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Research Article
Alicia Masters1,2, Minjeong Kang1,3,4, Morgan McCaw1,3, Jacob D. Zobrist1,3,5, William Gordon-Kamm2, Todd Jones2, Kan Wang1,3
1Department of Agronomy,Iowa State University, 2Department of Applied Science and Technology,Corteva Agriscience, 3Crop Bioengineering Center,Iowa State University, 4Interdepartmental Plant Biology Major,Iowa State University, 5Interdepartmental Genetics and Genomics Major,Iowa State University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
植物形態素遺伝子は、再生成遺伝型の遺伝子変換を改善するために使用することができる。ここに記載されているのは、3つの重要な公共トウモロコシ近交線のためのアグロバクテリウム媒介遺伝形質転換(QuickCorn)プロトコルである。
ここで実証されたアグロバクテリウム媒介性遺伝子の近交線の形態形成遺伝子ベビーブーム(Bbm)とWuschel2(Wus2)を使用した間近線の詳細なプロトコルである。Bbmは、トウモロコシリン脂質トランスファーゼ遺伝子(Pltp)プロモーターによって調節され、Wus2はトウモロコシオーキシン誘導性(Axig1)プロモーターの制御下にある。これらの形態形成遺伝子を移動DNA(T-DNA)に搭載するアグロバクテリウム株とアグロバクテリウム病原(vir)遺伝子の余分なコピーは、未熟な胚のトウモロコシに感染するために使用されます。体細胞性胚は、感染した胚のスキューテラ上に形成され、除草剤耐性によって選択され、植物に発芽することができる。DNAコンストラクトに組み込まれた熱活性化cre/loxP組換えシステムにより、形質転換プロセスの初期段階でトウモロコシゲノムから形態素遺伝子を除去することができます。このプロトコルを使用して、W22、B73、Mo17に対して、約14%、4%、および4%(感染した100個の感染した胚当たりの独立したトランスジェニック事象の数)の変換頻度をそれぞれ達成することができる。
形質転換は、トウモロコシの外来遺伝子発現を評価し、研究と商業目的の両方で遺伝子組み換えトウモロコシラインを生産するための基本的なツールです。高スループット変換へのアクセスは、トウモロコシ分子および細胞生物学研究の必要性の増加を促進することができます1.作物種を遺伝的に変換する能力は、公立および民間の両方の研究所にとって不可欠です。これにより、遺伝子調節メカニズムの基本的な理解と、増え続ける人口を支える地球規模での作物改善の両方が可能になります。
トウモロコシからの未熟な胚が生殖可能なカルスの産生に使用できるという発見は、1975年2年に始まった。この啓示以来、ほとんどのスケーラブルなトウモロコシ変換プロトコルは、再生3の前にカルスの形成と選択を必要としてきました。遺伝的形質転換の過程で、アグロバクテリウム感染または生物的爆撃を受けた未熟胚は、胚発生カルス誘導のために培地上で培養される。誘発されたカリは、選択的培地(例えば、除草剤を含む)で培養され、変換されたカルス片だけが生き残ることができるようになる。これらの除草剤耐性推定トランスジェニックカリは、増量され、植物に再生されます。この方法は有効ですが、プロセスは長く、労働集約的であり、4を完了するのに3ヶ月以上かかることがあります。さらに重要なことに、従来のトウモロコシ変換プロトコルははるかに大きな制限を有し、すなわち、限られた数のトウモロコシ遺伝子型のみが5,6に変換できる。
Lowe et al.7,8は、変換プロセスの期間を大幅に短縮するだけでなく、変換可能な遺伝子型のリストを拡張した "QuickCorn" 変換方法を以前に報告しました。クイックコーン法は、赤対数転写因子ベビーブーム(BBM)9およびWUS(WUS)10のトウモロコシオルソログ(Zm-BbmおよびZm-Wus2)を利用する。形質転換ベクター系に組み込まれると、これらの遺伝子は、胚発生成長を刺激するために相乗的に働く7。
この作品で説明したQuickCornプロトコルはジョーンズら11のプロトコルに基づいており、Lowe etal7,8によって報告された方法のさらなる改善であった。本研究では、バイナリベクトル構造PHP81430(図1)とアクセサリープラスミドPHP7153912を有するアグロバクテリウム株LBA4404(Thy-)を変換に使用している。PHP81430のT-DNAには、以下の分子成分が含まれています。(1)形質転換選択的マーカー遺伝子Hra発現カセット。このトウモロコシのフラ(Zm-Hra)遺伝子は、スルホニル尿素およびイミダゾリノン類などのALS阻害除草剤に耐性のあるアセトルラクターゼ(ALS)遺伝子を13、14に変更した。Zm-Hra遺伝子はソルガムALSプロモーター8およびジャガイモプロテイナーゼ阻害剤II(ピンII)ターミネータ15によって調節される。T-DNAには、(2)形質スクリーンマーカー遺伝子ZsGreenを有する発現カセットも含まれる。この緑色蛍光タンパク質遺伝子ZsGreenはゾアンサスspサンゴ礁16から、ソルガムユビキチンプロモーター/イントロンおよび米ユビキチンターミネーターによって調節される。
また、T-DNAには(3)形態素性遺伝子Bbm発現カセットが含まれる。Bbmは、胚発生9、17に関連する転写因子である。Bbmは、トウモロコシリン脂質トランスファーーゼタンパク質(Pltp)プロモーター8および米T28ターミネーター18によって調節される。Zm−Pltpは、胚スキュテラー上皮、絹毛、および葉子会社細胞(ガード細胞に隣接する)において強い発現を有する遺伝子であり、生殖器官における低発現、および根8における発現がない。また、(4)形態素遺伝子Wus2発現カセットを含有する。Wus2は、尖部メリステム19の維持に関連する別の転写因子である。Zm-Wus2は、トウモロコシオーキシン誘導性プロモーター(Zm-Axig1)20およびトウモロコシIn2-1ターミネーター21の制御下にある。最後に、T-DNAは(5)cre-loxP再結合系を含む。 また、cre recombinase遺伝子22は、トウモロコシ熱ショックタンパク質17.7(Hsp17.7)23プロモーター及びポテトピンIIターミネーターの制御下にある。2つのloxP部位(同じ向き)24はZsGreen、cre、BbmおよびWus2を含む4つの遺伝子発現カセットを隣接する。
形態形成遺伝子の存在は植物の成熟とその後の子孫には望まれていないため、熱誘発性cre-loxP組み換えシステムがT-DNAに組み込まれ、正常なカルスの再生と植物の発達を可能にするためにトウモロコシゲノムから形態形成遺伝子を除去しました。熱処理の際、CREタンパク質の発現は、Hra選択遺伝子を除くすべての遺伝子のトランス遺伝子を除去する。成功した形質転換体は除草剤耐性であるべきであるが、ZsGreen-陰性である。形質転換頻度をさらに高めるために、アグロバクテリウム株はまた、アグロバクテリウム病原(vir)遺伝子12の余分なコピーを有する追加の付属プラスミド(PHP71539)を収容する。
QuickCornメソッドは、変換中にカルス誘導ステップを伴わないため、従来のトウモロコシ変換プロトコルとは異なります。アグロバクテリウム感染後の最初の週に、体細胞胚は感染した未熟な胚のスキュテーラー上皮に発生する。その後、胚は胚の成熟と芽形成を促すホルモンを持つ培地に移される。体細胞胚を急速に成熟/撃つ形成媒体に移すため、トウモロコシの形質転換に以前に使用されていた伝統的なカルス段階をスキップし、T0植物8の直接生成を可能にする。以前に公開されたトウモロコシ変換法6と比較して、QuickCorn法はより速く、より効率的で、より少ない遺伝子型依存である。この方法を使用して、根付いた植物は、通常、従来のプロトコルで必要とされる3ヶ月以上ではなく、わずか5〜7週間で土壌に移す準備ができています。この記事の目的は、この方法の詳細な説明とデモンストレーションを提供し、ほとんどの学術機関で一般的に見られる実験室の設定で簡単に複製できるようにすることです。
1. 成長メディアの準備
2. ドナー植物の成長と未熟な耳の収穫
3. アグロバクテリウム懸濁液培養の感染準備
注: PHP81430 (図 1)と PHP7153912を含むアグロバクテリウム株 LBA4404(Thy-) は、グリセロールストックとして -80 °C で保存されます。これらの材料は、物質移転契約を通じてコルテバ・アグリサイエンスから得ることができます。LBA4404(Thy-)は、成長培地に供給されるチミジンを必要とする栄養性株です。オーキソトロフアグロ株の主な有用性は、バイオ封じ込めの目的のためである。それは、アグロの過剰増殖を減らす追加の利点を持っています。栄養栄養性アグロ株は、補助チミジンなしでは成長しません。それにもかかわらず、チミジンは(おそらく)培養中の植物組織を死ぬことによって供給することができる。従って、栄養性アグロを完全に制御するために培地中に抗生物質を提供する必要が依然として存在する。しかし、チミジンの不在時に栄養圧性株の成長が損なわれるため、制御が容易になる。
4. 胚の解剖、感染、共培養
5. 選択、熱処理、再生
温室への移植とT1種子の生産
ここで実証されたのは、トウモロコシ遺伝学の分野で重要であった3つの公共トウモロコシ近交系(B73、Mo17、およびW22)のアグロバクテリウム媒介遺伝変換のためのステップバイステップのプロトコルです。3つの近親線の変換は、従来のトウモロコシ変換プロトコル5を使用して達成できませんでした。図1と図2は、ここで使用される構成材料と出発材料をそれぞれ示しています。耳は一般的に受粉後9-12日後に収穫される。1.5 ~ 2.0 mm の範囲の長さの IZ は、このプロトコルの変換に最適なエクスプラントです (図 2)。
感染から8日後、ZsGreen-発現体細胞胚を蛍光顕微鏡のGFPチャネルで可視化した(図3)。感染したIZEsは、感染後8日後に熱処理を行った(ステップ5.1および5.2)。この治療は、2つのロクスプ部位の間に挟まれたBbm、Wus2、cre、及びZsGreen発現カセットを摘出するCREリコンビナーゼの発現を誘導した(図1)。 熱処理された組織は、形態素遺伝子除去後の形質転換組織の選択のために除草剤イマザピルを含む芽形成培地上で培養した。
イマザピルに耐性であった成熟胚または芽を有する増殖組織は、感染後3〜4週間前後で観察された(図4)。いくつかのイマザピル耐性組織はZsGreenに対して陰性であり、これらの組織でcre-媒介切除が起こりそうな可能性が示唆されている(図4)。組織を発根培地と光インキュベーションに移動した後、撃ち子が発達し始めた(図5)。よく発達した根を持つ健康で活発な成長の芽を収穫した(図5)。いくつかの組織は、複数の芽を持っているように見えました (図 5E,F,G).このタイプの「草むし」再生は、同一の遺伝子導入パターンを有するクローン植物に起因し得る。これらの植物を遺伝子型化するには分子生物学的分析が必要である。
3つのパブリック近親交配ラインはすべて、このプロトコルとこの作業で使用される構造を使用してうまく反応しました。W22は、イマザピル耐性芽の最も高い頻度を産生し、頻度は約14%(感染した100個の未熟胚あたり約14個のトランスジェニック芽)を有する。B73とMo17の両方が約4%のトランスジェニック芽を生成しました。これらの周波数は、形態形成遺伝子を運ぶ植物とCRE媒介性切除によって除去された形態形成遺伝子を有する植物の両方を含むすべてのトランスジェニック芽を示す。

図1:バイナリプラスミドPHP81430のT-DNA領域の概略図RB = 右 T-DNA 境界;loxP = CREリコンビナーゼターゲットサイト;Axig1プロ:Wus2 = トウモロコシオーキシン誘導プロモーター (Zm-Axig1) + Zm-Wus2 + トウモロコシIn2-1ターミネーター;Pltpプロ:Zm-Bbm = トウモロコシリン脂質トランスファーゼタンパク質 (Zm-Pltp) プロモーター + Zm-Bbm + 米T28ターミネーター (Os-T28);Hsppro:cre = トウモロコシ熱ショックタンパク質 17.7 プロモーター (Zm-Hsp17.7) + cre recombinase遺伝子 + ポテトプロテイナーゼ阻害剤 II (pinII) ターミネーター;ウビプロ:ZsGreen = ソルガムユビキチンプロモーター/イントロン (Sb-Ubi) + 緑色蛍光タンパク質ZsGreen遺伝子 + 米ユビキチンターミネーター (オス-Ubi);フラカセット = ソルガムアセトルラクターゼ合成酵素 (Sb-Als) プロモーター + トウモロコシフラ (Zm-Hra) 遺伝子 + pinIIターミネーター;LB = 左 T-DNA 境界;colE1,プラスミドの複製起源 ColE125;スペックR=菌選択のためのTn21からのスペクチノマイシン耐性遺伝子aadA1 26;Rep A,B,C =アグロバクテリウム・リゾゲネス27のpRiA4からの複製起源.この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図2:出発資料B73耳は12日後の受粉後に収穫しました (A).B73 (B) 、 Mo17 (C) 、 W22 (D) の未熟な胚この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図3:感染後1週間の安静培地の組織発達胚(感染後8日)を蛍光顕微鏡下で(GFPフィルター)、Mo17(A)およびW22(B)の体細胞胚を発現するGFPを示す。明視野下で組織(B73)を開発する(C)およびGFPフィルター(D)。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図4:選択を伴う成熟培地の組織の発達W22成熟プレート (A)明視野(B)およびGFPフィルター(C)の下で組織(Mo17、感染後15日間)を発症する。明視野(D)およびGFPフィルター(E)の下で組織(Mo17、感染後28日間)を発症する。矢印は、GFP発現を欠いている組織を再生することを指し、熱誘発CREタンパク質活性の後のloxP部位間のZsGreen遺伝子の切除を示唆している。この図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。

図5:根付きメディアの組織の発達W22 (A) 、 B73 (B) 、および Mo17 (C,D) のシュートB73 (E) と W22 (F,G) の複数のシュート (草の再生) を伴うイベント。B73(H)と W22 (I) のルーツを持つシュートこの図の大きなバージョンを表示するには、ここをクリックしてください。
表 1: トウモロコシ変換のためのメディアコンポジションこの表を表示するには、ここをクリックしてください (右クリックしてダウンロードしてください)。
アリシア・マスターズ、ウィリアム・ゴードン・カム、トッド・ジョーンズは、この記事で使用されているB73、Mo17、およびW22のプロトコルとトウモロコシの耳を提供したコルテバ・アグリサイエンスの従業員です。著者のミンジョン・カン、モーガン・マッコー、ジェイコブ・ゾブリスト、カン・ワンは何も開示していない。
植物形態素遺伝子は、再生成遺伝型の遺伝子変換を改善するために使用することができる。ここに記載されているのは、3つの重要な公共トウモロコシ近交線のためのアグロバクテリウム媒介遺伝形質転換(QuickCorn)プロトコルである。
私たちは、トウモロコシの未熟な耳を提供してくれたコルテバ温室チーム、メディアを作るための支援を提供するためのコルテバメディア準備ラボ、アグロバクテリウム構造の助けを求めてコルテバからニンワン、アイオワ州立大学のキューサブ・リーに支援を提供してくれたことに感謝します。このプロジェクトは、国立科学財団植物ゲノム研究プログラムがK.W.に1725122と1917138を与え、予測植物フェノミクス研究研修プログラム(国立科学財団グラントDGE-1545453)からJ.Z #IOW04341.に部分的に支援されました。
| 2,4-D | ミリポアシグマ | D7299 | |
| 6-ベンジルアミノプリン(BAP) | ミリポアシグマ | B3408 | |
| アセトシリンゴンミリ | ポアシグマ | D134406 | |
| 寒天 | ミリポアシグマ | A7921 | |
| アルミホイル | フラ | スコを覆うために | |
| アンモニウムミリ | ポアシグマ | A4418 | |
| 分析天びん | 少量の化学物質を計量するには | ||
| Autocalve | Primus (ネブラスカ州オマハ) | PSS5-K | オートクレーブ培地とツールへ |
| 細菌培養ループ (10 µl) | フィッシャーサイエンティフィ | ック22-363-597 | は、プレートからアグロバクテリウムを収集して液体 |
| バクトアガル | BDバイオサイエンス | 214030 | |
| カー(1 L、2 L、4 L) | メディアベノミルミリポアシグマ#45339 | ||
| 白剤(8.25%次亜塩素酸ナトリウム) | クロロックス | 種子滅菌 | |
| ホウ酸 | ミリポアシグマ | B6768 | |
| 塩化カルシウム二水和物 | ミリポアシグマ | C7902 | |
| カルベニシリン | ミリポアシグマ | C3416 | |
| カゼイン加水分解物 | フィトテック | C184 | |
| セフォタキシム | フィトテック | C380 | |
| コニカルチューブ (50 mL) | フィッシャーサイエンティフィ | ック06-443-19 | 液体媒体と農業懸濁液を含む |
| キュベット(セミマイクロ) | フィッシャー科学 | 14955127 | OD測定用液体を保持するため |
| Dicamba | Phytotech | D159 | |
| デジタル湿度計 | 熱処理のための温度と湿度の確認 | ||
| EDTA、二ナトリウム塩、二水和 | 物ミリポアシグマ | 324503 | |
| エッペンドルフチューブ(2.0mL) | ThermoFischer Scientific | AM12475 | |
| Eriksson's Vitamins | Phytotech | E330 | 1000x in liquid |
| Ethanol (70%) | 滅菌ツールと表面 | ||
| 硫酸第一鉄 七水和物 | Millipore Sigma | F8263 | |
| 肥料、Osmocote Plus 15-9-12 | ICL 特殊肥料 (オハイオ州ダブリン) | A903206 | 肥料 |
| フラスコ(2 L) | Pyrex | 10-090E | オートクレーブ媒体および用具 |
| フラット(標準1020、穴、11 "W x 21.37 " L x 2.44 "D) | Hummert International(アースシティ、ミズーリ州) | 11300000 | トレイ土とポットインサートを保持するために、Humidome |
| 鉗子(細い先端と大きい) | 胚の取り扱いに適しており、大きな植物材料には大きく、イヤーホルダー | ||
| として使用しますゲンタマイシン | ゴールド | バイオテクノロジーG-400 | |
| ガラス瓶(1 L) | パイレックス | 06-414-1D | オートクレーブ媒体に |
| メスシリンダー | メディア | のボリュームを調整するには | |
| イマザピル | ミリポアシグマ | 37877 | |
| インキュベーター、20°;C | Percival Scientific | Model I-36NL | アグロ感染インキュベーター中に母板を成長させ、胚をインキュベートするには |
| 、27°C;C | Percival Scientific | Model I-36NL | 共同栽培プレートとトウモロコシ胚培養 |
| インキュベーターを育てるには、45°C;C | ヒートショック治療 | ||
| インサート TO スタンダード、ポット | ハマート インターナショナル (アース シティ、ミズーリ州) | 11030000 | 根付く植物から土壌への移植用、フラットフィット、ヒュミドーム |
| 層流フード | 無菌状態を維持 | ||
| L-プロリン | フィトテック | P698 | |
| 硫酸マグネシウム 七水和物 | ミリポア シグマ | M1880 | |
| トウモロコシ近交系種子 B73 | 米国国立植物 生殖形質 | id=47638 | |
| トウモロコシ近交系種子 Mo17 | 米国国立植物 生殖形質 | id=15785 | |
| トウモロコシ近交系種子 W22 | 米国国立植物 生殖形質 | id=61755 | |
| 硫酸マンガン一水和物 | ミリポアシグマ | M7899 | |
| Milli-Q 浄水システム | ミリポアシグマ | MILLIQ | 組織培養グレードの水用 |
| MS 基礎培地 | ミリポアシグマ | M5519 | |
| MS 基礎塩混合物 | ミリポアシグマ | M5524 | |
| N6 基礎塩混合物 | ミリポアシグマ | C1416 | |
| ペーパークリップ、滑り | 止め | タッセルバッグに保持 | |
| ペプトン | BD バイオサイエンス | 211677 | |
| ペトリ皿(100x15 mm) | フィッシャー科学 | FB0875713 | 細菌培養培地用 |
| ペトリ皿(100x25 mm) | フィッシャー科学 | FB0875711 | 植物組織培養培地 |
| 用pHメーター | フィッシャー科学 | AB150 | 培地のpHを調整するピ |
| ペット(1 mL) | ThermoFischer Scientific | 4641100N | |
| プラスチックボックス | コンテナストア | 10048430 | 組織培養の保存とインキュベーション用 |
| プラスチック humidy dome (Humi-Dome) | Hummert International (Earth City, Mo) | 14385100 | フラット |
| ヨウ化カリウム | ミリポア シグマ | 793582 | |
| 硝酸カリウム | ミリポア Σ | P8291 | |
| リン酸カリウム 一塩基性 | ミリポアSigma | P5655スケール | |
| メディア用化学物質の計量 | |||
| メスブレード(No.11、4 cm) | Thermo Scientific | 3120030 | 胚解剖用のカーネルクラウンの上部を取り外す |
| メスのハンドル メスの刃 | を保持する | ||
| シェンク&ヒルデブラントビタミン(S&Hビタミン) | Phytotech | S826 | 100xパウダー |
| はさみ | カッティングイヤーシュート | ||
| バッグ(キャンバスバック-半透明) | Seedburo(Des Plaines、IL) | S26 | 耳を覆う半透明バッグ |
| 硝酸銀 | ミリポアシグマ | S7276 | |
| リブデン酸ナトリウム二水和 | 物ミリポアシグマ | M1651 | |
| Soiless substrate LC1 | SunGro Horticulture (Agawam, Ma) | #521 | For growing maize plants |
| へら (Double Ended Micro-Tapered) | Fischer Scientific | 2140110 | 穀粒から胚を解剖 |
| へら (スプーン付き) | Fisher scientific | 14-375-10 | 培地用化学物質の測定 |
| Spectinomycin | Millipore Sigma | S4014 | |
| 分光光度計 (Genesys 10S UV-Vis) | Thermo Scientific | 840-300000 | 農業懸濁液の外径を測定 |
| 攪拌バー | フィッシャーサイエンティフィック | 14-513-67 | メディアを混合するには |
| 攪拌ホットプレート | メディアを混合するには | ||
| シリンジ(針なし、60 mL) | フィッシャーサイエンティフィ | ック14-823-43 | フィルター滅菌用 |
| シリンジフィルター(0.22 & マイクロ;m) | フィッシャーサイエンティフィック | 09-720-004 | フィルター滅菌用 |
| タッセルバッグ(キャンバスバックブラウン) | Seedburo(イリノイ州デプレインズ) | T514 | 非トランスジェニック植物の房を覆うバッグタ |
| ッセルバッグ(キャンバスバックグリーンストライプ) | Seedburo(イリノイ州デスプレインズ) | T514G | トランスジェニック植物のタッセルを覆うバッグ |
| チアミンHCl | フィトテック | T390 | |
| Thidiazuron | Phytotech | T888 | |
| Thymidine | Millipore Sigma | T1895 | |
| Timentin | Phytotech | T869 | |
| Tween 20 | Fisher Scientific | Cas #9005-64-5 | 界面活性剤 |
| Vortex Genie 2 | Scientific Industries | SI0236 | 液体を均質化します(農業懸濁液) |
| ウォーターバス(大 - 精密モデル186) | フィッシャーサイエンティフィ | ックは、4 + 2Lフラスコに適合し、55°に達することができるもの。C | オートクレーブされた培地を最適な温度に保ちます |
| 計量皿 | フィッシャーサイエンティフィック | 08-732-112 | メディア用化学物質を測定するには |
| 計量紙 | フィッシャーサイエンティフィック | 09-898-12A | メディア用化学薬品を測定するには |
| 酵母エキス | フィッシャーサイエンティフィ | ックBP14222 | |
| ゼアチン | ミリポアシグマ | Z0164 |