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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
ここでは、ラットのサイズと重量の増加に対応するためにマウスウォーカー装置を再設計することによって構築されたラットウォーカーシステムについて説明します。このシステムは、フラストレーション全反射(FTIR)、高速ビデオキャプチャ、およびオープンアクセス分析ソフトウェアを使用して、歩行パラメータを追跡および定量化します。
パーキンソン病(PD)は、黒質緻密症におけるドーパミン作動性(DA)ニューロンの喪失によって引き起こされる進行性の神経変性疾患です。腕の振りの減少、歩行速度の低下、歩数の短縮などの歩行異常は、PD患者によく見られ、病気の経過の初期に現れます。したがって、PDの動物モデルにおける運動パターンの定量化は、疾患経過中および治療中の表現型の特徴付けにとって重要になります。PDのほとんどの症例は特発性です。しかし、PDの遺伝型を同定したところ、ミトコンドリアの品質管理に関与する2つのタンパク質であるPink1とParkinの機能喪失変異などの遺伝子変異と変異体が明らかになり、動物モデルの作成に利用できるようになりました。マウスはPink1およびParkinの喪失(単一および複合欠失)による神経変性に耐性があるが、ラットでは、Pink1はパーキン欠損ではないが、黒質DAニューロン喪失および運動障害を引き起こす。ここでは、Pink1ノックアウト(KO)ラットで以前に報告された後肢の引きずりを特徴とする、Pink1とParkinの複合喪失を伴う自由に歩く若い(生後2か月)オスラットの歩行変化を明らかにするためのFTIRイメージングの有用性を報告します。
最も一般的な加齢性神経変性運動障害であるPDは、黒質緻密症におけるDAニューロンの喪失によって引き起こされます。この黒質DAニューロンの喪失と線条体へのDA入力は、PD 1,2の患者に見られる観察された運動機能障害につながります。パーキンソニズムと総称されるPD患者の定義運動特性には、硬直、安静時振戦、運動緩慢、姿勢不安定性、および顕微鏡写真が含まれます3。さらに、PD患者によく見られる歩行障害は、疾患の経過の初期に現れます1,4,5。健康的な食事や定期的な運動など、PDの進行を遅らせるのに役立つ特定のライフスタイルが提案されていますが、現在、PDの治療法はなく、症状を管理するための薬しかありません。これは、治療法の改善を期待して、さらなる調査の必要性の余地を残しています。したがって、PD動物モデルにおける歩行パターンの特性評価は、モデルの関連性と、PDを制御することを目的とした治療的治療が運動障害をどのように予防または改善しているかを特徴付けるための重要なツールです。
治療法の試験に使用されているさまざまなPD動物モデルがありますが、それぞれに限界があります。たとえば、神経毒1-メチル-4-フェニル-1,2,3,6-テトラヒドロピリジン(MPTP)で治療された動物モデルは、黒質DAニューロンの喪失とその後の線条体適応に重要なプロセスに関する豊富な情報をもたらし、PD病因におけるミトコンドリアの役割を指摘しました。しかしながら、MPTPモデルの病因的背景は、ヒトPD6のような神経変性過程ではなく毒性の性質のものである。追加の化学的に誘導可能なモデルには、6-ヒドロキシドーパミン(6-OHDA)およびロテノンが含まれる。6-OHDAは、DAニューロンに薬物を選択的に蓄積することによってPDを誘導するために使用された最初の薬剤であり、最終的にはニューロンを殺し、PDのような症状を引き起こします。このモデルは、アンフェタミンとアポモルヒネ7に応答した挙動を調べることにより、DA枯渇の追跡に最初に使用されました。このPD誘導法は、DAおよびその受容体に影響を与える薬理学的物質のスクリーニングに有用であることが証明されています8。6-OHDAモデルは、定量化可能な運動障害を追跡するための優れたモデルですが、このモデルは、ニューロンの段階的な喪失とレビー小体の形成が動物にどのように影響するかを示していません。他の誘導方法であるロテノンは、チロシンヒドロキシラーゼとDAトランスポーターの喪失を伴う黒質線条体ニューロンの進行性変性を有することが示されており、ニューロンの喪失を経時的に追跡するためのより良いモデルを可能にする9。ロテノン処理ラットは、運動緩慢、姿勢不安定、および不安定な歩行を示しました10。しかし、この方法はラットの異なる系統間で大きく変動することが見出されており、ロテノンが信頼できるPDモデルであるかどうか疑問を投げかけている11、12、13。歩行解析はラットにおけるPDの誘導によって影響を受けることが示されているが、これまで、遺伝的に誘導されたPDラットモデルは、滑走路を自由に歩くことによる歩行解析に容易に使用されていない。
自由に歩くげっ歯類の運動障害を分析する1つの方法は、FTIRイメージングを利用して実行できる運動学的歩行分析です。この確立された方法は、FTIRに基づく光学式タッチセンサを使用し、滑走路14,15,16を下る齧歯類の足跡を記録および追跡する。他の方法と比較して、FTIRは足跡を妨げる可能性のある動物の体のマーカーに依存しません。ビデオデータの生成により、4つの手足すべてのデジタル足跡が生成され、それを組み合わせて、さまざまなげっ歯類モデルの動的で再現可能な歩行パターンを作成できます。画像ベースの歩行分析の原理は、個々の足を取り、げっ歯類が滑走路を歩くときの経時的な接触面積を測定することです。各スタンスは、足面積の増加(制動段階)と足面積の減少(推進段階)で表されます。これは、足の信号が検出されないスイングフェーズによって進行します。ビデオの評価後、野生型(WT)モデルとPDモデルを比較するために使用できるいくつかのパラメータが生成されます。パラメータの例としては、ステップ長(足が1ステップでカバーする距離)、スイング持続時間(足が滑走路に接触していない時間)、スイング速度(スイング時間の関数としてのステップ長)、およびステップパターン(斜めのステップ、横方向のステップ、またはガードルステップ)があります。
ラットの初期の歩行パターンの変化を明らかにするためのFTIRの有用性を実証するために、PDの遺伝子ラットモデルを使用しました。PDのほとんどの症例は特発性ですが。PDの遺伝型を同定すると、ミトコンドリアの品質管理に関与する2つのタンパク質であるPink1とParkinの機能喪失変異などの遺伝子変異と変異が明らかになり17、動物モデルの作成に利用できる可能性があります18。残念ながら、マウスはこれらのタンパク質(単一および複合)が失われると神経変性に耐性があります19,20,21。ラットでは、パーキン欠損ではなくPink1は、黒質DAニューロン喪失および運動障害22をもたらすが、完全な浸透性はない。したがって、Pink1 / Parkinダブルノックアウト(DKO)ラットを組み合わせたモデルを生成し、オスのPink1 KOラット22で報告された明白な視覚的に明らかな後肢ドラッグ表現型を表示しますが、現在はより高い率で示されています:100%対4〜6か月のオスの30〜50%。
この方法はマウス14の運動障害を分析するのにうまく機能しますが、ラットのサイズと体重に対応するためのFTIRイメージング歩行システム仕様は、以前は非商業的に利用できませんでした。ここでは、ラットのサイズと体重に適合した場合を除き、マウスウォーカー14をモデルにした修正されたFTIR歩行イメージングシステムであるRatWalkerの構築方法について説明します。このシステムは、光学効果であるFTIRを利用して、動物の足跡を視覚化し、その後分析のために記録する方法を提供します。動物の足が光導波路(プラットフォーム)に接触すると、光路が乱れ、目に見える散乱効果が生じ、国産グレードの高速ビデオ撮影とオープンソースソフトウェアを使用した処理を使用してキャプチャされます。この研究は、PDの遺伝子ラットモデルにおける歩行変化の研究におけるFTIRイメージングの力を実証しています。例えば、早くても4ヶ月の雄DKOラットでは、視覚的に明らかな運動変化(後肢の引きずり)が明白に観察されますが、FTIRを使用すると、生後2か月の雄DKOラットのゲート異常を明らかにすることができます。
すべての動物実験は、ネブラスカ大学医療センターの施設内動物管理および使用委員会(IACUC)によって承認されました。
1.歩行装置
注:マウスウォーカー14からモデル化されたラットウォーカーは、ラットとマウスのステップ長の違いに比例した寸法で設計されました。サイドイルミネーションバックライト、歩道筐体、光導波路通路、ミラー、カメラで構成されています(図S1)。余分な材料を収容するために、通路とバックライト導波路の両側に千鳥配置に配置されたLEDストリップが使用されました。修正された歩行装置を構築するために必要な材料は、 表S1に見出すことができる。
2.機器のセットアップ
3.動物の順応
注:最初の実験の1週間前に、改造された歩行装置を通して動物を走らせます。
4.歩行手順
5.ビデオの前処理
注: ハイスピード カメラでキャプチャされたビデオは、120 fps および 1080p の解像度で mp4 形式でレンダリングされます。ダウンストリームの分析ソフトウェアの負担を軽減するには、まず不要な映像をトリミングし、LosslessCutソフトウェア(バージョン3.23.7、https://github.com/mifi/lossless-cut)を使用して各ビデオからオーディオを取り除き、次にオープンソースソフトウェアFFmpeg(バージョン4.2、http://ffmpeg.org/)を使用してmp4ビデオストリームをpng画像シーケンスに変換します。注:pngの代わりにtiffなどの他の可逆形式を利用できます。
6.歩行処理
注意: 歩行データは、無料で入手できるソフトウェアであるMouseWalker(http://biooptics.markalab.org/MouseWalker/)14を使用して処理および定量化されます。
7.データ分析
ラットコロニーのメンテナンス
Pink1およびParkinシングルKOラットの生成および特徴付けは、以前に記載されている22。Pink1およびParkinシングルKOラットはSAGE Labsから入手した(現在はEnvigoから入手可能)。DKOラットは、Pink1-/-ラットとパーキン-/-ラットを交配してPink1+/-/Parkin+/-ラットを得、これを交配してPink1-/-/Parkin-/-ラットを得ることによって生成されました(Envigoから入手可能になります)。Park6(Pink1をコードする遺伝子)における26 bpの欠失を確認するために、5'-CCCTGGCTGACTATCCTGAC-3'フォワードプライマーおよび5'-CCACCACCACTACCACTTACT-3'リバースプライマーを用いてジェノタイピングを行った。Park2(パーキンをコードする遺伝子)における5bpの欠失は、前方5'-GGTGTCTTGGCTCAGTGA-3'および逆5'-GCCACCCAGAATAGCATCTC-3'を用いてDNAを増幅した後に試験した。増幅ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)サンプルを、シーケンシングのためにACGT Inc(イリノイ州ホイーリング)に送った(図S7)。すべてのラットは、ロングエバンスフード付き(LEH)の背景に保たれました。DKOラットは生存可能で繁殖力がありました。しかし、分娩時のDKOダムの死亡率は高かった(約30%)。これらの実験では雄ラットのみが利用された。ラットは、12時間の明暗サイクルとラットの飼料と水への自由なアクセスを備えた温度制御された環境に保たれました。
結果
14歳から適応されたラット用FTIR歩行分析システムの有用性の例として、生後2か月の雄のWTおよびPink1 / Parkin DKOラットで歩行分析を実施し、運動学的歩行分析の使用が、生後4か月から始まる肉眼的運動障害の出現前に人間の視覚では観察されなかった微妙な運動障害を発見できるかどうかを判断しました。
マウス14での以前の歩行研究と同様に、適応FTIRシステムは、歩行ラットによって作成された足跡パターンと、体の中心によって作成された経路を表示することができました(図1A)。WTと比較してDKOラットの体重が増加したにもかかわらず(図1B)、FTIR信号の強度によって決定される歩行面に加えられた足圧(ヒートマップとして視覚化)は変化しなかった(図1C)。歩行速度の関数としていくつかの歩行パラメータを評価したところ(図1D-H)、歩行速度と歩幅はWTラットとDKOラットの間で類似していることがわかりました(図1D)。しかし、WTラットとDKOラットの間の変動は、より遅い歩行速度での立脚期とスイング持続時間で明らかになりました(図1E、F)。脚が立脚段階にあるステップサイクルの割合(立脚時間/期間)がデューティファクターであり、このパラメーターは、ランニングに典型的なデューティファクターが減少するにつれて、スタンスフェーズよりもスイングフェーズで費やされた時間が長くなります(図1G)。ここでも、低速では違いが強調表示されます。さらに、WT動物ではスイング速度が速度の増加とともに増加するのに対し、DKOラットでは相関関係が鈍化している(図1H)。
FTIR歩行分析では、自由に歩くラットの体に対する各脚の立脚位相トレースのプロットも可能になりました(図2A、B)。スタンストレースは体長に正規化され、足のタッチダウン(前端位置、AEP)からスタンスフェーズの終わり(後端位置、PEP)までの体の中心に対する足の位置として定義されます。足の位置を比較すると、AEP(左後肢)とPEP(右後肢)に有意な変化が見られ、WTラットと比較して、DKOでは足の離陸(PEP)中に左後肢が体に近いこと、右後肢が体から離れていることが示唆されました(図2C)。
いくつかの追加のパラメータは、WTと比較してDKOラットにおいて有意に変化した。特に、後肢のスイングパターンの変化が明らかになりました。左後肢と右後肢の両方のスイング速度は、WTラットと比較してDKOラットで増加しましたが(図3A)、左右の後肢の両方のスイング時間は減少しました(図3B)。注目すべきは、ステップ長が変更されていないことです(図4)。

図 1.フットプリントパターンとステップパラメータの分析。 (A)WTおよび(B)DKOラットの代表的なフットプリントパターン(上パネル)ピクセル強度を表すフットプリントヒートマップと、体の経路を表す水平線、および(下パネル)異なる色でラベル付けされた個々の足:左前(LF、黄色)、左後方(LH、青)、右前(RF、オレンジ)、および右後方(RH、緑)。(c)各WT(n=7)およびDKO(n=8)ラットの平均歩行速度。SEMで平均します。 重要ではありません。(D-H)WT(n=7)およびDKO(n=8)ラットにおける速度の関数としてのステップパラメータ。線形回帰直線とR平方値が含まれています。(D)ステップ長は、WTラットとDKOラットの速度とともに増加します。(E)スイング持続時間は、WTラットでは速度に反比例するが、DKOラットではそうではない(有意ではない)。(F)スタンス持続時間は、WTおよびDKOラットの速度とともに減少します。.(G)デューティファクターは、DKOラットの速度に反比例しますが、WTラットではそうではありません(有意ではありません)。(H)スイング速度はWTラットでは速度とともに直線的に増加しますが、DKOラットでは増加しません(有意ではありません)。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図 2.スタンストレースと足の位置分析。 (A)WTラットの代表的な歩行軌跡解析(背景補正前後)を鼻(赤実線)、頭部輪郭(青破線)、尾輪郭(緑破線)、体心(白破線)、足跡(円:緑、RF、水色、LH)で可視化した。(B)自由に歩くWTおよびDKOラットのスタンストレースの代表的なプロット。(c)WT(n=7)およびDKO(n=8)ラットにおける足の位置を示す。AEP、前方極端位置;PEP、後方極端位置;L、左;R、右;F、前足;H、後足。SEMによる平均は、二元配置分散分析とシダックの多重比較検定を使用したWT(p < 0.05*、0.001***)と比較して有意です。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図 3.後足のスイングパラメータはDKOラットで変化しました。 WT(n = 7)およびDKO(n = 8)ラットにおける(A)足が動いている速度および(B)時間足が空中に浮遊している前足および後足の測定。L、左;R、右;F、前足;H、後足。ウェルチの補正を使用したスチューデントの対応のない両側t検定を使用したWT(p < 0.01**)と比較して有意。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図 4.DKOラットではステップ長は変化していません。 WT(n=7)およびDKO(n=8)ラットにおける前足および後足のステップ長の測定。L、左;R、右;F、前足;H、後足。SEMの平均。 ウェルチの補正を伴うスチューデントの対応のない両側t検定を使用したWT(有意ではない)と比較して有意。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
著者は、競合する金銭的利益を宣言していません。
ここでは、ラットのサイズと重量の増加に対応するためにマウスウォーカー装置を再設計することによって構築されたラットウォーカーシステムについて説明します。このシステムは、フラストレーション全反射(FTIR)、高速ビデオキャプチャ、およびオープンアクセス分析ソフトウェアを使用して、歩行パラメータを追跡および定量化します。
KSとHFは、パーキンソン病に関する研究を支援してくれたパーキンソン病研究のためのマイケルJフォックス財団に感謝します。
| <強力>アルミニウム強力> | |||
| 1.5インチアルミニウム角度(1/8 "-6063) | 寸法:8' 数量:8 | ||
| 1"アルミスクエアチューブ(1/16" - 6063) | 寸法:8' 数量:4 | ||
| 32ゲージアルミシート | 寸法:10' 数量:1 | ||
| 1 "アルミニウム管 (1/8" - 6063) | 寸法: 8' 数量: 1 | ||
| アクリル | |||
| 7/32"透明アクリルシート | 寸法:4'x8' 数量:2 | ||
| 1/8 "白いアクリルシート55%(2447) | 寸法:4'x8' 数量:1 | ||
| Mirror< /strong> | |||
| 7/32"ガラスミラー | 寸法:60 "x12" 数量:1 | ||
| LED< /strong> | |||
| 5050LEDテープライト(緑) | 寸法:16.4 ' 数量:1 | ||
| 5050 LEDテープライト(赤) | 寸法:16.4 ' 数量:1 | ||
| Camera< / strong> | |||
| GoPro Hero 6 Black | 数量: 1 | ||
| 三脚 | 寸法 | : 57" 数量: 1 |