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方法論記事

マウス脂肪組織の採取と RNA 解析のための処理

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DOI:

10.3791/57026

2018年1月31日

この記事について

サマリー

本稿の目的は、マウスから異なる白色脂肪組織を収集、脂肪質のサンプルを処理および RNA を抽出する手順を提示することです。

要約

他の組織と比較して、白色脂肪組織は、脂質がほとんど含まれているのでは、下流用リアルタイム PCR および西部のしみなどかなり少ない RNA および蛋白質内容です。これらの脂質を避けるために余分な手順が必要と脂肪組織サンプルからの RNA の隔離も挑戦します。これらのサンプルを処理し、RNA の隔離を実行するマウスから 3 つの異なる解剖学的白色脂肪組織を集めるための手順を紹介します。さらにリアルタイム PCR を用いた cDNA や遺伝子発現実験の合成について述べる。ここに記載されているプロトコルには、動物の毛や組織コレクション中に別の脂肪パッド間の交差汚染と同様、脂肪パッド上の血からの汚染の削減ができます。また、抽出した RNA の十分な量と質を確保するため最適化されています。このプロトコル脂肪組織サンプル、リアルタイム PCR など日常の実験に必要な任意のマウスのモデルに広く応用することができますが、主な脂肪細胞培養からの分離のためのものではありません。

概要

肥満はタイプ 2 の糖尿病1などの合併症につながることが世界的に流行です。食餌誘導性肥満と遺伝子組み換え動物モデルは、肥満とその関連する合併症で研究に頻繁に使用されます。通常、白色脂肪組織は余分なエネルギーのための収納スペースとして知られている、脂質の構成は主にエネルギーに変える褐色脂肪組織熱2,3間。脂肪組織は動的と拡大し、食品の摂取量、身体活動など多くの要因によって縮小します。したがって、これらの変更に貢献の要因を決定する適切な脂肪組織の採取と処理が必要な4 です

白色脂肪組織の間で、皮下脂肪および内臓脂肪質のターミナルを解剖学的局在など異なるプロパティを持つ機能25それを一般に認められます。その結果、矛盾する結果や大規模な変動を避けるためには、注意を脂肪パッドを収集するときこれらの異なる脂肪質のターミナル間の交差汚染を避けるために取られる必要があります。

また、白いマウス脂肪組織からタンパク質や RNA を隔離するときの 3 つの主要な課題があります。まず、肥満マウスの脂肪パッドを収集....

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プロトコル

ケアの手順で使用するマウスの管理と動物保護のためのカナダの理事会によって設定実験動物の使用のための基準を遵守しました。すべてのプロシージャは、大学動物ケアとなかよし研究所利用委員会によって承認されました。

1. 剖検と男性マウス脂肪組織コレクション

  1. 研究目的に応じて実験グループを作る。本研究では採取した雄マウスの 2 つのグループから C57Bl/6 背景に (n = 12-14/グループ)。確認ここで使用されるマウス 12-15 週齢と normal (N) または (HF) の高脂肪食にアクセス 12 h 明暗サイクルに保持されている期間 10 週間11自由を水します。
  2. それが 10 分間 6% CO2にさらされている密閉されたチャンバー内でマウスを配置することによって、マウスを安楽死させます。
  3. 動物の胸骨の左側にちょうど 26 G 1/2po 針搭載 1 mL 注射器をゆっくりと挿入して動物の血液の大部分を除去するピストンをゆっくりと引いて心臓穿刺を行います。注射器が動物の体に平行であることを確認します。血液が注射器に付属していない場合は、ピストンを引きながら注射器をゆっくりと回転させます。
    注:(0.8 と 1 mL 血液量) の間成功心臓穿刺は、血と脂肪組織の汚染を減少します。

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結果

剖検手順に従って 3 つの白色脂肪組織は収集されマウス (N と HF 食飼育マウス) の 2 つのグループから加重します。予想通り、心不全の食事療法のマウスは最終的な体重と同腹子 N ダイエット (表 1) と比較して体重を増加していた。これらの観察と一緒に伴われたよりも N 食事のものと比較して肥満マウスの PGF、PRF、および SCF の体重の 2 倍増加します。

隔離された RNA で実験を実行する前にその純度は手順 4.9 を評価しました。それぞれの白色脂肪組織のフェノール溶液による RNA の隔離は RNA (表 2) の純粋として考慮される OD260/OD280 が 2.0 前後比として十分な品質でサンプルを生産しました。リアルタイム PCR のデータは、レプチン mRNA 発現も PGF、PRF、N 食事 (図 4

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ディスカッション

次 HF 食事供給、肥満マウスは体と白色脂肪組織重量 N 飼料飼育マウスと比較して増加するいると見つけられました。フェノール溶液を使用して抽出した RNA 純度の良い試料が得られました。レプチンは主に脂肪組織によって生成、アデポカイン、脂肪質量16と正の相関が知られています。予想通り、自分の脂肪の塊な肥満マウスにおけるレプチン mRNA の発現が増加しました。

このメソッドは、いくつかの重要な手順です。主要である別の 1 つの白色脂肪組織のデポの汚染さまざまな機能2,5を別の脂肪組織の拠点にいる知られています。汚染は、下流のアプリケーションで、誤解を招く結果をもたらすことができます。さらに、脂肪は、一度マウスの間に定期的かつ一貫したペースで白色脂肪組織を収集、空気との接触に乾燥する傾向があるお勧めかどうか重量は取られる必要があります。そうでなければ、脂肪パッドの総重量は正しいかもしれない。最近公開された MIQE、次の.......

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開示事項

著者が明らかに何もありません。

謝辞

この作品は、糖尿病カナダによって支えられました。

....

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材料

この記事で使用された材料の一覧
名前会社カタログ番号コメント
1 mL seringes
1X TE 溶液 (10 mM Tris-HCl および 1 mM EDTA•Na2.pH 8.0)
22 G 針
26 G 針
75% エタノール
ブロックヒーター (ドライバス)
クロロホルムシグマC2432-500mL
dATP   サーモサイエンティフィックR0141
dCTP  Thermo scientificR0151
dGTP  Thermo scientificR0161
DNase I (1 U/µl) Thermo scientificEN0521
dTTP Thermo scientificR0171
Faststart Universal SYBR green Master (Rox)Roche4913922001
Faststart universal SYBR green master (Rox) fluorescent dye ロシュ4913914001
フィルターチップ
鉗子 InstrumentariumHB275
ガーゼ
ハンマー
高脂肪げっ歯類ダイエットBio-Serv、フレンチタウン、ニュージャージーF3282
イソプロパノール ラボラトリー MATIH-0101
レプチン フォワード PCR プライマー (5'-GGGCTTCACCCCATTCTGA-3') 10 uM
レプチン リバース PCR プライマー (5'-GGCTATCTGCAGCACATTTTG-3') 10 uM
液体窒素
Maxima 逆転写酵素 (酵素および 5x バッファー)Thermo scientificEP0742
ナノ純水(超純水と呼ばれる)
ニトリル検査用手袋
ニトリル手袋
通常のげっ歯類の食事Harlan Laboratories, Madison, WIHarlan 2018
P1000 pipetman
P2 pipetman
P20ピペットマン
P200ピペットマン
フェノール溶液(トリゾール) アンビオンライフテクノロジーズ15598018
事前に識別されたアルミホイ
クォーツ分光光度計
PCRチューブストリップ
RT-PCRチューブストリップ
ランダムヘキサマー Invitrogen58875
リアルタイム PCR ローター遺伝子システム Corbett researchRG-3000 Rotor-Gene サーマルサイクラー
冷蔵ベンチトップ遠心分離機
RiboLock RNase Inhibitor Thermo scientificEO0381
RNase-free 1.5 mL eppendorf tubes
RNase-free 1.5 mL スクリューキャップチューブ
PCR チューブストリップ (0.2 mL) &
HycloneSH30538.02
RT-PCR machineQiagenRotor-Gene Corbett 3000
RT-PCR チューブストリップ (0.1 mL) とキャップ
S16 フォワード PCR プライマー (5'-ATCTCAAAGGCCCTGGTAGC-3') 10 uM
S16 リバース PCR プライマー (5'ACAAAGGTAAACCCCGATCG-3')10 uM
分光光度計BiochromUltrospec 3100 pro
ステンレス鋼の乳鉢と乳棒
手術用パッドホームは使い捨ての吸収性アンダーパッド
外科用ハサミ Intrumentarium130.450.11
サーマルサイクラー
サーマルサイクラー BiometraThermocycler
Vortex mixer
計量スパチュラ
州ル 用ラック用ラック RNase-free で包まれた発泡スチロール板を作りました

参考文献

  1. Guh, D. P., et al. The incidence of co-morbidities related to obesity and overweight: a systematic review and meta-analysis. BMC. Public Health. 9, 88(2009).
  2. Wronska, A., Kmiec, Z. Structural and biochemic....

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再版と許可

タグ

RNA PCR