このプロトコルは、強力な3Dイメージング技術であるシリアルブロック顔走査電子顕微鏡(SBF-SEM)を使用するための日常的な方法を概説しています。SBF-SEMヒンジの適用に成功し、適切な固定および組織染色技術に加え、イメージング設定を慎重に検討します。このプロトコルには、このプロセス全体に対する実用的な考慮事項が含まれています。
方法論記事
このプロトコルは、強力な3Dイメージング技術であるシリアルブロック顔走査電子顕微鏡(SBF-SEM)を使用するための日常的な方法を概説しています。SBF-SEMヒンジの適用に成功し、適切な固定および組織染色技術に加え、イメージング設定を慎重に検討します。このプロトコルには、このプロセス全体に対する実用的な考慮事項が含まれています。
シリアルブロック顔走査電子顕微鏡(SBF-SEM)は、数百から数千の連続登録された超構造画像の収集を可能にし、組織微小解剖学の前例のない3次元ビューを提供します。SBF-SEMは近年、使用が急激に増加していますが、このイメージングモダリティの成功には、適切な組織調製やイメージングパラメータなどの技術的側面が最も重要です。このイメージングシステムは、デバイスの自動化された性質から恩恵を受け、イメージングプロセス中に顕微鏡を放置することができ、1日で何百もの画像を自動収集することができます。しかし、適切な組織製剤がなければ、細胞の超構造は、誤った結論や誤解を招く結論が導かれるような方法で変更することができます。さらに、画像は、樹脂組み込み生物学的サンプルのブロック面をスキャンすることによって生成され、これはしばしば対処しなければならない課題と考慮事項を提示します。「組織充電」と呼ばれるイメージング中のブロック内の電子の蓄積は、コントラストの喪失と細胞構造を理解できないことにつながる可能性があります。さらに、電子ビームの強度/電圧を上げたり、ビームスキャン速度を下げたりすると画像解像度が向上しますが、これはまた、樹脂ブロックを損傷し、イメージングシリーズの後続の画像を歪めるという不幸な副作用を持つことができます。ここでは、細胞の超構造を維持し、組織の充電を減少させる生体組織サンプルの調製のためのルーチンプロトコルを提示する。また、組織ブロックへのダメージを最小限に抑えた高品質のシリアル画像の迅速な取得に関する画像化に関する考慮事項も提供しています。
シリアルブロック顔走査電子顕微鏡(SBF-SEM)は、1981年にレイトンによって最初に説明され、樹脂に埋め込まれた組織の薄い部分を切断して画像化できる内蔵のミクロトームで増強された走査型電子顕微鏡を作りました。残念ながら、技術的な制限は、生体組織などの非導電性サンプルが許容できないレベルの充電(組織サンプル内の電子蓄積)を蓄積したように、その使用を導電性試料に制限した。蒸発した炭素減らされたティッシュの充満で切り傷の間のブロック面をコーティングする間、この画像取得時間およびイメージ貯蔵は、当時のコンピュータ技術が装置によって作成された大きなファイルサイズを管理するのに不十分であったため、問題が残った。この方法論は、可変圧室2を搭載したSBF-SEMを用いて、2004年にデンクとホルストマンによって再検討された。これにより、サンプル内の充電を低減するイメージングチャンバに水蒸気を導入することができ、非導電性サンプルのイメージングは、画像解像度の損失とはいえ実行可能になります。組織調製法およびイメージング法のさらなる改善により、高真空を用いたイメージングが可能となり、SBF-SEMイメージングは、もはや、充電3、4、5、6、7、8、9を放散するために水蒸気に依存しなくなりました。SBF-SEMは近年、使用が急激に増加していますが、このイメージングモダリティの成功には、適切な組織調製やイメージングパラメータなどの技術的側面が最も重要です。
SBF-SEMは、3-5 nm10、11の小さな平面解像度で、何千もの連続登録電子顕微鏡画像の自動収集を可能にします。重金属を含浸させ、樹脂に埋め込まれた組織は、ダイヤモンドナイフを取り付けた超ミクロトームを含む走査型電子顕微鏡(SEM)内に配置される。平らな表面をダイヤモンドナイフで切断し、ナイフを引き込み、ブロックの表面を電子ビームでラスターパターンでスキャンして組織の超構造の画像を作成します。次に、ブロックは「z ステップ」と呼ばれる z 軸で指定された量 (例えば 100 nm) を上げ、プロセスが繰り返される前に新しいサーフェスがカットされます。このようにして、組織が切り取られると、画像の3次元(3D)ブロックが生成されます。このイメージングシステムは、デバイスの自動化された性質からさらに恩恵を受け、イメージングプロセス中に顕微鏡を放置することができ、1日で何百もの画像を自動収集することができます。
SBF-SEMイメージングは主にブロック面の画像を形成するために後方散乱電子を使用するが、二次電子は、撮像プロセス12の間に生成される。二次電子は、ブロックから逃げない後方散乱型電子や一次ビーム電子と並んで蓄積し、ブロック面に局在する静電場につながる「組織充電」を生み出す。この電子蓄積は、画像を歪めたり、ブロックから放出される電子を発生させ、後方散乱検出器によって集められた信号に寄与し、信号対雑音比13を減少させる。組織の帯電のレベルは、電子線の電圧または強度を低減させることによって減少させることができるが、またはビームのドウェル時間を短縮するが、これは減少する信号対雑音比14をもたらす。低電圧または強度の電子ビームを使用する場合、またはビームが各ピクセル空間内に短期間だけ収まる場合、組織から放出される後方散乱電子が少なく、より弱い信号をもたらす電子検出器によって捕捉される。デンクとホルストマンは、チャンバーに水蒸気を導入することによってこの問題に対処し、それによって画像解像度を犠牲にしてチャンバーとブロック面の電荷を低減した。チャンバー圧力が10-100 Paの場合、電子ビームの一部が散乱して画像ノイズや分解能の損失を起こしますが、試料室ではイオンが生成され、サンプルブロック2内の電荷が中和します。サンプルブロック内の電荷を中和する方法は、撮像中にブロック面上に窒素の焦点ガス注入を使用する、またはプローブビーム集荷エネルギーを減少させ、6、7、15を集めた信号を増加させるためにSBF-SEM段階に負の電圧を導入する。ステージバイアスを導入するのではなく、チャンバー圧力や局在窒素注入をブロック表面への電荷蓄積を低減させ、より積極的な撮像設定16を可能にする樹脂ミックスにカーボンを導入することにより樹脂の導電率を高めることも可能である。以下の一般的なプロトコルは、2010年に発表されたDeerinckら.プロトコルの適応であり、高分解能画像取得3、17、18、19を維持しながら組織の充電を最小限に抑えるために有用であるとわかった組織準備およびイメージング方法論の変更をカバーしている。前述のプロトコルは組織処理と重金属含浸に焦点を当てていますが、このプロトコルはSBF-SEM研究に固有のイメージング、データ分析、および再構築ワークフローに関する洞察を提供します。当研究室では、このプロトコルは、角膜や前部構造を含む多種多様な組織にうまく、再現的に適用されています。 まぶた、涙液および硬直腺、失明および視神経、心臓、肺および気道、腎臓、肝臓、クレマスター筋肉、および大脳皮質/髄質、およびマウス、ラット、ウサギ、モルモット、魚、単層および層状細胞培養、豚、非ヒト霊長類、ヒト20、22、23小さな変更は特定の組織やアプリケーションにとって価値があるかもしれませんが、この一般的なプロトコルは、当社のコアイメージング機能のコンテキストで非常に再現性と有用性が証明されています。
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すべての動物は、視力および眼科研究における動物の使用に関する視覚および眼科研究の研究声明およびヒューストン大学検眼動物取り扱いガイドラインに記載されているガイドラインに従って取り扱われました。すべての動物の手順は、彼らが取り扱われた機関によって承認されました:マウス、ラット、ウサギ、モルモット、および非ヒト霊長類の手順はヒューストン大学動物ケアと使用委員会によって承認され、ゼブラフィッシュの手順はDePauuu大学動物ケアと使用委員会によって承認され、豚の手順はベイラー医科大学動物ケアと使用委員会によって承認されました。ヒト組織に関する研究に関する全てのヒト組織はヘルシンキ宣言に従って取り扱われ、適切な機関審査委員会の承認が得られた。
1. 組織処理
2. ブロックの準備
注: この方法は、サンプルがブロック内でどのように向き付けされているか、および断面がどのように行われるかによって異なります。しかし、最も一般的な組織の配向は、樹脂ブロックの先端に中心となる組織を見つけ、樹脂ブロックの長い端に垂直である。
3. ブロック面をイメージングするための SEM 設定
注: 以下の画像設定は、著者が使用するデバイスで作成されたもので、提供されている 資料表 に記載されています。この装置は可変的な圧力のイメージ投射が可能である間、最もよい結果は高真空の下で捕獲された。
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マウスコルネア
このプロトコルは、マウス角膜に広く適用されています。SBF-SEMイメージングを用いて、エラスチンフリーマイクロフィブリル束(EFMB)のネットワークが成体マウス角膜内に存在することが示された。以前は、このネットワークは胚性および出生後早期の発達中にのみ存在すると考えられていました。SBF-SEMは角膜全体に広範なEFMBネットワークを明らかにし、断面で測定すると個々の繊維の直径は100〜200nmであることが判明した。また、このEFMBネットワークは、角膜細胞と密接に関連する繊維を持ち、角質細胞表面上の浅い内層に横たわっている異なる層に編成されていたことも明らかになった(図5)。成体角膜におけるEFMB繊維の発見は、免疫金標識透過電子顕微鏡(TEM)に至り、このネットワーク23の性質をさらに理解するための蛍光および共焦点研究である。
このプロトコルのさらなる応用は、間質上皮境界で基底上皮細胞と融合する、これまで知られて...
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この方法論文の目的は、当社の研究室が高解像度のシリアル電子顕微鏡画像を確実にキャプチャすることを可能にした組織調製法とイメージング方法論を強調し、この結果につながる重要なステップと、SBF-SEMイメージングを行う際に起こり得る潜在的な落とし穴を指摘することです。このプロトコルを使用して成功するには、組織の適切な固定、サンプルへの重金属の含浸、充填樹脂の改質による充電の低減、画像収集に使用される顕微鏡およびイメージング設定の理解が必要です。「品質、品質アウト」は、SBF-SEMイメージングに適した公理です。SBF-SEMの目標は、多くの場合、超構造詳細の評価または定量化であるため、組織の歪みが発生しないように、固定戦略に特別な注意を払う必要があります。サンプルの調製の任意の時点で組織が歪んだ場合(すなわち、細胞形態の腫脹、縮小、または破壊を受ける)、組織の再構成および量子化は正確なデータを得ない。さらに、誤ったイメージング設定を使用すると、SBF-SEMイメージングが破壊プロセスであるために再キャプチャできないデータの損失につながる可能性があります。また、繊細なダイヤモンドナイフは急いでまたは誤ったサンプル調製によって損傷を受ける可能性...
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著者らは開示するものは何もない。
サム・ハンロン博士、エブリン・ブラウン博士、マーガレット・ゴンド博士の優れた技術支援に感謝します。この研究は、国立衛生研究所(NIH)R01 EY-018239およびP30 EY007551(国立眼科研究所)の一部、一部はライオン視覚財団、一部はNIH 1R15 HD084262-01(国立小児保健人間開発研究所)によって支えられました。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 1/16 x 3/8 アルミ リベット | 工業用リベット &ファスナー(株) | 6N37RFLAP/1100 | 試料ピンとして使用します。 |
| 2.5mmマイナスドライバーWiha | 品質ツール | 27225 | |
| アセトン | 電子顕微鏡科学 | RT10000 | 銀塗料を希釈するために使用されます。 |
| アスパラギン酸 | Sigma-Aldrich | A8949 | |
| 塩化カルシウム | FisherScientific | C79-500 | |
| 導電性シルバーペイント | テッド・ペラ | 16062 | |
| デントン デスク - II 真空スパッタリング装置 標準金箔ターゲットを装備 | デントン真空 | N/A | これは、著者が使用する金スパッタリング装置であり、代替は許容されます。 |
| 両刃のカミソ | フィッシャーサイエンティフィック | 50-949-411 | |
| 812 | 電子顕微鏡科学 | 14120 | |
| Gatan 3View2 テスキャン Mira3 電界放出型 SEM | Gatan &Tescan | N/A | これは著者が使用するSBF-SEMデバイスであり、代替は許容されます。 |
| ガラスシェルバイアル、0.5 DRAM (1.8 ml) | 電子顕微鏡科学 | 72630-05 | |
| グルトアルデヒド | 電子顕微鏡科学 | 16320 | |
| ゴリラ瞬間接着剤 - インパクトタフ | NA | NA | 本文ではシアノアクリレート接着剤と呼ばれています。 |
| Ketjen Black | HM Royal | EC-600JD | 本文ではカーボンブラックと表記されています。 |
| KOH | フィッシャーサイエンティフィック | 18-605-593 | |
| 硝酸鉛 | フィッシャーサイエンティフィック | L62-100 | |
| マイクロ波 | ペルコ | バイオウェーブプロ | これは著者が使用するマイクロ波であり、代替は許容されます。 |
| 四酸化オスミウム | Sigma-Aldrich | 201030 | |
| フェロシアン化カリウム | Sigma-Aldrich | P9387 | |
| シリコーン埋め込み金型 | テッドペラ | 10504 | |
| カコジル酸ナトリウム三水和物 | 電子顕微鏡 科学 | 12300 | |
| Samco Transfer ピペット | サーモフィッシャー サイエンティフィック | 202 | 試料ピンの製造に使用保存チューブ。 |
| スイスパターンニードルファイル | 電子顕微鏡科学 | 62115 | |
| チオカルボヒドラジド | Sigma-Aldrich | 223220 | |
| ウラニルアセテート | Polysciences, Inc. | 21447-25 | |
| Reconstruction Software | |||
| Amira Software | Thermo Scientific | N/A | 図5-7および図9にある再構成を作成するために使用しました。 |
| フィジー(フィジーは単なるImageJです) | ImageJ.net | N / A | TrakEM2をフィジーに追加して、手動セグメンテーションをアシストできます。 |
| 顕微鏡画像ブラウザ(MIB) | University of Helsinki, Institute of Biotechnology | N/A | |
| Reconstuct Software | Neural Systems Lab | N/A | |
| SuRVoS Workbench | Diamond Light Source &ノッティンガム大学 | N/A | |
| SyGlass | IstoVisio, Inc. | N/A | バーチャルリアリティでの再構成とヒストグラムベースの再構成方法が可能です。 |
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