本研究では、キネシン-3ファミリーのメンバーであるKIF1A(1-393LZ)をSf9-バキュロウイルス発現系を用いて精製する。これらの精製モーターの in vitro 単一分子およびマルチモーターグライディング分析は、哺乳類細胞ライセートからのモーターに匹敵する堅牢な運動特性を示しました。したがって、Sf9-バキュロウイルス系は、目的のモータータンパク質を発現および精製するのに適している。
方法論記事
本研究では、キネシン-3ファミリーのメンバーであるKIF1A(1-393LZ)をSf9-バキュロウイルス発現系を用いて精製する。これらの精製モーターの in vitro 単一分子およびマルチモーターグライディング分析は、哺乳類細胞ライセートからのモーターに匹敵する堅牢な運動特性を示しました。したがって、Sf9-バキュロウイルス系は、目的のモータータンパク質を発現および精製するのに適している。
複雑な細胞環境は、単一分子の運動性解析に課題をもたらします。しかし、イメージング技術の進歩により、単一分子の研究が改善され、蛍光タグ付き分子の動的挙動の検出と理解において絶大な人気を得ています。ここでは、全反射蛍光(TIRF)顕微鏡を用いたキネシン-3ファミリーモーターのin vitro 単一分子研究の詳細な方法について説明します。キネシン-3は、細胞内貨物輸送から細胞分裂、発生に至るまで、細胞および生理学的機能において重要な役割を果たす大きなファミリーです。我々はこれまで、構成的に活性な二量体キネシン-3モーターが、哺乳類細胞でモーターを発現させて調製した細胞ライセートを用いて、1分子レベルで高い微小管親和性を有する高速かつ超加工的な運動性を示すことを示した。私たちの研究室では、キネシン3モーターとその制御機構を細胞学的、生化学的、生物物理学的アプローチを用いて研究しており、そのような研究では大規模な精製タンパク質が必要です。哺乳類細胞を用いたこれらのモーターの発現および精製は高価で時間がかかるが、原核生物発現系での発現は有意に凝集し、不活性なタンパク質をもたらした。細菌精製システムと哺乳類細胞ライセートによってもたらされる制限を克服するために、これらのモーターを発現および精製するための堅牢なSf9バキュロウイルス発現システムを確立しました。キネシン-3モーターは、シグナルを増強し、光退色を減少させる3タンデム蛍光タンパク質(3xmシチリンまたは3xmCit)でC末端にタグ付けされています。Sf9精製タンパク質の in vitro 単一分子およびマルチモーター滑走分析は、キネシン-3モーターが哺乳類細胞溶解物を用いた以前の研究と同様に高速で超加工的であることを示しています。これらのアッセイを使用する他のアプリケーションには、モーターのオリゴマー条件、生化学的研究と並行している特異的結合パートナー、およびそれらの速度論的状態に関する詳細な知識が含まれます。
非常に混雑した細胞環境は、運命のタンパク質や分子を選別する際に多くの課題をもたらします。細胞質内の分子の組織化と時空間分布のこの激しい作業負荷は、分子モーターと細胞骨格トラックによって促進されます。分子モーターは、ATPなどのエネルギー通貨を加水分解し、運動や力の生成中にそのエネルギーを利用する酵素です1。アミノ酸配列の類似性に基づいて、キネシンは14のファミリーにグループ化され、この類似性にもかかわらず、各モーターは細胞の機能に一意に貢献します。キネシン3ファミリーモーターは、5つのサブファミリー(KIF1、KIF13、KIF14、KIF16、KIF28)2からなる最大のモーターの1つであり、小胞輸送、シグナル伝達、有糸分裂、核移動、発生など、多様な細胞および生理学的機能に関連しています3,4,5。キネシン-3輸送機能の障害は、多くの神経変性疾患、発達障害、および癌疾患に関与しています6,7,8,9。
最近の研究では、キネシン-3モーターはモノマーであるが、貨物誘起二量体化を受け、従来のキネシン10,11,12,13と比較して高速で超加工的な運動性をもたらすことが実証されている。それらの生化学的および生物物理学的特性評価には、大量の精製された活性タンパク質が必要です。しかし、原核生物発現系におけるそれらの産生は、おそらく不適合なタンパク質合成、折り畳みおよび修飾機構のために、不活性または凝集したモーターをもたらした14,15,16,17,18。このような制限を回避し、収量を増やすために、ここでは、これらのモーターを発現および精製するための堅牢なSf9バキュロウイルス発現システムを確立しました。
バキュロウイルス発現システムは、ハイスループット真核生物組換えタンパク質発現のための宿主系としてSf9昆虫細胞株を使用する19,20。バキュロウイルスは、異種遺伝子発現と可溶性組換えタンパク質の産生を補助する強力なポリヘドリンプロモーターを持っています17。その費用対効果、取り扱いが安全で、かつ大量の活性タンパク質発現のために、それは強力なツール21となっている。目的のタンパク質を発現させるための重要なステップは、組換えバクミドを生成することです。市販のバクミド生成キットは高価であり、より多くのサンプルを扱うため、キネシン-3モーターをバクミドに大小両方のインサートするための社内プロトコルを開発しました。Sf9精製されたキネシン-3モーターを使用して、全反射蛍光(TIRF)顕微鏡を使用してin vitroの単一分子およびマルチモーター微小管滑走特性を特徴付けました。モーターは、3タンデム蛍光分子(3xmCit)でC末端にタグ付けされており、シグナルを強化し、光退色を低減します。TIRFイメージングは、シグナル対ノイズ比の増加、光毒性の低減、カバーガラスに近い非常に小さな領域の選択的イメージングにより、in vivoおよびin vitroで単一分子レベルでタンパク質動態を視覚化するために広く使用されています。
本研究では、Sf9バキュロウイルス発現系を用いたキネシン3モーターの精製と、TIRF顕微鏡を用いたモーターの in vitro 単一分子イメージングおよびマルチモーター滑空解析について説明します。全体として、この研究は、Sf9精製モーターの運動特性が哺乳類細胞溶解物から調製されたモーターの運動特性と同一であることを示しています。したがって、Sf9-バキュロウイルスシステムは、目的のモータータンパク質を発現および精製するように適応できると考えています。
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1. Sf9培養、トランスフェクション、ウイルス生成
注:抗生物質/抗真菌剤を含まない100 mLの滅菌済みコニカルフラスコ内の30 mLのSf-900 / SFM培地中のSf9細胞を28°Cに維持します。 懸濁培養液を90rpmのオービタルシェーカーに保ちます。CO2の供給と湿度の維持は必要ありません。細胞は通常、4日目に2.0 x 10 6細胞/ mLの密度に達するために0.5 x 106細胞/ mLを接種することにより、4日ごとに継代培養されます。
2. キネシン-3モーターのSf9精製
3. Sf9精製キネシン-3モーターを用いた in vitro1 分子運動アッセイ
注:Sf9精製されたキネシン-3モーターは、ATP回転率、微小管親和性、速度、ランレングス、ステップサイズ、力生成などの生化学的および生物物理学的特性の研究に使用できます。ここでは、全反射蛍光(TIRF)顕微鏡を用いたKIF1A(1-393LZ)の in vitro 単一分子運動性分析のための詳細なプロトコルについて説明します。すべての緩衝液組成および試薬については、 別表1を参照してください。
4. インビトロ 微小管グライディングアッセイ
注:キネシン-3モーターの集団的挙動を理解するために、インビトロ微小管滑走アッセイを実施した18、30、31。モーターが逆さの位置でカバーガラスに固定され、微小管をチャンバーに追加すると、微小管がモーターに着地し、モーターがモーター上を歩こうとすると滑空します(図5A、B)。
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Sf9バキュロウイルス発現を用いて活性型および機能的組換えモータータンパク質を大規模に発現・精製するためには、Sf9細胞に感染するためのコード配列を安定に保持するウイルス粒子の生成が必要です。これを達成するために、Sf9細胞にKIF1A(1-393LZ)-3xmCit-FLAGをコードする組換えバクミドをトランスフェクトした。72時間後、有意な細胞集団が細胞および核の拡大を伴う緑色蛍光タンパク質(mCitrine)の発現を示し(図1 および 図2)、ウイルス粒子(P0)の生成に成功したことが示唆された。これらのウイルス粒子は、新鮮なSf9集団に大量に感染させて、貯蔵および大規模感染用のP1ウイルスストックを生成することによってさらに拡大した。キネシン-3モーターの精製のために、Sf9細胞の30mL培養物を1mLのP1ウイルス粒子で感染させた。感染の72時間後、緑色蛍光タンパク質を明るく発現する細胞を回収し、溶解し、抗FLAG抗体コーティング樹脂によるC末端FLAGタグアフィニティー精製を用いて精製した。興味深いことに、...
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Sf9-バキュロウイルス発現システムは、ハイスループットタンパク質生産のための最も用途が広く成功した方法の1つです19、36、37。Sf9細胞の翻訳後修飾能は、哺乳動物系15と非常に同等である。このシステムを使用することのかなりの欠点は、それが遅く、汚染に敏感であることです。最も重要なステップの1つは、Sf9細胞での効率的な感染と発現の成功であり、汚染のないSf9細胞の適切な取り扱いと維持が必要です。このシステムには、専用のほこりのないスペースと、温度制御されたインキュベーターやシェーカーなどの機器が必要です。不規則な細胞培養の実践と生い茂った培養の使用は、感染不良、成長の鈍化、および重大な細胞死をもたらします。
Sf9細胞で発現するタンパク質のFLAGタグ精製にはいくつかの利点があります。まず、Sf9細胞を効率的に溶解して、ほとんどのタンパク質を活...
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著者は、宣言する競合する金銭的利益を持っていません。
V.S.とP.S.は、Kristen J. Verhey教授(ミシガン大学、米国ミシガン州アナーバー)とRoop Mallik教授(インド工科大学ボンベイ校(IITB)、ムンバイ、インド)の研究を通して無条件の支援に感謝します。P.S. シヴァプリヤ・キルバカラン博士のプロジェクト全体を通しての支援に感謝します。V.S.は、DBT(助成金番号:BT/PR15214/BRB/10/1449/2015およびBT/RLF/再入国/45/2015)およびDST-SERB(助成金番号:ECR/2016/000913)を通じた資金提供を認めています。P.K.Nは、ICMRの資金提供を認めています(助成金番号5/13/13/2019/NCD-III)。P.S. は DST からの資金提供を認めます (助成金番号: SR/WOS-A/LS-73/2017)。D.J.SはIITガンディナガルからのフェローシップを認めています。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| Sf9 培養およびトランスフェクション材料 | |||
| 抗FLAG M2 アフィニティー | バイオレジェン | ド 651502 | タンパク質精製用 |
| アプロチニン | Sigma | A6279 | タンパク質精製用 |
| Cellfectin | Invitrogen | 10362100 | Sf9 トランスフェクション用 |
| DTT | Sigma | D5545 | 運動アッセイおよびタンパク質精製用 |
| FLAGペプチド | Sigma | F3290 | タンパク質精製用 |
| グリセロール | シグマ | G5516 | タンパク質を凍結するには |
| HEPES | Sigma | H3375 | Sf9溶解バッファー用 |
| IGEPAL CA 630 | Sigma | I8896 | Sf9溶解バッファー用 |
| KCl | Sigma | P9541 | バッファー調製用 |
| ロイペプチン | Sigma | L2884 | タンパク質精製用 |
| MgCl2 | Sigma | M2670 | バッファー調製用 |
| NaCl | Sigma | S7653 | 溶解バッファー調製用 |
| PMSF | Sigma | P7626 | タンパク質精製用 |
| Sf9細胞 | トーマス・プカディル博士(インド科学研究所)からの親切な贈り物Education and Research、プネー、インド)。 | バクロビルの発現およびタンパク質精製用 | |
| Sf9培養ボトル | Thermo Scientific | 4115-0125 | 懸濁培養用 |
| Sf-900/SFM 培地 (1X) | Thermo Scientific | 10902-096 -500ml | Sf9細胞の培養用 |
| ショ糖 | シグマ | S1888 | Sf9細胞の溶解緩衝液の調製 |
| Unsupplemented Grace's media | Thermo Scientific 11595030 | -500ml | Sf9 トランスフェクション |
| Mirotubule 重合および単一分子アッセイ用 materails | |||
| ATP | Sigma | A2647 | 運動性および滑走アッセイ用 |
| BSA | Sigma | A2153 | ブロッキング運動性チャンバー |
| カタラーゼ | ΣC9322 | 運動性および滑走アッセイ | |
| DMSO | Sigma | D5879 | ローダミン |
| EGTA | Sigma | 3777 | バッファー調製用 |
| グルコース | ΣG7021 | 運動性および滑走アッセイ用 | |
| グルコースオキシダーゼ | ΣG2133 | 運動性および滑走アッセイ用 | |
| GTP | ΣG8877 | 微小管重合用 | |
| KOH | Sigma | P1767 | PIPESバッファーの調製 pH 6.9 |
| PIPES | Sigma | P6757 | 運動性および滑走アッセイバッファーの調製 |
| 用微小管滑走アッセイ 材料 | |||
| 26G 針 | Dispovan | 微小管のせん断用 | |
| カゼイン | Σ | C3400 | 微小管滑走アッセイ |
| GFPナノボディ | Sivaraj Sivaramakrishnan博士(ミネソタ大学、米国)からのギフトカバー | スリップへのモーターの取り付け用 | |
| Rhodamine | Thermo Scientific | 46406 | ラベリングチューブの調製用チューブリン |
| <ストロング>顕微鏡およびその他の機器 | |||
| 0.5ml、1.5および2mlの微量遠心チューブ | エッペンドルフ | Sf9の培養と精製 | |
| 10ml 使い捨て滅菌ピペット | エッペンドルフ | Sf9の培養と精製 | |
| 10ul、200ul、1mlのマイクロピペットチップ | エッペンドルフ | Sf9の培養と精製 | |
| 15mlのコンカルチューブ | ッペンドルフ | Sf9の培養と精製 | |
| 35mm細胞培養ディッシュ | コール・パーマー | 15179-39 | Sf9培養 |
| 用バランス | Sartorious | 0.01g-300g | |
| 卓上型オービアル振盪インキュベーター | REMI | Sf9 suspenculture at 28oC | |
| カメラ | EMCCD Andor iXon Ultra 897 | TIRF イメージングおよびアクセション用 | |
| 両面テープ | スコッチ | 運動性チャンバーを作るため | |
| ガラスカバースリップ | フィッシャーファイネスト | 12-548-5A | サイズ; 22X30 |
| スライドガラス | ブルースター | 運動性チャンバーを作るため | |
| 加熱ブロック | ノイエーション | パラフィンワックスを溶解 | |
| 倒立顕微鏡 | ニコン エクリプス Ti- U | タンパク質発現をチェックするため | |
| レーザー | 488nm (100mW) | TIRFイメージング用 | |
| 液体窒素 | サンプルの凍結および保存用 | ||
| マイクロキャピラリーローディングチップ | エッペンドルフ | EP022491920 | 微小管のせん断用 |
| 顕微鏡 | ニコン Eclipse Ti2-E DICセットアップ | 用 TIRFイメージング用 | |
| ミニスピン | Genetix, BiotechAsia Pvt.Ltd | クイックスピン | |
| 用 対物レンズ | 100X TIRF対物レンズ、1.49NA油浸 | TIRFイメージング用 | |
| オプティマ ウルトラ遠心分離機 XE | ベックマン・コールター | タンパク質精製用 | |
| パラフィルム | エッペンドルフ | ||
| pHメーター | コーニング | コアリング430 | pHを調整するため |
| ピペットボーイ | VWR | Sf9の培養と精製用 | |
| Sorvall Legend Micro 21 | サーモサイエンティフィック | タンパク質精製用 | |
| Sorvall ST8R遠心分離機 | Thermo Scientific | タンパク質精製 | |
| ThermoMixer | Eppendorf | 微小管重合用 | |
| 超遠心ローター | ベックマン・コールター | SW60Tiローター | |
| 超遠心チューブ | ベックマン | 5 mL、オープントップ薄壁超透明チューブ、13 x 51mm | |
| ボルテックスミキサー | ニューエーション | サンプルミキシング | |
| ワックス | シグマ | V001228 | 運動性チャンバーをシールするために |
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