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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
ここでは、蛍光蛋白質、Eos、生きている動物の表現する特定の領域に紫外線暴露により光電セルを達成する方法を表示するためのプロトコルを提案する.
動物や植物の組織細胞の異なる集団で構成されます。これらの細胞と組織を維持・構築に時間をかけて対話中断されるとき病気を引き起こすことができます。科学者は、細胞のサブセットに蛍光蛋白質を表現することによって特徴とそのまま組織内でこれらの細胞の自然動態を調査するためのテクニックを開発しました。しかし、時は、実験は時単一細胞または細胞の人口のように、組織内の細胞より選択した可視化する必要があります。科学者はこれを実現し、セルの人口内の単一のセルを可視化する蛍光タンパク質の単一セルの光電を活用しています。このテクニックを示すためには、方法を示しますここをそのまま、興味の Eos を表現する細胞に UV ライトを指示するゼブラフィッシュの生活します。私たちは、どのように彼らは組織の変更を確認するそれらの photoconverted Eos+セル 24 時間後をイメージします。二つの手法: 単一セルの光電とセルの人口の photoconversions。これらの技術は、細胞間相互作用、細胞運命と分化、細胞移動、作りそれ多数の生物的質問に適用する技術を視覚化する使用できます。
複数の異なる細胞が複雑な動物や植物の組織の維持・構築に対話します。これらの細胞は、インターカ レートとティッシュの固定を必要とする高分解能顕微鏡なしの単一セルのレベルで近所の人から区別することは困難。しかし、どのようにこれらの組織フォームを理解、維持、病気になるには、組織内の単一のセルを調べることが不可欠がされて時間をかけて相互作用しています。理想的には、これらの実験は、固定する必要がなく非侵襲的な方法で組織内の単一セルのラベルを必要とします。科学者は今この作業1,2,3、4を達成するために多数の技術を開発しました。
発見とクラ ゲの緑色蛍光タンパク質 (GFP) の実装は、組織環境1の異なるセルのラベルの 1 つの刺激的なアプローチだった。細胞特異的発現プロモーターを使用して、それは遺伝子1のラベルが付いているセルのサブセットを選択することが可能です。また、GFP3,4のユーザー選択式の GFP の発現するウイルスを利用できます。GFP 発現の遺伝的媒介が; 組織における細胞のサブセットの内でユーザーが選択した式を許可しませんが、非常に便利でき、GFP のウイルス発現が有利な侵襲的です。単一細胞および複雑な組織2,でそれらの間の相互作用を視覚化することが可能なっている GFP 誘導体および Brainbow 組織内よりまばら異なる蛍光蛋白質を表現するような巧妙な技術の出現で、5します。 ただし、これらのアプローチがランダムな方法で細胞をラベルします。目的の実験には、単一細胞の可視化や実験者によって定義されているセルの人口が必要とする場合そのため制限されます。そのような実験と区別する単一のセル方式で操作できる遺伝子発現蛍光タンパク質を持っているに有利であろう他の蛍光・非蛍光性の細胞から。
この目標を達成するため、複雑な生体組織内の単一セルの細胞生物学を視覚化は、科学的なコミュニティは、異なる蛍光タンパク質6,7,8の単一セルの光電を使用します。緑から赤の蛍光状態紫外線にさらされたときに移行蛍光蛋白質 (すなわち、eos、楓等) の表現を制御する遺伝子を使用して (488 nm) 光、我々 は蛍光に分類されたからの単一のセルを区別できます。隣人6,7,8。このアプローチは、回折限界領域にレーザー スタックからライトを指示することができます私たちの共焦点の顕微鏡に接続されている装置を利用しています。この手法により、我々 はどちらか単一セルまたはユーザー定義の方法9,10,11より大きい人口ラベルできます。手法は、ウイルス ・ GFP の単一細胞注射に比べて低侵襲です。Photoconvert 末梢神経系と脊髄9,10の腹側に位置する細胞のようなより大きい人口を photoconvert 神経節内の単一細胞ことを示して我々 の概念の証拠として 11,12。彼らの動きや開発中に分化に洞察力を得るためにこれら photoconverted のセル人口 24 h 後、視覚化できます。
すべての動物の研究は、ノートルダム大聖堂機関動物ケアおよび使用委員会の大学によって承認されました。
1. ゼブラフィッシュ標本の作製
2. 顕微鏡取り付けと事前変換イメージング
3. 単一セルの光電
4. ポスト光電イメージング
組織6内の個別のセルにラベルを付けるには、蛍光タンパク質の光変換を使用できます。これを示すには、 Tg(sox10:eos)魚9 sox10の規制のシーケンス下の蛍光蛋白質 Eos を表現する使用されました。48 Tg(sox10:eos)動物 hpf が最初にマウントされていると、可能性があります任意の非特異的光電検出イメージを作成します。未変換の蛍光信号と小さな Eos photoconverted 蛍光信号が当時 Eos 視覚化 (図 10)。動物は、非固有光電は最低限確保するため暗闇の中で保たれました。その後、関心領域は、共焦点顕微鏡のセットアップを使用して紫外線にさらされました。単一セルされた紫外線暴露の結果として photoconverted であることを確認するには、photoconverted 地域にまたがる領域の z スタックしました。成功した光電と一致して、非変換 Eos 関心領域の外のほとんどの検出、photoconverted Eos 関心領域の内ではっきりと存在していた。結果のイメージは、隣国 (図 10) から間違いなくラベルは神経節内の単一セルを示しています。
この光電手法の有用性を示すためには、セルの人口も紫外線にさらされました。このパラダイムで pre 光電画像が撮影され、国連 photoconverted Eos 信号が存在しません。次に、脊髄の腹側はライン (図 11) を使用して紫外線にさらされました。成功した光電を確認するポスト光電画像が撮影され、我々 を描いた興味の線の位置で腹側脊髄細胞の Eos が photoconverted 可視化 (図 11)。非 photoconverted Eos 信号は他のすべての領域で表示されていた。この手法を拡張するには、私たち、同一の画像を取った光変換後 24 時間。これらの画像で photoconverted Eos+細胞が脊髄の背側と腹側の両方の場所 (図 12) 地域も散乱して認められました。これらのデータは記述されている10の以前として場所を背に腹側脊髄細胞が移転仮説と一致しています。一緒にこれらの 2 つの手法を示すその光電 Eos の単一のセルまたはユーザ定義の方法で組織の領域内のセルの人口を視覚化する利用することができます。これは、細胞の移動、コミュニケーション、ダイナミクスなど細胞の特性の理解に貢献しています。

図 1: キャプチャして Windows をフォーカスします。キャプチャおよびフォーカス ウィンドウ、ラボ特定「魚アブレーションにおけるチップ」ドロップ ダウン タブの場所を描いたソフトウェアのスクリーン ショット。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 2: c488 レーザー パラメーター 。C488 レーザーの特定のパラメーターを示すキャプチャ ウィンドウのスクリーン ショット。露出は 300 さんレーザー パワー 5 です。強化 75 です。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 3: 光電レーザー パラメーター 。アウトラインの特定のレーザー設定フォーカス ウィンドウの [photomanipulation] タブのスクリーン ショットは、光電に必要です。Laserstack 電源は 2 です。ダブルクリック サイズ 4 です。ラスター ブロック サイズは 1 です。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 4: 光電レーザーのパラメーターの詳細設定します。キャプチャ ウィンドウの高度なレーザー設定のスクリーン ショット。[Photomanipulation] タブでキャプチャ設定ウィンドウが開きます。ダブルクリックの繰り返しは 2 に設定されます。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 5: 事前変換パラメーターをイメージングします。フォーカスおよびキャプチャ ウィンドウのスクリーン ショット。事前変換イメージングに必要なキャプチャ ウィンドウの特定のパラメーターを強調表示します。キャプチャ設定は「魚イメージング」キャプチャ タイプの下に 3 D のボックスがチェックされます。3D キャプチャ設定が指定されています。範囲は 35、面の数は 36、ステップ サイズは 1 で、オフセットは-15。「現在位置」と「現在の周りの範囲」ボックスも選択されます。赤いボックスを参照してください。(左) キャプチャ ウィンドウで 1 つまたは複数のポイントを選択する方法、およびフォーカス ウィンドウ (右) の個々 の点を選択する方法を示しています。緑色のボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 6: 光変換ウィンドウを開くします。設定したパラメーターに従って描いたタイムラプス キャプチャ タイプのスクリーン ショットを選択します。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 7: 光変換を設定します。[円] ツール (上) と (右) に表示されるキャプチャ コントロール ウィンドウの位置を示すスクリーン ショット。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 8: 単一セルの光電。サークル光変換ツールと右クリックの使用を描いたスクリーン ショットはドロップ ダウン メニュー。「FRAP すべて地域」変換アクションは、右のドロップ ダウン メニュー内にあります。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 9: ポスト光電 c561Laser パラメーター 。C561 レーザーの特定のパラメーターを示すキャプチャ ウィンドウのスクリーン ショット。露出は、500 さんのレーザー出力は 10 です。強化 75 です。赤いボックスを参照してください。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 10: 単一セルの光電。(A). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ光電前に末梢神経系で 48 hpf 示す後根神経節での回路図と共焦点の z-予測。破線は、後根神経節脊髄エントリのおおよその位置を示して.(B). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ光電中に末梢神経系で 48 hpf 示す後根神経節での回路図と共焦点の z-予測。破線は、後根神経節脊髄エントリを示します。黄色の円は変換サイトを表し、照明ボルトは紫外線暴露を。(C). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ末梢神経系ポスト光電で 48 hpf 示す後根神経節での回路図と共焦点の z-予測。破線は、後根神経節脊髄エントリを示します。中枢神経系は中枢神経系の略と PNS は、末梢神経系 (A ~ C) の略。スケール バーでは、10 um と同じです。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 11: 脊髄のより大きい地域の光電プロシージャ。(A). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ 48 hpf 示す Opc と光電前に脊髄の腹側領域に後根神経節での回路図と共焦点の z-予測。破線は、脊髄の背側領域を示します。(B). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ 48 hpf 示す Opc と光電中に脊髄の腹側領域に後根神経節での回路図と共焦点の z-予測。黄色い線は、光変換の選択した領域を示します。破線は、脊髄の背側領域を示します。(C). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ 48 hpf 示す Opc と光電後脊髄の腹側領域に後根神経節での回路図と共焦点の z-予測。破線は、脊髄の背側領域を示しています。スケール バーでは、10 um と同じです。

図 12: 携帯電話の追跡と可視化のポスト光電。(A). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ脊髄 48 hpf 示す Opc と光電後脊髄の腹側領域に後根神経節での概略図。稲妻は、UV 光変換を示します。(B). Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュ脊髄光電以降 48 hpf 示す Opc と脊髄の腹側の地域における後根神経節での共焦点 z 予測。稲妻は、UV 光変換を示します。スケール バーでは、10 um と同じです。
著者が明らかに何もありません。
ここでは、蛍光蛋白質、Eos、生きている動物の表現する特定の領域に紫外線暴露により光電セルを達成する方法を表示するためのプロトコルを提案する.
ベルナール ・ Kulemaka とサム ・ コネルとブレント レッドフォード 3i ゼブラフィッシュ ケアのため画像の質問とデボラ ビッグバン カレン耳を傾ける、ケイ ・ スチュワートの守備のための有用なコメントと試薬指導、スミス研究室のメンバーに感謝しますこの作品は、ゼブラフィッシュ研究幹細胞のセンターとノートルダム大学とノートルダム大学で再生医療のノートルダム大学、エリザベスとマイケル ・ ギャラガー家族、アルフレッド ・ p. スローン財団、センターによって支えられました。大聖堂。すべての動物の研究は、博士コーディ スミスに IACUC ノートルダム大学に準拠して行われました。
| Tg(sox10:eos)ゼブラフィッシュの動物 | 魚は、ノートルダム大学の魚の施設から入手し、交配しました | ||
| 100 X 15 mm ペトリ皿 | VWR | 25384-302 | |
| 胚媒体 | 胚培地は毎週作られ、ノートルダム大学の魚の施設から提供され、5L RO水、30uLのメチレンブルー、200mLの塩ストックが含まれています。 | ||
| 0.8%低融点アガロース | ドットサイエンティフィックインク | 9012-36-6 | |
| 35 X 10 mmガラスカバースリップボトムペトリディッシュ | テッドペラ株式会社 | 14021-20 | |
| 針解剖プローブ | |||
| 0.002%3-アミノ安息香酸エステル(トリカイン) | フルーカ分析 | A5040-250GGFP | |
| フィルター付き蛍光解剖顕微鏡 | ZEISS Axiozoom | ||
| レーザーGFPおよびRFPフィルターセット | 3iスピニングディスク共焦点 | ||
| 光変換用UV光源(レーザー) | 405nmレーザー | ||
| スライドブックソフト | 3i | ||
| メチレンブルー | コルドン |