットエッジ |
| カバースリップ | Thermo Scientific | DV40008 | |
| 湿ったボックス | 湿ったペーパータオルとスライドサポートが入ったプラスチックの箱< | ||
| strong>名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
| strong>Solutions | |||
| Fixatives | |||
| Carnoy's (Farmer's) 固定液 | 無水エタノール : 氷酢酸, 3:1 (ml:ml) | ||
| メタノール/酢酸 | 50 % (v/v) メタノール, 10 % (v/v) 氷酢酸 脱イオン水 | ||
| FPA50 固定液 | ホルマリン, プロピオン酸, 50% エタノール; 5:5:90 (ml:ml:ml) | ||
| <強力>クリアリング溶液 | |||
| クロラール水和物/グリセロール | クロラール水和物:グリセロール:水、8:1:2 (g:ml:ml)。花の発育期全般に使用でき、DIC顕微鏡によるシリック発育にも使用可能です。最良の固定剤は、ホルマリンベースのFPA50 | ||
| 変性ホイヤー | ガムアラビア7.5 g、クロラール水和物100 g、グリセロール5 ml、水30 mlです。花の発育期全般に使用でき、DIC顕微鏡によるシリック発育にも使用可能です。最もよい固定剤はホルマリンによって基づくFPA50 | ||
| Herrの4½ 液体乳 | 酸、クロラール水和物、フェノールの結晶、クローブ油、キシレン; 2:2:2:1、重量によって; 2:2:2:1である。すべての花の発育段階(特に雄しべの発育)とDIC顕微鏡によるシリックの発育に使用できます。最適な固定剤は、ホルマリンベースのFPA50 | ||
| SDS/NaOH溶液 | SDSとNaOHストック溶液を1% SDS / 0.2 N NaOH(10倍希釈)に混合希釈します。花とシリックの発達段階のすべての段階に。最適な固定剤は、メタン/酢酸固定剤です。他の2つの固定剤も使用できます。カルコフロー、オーラミン、DAPI、アニリンブルー染色液と組み合わせることができます。 | ||
| SDSストック溶液 | 10%(w / v)ドデシル硫酸ナトリウム。10 gのドデシル硫酸ナトリウムを80 mlの脱イオン水に溶解し、脱イオン水で最大100 mlを作ります。 | ||
| NaOHストック溶液 | 2 N NaOH溶液:4 gのNaOHを40 mlの脱イオン水に溶解し、脱イオン水で最大100 mlを作り | ||
| 透明化と染色を組み合わせた溶液 | |||
| HerrのIKI-4½ | 標準4½(合計9 g)追加:ヨウ素100 mg、ヨウ化カリウム500 mg。この清算液は、すべての花の発育段階と、コントラストの増加またはデンプンダイナミクスの特性評価のためのシリック開発に使用できます。構造解析にはFPA50を、定量デンプン分析にはカーノイの固定液を使用します。 | ||
| アレキサンダー染色 | エタノール95%10ml、マラカイトグリーン(95%EtOH中1%)1ml、フクシン酸(ddH2O中1%)5ml、オレンジG(ddH2O中1%)0.5ml、フェノール5g、クロラール水和物5g、氷酢酸2ml、グリセロール25ml。この清算/染色は、単独で、またはHerrの4½と組み合わせて;このソリューションは、成熟した三細胞花粉粒を持つ花の花粉流産を評価するために使用できます。それは新しく研ぎ澄まされた非固定材料で使用されます。 | ||
| <強>染色液 | |||
| カルコフルーオリュール溶液 | カルコフルーオ 0.007% 水 (g:ml)。もともとは蛍光増白剤として使用されていました。細胞壁のセルロース、カルボキシル化多糖類、カロースの染色に使用できます。花粉粒のインタインを染色するためによく使われます。この溶液では、3つの固定剤すべてを使用できます。 | ||
| オーラミン溶液 | オーラミン0.01%水(g:ml)。この親油性蛍光色素は、キューティクル、クチン、エキシンなどの染色に使用できます。3つの固定剤はすべて、この溶液 | ||
| Calcofluor-Auramine混合物 | Auramine溶液:Calcofluor溶液、3:1で使用できます。両方の溶液による複合染色に使用できます。他の比率は、オーラミンに対してカルコフルーアのより小さな割合を維持してアッセイすることができる。 | ||
| DAPI溶液 | DAPI0.4 ug / ml、0.1 Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH 7)、0.1%Triton-X-100、1 mM EDTA。この溶液は、男性と女性の減数分裂中の染色体スプレッド、および任意の組織の細胞核の染色に使用できます。花粉粒の発達の研究によく使われます。Carnoy'sおよびメタノール/酢酸は、この溶液に最適な固定剤です。FPA50などのホルムアルデヒド系固定剤は、染色を妨げる可能性があります。UVでの励起と最大発光は約461nmです。 | ||
| リン酸ナトリウム緩衝液(0.1 M) | プロトン受容体:0.2 M Na2HPO4、プロトンドナー:0.2 M NaH2PO4、プロトンドナー/プロトン受容体の比率:1.364(pH 7の場合) | ||
| アニリンブルー溶液 | 0.1%(w / v)アニリンブルー、108 mM K3PO4(pH 11)、2%グリセロール。この溶液は、多くの発達段階のカロースおよびセルロースの染色に使用できます(例:オスおよびメスのテラッドへのカロース沈着、花粉管内のカロースプラグ)。UVでの励起と最大放出は約455です。また、514 nmで励起され、細胞内容物の染色のために赤色で発光します。 |
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