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Research Article
Andrea Soto-Padilla1,2, Rick Ruijsink3, Mark Span4, Hedderik van Rijn*4, Jean-Christophe Billeter*1
1Groningen Institute for Evolutionary Life Sciences,University of Groningen, 2Department of Cell Biology, University of Groningen,University Medical Center Groningen, 3Ruijsink Dynamic Engineering, 4Department of Psychology,University of Groningen
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
ここで時間と空間で高速かつ正確な温度変化を生成するプログラム可能な温度制御のアリーナを使用して温度変化でショウジョウバエの歩行のパフォーマンスを自動的に決定するためのプロトコルを提案する.
温度は、種の配布および動作方法に影響を与えるユビキタス環境要因です。ショウジョウバエの種の生理的な耐性と適応性によると温度変化に対する具体的な応答があります。ショウジョウバエハエには、温度感知温度 ectotherms の処理の神経基盤を理解する基礎となっているシステムも所有しています。温度変化に個々 のはえの応答を探索する時間と空間の制御と高速高精度の温度変化を可能にする温度制御のアリーナをご紹介します。個々 のはえはアリーナに配置、設定を決定するのに同時に温度を反応規範を決定するまたは空間的分散温度で均一徐々 に増加など、事前にプログラムされた温度の課題にさらされています。個人は速度または位置の好みの定量化をできるように、自動的に追跡されます。このメソッドは、急速にショウジョウバエの温度性能曲線を決定する温度の大きい範囲または同じようなサイズの他の昆虫に応答を定量化する使用ことができます。さらに、温度の設定と変異体や野生型ハエの反応を数値化する遺伝学的研究のためこのそれを使用できます。このメソッドは、熱の種分化、適応と温度処理の背後にある神経のメカニズムの基礎を明らかに助けることができます。
温度が一定の環境要因の生物機能し、1を動作に影響を与えるです。緯度や高度の違いは、生物が、温度2,3への応答に対する進化的選択の結果にさらされている気候の種類の違いに します。4自分の特定の環境下でのパフォーマンスを最大化する形態学的、生理学的なおよび行動の適応によって異なる温度に応答する生物。例えば、ミバエショウジョウバエのさまざまな地域からの人口がある異なる温度の設定、本体サイズ、発達度、長寿、多産、歩行性能別温2 ,5,6,7。異なる起源のハエとの間観察された多様性は遺伝的変異とプラスチック遺伝子式8,9によって部分的に説明されます。同様に、さまざまな分野からショウジョウバエ種温度勾配の間で異なる配布し、極端な暑さと寒さテスト10、11,12に抵抗性の差異を表示します。
ショウジョウバエも最近温度知覚13,14,15,16,17の遺伝学的および神経の基礎を理解するための好みのモデルとなっています。成虫が温度を感知するアンテナの冷・温の周辺温度センサーと温度センサー脳13,14,,1516を通して広く、,17,18,19,20. 高温下に末梢受容器表現Gr28b.d16または発熱21周囲中冷たい受容器はBrivido14によって特徴付けられます。脳の温度はTrpA115を表現するニューロンによって処理されます。これらの経路の突然変異体の行動研究は温度の処理方法の私達の理解を改善しているし、さまざまな地域からショウジョウバエの個体数によって異なるメカニズムに洞察力を与えます。
ここで高速かつ正確な温度変化を生成する温度制御のアリーナをについて説明します。捜査済み人手を介さず標準化され、再現性のある温度を操作することができますこれらの変更プログラムできます。ハエは記録および実験の異なるフェーズでその位置と速度を決定するための特殊なソフトウェアを使用して追跡。このプロトコルで主な測定は各温度下での歩行速度である個々 の熱的適応性5を識別できる生理学的な性能の生態学的関連性の高いインデックス。温度受容体変異体と共にこの手法は細胞および生化学的レベルでの温度適応のメカニズムを明らかにすることができます。
1. はえの食糧媒体の作製
2. ハエの準備
3. ライトのフレーム
4. 低温アリーナ
5. 温度行動実験
6. ビデオ追跡とデータ解析
温度制御アリーナ (図 1 a) は温度はプログラマブル回路を個別に制御することができます銅の 3 つのタイルから成っています。各銅のタイルでは、プログラマブル回路にフィードバックを与える温度センサーを所有しています。回路は、各タイルの温度が上昇するため電源をアクティブにします。受動的な熱電変換素子は、一定の冷却ファンにより冷却ヒートシンクを提供しながら、所望の温度を維持するために一定に加熱要素として機能します。温度変化の大きさは、非線形の方法でプロセスの速度を決定します。2 の ° C の増加が必要なだけ 0.1 s、および 18 の ° C の増加が必要です 4 s。プログラマブル回路 (図 1) に接続されている画面各タイルの温度センサーで測定した温度のユーザーに通知します。銅のタイルは、常に周囲の半導体 (図 1 bと1 C) 50 ° C に加熱、アルミのリングで囲まれます。このリングは、飛ぶアリーナ (図 1)、ハエを配置する領域のエッジを形成します。飛ぶアリーナは、ハエが歩くが、飛ぶことを保障する 3 mm 高空間を提供するシリコーン ガラス カバー (図 1 a 1 C) によって覆われています。飛ぶアリーナの横にあるさまざまな実験的段階をマークするようにプログラムすることができます 2 つの赤色 Led (図 1) にあります。たとえば、図 2 aに示すように結果を得るのため、各 LED が関連付けられている異なる温度図 2 b中、各 led 60 s。FlyStepsソフトウェアを示す Led のそれぞれが上と研究者は自動的に温度や時間に基づく実験的段階を決定するこの情報を使用できます、登録できます。
温度制御されたアリーナは、動的温度変化に異なる遺伝的背景からハエの行動応答を比較する使用できます。たとえば、異なる種からハエは熱的性能の違いを比較する (図 3) の温度を徐々 に公開できます。最大のパフォーマンス、それは虫歯や、死んだ後のポイントに到達するまで温度が上昇するにつれては、すべての種の速度。しかし、それぞれの種は、最大応答速度と熱許容範囲で特定の応答曲線を持っています。以前のレポートを示しているショウジョウバエ種から発生時期、長寿、多産、ボディサイズ、性的コミュニケーション、温度耐性3,6,7 の間で異なる ,8,22。したがって、仕事のこの身体を温度勾配で種特異的な歩行の私たちの説明を追加します。
エアコンの温度に基づいて実験への応答を探索する低温アリーナを使用もできます。このアプローチの最も単純な形式は、アリーナ ウォーミング アップされる側で、他の上の 1 つの側面を回避23,24,25を好むためハエが訓練されるオペラント条件づけパラダイムです。私たちは快適な 22 ° C (図 4) で、他のタイルを残しながら中高側タイルの 1 つに 40 ° C に個々 のはえをさらされます。野生型のハエはすぐにアリーナに沿って移動を停止し、快適な場所に残った。対照的に、古典的なメモリ変異体劣等生はアリーナを探索保持し、快適な場所にコントロールよりも少ない時間を費やしています。野生型のハエのパフォーマンスと劣等生の突然変異体の違いは、すべてのタイルは 22 ° C に設定され、試験治療グループ間比較を行ったときにより大きくなった。劣等生の突然変異体はまた、野生型ハエ (図 4) と比較してトレーニングとテスト段階の大きい違いを示した。これらの結果は、快適な場所で残りのメモリの効果をお勧めします。
温度と場所の組み合わせが動的温度変更時に異なる温度受容体の機能を理解するのに役立ちます。我々 は温度上昇への個々 のショージョーバエ ・ Gr28b.dとTrpA1GAL4変異体をさらされて (2 ° C 増加すべての 60 s) 22 ° C (図 5) での快適な場所を提供しながら。快適な場所は左から右へと逆に、イテレーションごと移った。結果は、温度上昇と快適な場所により多くの時間を費やすと、周囲温度受容体Gr28b.dの変異体がコントロールとして動作することを示す.ただし、脳温度受容体TrpA1GAL4変異体は、温度上昇の影響を受けません、アリーナ内の場所を変更しないでください。増加、 TrpA1GAL4変異体のカーブの減少になる前に快適で残ったがその段階ですでに快適な場所に座っていたハエで効果を示します。ピークの整合性とTrpA1GAL4の曲線の谷これらのハエがほとんど実験; のためにまだ残っていることを示唆しています。それ故に、彼らは常に彼らの場所が快適と見なされるものを数えられました。この結論は、記録されたビデオの視覚的検査によって確認されました。以前Gr28b.d17に依存しない高速かつ大規模な変更の周囲の認識を示唆する生理学的なレポートとハエがTrpA1 に基づいて検出温度に主要な中央メカニズムを所有しているこれらの結果のサポート 14,21。

図 1: 温度制御アリーナのダイアグラム。(A) 低温アリーナの側面の景色。プログラマブル回路は、加熱要素の温度を制御する銅のタイルの下に電源供給と温度センサーを接続します。タイルは常にファンに接続されているヒートシンクを介して冷却されます。周りにタイルは、ガラスのカバーがかかっている温水アルミニウム リング。(B) 熱セット 24 の ° C (上) および 30 ° c (下) 中央のタイルで 24 ° c 側タイルでタイルを示す画像します。(C) 競技場の平面図です。カメラは銅タイル、アルミニウム リングと赤色 Led を記録し、実験段階を自動的に決定します。カメラによって記録されない、[ボックスの隅に画面には、現在のタイルの温度が表示されます。(D) 光のリング: ホワイト ペーパーで覆われた木製の箱の中の 2 つの暖かい白の LED ストリップ アリーナ全体の定数、対称性の照明を確保します。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 2: ハエは温度プロトコルを開始する前に、アリーナに順応する必要があります。(A) 単一の男性のハエはアリーナに導入され、その後温度を増やし始めた 1 分定数の 16 ° C で探検することが。(B) 16 ° C、20 ° C、または 24 ° C にさらされるハエの単一 (グループ違いはありません; 双方向分散 F (2,570) = 4.156, p = 0.162) 5 分後よりも実験の先頭に高い歩行がある (双方向 RM ANOVA F (9,570) = 7.803, p < 0.0001)。データは、平均と 20 処女雌成虫 5 〜 7 日古い複数日にわたるテストの平均値 (± SEM) の標準誤差です。印は群間で有意差 (* * * p < 0.0001;テューキーの多重比較検定、p = 0.05)。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 3: 移動徐々 に温度にさらされる 5ショウジョウバエ属.温帯 (青)、熱帯 (赤) から個々 の男性が飛んできて、コスモポリタン (ブラウン)ショウジョウバエ種が増加する温度勾配にさらされた (2 ° C 毎の 60 s) 16 ~ 46 ° C最初の 7 分は 22 ° C でアリーナを探索するハエを許可するように常にだった。種が大幅に異なる (双方向 RM 分散 F(4,70) = p < 0.001 28.46)。(a)キイロショウジョウバエ(茶色; 円をいっぱい) は速く、アリーナに導入されました。(b) d. 町役場(赤; 空の正方形) 増加する温度と高速だった。(c) D. クニガミサンショウズル(茶色; 塗りつぶされた正方形) はその時点で最大のパフォーマンスの他の国際的なハエよりも遅くなります。(d) d. 菌(茶色; 空の円) + キイロショウジョウバエの最大の時点で崩壊だった。各ポイントは、15 男性ハエ 5 〜 7 日古い数日テストの平均値 (± SEM) を表します。意義が記号で示さ (♦ すべて、p < 0.0001; から違いを = †ショージョーバエ ・以外のすべての違いを = p < 0.0001; •ショージョーバエ ・から違いを = p < 0.01; ¢ショージョーバエ ・ p から違いを = <0.001;= p < 0.0001; 名前付きグループの違いテューキーの多重比較検定、p = 0.05)。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 4: 温度制御されたアリーナはオペラント条件づけに使用できます。ショージョーバエ ・カントン S ひずみ (野生型; 黒ボーダー) dnc1 (劣等生; 赤い境界線) 変異体 (トレーニング、いや 4 分の 40 ° C に真ん中を温暖化後、反対側のタイル 22 ° C で横タイルを好む訓練を受けていたとパターン)。加熱された領域のメモリが 22 ° C (テスト; グリッド パターン) にすべてのタイルを設定することによってテストされます。ハエは、実験の半分に左上のタイルそして他の半分の右側のタイルを好む完備でした。パフォーマンスを比較するトレーニングとテスト中の 22 ° C でタイルの内部時間の合計の割合を測定しました。グループが大幅に異なる (一方通行 ANOVA F(3,76) = p < 0.0001 23.23)、劣等生を全面的に行って野生型よりも悪いと。データは、平均値 (± SEM) 20 処女雌成虫 5 〜 7 日古い数日テストのです。グループ間の差を示すアスタリスク (* * * p > 0.0001; * * * p > 0.001; * * p > 0.01;テューキーの多重比較検定、p = 0.05)この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。

図 5: 温度変異体の快適な場所を提供するとき温度の上昇に対する応答。温度変異体Gr28b.d (グリーン; 正方形) 対応コントロール (w1118黒; 円) 温度上昇として快適なエリアでの時間の割合を増やすことによって (双方向 RM ANOVA F (1,38) 0.5107、p = = 0.479)。TrpA1GAL4変異体 (黄色; 三角形) は、温度が上がるにつれて快適なエリアで時間が増加しないコントロール (w1118黒) と異なる (双方向 RM ANOVA F (1,38) 1.670、p = = 0.019)。データは、20 男性のハエ 5 〜 7 日古い数日テストの平均値 (± SEM) です。TrpA1GAL4とは大きく異なるGr28b.dと制御 (p < 0.05;テューキーの多重比較検定、p = 0.05)。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
著者は、彼らは競合する金銭的な利益があることを宣言します。
ここで時間と空間で高速かつ正確な温度変化を生成するプログラム可能な温度制御のアリーナを使用して温度変化でショウジョウバエの歩行のパフォーマンスを自動的に決定するためのプロトコルを提案する.
この作品に支えられ一部奨学金行動とフローニンゲン大学と国立ナシオナル デ サイエンス y メキシコからテクノロジー (CONACyT) から大学院奨学金の認知神経科学プログラムから付与されたアンドレアソト-padilla さん、Hedderik ・ ファン ・ レインとジャン-クリストフ ・ Billeter に与えられる時間の調査のためのジョン ・ テンプルトン財団からの助成金。FlyStepsラッカーの開発の彼の参加のためピーター ゲリット Bosma に感謝しております。
補足情報として、以下の一時、公開リンクでスクリプトTemperaturePhases、FlySteps、およびFlyStepAnalysisを見つけることができます。
https://dataverse.nl/privateurl.xhtml?token=c70159ad-4d92-443d-8946-974140d2cb78
| Arduino | によるArduino | のA000062 | ソフトウェアRUG |
| エレクトロニクスボード | Ruijsinkダイナミックエンジニアリング | FF-Main-02-2014 | |
| 電源ブースト | XP-パワー48。V 65 W | ECS65US48 | 53 ボルトに設定 |
| 電源タイル暖房 | XP-Power 15.V 80 W | VFT80US15 | |
| 電源冷却 | XP-Power 15.V 130 W | ECS130U515 | |
| ペルチェ素子 | マーローインダストリー | ズRC12-4 | 2 素子、制御された DC フィード |
| ヒートシンク | フィッシャーテクニック | LA 9/150-230V | 振動のために分離 |
| 温度センサー | 測定の専門分野 | MCD_10K3MCD1 マイクロサーミスタプローブ | |
| 銅ブロック/タイル | Ruijsink ダイナミックエンジニアリング | FF-CB-01-2014 | |
| Auminumリング | Ruijsinkダイナミックエンジニアリング | FF-RoF-02-2015 | |
| サ4104ホワイトテープ25 x 66 mm | RSコンポーネント | 111-2300 | 白色導電性テープ |
| 赤色LED | ラッキーライト | ll-583vc2c-v1-4da | 波長 625 nm、20 mAmp、6 V 温 |
| 白色LEDストリップ | Ledstripkoning | HQ-3528-SMD | 60 LEDs/メートル |
| スイッチ電源 | 汎用 | T-36-12 | |
| Logitech c920 | Logitech Europe S.A | PN960-001055 | |
| QuickTimeプレーヤー | アップルコンピュータ | 録音プログラム | |
| トラッキング解析ソフトウェア | R | パッケージ: pacman | |
| トラッキング解析ソフトウェア | MATLAB | ||
| サーマルイメージング | FLIR T400sc | ||
| グラフと統計ソフトウェア | グラフパッド プリズム | ||
| Sigmacote | Sigma-Aldrich | SL2-100ML | シリコン化剤 |
| フライ飼育ボトル | フライスタッフ | 32-130 | 6オンス ショウジョウバエストックボトル |
| フライパッド | フライスタッフ | 59-114 | |
| フライ飼育バイアル | ドミニク・ダッチャー | 789008 | ショウジョウバエチューブ 狭い 25x95 mm |
| インキュベーター | 三洋 | MIR-154 | |
| 磁気ホットプレート | ハイドルフ | 505-20000-00 | MR ヘイスタンダード |
| 寒天 | 培地カルディック 成分B.V.さん | 010001.26.0 | |
| グルコース | Gezond&wel | 1019155 | デキストロース/Druivensuiker |
| ショ糖 | Van Gilse | グラ | ニュー糖 |
| コーンミール | フライスタッフ | 62-100 | |
| 小麦胚芽 | Gezond&wel | 1017683 | |
| 大豆粉 | フライスタッフ | 62-115 | |
| 糖蜜 | フライスタッフ | 62-117 | |
| 活性ドライイースト | レッドスター | ||
| テゴセプト | フライスタッフ | 20-258 | 100% |