AAV6に対する中和元素を検出するための、迅速で費用対効果が高く、簡単な比色細胞ベースのアッセイについて、包括的なラボプロトコルと分析ワークフローが説明されています。
方法論記事
AAV6に対する中和元素を検出するための、迅速で費用対効果が高く、簡単な比色細胞ベースのアッセイについて、包括的なラボプロトコルと分析ワークフローが説明されています。
組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)は、実験室と診療所の両方でさまざまな健康状態を治療するために遺伝物質を転写するための安全で成功したベクターであることが証明されています。しかし、AAVカプシドに対する既存の中和抗体(NAbs)は、大型動物実験モデルとヒト集団の両方で遺伝子治療を成功裏に投与するための継続的な課題を提起する。AAVに対する宿主免疫の予備スクリーニングは、AAVベースの遺伝子治療が研究ツールとして、また臨床的に実行可能な治療薬としての有効性を確保するために必要です。このプロトコールは、AAV血清型6(AAV6)に対する中和因子を検出するための 比色インビトロ アッセイを記載する。このアッセイは、アルカリホスファターゼ(AP)レポーター遺伝子をコードするAAVとその基質NBT/BCIPとの間の反応を利用し、組み合わせると不溶性の定量可能な紫色の染色を生成する。
このプロトコールでは、血清サンプルをAPを発現するAAVと組み合わせ、潜在的な中和活性が起こるようにインキュベートする。ウイルス血清混合物は、その後、中和されていない任意のAAVのウイルス形質導入を可能にするために細胞に添加される。NBT/BCIP基質が添加され、ウイルス形質導入および中和活性に対応する発色反応を受ける。着色された領域の割合は、中和力価を生成するためにフリーソフトウェアツールを使用して定量化される。このアッセイは、着色とウイルス濃度との間に強い正の相関を示す。組換えAAV6の投与前後のヒツジ由来の血清サンプルの評価は、中和活性の劇的な増加(125〜>10,000倍の増加)をもたらした。アッセイは、>1:32,000血清希釈液中の中和活性を検出するのに十分な感度を示した。このアッセイは、AAVに対してNAbsを検出するための簡単で迅速で費用対効果の高い方法を提供します。
アデノ随伴ウイルス(AAV)は、心臓血管系、肺系、循環器系、眼系、および中枢神経系に影響を与えるさまざまな健康状態の試験的治療への遺伝子治療を提供するためのベクターとしてますます使用されています1,2,3,4,5。主要な遺伝子治療プラットフォームとしてのAAVベクターの人気は、その肯定的な安全性プロファイル、長期的な導入遺伝子発現、および広範囲の組織特異的指向性に由来しています1,6。動物実験での成功の結果は、有効性エンドポイント7に成功した50以上のAAV遺伝子治療臨床試験への道を開き、米国食品医薬品局によって承認された最初の市販のAAV遺伝子治療薬のリリース8。最初の成功の後、AAVは選択ベクターとして基礎研究および臨床研究分野で牽引力を得続けており、現在、米国とヨーロッパで臨床使用が承認された唯一のin vivo遺伝子治療です9。それにもかかわらず、AAVベクターカプシドに対する既存の中和抗体(NAbs)の存在は、前臨床研究および臨床試験の有効性の両方にとって依然として障害である。NAbは、ナイーブなヒトおよび動物集団の両方に存在し、AAVベクター1のインビボ投与後の遺伝子導入を阻害する。AAV血清陽性は、ほとんどの遺伝子治療試験の除外基準であるため、宿主免疫の予備スクリーニングは、実験室と診療所の両方で非常に重要です。AAVに対するNAbsの存在を検出できるアッセイを確立することは、AAV遺伝子治療ベースの研究プロジェクトのパイプラインにおいて不可欠なステップです。このレポートは、横紋筋(心臓および骨格筋)における効率的かつ選択的な形質導入のために研究者にとって興味深いAAV6に焦点を当てています1,10,11,12。遺伝子治療は、侵襲的な開心処置なしに心臓を特異的に標的とすることは困難であるため、心臓を標的とするための有望な戦略と考えられている。
中和活性は、通常、細胞ベースのインビトロまたはインビボ形質導入阻害アッセイのいずれかを用いて決定される。インビボでNAbアッセイは、通常、試験対象(例えば、ヒトまたは大型動物)からの血清をマウスに投与し、続いてレポーター遺伝子を有するAAVを投与し、続いてレポーター遺伝子または対応する抗原の発現について試験することを含む。インビトロアッセイは、レポーター遺伝子を発現する組換えAAV(rAAV)と共に段階希釈下でヒトまたは大型動物由来の血清または血漿をインキュベートすることによってNAb力価を決定する。細胞を血清/ウイルス混合物に感染させ、対照と比較してレポーター遺伝子発現が阻害される程度を評価する。インビトロアッセイは、インビボアッセイと比較して、比較的低コスト、試験の迅速性、標準化および検証の能力が高いため、NAbスクリーニングに広く使用されています13,14。インビボアッセイはしばしばより高い感度を有すると報告されている15,16が、インビトロアッセイに関しても同じ主張がなされている14,17。
今日まで、インビトロNAbアッセイは、中和を検出するためのレポーター遺伝子として発光(ルシフェラーゼ)を主に使用してきた。光ベースの方法は多くの文脈においてメリットを有するが、比色法/発色性NAbアッセイは状況によっては有利であり得る。中和を評価するための比色アッセイは、インフルエンザやアデノウイルスなどの他のウイルスについても成功裏に採用されています18,19。その魅力は、そのシンプルさ、低コスト、そして日常的な実験装置とツールのみの要件に由来しています20。発光ベースのレポーター遺伝子を使用するNAbアッセイには、高価な基質キット、ルミノメーター、および分析用の対応するソフトウェアが必要です21。この比色アッセイは、光学顕微鏡と非常に安価な基質のみを必要とするという利点を有する。比色アッセイと発光アッセイの感度の報告は、相反する結果をもたらしました。ある研究では、発光ベースのELISAアッセイは比色アッセイと比較してより高い感度と同等の再現性を示すことが示唆され22、別の研究では比色ベースのELISAアッセイがより高い感度を付与することが示唆されました23。ここでは、アルカリホスファターゼ(AP)レポーター遺伝子をコードするAAVとニトロブルーテトラゾリウム/5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリルホスフェート(NBT/BCIP)基質との間の発色反応を利用するAAVに対するインビトロNAbアッセイのための詳細なプロトコールが提供される。このステップバイステッププロトコルは、hPLAP(ヒト胎盤アルカリホスファターゼ)レポーター遺伝子(AAV6-hPLAP)を利用してAAV24に対する中和活性を検出した以前の報告に基づいて開発されました。このアッセイは、費用対効果が高く、時間効率が高く、セットアップが簡単で、最小限の技術スキル、実験装置、および試薬を必要とします。さらに、このアッセイの単純さは、異なるタイプの細胞、組織、またはウイルス血清型にわたる幅広い用途に最適化される可能性を与えます。
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動物の世話と実験のあらゆる側面は、Florey Institute of Neuroscience and Mental Healthのガイドラインと、参考文献25に続く科学的目的のための動物の世話と使用のためのオーストラリア規範に従って実施されました。1.5-3歳のメリノ・ウエイズが研究に使用された。アッセイプロトコルの概略概要を 図1に示します。

図1:NAbアッセイプロトコルの概略図。 (A)3日間のプロトコールに関与する主要なステップを示すNAbアッセイの視覚的表現。簡単に言えば、細胞を増殖させ、一晩で播種する。翌日、血清の段階希釈液を調製し、AAVと共にインキュベートし、次いで細胞と共に一晩インキュベートする。翌日、細胞を固定し、洗浄し、インキュベートし、基質と合わせ、再度インキュベートし、続いてイメージングおよび定量を行った。(b)最小シグナル制御(完全AAV阻害)、最大シグナル制御(阻害なし)、および〜50%シグナル阻害を有するウツジ血清サンプルの代表画像。スケール バー = 0.5 mm。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
1. 初期準備
2. 1日目 - 細胞のめっき
3. 2日目 - 細胞に感染する
| 希釈カスケードラベル | 希釈 | 3 x サンプル (240 μL) + 10% バッファー容量 (24 μL) | 血清の比率:培地 |
| 希釈 1 (D1) | 1/2 | 264 μL 血清 264 μL 培地 | 50:50 |
| 希釈 2 (D2) | 1/4 | 264 μL D1 + 264 μL 培地 | 25:75 |
| 希釈 3 (D3) | 1/8 | 264 μL D2 +264μL 培地 | 12.5:87.5 |
| 希釈 4 (D4) | 1/16 | 264 μL D3 +264 μL 培地 | 6.25:93.75 |
| 希釈 5 (D5) | 1/32 | 264 μL D4 +264 μL 培地 | 3.13:96.87 |
| 希釈 6 (D6) | 1/64 | 264 μL D5 +264 μL 培地 | 1.56:98.44 |
| 希釈 7 (D7) | 1/128 | 264 μL D5 +264 μL 培地 | 0.78:99.22 |
| 希釈 8 (D8) | 1/256 | 264 μL D5 +264 μL 培地 | 0.39:99.61 |
| 希釈 9 (D9) | 1/512 | 264 μL D7 + 264 μL 培地 | 0.2:99.8 |
| 希釈 10 (D10) | 1/2048 | 132 μL D8 + 396 μL 培地 | 0.05:99.95 |
| 希釈 11 (D11) | 1/8192 | 132 μL D9 + 396 μL 培地 | 0.01:99.99 |
| 希釈 12 (D12) | 1/32768 | 132 μL D10 + 396 μL 培地 | 0.003:99.997 |
表1:血清の連続希釈を3連で生成するのに必要な血清および希釈剤の量。
| 血清サンプル#1 | 血清サンプル#2 | 血清サンプル #3 | モノラルAB(mAB)、コントロールおよび追加サンプル | |||||||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | 11 | 12 | |
| ある | 1/2 | 1/2 | 1/2 | 1/2 | 1/2 | 1/2 | 1/2 | 1/2 | 1/2 | 50 ng MAb | 50 ng MAb | 50 ng MAb |
| B | 1/4 | 1/4 | 1/4 | 1/4 | 1/4 | 1/4 | 1/4 | 1/4 | 1/4 | 5 ng MAb | 5 ng MAb | 5 ng MAb |
| C | 1/8 | 1/8 | 1/8 | 1/8 | 1/8 | 1/8 | 1/8 | 1/8 | 1/8 | 0.5 ng MAb | 0.5 ng MAb | 0.5 ng MAb |
| D | 1/16 | 1/16 | 1/16 | 1/16 | 1/16 | 1/16 | 1/16 | 1/16 | 1/16 | MO (-C) | MO (-C) | MO (-C) |
| E | 1/32 | 1/32 | 1/32 | 1/32 | 1/32 | 1/32 | 1/32 | 1/32 | 1/32 | VO (+C) | VO (+C) | VO (+C) |
| F | 1/64 | 1/64 | 1/64 | 1/64 | 1/64 | 1/64 | 1/64 | 1/64 | 1/64 | サンプル#1 1/512 | サンプル#1 1/512 | サンプル#1 1/512 |
| G | 1/256 | 1/256 | 1/256 | 1/256 | 1/256 | 1/256 | 1/256 | 1/256 | 1/256 | サンプル #2 1/512 | サンプル #2 1/512 | サンプル #2 1/512 |
| H | 1/512 | 1/512 | 1/512 | 1/512 | 1/512 | 1/512 | 1/512 | 1/512 | 1/512 | サンプル#3 1/512 | サンプル#3 1/512 | サンプル#3 1/512 |
表2:1/2〜1/512の範囲の希釈液中のナイーブ血清サンプルを評価するための実施例96ウェルプレートレイアウト。AAV NAbsに対して陽性であることが知られているサンプル(投与後サンプル)を評価する場合、またはより高い力価が必要な場合、より高い希釈がアッセイに組み込まれる。MO (-C): メディアのみのコントロール。VO (+C): ウイルスとメディアのみを制御します。mAb:AAVに対するモノクローナル抗体(NAb陽性対照)。
4. 3日目 - 細胞への基質の固定と添加
5. ImageJを用いた中和活性を求める定量

図2:ImageJソフトウェアを使用して着色率を決定する手順。 (A) 解析する画像をImageJソフトウェアで開きます。(B) 画像を 8 ビットのグレースケールに変換します。(C) しきい値ウィンドウを開きます。(D) 最大しきい値を調整して、すべての色付きの領域がカバーされるようにしますが、背景領域はカバーされません (このしきい値はプレート全体で一貫している必要があります)。(E)「分析」ドロップボックスを選択し、「測定値の設定」をクリックして、「面積」、「面積分率」、「限界しきい値」、「表示ラベル」にチェックマークを付け、「OK」をクリックします。(F)「測定」をクリックして、カバーされた領域を測定します。% 領域は、色付けされた画像の割合を示します。次いで、これを対照サンプルと共に使用して、TI50 力価を決定することができる。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
6. 形質導入阻害(TI50)力価の判定
中和AAV粒子の定量
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プレートカバレッジに最適なウイルス投与量を確立するための形質導入アッセイ
十分に確立された線維肉腫細胞株であるHT1080細胞を、このアッセイのために選択した。1 x 104 HT1080細胞/ウェルの濃度は、96ウェルプレートの各ウェルにおいて〜50%の細胞コンフルエント性を提供しました。アッセイに最適なウイルス濃度を決定するために、hPLAP(ヒト胎盤アルカリホスファターゼ)レポーター遺伝子(AAV6−hPLAP)31 をコードするrAAVを、細胞当たりのvg含有粒子の濃度の範囲で3連で添加した(MOI:0、150、500、1500、5000、15000、50000&150000(図3A))。15000(1.5 x 108 vg/ウェル)のMOIは、36%のプレート着色を与え、最適なウイルス投与量として選択された。0〜15000の間のすべてのMOIについて、着色およびウイルス濃度の間に正の相関が観察された(n = 6、 r
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この報告は、インビトロウイルス形質導入の程度に対応する発色反応を評価することによって、所与の血清サンプル中のAAV中和の程度を評価する比色アッセイを記載する。このプロトコールの開発は、免疫組織化学などの用途におけるタンパク質標的検出のための染色ツールとして、またウイルス形質導入を評価するためのレポーターツールとして広く利用されてきた酵素アルカリホスファターゼとNBT/BCIPとの間の既知の発色反応に基づいていました24,33,34,35.そのメリットは、その時間と費用対効果、アクセシビリティ、セットアップと実行の容易さに由来し、高い有効性を実証しています。このアッセイで用いられるrAAV6(AAV-hPLAP)は、レポーター遺伝子ヒト胎盤アルカリホスファターゼ(hPLAP)を担持し、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター34<...
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著者らは開示するものは何もありません。
この研究は、JRMとCJT(ID 1163732)への国家保健医療研究評議会プロジェクト助成金と、ビクトリア州政府の運用インフラ支援プログラムによって部分的に資金提供されました。SBは、共同ベーカーハートと糖尿病研究所 - ラトローブ大学博士奨学金によってサポートされています。KLWは、シャイン・オン・ファウンデーションとオーストラリア国立心臓財団(ID 102539)のフューチャー・リーダー・フェローシップの支援を受けています。JRMは、国立衛生医学研究評議会上級研究員(ID 1078985)の支援を受けています。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 0.05% トリプシン/EDTA | Gibco | 25300-054 | |
| 50 mL 円錐形遠心分離管 | Falcon | 14-432-22 | または同等の |
| 75 cm2 正方形フラスコ | Falcon | 353136 | または同等の |
| 96 ウェル平底プレート | Falcon | 353072 | |
| AAV6-CMV-hPLAP ベクター | 筋肉研究&Therapeutics Lab(オーストラリア・メルボルン大学) AAV6-CMV-hPLAPはご要望に応じて提供可能です。 | ||
| アルミホイル | |||
| 抗AAV6(無傷粒子)マウスモノクローナル抗体、(ADK6) | プロゲン | 610159 | ポジティブコントロールモノクローナル抗体 |
| BCIP/NBT | SIGMAFAST | B5655 | |
| 細胞および組織培養安全キャビネット | |||
| 電子ピペット | 5 & 10 mL ストリペットインサート | ||
| ウシ胎児血清 | Gibco | 10099-141 | |
| 血糖値計算盤 | |||
| 高グルコース ダルベッコ修正イーグル培地 (DMEM) | Gibco | 11965118 | |
| HT1080 cells | ATCC | ||
| ImageJ ソフトウェア | 無料入手可能: https://imagej.nih.gov/ij/download.html | ||
| インキュベーター | 37度;C、5% CO2 | ||
| カメラ付き | 4倍の対物レンズで写真を撮ることができる | ||
| オーブン | 65 >Cインキュベーション | ||
| パラホルムアルデヒド | MERCK | 30525-89-4 | |
| ペニシリン ストレプトマイシン | Gibco | 15140-122 | |
| リン酸緩衝生理食塩水 | |||
| ピペットとチップ | 20 μL、200 μL&1 mLシングルピペットとチップ&200 μL マルチチャンネルピペット | ||
| ステリカップ クイックリリースフィルター | ミリポア | S2GPU10RE | 培地試薬の併用に使用 |
| トリパンブルー溶液 | シグマ・アルドリッチ | T8154 | |
| バキュエットチューブ 8ml CAT 血清セパレーター 血栓活性化剤 | グライナー BIO-ONE | 455071 | 羊からの血清採取・処理に使用 |
| ウォーターバス |
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