このプロトコルは人間の好中球のβ2インテグリンの活発化を禁じる低分子薬剤を識別するために流れのcytometryベースの、ハイスループットのスクリーニング方法を記述する。
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このプロトコルは人間の好中球のβ2インテグリンの活発化を禁じる低分子薬剤を識別するために流れのcytometryベースの、ハイスループットのスクリーニング方法を記述する。
このプロトコルは、β2インテグリン活性化の低分子アンタゴニストを特定する方法を確立することを目的としており、コンフォメーション変化報告抗体とハイスループットフローサイトメトリーを利用しています。この分析法は、他の抗体ベースのハイスループットスクリーニング法のガイドとしても役立ちます。β2インテグリンは、免疫応答に重要な白血球特異的な接着分子です。好中球は、感染症と戦うだけでなく、複数の炎症性疾患に関与するために、血流から出るためにインテグリンの活性化に依存しています。β2インテグリンの活性化を制御することは、好中球関連炎症性疾患を治療するための実行可能なアプローチです。このプロトコルでは、モノクローナル抗体であるmAb24は、β2インテグリンの高親和性ヘッドピースに特異的に結合し、単離された一次ヒト好中球のβ2インテグリンの活性化を定量化するために利用されます。N-ホルミルメチオニル-ロイシル-フェニルアラニン(fMLP)は、好中球β2インテグリンを活性化するための刺激として使用されます。この研究では、384ウェルプレートサンプルを自動的に分析できるハイスループットフローサイトメーターを使用しました。β2 インテグリン阻害に対する 320 種類の化学物質の効果を 3 時間以内に評価します。このアプローチにより、β2インテグリンを直接標的とする分子、またはGタンパク質共役受容体開始インテグリンのインサイドアウト活性化シグナル伝達経路の標的分子を同定することができます。
多くの炎症性疾患は、腫れまたは損傷の部位における好中球の浸潤を特徴とする1。これらの組織に浸潤するために、好中球は、内皮への停止、血管壁を横切る血管外漏出、および組織への動員を含む好中球動員カスケードを完了する必要があります2。循環好中球は、特に停止期において、このカスケードを完了するためにβ2インテグリン活性化を必要とします。したがって、好中球の接着、血管外漏出、および動員を減少させるインテグリン阻害薬は、炎症性疾患を効果的に治療する可能性があります3,4。
β2インテグリンは、以前から炎症性疾患の標的となっていました。インテグリンαLβ2を直接標的とするモノクローナル抗体であるエファリズマブは、乾癬の治療薬として開発されました5。しかし、エファリズマブは、JCウイルスの再活性化に起因する進行性多巣性白質脳症という致命的な副作用のために中止されました6,7。新しい抗炎症インテグリンベースの治療法では、副作用を最小限に抑えるために白血球の抗感染機能を維持することを考慮する必要があります。エファリズマブの副作用は、血流中のモノクローナル抗体の循環が長引くことが原因である可能性があり、長期的には免疫機能を阻害する可能性があります8。最近の研究では、エファリズマブがαLβ2架橋とα4インテグリンの望ましくない内在化を媒介することが示されており、副作用の代替的な説明を提供しています9。したがって、短命の低分子アンタゴニストはこの問題を回避できる可能性があります。
ここでは、ヒト好中球を用いた低分子β2インテグリン拮抗薬のスクリーニングのためのハイスループット法を紹介します。β2インテグリンの活性化は、インテグリンエクトドメインへのアクセスとリガンドへの結合親和性の増加を得るために、インテグリンエクトドメインの立体配座変化を必要とします。正準スイッチブレードモデルでは、ベントクローズドインテグリンエクトドメインは、最初に拡張-閉鎖コンフォメーションまで伸長し、次にそのヘッドピースを完全に活性化された拡張-開放コンフォメーションに開きます10,11,12,13。また、ベントクローズドからベントオープン、エクステンデッドオープン、最終的には14,15,16,17,18,19までの代替経路もあります。コンフォメーション特異的抗体mAb24は、エクトドメインのヘッドピースが開いているときにヒトβ2-I様ドメインのエピトープに結合します20,21,22,23。
ここでは、mAb24-APCを使用して、β2インテグリンが活性化されているかどうかを判断します。好中球とインテグリンを活性化するために、好中球β2インテグリン24を活性化できる細菌由来の短い走化性ペプチドであるN-ホルミルメチオニル-ロイシル-フェニルアラニン(fMLP)をこのプロトコルの刺激として使用します。fMLPが好中球上のFpr1に結合すると、Gタンパク質、ホスホリパーゼCβ、およびホスホイノシチド3-キナーゼγを含む下流のシグナル伝達カスケードが活性化されます。これらのシグナル伝達事象は、最終的に、インサイドアウトシグナル伝達経路を介してインテグリン活性化をもたらす18,25。β2インテグリンに直接結合し、インテグリン活性化の立体構造変化を防ぐ低分子アンタゴニスト26に加えて、β2インテグリンのインサイドアウト活性化シグナル伝達経路の成分を阻害できる化合物もこの方法で検出されます。自動フローサイトメーターにより、ハイスループットスクリーニングが可能になります。新しいアンタゴニストを同定することで、インテグリン生理学の理解が深まるだけでなく、インテグリンベースの抗炎症療法に関するトランスレーショナルな洞察が得られる可能性があります。
ヘパリン処理された全血サンプルは、ヘルシンキ宣言の原則に従って、UConn Health の治験審査委員会によって承認されたインフォームド コンセントを取得した後、匿名化された健康な人間のドナーから採取されました。すべてのドナーからインフォームドコンセントが得られました。この研究の選択/除外基準は、参加者の適合性を確保し、潜在的なリスクを最小限に抑えるために慎重に開発されました。適格な参加者は、18歳から65歳で、あらゆる民族で、英語に堪能で、インフォームドコンセントを提供できる人でした。除外された参加者には、法的に権限のある代理人を必要とする人、18歳未満または65歳以上の個人、投獄された個人、妊娠中の女性など、自分でインフォームドコンセントを提供できない人が含まれていました。さらに、参加者は抗炎症薬の使用や炎症状態から解放されている必要がありました。現在の感染症または進行中の慢性または急性炎症状態も除外基準でした。最後に、COVID-19感染の既往歴がある人または最近の人は、この研究に不適格でした。これらの基準は、研究結果に影響を与える可能性のある潜在的な交絡因子を最小限に抑えながら、参加者の安全性と適合性を確保するように設計されています。
1. 試薬の調製
2. ヒト血液からの好中球分離
3. 384ウェルプレートの調製
4. 細胞の処理
5. フローサイトメトリー
6. データ解析
代表的な384ウェルプレートスクリーニングのデータ(図4)では、陰性対照のmAb24-APCのMFIは3236±110であり、陽性対照のmAb24-APCのMFIは7588±858であることが明らかになりました。このプレートのZ'係数は約0.33で、許容範囲内です31。ただし、Z'は二次アッセイでさらに検証する必要があります。
データを正規化するために、すべての値をスケーリングして、正の平均に最大値 1 を割り当て、負の平均に最小値 0 を割り当てました。Z'因子は、二次アッセイでより厳密な検証を受けます。このプレートのカットオフは 0.41 に設定されており、相対 MFI が 0.41 未満のサンプルは、ヒト好中球における fMLP 誘導性 β2 インテグリン活性化を阻害するヒットと見なされます。このプレートからのヒットは確認されませんでした。
プロトコルの有効性を確認するために、Rac-1機能に拮抗してβ2インテグリン活性化を阻害するNexinhib20と、インテグリンαLβ2に直接拮抗するlifitegrast32,33が使用された。ただし、インキュベーション時間は、ネキシンヒブ20で1時間、リフィテグラストで30分に調整されました。.これらの実験から得られたデータは、上記と同じスケーリング方法を使用して正規化されました。次に、これらのデータポイントをプレートの結果と組み合わせ、まとめて分析しました(図4)。

図1:化合物スクリーニングのプレートレイアウト。 384 ウェルプレートにおけるスクリーニング化合物およびコントロールの配置を示す概略図。ネガティブコントロールウェルは青色(1列目と23列目)で、ポジティブコントロールウェルは赤色(2列目と24列目)で示されています。試験井はベージュ色で表されます(列3から22)。矢印は、プレートを読み取るための順序を示します。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図2:密度勾配培地を用いた好中球分離。 密度勾配培地を用いた好中球の分離の成功と失敗を示す代表的な写真。(A)最初に、4 mLの血液を8 mLの密度勾配培地に層状にします。(B)遠心分離後、主に末梢血単核球(PBMC)を含む上部バンドと、赤血球(RBC)を含む好中球を主に含む下部バンドの2つの濁ったバンドが見えるはずです。ほとんどの赤血球は底部にペレット状にされています。(C)赤血球がペレット化されず、好中球バンドが観察されない分離の失敗。好中球バンドを分離するには、追加の遠心分離(10〜30分)が必要です。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図3:FSC/SSCプロットを用いた好中球のゲーティング。 好中球を同定するためのゲーティング戦略を示す代表的な前方散乱線(FSC)および側方散乱線(SSC)プロット。(A)好中球は、フローサイトメーターによって記録された前方散乱(FSC-A)および側方散乱(SSC-A)の面積に基づいてゲーティングされます。(B)前方散乱の幅(FSC-W)と高さ(FSC-H)、および(C)側方散乱の幅(SSC-W)と高さ(SSC-H)に基づいて、単一セルをさらにゲーティングします。カラー スケールはセル密度を表し、密度が減少するにつれて赤から黄、緑、青に変化します。この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図4:代表的な384ウェルプレートでのスクリーニング結果。 スクリーニング結果は代表的な 384 ウェルプレートで、Z' 係数は 0.3 でした。ネガティブコントロールとポジティブコントロールは、それぞれ青と赤の点で示されます。さまざまな化合物で処理されたテストサンプルは、ベージュのドットで表されます。破線は、ヒットを識別するための平均蛍光強度(MFI)カットオフを表します。試験されたすべての化合物がカットオフラインを超えるMFI値を示したため、試験された化合物はいずれもβ2インテグリン拮抗薬として同定されませんでした。既知のβ2インテグリン拮抗薬をさまざまなインキュベーション時間(ネキシンヒブ20を1時間、ライフテグラストを30分)で試験した独立した実験の結果を、この図に示するためにプールしています。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。
好中球の刺激と染色の開始と終了は、好中球と固定剤PFAの添加によって決定されます。したがって、好中球または PFA を各カラムにピペッティングする間隔を同じにすることが重要です。これにより、各ウェルからの好中球の刺激と染色時間が一定に保たれます。好中球の寿命は短いため、ドナーからの採血からフローサイトメトリーの完了まで、すべての実験を同じ日に実施する必要があります。好中球は温度変化に非常に敏感であり、4°Cから室温または室温から37°Cへの移行などの急激な温度上昇にさらされると活性化する可能性があります。 さらに、これまでの経験から、fMLPによる好中球β2インテグリンの活性化は、細胞を氷上または4°Cで保存した場合には起こりません(データは示していません)。したがって、固定前に、全血および好中球を室温または20°C(単離遠心分離ステップ中)に保管する必要があります。全血や好中球を氷の上に置かないでください。
ネガティブコントロールでmAb24を染色すると、非常に低い結果が得られるはずです。実験で高いmAb24染色レベルが観察された場合は、(1)固定前の実験中に有意な温度変化があったかどうかを確認してください。(2)好中球培地にfMLPまたはエンドトキシン汚染があったかどうか。(3)ピペッティングや混合中に気泡が発生するなど、サンプルの取り扱いが強すぎないか。
現在のプロトコルでは、mAb24を使用してβ2インテグリンヘッドピースの開口を報告します。理論的には、β2インテグリンの伸長を報告するモノクローナル抗体であるKIM127 34,35をmAb24と併用することで、β2インテグリンのコンフォメーションを包括的に評価することができます。しかし、KIM127染色のS/N比(1.5〜2倍)はmAb24のS/N比(5〜10倍)ほど良好ではなく、通常、384ウェルプレートアッセイでは満足のいくZ'因子が得られません。96ウェルプレートアッセイでは、フローサイトメトリーを行う前にサンプルを洗浄できるため、可溶性抗体由来のバックグラウンドシグナルが低減されます。したがって、KIM127ベースのアッセイは、384ウェルプレートアッセイと比較してスループットの低い96ウェルプレートアッセイで実施できます。
この方法では、薬物のインテグリン阻害効果を評価するための読み出しとして蛍光強度を使用するため、一部の蛍光薬物が結果を妨げる可能性があります。さらに、10分間の刺激期間内に好中球死を誘発する有毒薬物も、インテグリン阻害を報告するようです。好中球の脱顆粒を阻害する薬剤は、β2インテグリンの全体的な発現を抑制します。これらの脱顆粒阻害剤もスクリーニングで特定されます。したがって、ヒットの抑制効果を確認するために、他の対照との二次スクリーニングが必要です。セカンダリ画面は、ヒットの作用機序を検証および決定するための手段として参照されます。mAb24 テストを繰り返すことに加えて、細胞表面の総 CD18 発現は、汎抗ヒト CD18 抗体を使用して評価されます。mAb24 によって測定される活性化 β2 インテグリンのレベルは、総 CD18 発現によって正規化されます。これにより、薬剤の作用機序がインテグリンの活性化に拮抗するか、細胞表面でのCD18の発現を阻害するかを決定することができます。生存率アッセイは、ヒットの毒性作用を除外するために、二次スクリーニングでも実行する必要があります。
このプロトコルには制限があります。第1に、mAb24は、インテグリンが高親和性状態にある場合にのみ、β2 I様ドメインを検出することができます。したがって、mAb24結合の減少により、リフィテグラストなどのα/β I様アロステリックアンタゴニストを同定することはできません。リフィテグラストはより多くのmAb24結合を誘導し32 、mAb24でMFI値が異常に増加します(図4)。このような異常な値の場合、これらのヒットがα/β I様アロステリックアンタゴニストであるかどうかを検証するために、他のアッセイが必要になる場合があります。第二に、このアッセイのZ'係数は最適ではなく、自動ピペッティングと撹拌の使用によって改善される可能性があります。残念ながら、私たちの研究室には、この仮説を検証するために必要な機器がありません。アッセイの複製または三重化は、上記の方法でZ'因子をさらに改善できない場合に、偽陽性および偽陰性を特定するのに役立ちます。さらに、既知のβ2インテグリン活性化阻害剤Nexinhib20で観察されるように、阻害効果を生じさせるには1時間のインキュベーションを必要とするように、インキュベーション時間を延長してより多くのヒットを同定することが有益であり得る。この研究は、即効性のある薬剤の同定に焦点を当てました。研究者は、特定のニーズに合わせてインキュベーション時間を変更できることに注意する必要があります。
私たちの知る限り、これはβ2インテグリン拮抗薬に対する最初のハイスループットスクリーニング法です。このアプローチは、β2インテグリンに直接結合し、インテグリンαIIbβ3およびα4β1について最近報告された「アゴニスト」特性を持たないアンタゴニストと同様に、中親和性/高親和性インテグリン状態につながるコンフォメーション変化を阻止する低分子化合物を特定するために使用できる可能性があります26。好中球は、心筋虚血再灌流障害36、敗血症37、自己免疫疾患38,39など、多くの炎症性疾患において重要である。低分子医薬品は、抗体ベースの医薬品と比較して、これらの疾患の治療においてより柔軟性が高い可能性があります。私たちの画面からのヒットは、炎症性疾患の潜在的な治療法を提供する可能性があります。
現在の方法は、蛍光抗体ベースのハイスループットスクリーニングです。β1 40,41,42,43,44、αIIbβ345,46、αLインテグリン47,48,49,50にも活性化レポーター抗体が利用できるため、この方法は他のインテグリンのアンタゴニストの同定にも拡張できます。β1ハイブリッドドメイン51,52,53に結合するHUTS-21のような立体構造感受性抗体は、非常に遅い抗原-4(VLA-4、インテグリンα4β1)アロステリックアンタゴニストを同定するためにハイスループットスクリーニングで用いられている54。本スクリーニング方法は、嚢胞性線維症(CF)細胞における嚢胞性線維症膜貫通コンダクタンス調節器(CFTR)表面発現を増加させる化合物など、他の表面受容体の発現を阻害または促進する薬物を見出すために、改変および拡張することもできる。CFでは、複数の変異がCFTRのミスフォールディングを引き起こし、その結果、細胞膜上でCFTRの発現が欠如する55。低分子医薬品はCFTR発現を回復させることが示されている56。プロトコールの修飾では、薬物のインキュベーション時間を数時間に増やして、タンパク質の発現変化を発生させる必要があります。
著者らは、競合する金銭的利害関係がないことを宣言します。
UConn HealthのフローサイトメトリーコアのEvan Jellison博士とLi Zhu氏にはフローサイトメトリーの支援を、UConn Healthの免疫学部門のLynn Puddington博士には機器のサポートを、UConn Healthの臨床研究コアには血液サンプルの採取に協力していただいたSlawa Gajewska氏とPaul Appleton博士に感謝します。UConn School of MedicineのChristopher "Kit" Bonin博士とGeneva Hargis博士には、この原稿の科学的執筆と編集に協力していただいたことに感謝します。この研究は、米国国立衛生研究所、国立心肺血液研究所(R01HL145454)、米国国立総合医学研究所(P20GM121176)、米国心臓協会からのキャリア開発賞(18CDA34110426)、およびUConn Healthからのスタートアップ資金の支援を受けました。 図 1 は BioRender.com で作成されました。
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| 16チャンネルピペット | Thermo | 4661090N | Instrument |
| 384-well plate | Greiner | 784201 | Materials |
| APC anti-human CD11a/CD18 (LFA-1) Antibody Clone: m24 | BioLegend | 363410 | Reagents |
| Bravo 自動リキッドハンドリングプラットフォーム | Agilent | 16050-102 | 384マルチチャンネル液体ハンドラー |
| 遠心分離機 | Eppendorf | モデル5810R | 機器 |
| FlowJo | Becton、Dickinson &NA | 社ソフトウェア | |
| ヒト血清アルブミン溶液(25%) | GeminiBio | 800-120 | 試薬 |
| Lifitegrast | サーモフィッシャー | 50-208-2121 | 試薬 |
| Nexinhib20 | Tocris | 6089 | 試薬 |
| N-Formyl-Met-Leu-Phe (fMLP) | Sigma | F3506 | 試薬 |
| パラホルムアルデヒド 16% 溶液 | 電子顕微鏡 科学 | 15710 | 試薬 |
| プレートバケット | Eppendorf | UL155 | アクセサリー |
| プレート シェーカー | Fisher | 88-861-023 | Instrument |
| PolymorphPrep | PROGEN | 1895 (previous 1114683) | 試薬 |
| Prestwick Chemical Library コンパウンドプレート (10 mM) | Prestwick Chemical Libraries | Ver19_384 | 1520 small molecules, 98% marketed approved drugs (FDA, EMA, JAN, およびその他の機関が承認) |
| RPMI 1640 Medium, no phenol red | Gibco | 11-835-030 | 試薬 |
| スイングバケットローター | Eppendorf | A-4-62 | Rotor |
| ZE5 Cell Analyzer | Bio-Rad Laboratories | Model ZE5 | Instrument |
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