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Research Article
Viviana Zlochiver*1, Stacie L. Kroboth*1, Christopher R. Beal1, Jonathan A. Cook1, Rosy Joshi-Mukherjee1,2,3
1Aurora Research Institute,Advocate Aurora Health Care, 2Department of Biomedical Engineering, College of Engineering and Applied Science,University of Wisconsin-Milwaukee, 3Department of Medicine-Cardiovascular, School of Medicine,Johns Hopkins University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
本稿では、マルチウェルMEAプレート上で培養されたヒト誘導多能性幹細胞由来心筋細胞(hiPSC-CM)ネットワークの開発のためのプロトコルのセットを含み、作用電位測定のために細胞膜を可逆的に電気ポレートする。ハイスループットの記録は、同じセルサイトから何日も繰り返し取得されます。
心臓の安全性スクリーニングは、創薬および治療にとって最も重要です。したがって、効率的な薬物検査には、hiPSC由来心筋細胞(hiPSC-CM)製剤に対する新しいハイスループット電気生理学的アプローチの開発が非常に必要とされている。多電極アレイ(MEA)は、興奮性細胞のフィールド電位測定に頻繁に使用されていますが、Joshi-Mukherjeeたちは、再発作用ポテンシャル(AP)記録への応用を説明し、検証した最近の出版物です。何日も同じhiPSC-CMの準備から。ここでの目的は、高精度と1 μsの時間分解能で電気ポレーションを介してAP波形を測定するための詳細なステップバイステップの方法を提供することです。このアプローチは、信頼性の高い電気生理学的調査のためのハイスループットAP測定のための細胞内アクセスを得るために使いやすい方法論の欠如に対処します。マルチウェルMEAプレート上のhiPSC-PMのメッキの詳細な作業フローと方法は、必要に確かな場合は重要なステップを強調して議論されます。さらに、迅速なデータ処理、抽出、解析を行うためのカスタム構築されたMATLABスクリプトを報告し、さまざまなAPデュレーションパラメータに関する形態の微妙な違いを定量化するために波形解析を包括的に調査します。不整脈と心毒性。
ヒト誘導多能性幹細胞由来心筋細胞(hiPSC-PM)は、研究室1、2、3、4、5、6の増加する数のゴールドスタンダードです。 ,7,8,9,10.胚体11、12、13および単層3、7、10、11、12を打ち負かす13、14、15、16、17の分化は心筋細胞産生の好ましい方法であり、多電極アレイ(MEA)は一般的なモダリティとなっているこれらのネットワークの電気力学を監視するための18,19,20.打率、振幅、持続時間、RR間隔などのフィールド電位(GP)から抽出できるパラメータは、単層18、21を自発的に打ち負かすベースライン電気生理学的応答である一方、 22,23, これらの細胞外FP信号の基礎となる作用電位(AP)成分は、24を外挿することは困難である。直接再発AP測定のためのMEAの応用の発見に関する最近の出版物は、複数の再偏光段階で広範な波形解析を用いる例示的な細胞内AP読み出しの方法論の証明を提供するhiPSC由来心筋細胞ネットワーク3のバッチ。今回の研究では、hiPSC由来心筋細胞のネットワークへの電気刺激パルスの送達により、AP記録に対する細胞内アクセスが可能であることを実証した。これらの一時的なAP記録は、傷害部位3、25、26を通して観察される膜電位回復に依存する。本研究では、MEAとパッチクランプを介して記録された波形は、アプローチ3の信頼性を検証する同様のAP形態を示した。
いくつかの研究室は、カスタム構築されたMEA18、21、26、27、28、29を使用して、様々な電気原性細胞からのAPを測定すると報告しています。 30が、一貫性のある繰り返しAP測定のためにMEAを使用する信頼性は評価されなかった。現在、ゴールドスタンダードパッチクランプ技術は端末記録7、31に限定されていますが、MEAベースのAP測定値は一時的であるため、同じセル上で複数回行うことができます。また、最小限のフィルタリングを必要とするミリボルト範囲で高品質のAP信号を簡単に記録できることも示しています。したがって、研究者は、MEAを使用して同じ製剤で急性だけでなく慢性薬物研究を行うことができます。不整脈予測と薬物関連の心毒性に重点が置かれていることを考えると、24,32,33,34,35, AP測定の統合薬剤の安全性と有効性の評価を強化します。
ここでは、1)成熟のための凍結保存されたhiPSC-CMのプリメッキ、2)マルチウェルMEA上のhiPSC-CMの解離とめっき、3)hiPSC-CMネットワークからのGPとAPの記録、4)分析のためのデータのセグメント化と抽出、および5)のためのプロトコルを提示します。複数の再利用のために配列を復元します。各ステップは、重要なステップを重視して最適化されています。細胞の付着要件について、拍動同期単層を確保するための要件について議論し、反復的な電気生理学的研究のためのマルチウェルMEA修復の手順について説明する。最後に、AP信号抽出、品質保証、セグメンテーションワークフロー用にラボで開発されたカスタムGUIを提示し、APパラメータを定量化および分析します。
1. ソリューション・材料の作成(資料表参照)
2. 成熟のための凍結保存hiPSC-CMのプレメッキ(図1)
注:このセクションは、フィーダーフリー単層法3、16を用いて分化したhiPSC-PMを解凍および培養し、1〜200万個の細胞/バイアルで10日間分化後液体窒素で凍結保存することを目的としています。1つのバイアルからの細胞は、6ウェル組織培養プレートの2つの基板被覆井戸にめっきされる。心筋細胞はチューブの底部に定着する傾向があるので、プレメッキ時の穏やかな混合は、ウェル全体の細胞密度を達成するために重要です。
3. マルチウェルMEAプレート殺菌とコーティング(図2、図3)
注:ここで説明するプロトコルは、hiPSC-CMメッキ用のガラス上に12マイクロゴールドPEDOTコーティングされた電極を備えた24ウェルMEAプレートを準備するためのものです。電極に損傷を与える可能性があるため、プレートの底面に触れないようにしてください。
4. マルチウェルMEAプレート上のhiPSC-CM解離とめっき(図3)
注:MEAフィブロネクチンインキュベーションが完了する前に、約1時間前にこのステップを開始します。細胞解離液が37°Cで、iPSC-CM解凍媒体が室温であることを確認します。解離方法は、基板コーティングされた6ウェルプレート(ステップ2参照)で培養された分化後30日間最適化され、MEAめっきに対して約90%の実行可能なMSを得ています。細胞死を防ぐためにトリチュレーション中に気泡を導入しないように注意する必要があります。
5. hiPSC-CMエレクトロポレーションと信号集録(図4~6)
注:このプロトコルは、ハイスループット電極信号(24ウェルのそれぞれに対して12箇所)の同時記録用です。24 ウェル マルチウェル MEA システムは、取得ソフトウェアと共に使用されます (材料の表を参照)。すべてのMEAの記録は37 °Cで行われる。
6.再利用のためのマルチウェルMEAプレートクリーニング
7. データファイルの変換とエクスポート
注: MWR、MWC、MWD、MWS ファイルの 4 つのデータ ファイルが記録ごとに生成されます。コンバータソフトウェアを使用すると、MWDファイルをH5ファイルに変換して、カスタム構築されたスクリプトを使用して後続の分析を行うことができます(補足ファイル1を参照)。
8. データセグメンテーションと分析(図8-10)
注:Matlabベースのカスタムソフトウェアは、様々なFPおよびAPデータパラメータをセグメント化し、抽出するために使用されます。ソフトウェアはオンデマンドで利用できます。
解凍後のhiPSC-PMの生存率とめっき密度は、マルチウェルMEA培養に不可欠です。1-200万のhiPSC-CM/バイアルを50%以上の生存率を持つ6ウェル組織培養プレートの2つのウェルにプレメッキを施すと、48時間で自発的な打撃を受けた健全な単層培養が生まれます。非筋細胞集団。マルチウェルMEAめっきのために解離した場合、これらの単層は一般的に一貫性のない結果と悪い品質信号を生成するため、廃棄する必要があります。図1は、48時間ポストメッキにおける最適なhiPSC-C培養の例を示す。マルチウェルMEA上で直接ではなく、基板コーティングされた組織培養プレート上のMSを解凍すると、細胞回収および成熟3を可能にする。アレイ上の凍結保存されたSIMの直接めっきは、一貫性のない結果を生み出すのでお勧めしません。
解離されたCMの品質に加えて、マルチウェルMEA上の細胞アタッチメントは、細胞密度およびフィブロネクチンコーティング技術に大きく依存する。フィブロネクチン滴の大きさは、MSがフィブロネクチン被覆領域の境界に準拠するので重要です。このため、フィブロネクチン溶液の5μLのみが電極アレイ領域上に直接分配される。液滴が分散しないようにするには、コーティング時に井戸表面が完全に乾燥している必要があります。図2は、最適な調製のためのステップバイステップ前処理の回路図を用いたマルチウェルMEAプレートのレイアウトを示しています。さらに、フィブロネクチンがマルチウェルMEAプレートを乾燥させないようにするには、3時間以下のインキュベーション期間中に加湿室内に配置する必要があります(ステップ3.8参照)。インキュベーション期間が完了したら、CMメッキの直前に各ウェルからフィブロネクチン液滴を除去し、次のウェルメッキに進む方が重要です。MSの迅速かつ慎重な分配作業は、セルの接続を成功させる鍵です。
30日後分化におけるhiPSC-CM培養物は、酵素細胞解離法を用いてマルチウェルMEAめっきに対して解離される(ステップ4参照)。MSはフィブロネクチンコーティングされたMEA表面に3時間ずつ取り付け、アレイを覆う単層は24時間後のメッキ後に見える(図3)。単層の同期拍動は24〜48時間で観察され、細胞液滴分散は培養密度に影響を与えるか、あるいは乾燥および細胞死につながる。配列上の正確な細胞配置は最も重要であるため、最適なめっきのためにこの技術を実践する必要があります。参照電極への細胞接着は、電気信号の製造を妨げる。最適な CM 配置の画像と 24 時間後の培養の画像については、図 3を参照してください。
マルチウェルMEAで培養されたSIMは、48時間ポストメッキで電気的活動の品質チェックを受けます。通常、FP信号振幅は、約4日3日でμV範囲からmVに増加する。ネットワーク内の電極の 50% とネットワーク全体の 70% が FP 信号を生成しない場合、ネットワークまたはカルチャは最適ではないため、廃棄する必要があります。FP および AP 解析では、品質チェックに合格したカルチャのみが処理されます。図6は、良好およびサブ標準FP信号の例を示す。
エレクトロポレーション媒介AP記録は、培養物48hポストMEAメッキから複数回得ることができる。エレクトロポレーションを用いて、複数のhiPSC由来心筋細胞ネットワークから高解像度APを記録する細胞内アクセスを得た。30秒の低電圧パルス(1V、1ms、1 Hz)を、FPからAPへの可逆的な変換のために送達した。エレクトロポレーションにより、電極の約75%でAP測定に成功した細胞内アクセスが可能です。電気信号は、30sのプレエレクトロポレーション、30sの間に、1分のポストエレクトロポレーションを含む2分間記録されます。10 s AP 波形 10 s ポストエレクトロポレーションの列車は、信号品質と解析のためにすべてのサイトで評価されます。純粋な AP 信号に準拠していないトレースは破棄されます。AP振幅がFP信号に相関しているかどうかを調べるために、全288箇所を電光して波形を同時に記録した。2つの異なる電極から同じ細胞部位から記録された代表的なFPおよびAP信号を図11Aに示す。同じ細胞部位から記録されたFP振幅とポストエレクトロポレーションAP振幅との間に相関関係は認められなかった。さらに、0、24、48、72および96 hにおける同じ細胞部位の複数のエレクトロポレーションは、時間の経過とともにAP形状に有意な影響を及ぼさなかった(図11B)。
システムのハイスループットの性質を考えると、RR間隔、瞬間周波数、差動作用の潜在的な持続時間などの対象パラメータを抽出および定量する手動技術は非効率的で時間がかかります。要求ありの場合に研究コミュニティが利用できるカスタム構築されたMATLABスクリプトを使用して、1 μsの解像度で波形測定を行います。エレクトロポレーションタイムポイントは、信号抽出、品質保証、セグメンテーションワークフローを行うためのAPポストエレクトロポレーションの10sを識別するために抽出された信号と重ね合わせています(図8、図9、図)。 10)ユーザーインターフェイスはガイドとして重ね合わされたエレクトロポレーションの表示器を使用して目的の区間の選択を可能にする。セグメント化された波形は、個々のAP波形をさらに識別するためにサブルーチンによって処理されます。これはピーク検出によって完了し、サイクルごとに最高電圧と最低電圧が特定されます。このプロセスが完了すると、振幅が正規化され、関連付け時間ベクトルがシフトされ、ピーク値 1 で時間ゼロが定義されます。個々のサイクルに沿った交差点の補間を使用して、APD 測定値を決定しました。したがって、AP波形セグメンテーションの部分自動化ワークフローにより、短時間で複数のカルチャバッチにわたるさまざまな APD パラメータの効率的なデータ分析が可能になります。リアルタイムのデータ分析のために、GPとAPの包含基準と除外基準のさらなる自動化が進行中です。
マルチウェルMEAプレートの大きな利点は、複数回再利用できることです。この復元により、費用対効果の高い一貫したデータ収集のための反復的な電気生理学的研究が可能になります。6 つの復元後の同じアレイからの AP の記録を図 12に示します。信号対雑音比は、複数の再利用で同様です。反復的な電気生理学的研究のための配列の信頼性を実証するために、合計3815 AP波形が3つの復元バッチからプールされ、AP持続時間データが抽出され、結果の再現性を調べます。個々の波形APD 30、APD80、三角測量(APD80~APD30)および分数短縮((APD80~APD30)/(APD80))の分布プロットが表示されます(図13)。

図1:成熟のための凍結保存されたhiPSC-CMのプレメッキ。(A) 10日間の予備めっき1バイアルの細胞処理は、分化後10日間のバイアルを凍結保存し、(B)位相コントラスト画像の成功(左)と失敗(右)hiPSC培養物を使用する。スケールバー:275 μm。14 日と 24 日後の分化後のカルチャの例については、ビデオ 1およびビデオ 2を参照してください。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図2:マルチウェルMEAプレートのセットアップと準備。(A) マルチウェルMEAプレート回路図:プレートは、それぞれ12マイクロ電極アレイと4つの周辺参照電極を含む24ウェル(A1~D6)で構成されています。電極直径:30 μm/電極間距離:300 μm.記録は288個の電極から同時に得ることができます。(B) hiPSC-CMめっき前に行う殺菌および親水性処理工程。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図3:マルチウェルMEAプレート上のhiPSC-CM解離およびめっき。(A) 各ウェルのhiPSC-CM MEAメッキステップの回路図。(B)4参照電極に広がることなく全12極を覆う正しい細胞液滴配置を示す顕微鏡画像。(C) 位相コントラスト顕微鏡画像の例示的な(左)と最適でない(右)hiPSC-CMめっきは、24時間後めっきでMEAに置き換えます。スケールバー= 275 μm。MEA めっきの成功例については、ビデオ 3を参照してください。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 4: マルチウェルスクリーン取得ソフトウェア。矢印は、テキストで参照される主要な機能の位置を示します: 温度制御 (1) パネルは、実験全体を通してリアルタイムの温度監視を可能にします。挿入/取り出し(2)ボタンは、マルチウェルMEAプレートをエンゲージして離します。実験フロー(3)機能を定義すると、ユーザーは記録の継続時間を設定することができます。データ集録設定(4)機能により、サンプリングレートと集録フィルタ設定を設定できます。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 5:ハイプシ-CMエレクトロポレーションと信号集録.刺激定義タブはユーザーが電気ポレーションの脈拍変数を定義することを可能にする。刺激電極タブは、ユーザーが電極電極を選択することを可能にする。288の電極の任意の組合せは選ぶことができる。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図6:電気活動のためのマルチウェルMEAの品質チェック。マルチウェル- 最適(A)およびサブスタンダード(B)FP信号の代表的な例を持つ生データウィンドウを示す画面集録ソフトウェア。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 7: 新しいアレイと復元されたアレイからの FP 信号と AP 信号。マルチウェルMEA酵素洗浄ステップ(A)。新しいアレイのベースライン信号は、ノイズ比(B)に対する最小信号を示し、FP信号はネットワークの電気的活動を示します(C)。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 8: データのセグメンテーションと分析。波形解析のためのGUIのメインウィンドウのビュー。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 9: データのセグメンテーションと分析。ウェーブフォームボタンを初期化して、セグメンテーション用のAP波形を識別して抽出し、対象となるアクションの潜在的な領域をズームインして選択して予備処理を開始します。赤い円はエレクトロポレーションインジケータです。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 10: データのセグメンテーションと分析。すべての波形に対してピーク(赤い'x')と谷(黄色の円)が検出され、正規化されたAPは波形の品質チェックのために重ね合わされます。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図11:同じセルサイトからの複数の記録に対するFP信号へのAP振幅依存。2つの独立した電極から記録されたμV範囲(A、左上パネル)またはmV範囲(A、右上パネル)のFP振幅は、FP振幅とFP振幅との間に相関関係を示さないmV範囲(A、左下パネル)でAP振幅を生成し、ポストエレクトロポレーション AP 振幅。各記録の正規化された AP 波形は、各記録に示すように重ね合わされます。0~96時間の同じ細胞部位の複数のエレクトロポレーションにより、膜電気力学(B)の追跡を可能にする高品質のAP波形が生成された。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 12: 6 回の復元後の AP 録画。同時に記録されたAP波形は、同じウェルから12の電極にわたって10sポストエレクトロポレーションが表示されます。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図 13: 複数の復元からの APD パラメータヒストグラム。個々の波形 APD30 (A)、APD80 (B)、三角測量 (APD80—APD30)(C) および小数短さ ((APD80—APD30)/(APD80)の分布プロット)(D)が表示されます。この図のより大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
補足ファイル。ビデオ 1-3.このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
著者は何も開示していない。
本稿では、マルチウェルMEAプレート上で培養されたヒト誘導多能性幹細胞由来心筋細胞(hiPSC-CM)ネットワークの開発のためのプロトコルのセットを含み、作用電位測定のために細胞膜を可逆的に電気ポレートする。ハイスループットの記録は、同じセルサイトから何日も繰り返し取得されます。
なし
| Accutase | Sigma Aldrich | A6964-100ML | 細胞解離ソリューション |
| アクイジションソフトウェア | マルチチャンネルシステム | マルチウェルスクリーン v 1.9.2.0 | |
| B27 サプリメント | ThermoFisher | 17504-044 | CM メディアサプリメント |
| コンバーターソフトウェア | マルチチャンネルシステム | マルチチャンネル DataManager | |
| DMEM/F12 | サーモフィッシャー | 11330-032 | |
| D-PBS | サーモフィッシャー | 14190-250 | |
| FBS | フィッシャー サイエンティフィック | SH3007103HI | |
| フィブロネクチン | シグマ アルドリッチ | F1141-5MG | |
| ゲルトレックス | サーモフィッシャー | A1413202 | コーティング基板 |
| インターフェースボード | マルチチャンネルシステム | MCS-IFB 3.0 マルチブートインターフェースボード | |
| マルチウェル MEA プレート | マルチチャンネルシステム | 24W300/30G-288 | |
| RPMI 1640 | サーモフィッシャー | 11875-093 | CM ベース ミディアム |
| テルガザイム | シグマ アルドリッチ | Z273287-1EA | 酵素洗剤 |
| トランスファーピペット、個別包装 | フィッシャーサイエンティフィック | 1371148 | |
| トリパンブルー | シグマ アルドリッチ | T8154-100ML | |
| 超純滅菌水 | サーモフィッシャー | 10977-023 | |
| 6ウェル組織培養処理プレート | フィッシャーサイエンティフィック | 08-772-1B |