タイムラプス顕微鏡は、出芽酵母の減数分裂を研究するための貴重なツールです。このプロトコルでは、細胞周期同期、タイムラプス顕微鏡、および標的タンパク質の条件付き枯渇を組み合わせて、減数分裂染色体分配中の特定のタンパク質の機能を研究する方法を実証する方法について説明しています。
方法論記事
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タイムラプス顕微鏡は、出芽酵母の減数分裂を研究するための貴重なツールです。このプロトコルでは、細胞周期同期、タイムラプス顕微鏡、および標的タンパク質の条件付き枯渇を組み合わせて、減数分裂染色体分配中の特定のタンパク質の機能を研究する方法を実証する方法について説明しています。
タイムラプス蛍光顕微鏡は、固定細胞のイメージングでは見られない時間的および空間的データを提供することにより、減数分裂細胞周期イベントの理解に革命をもたらしました。出芽酵母は、多くの減数分裂遺伝子が高度に保存されているため、減数分裂染色体分配を研究するための重要なモデル生物であることが証明されています。出芽酵母の減数分裂のタイムラプス顕微鏡検査により、さまざまな減数分裂変異体をモニタリングして、突然変異が減数分裂プロセスをどのように破壊するかを示すことができます。しかし、多くのタンパク質は減数分裂の複数の点で機能します。したがって、機能喪失または減数分裂ヌル変異体の使用は、初期のプロセスを混乱させ、後のプロセスをブロックまたは妨害し、個々の役割に関連する表現型を決定することを困難にする可能性があります。この課題を回避するために、このプロトコルでは、タイムラプス顕微鏡を使用して減数分裂イベントを監視しながら、減数分裂の特定の段階でタンパク質を核から条件付きで枯渇させる方法について説明します。具体的には、このプロトコルでは、細胞が前期Iでどのように同期されるか、アンカーアウェイ技術を使用して特定の減数分裂段階で核からタンパク質を枯渇させる方法、およびタイムラプスイメージングを使用して減数分裂染色体分配を監視する方法について説明します。この技術の有用性の例として、減数分裂中の異なる時点で動原体タンパク質Ctf19が核から枯渇し、減数分裂IIの終わりにクロマチン質量の数が分析されました。全体として、このプロトコルは、減数分裂を監視しながら、核から異なる核タンパク質を枯渇させるように適合させることができる。
タイムラプス蛍光顕微鏡は、出芽酵母における減数分裂染色体分配のダイナミクスを研究するための貴重なツールです1,2。出芽酵母細胞は、重要な栄養素の飢餓を通じて減数分裂を起こすように誘導することができます3。減数分裂の間、細胞は1ラウンドの染色体分配を受け、続いて2つの分裂を経て、胞子にパッケージ化された4つの減数分裂産物を作成します(図1)。個々の細胞は減数分裂の各段階で視覚化でき、固定細胞イメージングでは簡単に見逃すことができる空間的および時間的データを生成します。このプロトコルは、タイムラプス蛍光顕微鏡法と、以前に確立された2つの方法、誘導性NDT80システム(NDT80-in)およびアンカーアウェイ技術を組み合わせて、異なる減数分裂段階における特定のタンパク質の機能を研究する方法を示しています。
NDT80-inシステムは、中減数分裂転写因子NDT80 4,5の誘導発現に依存する減数分裂細胞周期同期のための強力なツールです。NDT80発現は、前期I出口6,7に必要である。NDT80-inシステムでは、NDT80は、エストロゲン受容体(Gal4-ER)に融合したGal4転写因子を発現する細胞において、GAL1-10プロモーターの制御下にあります4,5。Gal4-ERはβ-エストラジオールに結合した場合にのみ核に入るため、NDT80-in細胞はβ-エストラジオールの非存在下で前期Iで停止し、前期Iの細胞の同期を可能にします(図1)。β-エストラジオールの付加は、Gal4-ER転写因子の核への転座を促進し、そこでGAL1-10に結合してNDT80の発現を促進し、減数分裂への同期的な侵入をもたらします。タイムラプス顕微鏡は同期なしで実行できますが、同期を使用する利点は、細胞が減数分裂の特定の段階にある間に阻害剤または薬物を追加できることです。
アンカーアウェイ技術は、ラパマイシン8を添加することでタンパク質を核から枯渇させることができる誘導可能なシステムである。この技術は、酵母細胞が核膜が破壊されない閉鎖有糸分裂および減数分裂を経験するため、出芽酵母の細胞分裂中の核タンパク質の研究に理想的です。さらに、この技術は、減数分裂全体を通して複数の機能を有するタンパク質にとって非常に有用である。欠失、変異対立遺伝子、減数分裂ヌル対立遺伝子とは異なり、特定の段階で核から標的タンパク質を除去しても、初期段階での標的タンパク質活性が損なわれないため、結果をより正確に解釈できます。アンカーアウェイシステムは、リボソームの成熟時に発生する核と細胞質の間のリボソームサブユニットの往復を利用します8。核から標的タンパク質を枯渇させるために、リボソームサブユニットRpl13AがFKBP12でタグ付けされている株において、標的タンパク質はFKBP12-ラパマイシン結合ドメイン(FRB)でタグ付けされる。ラパマイシンがなければ、FRBとFKBP12は相互作用せず、FRBタグ付きタンパク質は核内に残る。ラパマイシンを加えると、ラパマイシンはFKBP12およびFRBと安定な複合体を形成し、複合体はRpl13Aとの相互作用により核からシャトルされます(図1)。ラパマイシン添加時の細胞死を防ぐために、細胞はTOR1遺伝子のtor1-1変異を保持している。さらに、これらの細胞には、S. cerevisiae FKBP12タンパク質のヌル対立遺伝子であるfpr1Δが含まれており、内因性Fpr1がFRBとラパマイシンの結合に関してRpl13A-FKBP12を凌駕するのを防ぎます。アンカーアウェイバックグラウンド変異であるtor1-1およびfpr1Δは、減数分裂のタイミングや染色体分配に影響を与えません2。
この技術の有用性を実証するために、動原体タンパク質Ctf19は減数分裂を通して異なる時点で枯渇した。Ctf19は、有糸分裂には欠かせませんが、減数分裂における適切な染色体分配に必要な動原体の成分です9、10、11、12、13。減数分裂では、動原体は前期Iで脱落し、Ctf19は動原体再組み立てに重要です9,14。このプロトコルでは、NDT80-inシステムと細胞を同期させ、アンカーアウェイ技術を使用して、前期Iからの放出の前後で、および減数分裂後のI染色体分配後に標的タンパク質Ctf19を核から枯渇させました(図1)。このプロトコルは、減数分裂および有糸分裂の任意の段階で目的の他のタンパク質を枯渇させるように適合させることができる。
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1. 必要資料の準備
2.酵母細胞の胞子形成
3. アンカーアウェイ法による核からの標的タンパク質の枯渇
4. タイムラプス蛍光顕微鏡
5. クロマチン分配の解析
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クロマチン分離をモニターするために、ヒストンタンパク質Htb2をmCherryでタグ付けした。前期Iでは、クロマチンは単一のHtb2塊として現れる。相同染色体が最初の減数分裂で分離した後、クロマチンは2つの異なる塊として現れます(図3A)。姉妹染色分体が分離した後、クロマチンは4つの塊として現れる。一部の染色体が紡錘体微小管に付着しない場合、減数分裂Iまたは減数分裂IIの後に追加の腫瘤が見られます。
上記の方法は、出芽酵母減数分裂における適切な染色体分配を確実にする上での動原体成分Ctf19の役割を研究するために使用された。FRBでタグ付けされたCtf19を発現するアンカーアウェイ酵母株を、NDT80-inシステム(tor1-1;fpr1Δ;RPL13A-FKBP12;CTF19-FRB;GAL1-10はNDT80をプロモートしました。GAL4-ER)。対照として、アンカーアウェイ株をバックグラウンドでFRBタグ付きタンパク質を含まないNDT8...
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このプロトコルは、細胞を同期させるNDT80-inシステム、核からタンパク質を枯渇させるアンカーアウェイ技術、および減数分裂中の出芽酵母細胞を画像化する蛍光タイムラプス顕微鏡を組み合わせたものです。NDT80-inシステムは、前期Iの停止と放出を利用する減数分裂細胞周期同期のための方法です4,8。個々の細胞は、その後の減数分裂の各段階で費やされる時間量がわずかに異なりますが、ほとんどの細胞は減数分裂全体を通して高度な同期を維持します。
アンカーアウェイ技術は、有糸分裂および減数分裂研究に適応可能なツールです。ラパマイシン添加のアンカーアウェイ標的タンパク質および時間を変更することにより、この方法は、出芽酵母減数分裂の任意の段階における様々なタンパク質を研究するように適合させることができる。出芽酵母有糸分裂を研究するために条件付き変異体を作製するための一般的な方法は、減数分裂研究に必ずしも適していない。例えば、抑制可能なプロモーター...
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著者は、競合する金銭的利益を宣言していません。
インディアナ大学の光学顕微鏡イメージングセンターに感謝します。この研究は、国立衛生研究所(GM105755)からの助成金によってサポートされました。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| β-estradiol | Millipore Σ | E8875 | 95% EtOH |
| 0.22 uM Threaded Bottle-top Filter Millipore | Sigma | S2GPT02REΣ 100 | |
| % EtOH | Fisher Scientific | 22-032-601 | |
| 10X PBS | Fisher Scientific | BP399500 | の溶剤として使用するために1:10を希釈 |
| します。北米 | 48393241 | ||
| 25 mm x 75 mm 顕微鏡スライド | VWR 北米 | 48300-026 | |
| アデニン半硫酸塩 | ミリポアシグマ | A9126 | SC、SCA、および1% Kac |
| Bacto 寒天培 | BD | 214030 | |
| コンカナビアリン A | ムリポア シグマ | C2010 | カメラで 1mg/mL として製造 |
| セクション4.3 | 測光 | ||
| D-グル | コース フィッシャーサイエンティフィック | D16-10 | |
| ディフコ酵母 窒素塩基 アミノ酸なし | BD | 291920 | |
| ジメチルスルホキシド(DMSO) | ミリポアシグマ | D5879 | |
| エクリプス Ti2 倒立対物レンズ マイクロスコープ | ニコン | セクション4.4で使用 | |
| フィジー | NIH | https://fiji.sc/ | |
| GEパーソナルデルタビジョン顕微鏡 | 4.3 | 応用精度 | |
| L-トリプトファン | ミリポアシグマ | T0254 | SC、SCA、および1%Kac |
| モデリングクレイ | クレヨラ | 2302880000 | スライドホルダーにカバースリップを固定するには |
| NIS-Elements AR 5.30.04 イメージングソフトウェア | コン | セクション4.4で使用 | |
| ORCA-Fustion BTカメラ | 浜松 | C15440-20UP | セクション4で使用 |
| プラスチックピペットチップホルダー | ドットサイエンティフィック | LTS1000-HR | 本製品のラック部分の4角×4角を切り取ります。 |
| Pottassium Acetate | Fisher Scientific | BP264 | |
| Rapamycin | Fisher Scientific | BP29631 | 1mg/mL のストックを作成します |
| 。 | |||
| SoftWorx7.0.0 セクション | 4.3で使用された | 精密 | |
| 合成完全混合物(カイザー) | フォーミディアム | DSCK2500 | |
| タイプN浸漬油 | ニコン | MXA22166 |
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