ここでは、ヒト細胞におけるジカウイルスの感染と複製をリアルタイムで研究するための非常に簡単で簡単な方法として、細胞ベースの電気インピーダンス(CEI)の使用を示します。さらに、CEIアッセイは抗ウイルス化合物の評価に有用である。
方法論記事
ここでは、ヒト細胞におけるジカウイルスの感染と複製をリアルタイムで研究するための非常に簡単で簡単な方法として、細胞ベースの電気インピーダンス(CEI)の使用を示します。さらに、CEIアッセイは抗ウイルス化合物の評価に有用である。
セルベースの電気インピーダンス(CEI)技術は、電極が埋め込まれた培養プレートウェル上の接着細胞単層の成長または操作によって引き起こされるインピーダンスの変化を測定します。この技術は、ジカウイルス(ZIKV)感染と接着細胞複製の影響をリアルタイムで監視するために使用できます, このウイルスは非常に細胞病原性が高いため.これは、標識や侵襲的な方法の使用を必要とせず、リアルタイムデータを提供できるという利点がある簡単なアッセイです。ZIKV感染の動態は、使用する細胞株、ウイルス株、および感染多様性(MOI)に大きく依存しており、従来のエンドポイントアッセイでは簡単に研究することはできません。さらに、CEIアッセイは、抗ウイルス化合物の評価および特性評価にも使用でき、抗ウイルス化合物は感染過程にわたって動的な阻害特性も持つ可能性があります。この方法の記事では、CEIアッセイの実際の実行と、ZIKV研究および抗ウイルス研究全般におけるその潜在的な用途について詳細に説明します。
ジカウイルス(ZIKV)の発生は、小頭症やギランバレー症候群などの重篤な疾患合併症に関連しています1,2,3。蚊媒介生物の分布の広がりや都市化の進展など、さまざまな危険因子により、将来の流行はもっともらしいですが、これまでのところ、ワクチンや抗ウイルス薬はまだ市場に出回っていません3,4。したがって、従来のZIKV研究方法は、このウイルスとその潜在的な抗ウイルス化合物を研究するための新しいツールで補完する必要があります。抗ウイルス研究は、多くの場合、表現型アッセイに基づいており、エンドポイントは、ウイルス誘発性細胞変性効果(CPE)の出現やレポーター遺伝子による特定のウイルス誘導タンパク質の産生などの特定のパラメータの存在です5,6,7。ただし、これらのメソッドにはエンドポイントの読み出しがあり、労働集約的であり、複雑な分析が必要になる場合があります。したがって、インピーダンスベースの方法は魅力的な代替手段を提供します。
セルベースの電気インピーダンス(CEI)は、電極含有ウェルに播種された接着セル層によって引き起こされる、ある電極から別の電極への電流の流れに対する抵抗として定義されます。この方法論で採用されている確立されたCEI技術は、もともとGiaeverとKeese 8,9によって開発された電気セル-基板インピーダンスセンシング(ECIS)です。これは、癌転移、毒物学、創傷治癒などの生物学的研究領域の幅広い分野で使用されています10、11、12。その原理は、周波数の範囲にわたって交流(AC)電圧を連続的に掃引することによって生成される電界に依存しています13。細胞は、これらの非侵襲的電界にばく露され、そして所定の間隔で、細胞増殖または細胞接着もしくは形態の変化によって引き起こされるインピーダンス変化が測定される14。さらに、細胞生存率の変化はインピーダンスの変化にもつながり、この技術は細胞病原性ウイルスの感染を監視するための有用なツールになります15,16,17。細胞層の形態変化をナノスケールで検出するため、高感度な検出ツールとなります。この記事に記載されているCEIアッセイは、細胞のインピーダンス変化を経時的に測定するための簡単で非侵襲的なリアルタイムのラベルフリーの方法です。
CEIは、ZIKV感染の経過またはその潜在的な抗ウイルス薬を評価するために使用されていませんが、診断ツールとしてのCEIの使用は18年以前に調査されています。最近の研究では、A549細胞におけるいくつかのZIKV阻害剤の抗ウイルス活性を決定するためのCEIアッセイの使用が初めて検証されました19。この方法の記事では、このCEIアッセイをより詳細に説明し、さまざまな接着細胞株、およびさまざまな感染多重度(MOI)でのさまざまなZIKV株に拡張します。これにより、フラビウイルス抗ウイルス研究におけるこの方法の多目的な使用が実証される。この方法は、リアルタイムの細胞モニタリングという決定的な利点を有し、重要な感染時点の検出および潜在的な抗ウイルス化合物による動的阻害活性を可能にする。まとめると、CEIテクノロジーは、現在の抗ウイルス方法論の範囲を補完する強力で価値のあるツールを提供します。
記載されているすべてのステップは、バイオセーフティレベル2の実験室の層流キャビネット内で無菌条件下で実行されます。すべての使用済みウイルスは、ベルギーの治験審査委員会(Departement Leefmilieu, Natuur en Energie, Protocol SBB 219 2011/0011)およびKUルーヴェンのバイオセーフティ委員会の規則に従って、承認済みとして取得され、使用されました。
1. 細胞培養の維持
注:このプロトコルは、選択した細胞株を使用して実行されますが、もちろん、細胞播種密度の最適化のみを必要とする、任意の接着細胞株に適合させることができます。
2. CEIプレートの準備
3.細胞の播種
4. CEIアッセイのセットアップと実行
5. コンパウンドの調製とインキュベーション
注:抗ウイルス化合物の例として、ラビリントペプチンA1が使用されます( 材料の表を参照)。このプロトコルは、潜在的な抗ウイルス活性を有するすべての化合物に一般化することができるので、我々はそれを「化合物」と呼ぶ。
6.ウイルスの準備と感染
7.データ分析
この記事では、ZIKV研究におけるCEIアッセイの使用について詳しく説明します。このアッセイのワークフローを図1に示します。所望の細胞型におけるZIKV感染のリアルタイムモニタリングの簡便性、および抗ウイルス化合物による感染阻害の評価を実証する。抗ウイルス剤として、我々はよく記述されたペプチドラビリントペプチンA1(Laby A1)を使用する。これを「化合物」と呼ぶのは、その特定の特性がこの方法の記事の範囲を超えており、他の場所で議論されているためです20,21。注目すべきことに、この方法の再現性については、この方法を使用して得られた個々のインピーダンスプロファイルに焦点を当てたいため、結果のセクションでは説明しません。ただし、これは以前に説明されています19。
最初の一連の実験では、CEI感染アッセイを実行する際の細胞密度の最適化の重要性を実証しました(図2)。播種される細胞が多すぎると、細胞単層は完全に成長し、CEI電極全体にさらに広がることができなくなります。これにより、CCとVCの差が小さくなり、分解能が低下し、抗ウイルス活性の検出ウィンドウが減少します。これは 、図2Eでよく例示されています。U87細胞などの特定の大きな細胞タイプでは、細胞を高密度に播種しすぎると、プレートを操作するときに細胞単層が完全に剥離することさえあります(図2F)。これも顕微鏡で観察されます。
図2はまた、このアッセイが細胞感受性研究の実施に非常に有用であることを実証している。図2A,Bから、感染動態は細胞型に大きく依存していることが明らかです。図2Cは、U87細胞が高MOIでのみZIKV感染の影響を受けやすいことを示しています。
2番目の実験セットでは、CEI感染アッセイの用途の広い使用が、さまざまなMOIで、よく説明されている抗ウイルス化合物の存在下で、さまざまなZIKV株を使用して強調されています(図3)。これらの実験は、フラビウイルス研究で一般的に使用されるモデルであるA549細胞を用いて行われる22,23。この細胞株は、CEIアッセイ24においてその適合性を実証した他の研究においても使用されている。まず、アフリカ系統の代表的なZIKV株であるMR766による感染動態を、アジア系統のPRVABC59のものと比較する。図3Aは、両方の株が同等のCEIパターンを有し、PRVABC59がわずかに遅いCPE誘導特性を有することを示している。これは、CIT50の値にも反映されています(図3B)。この興味深いパラメータは、Fangら16によって最初に導入され、CEI測定の動力学を考慮に入れています。これは、セル制御と比較してインピーダンスを50%低減するのに必要な時間として定義されます。
次に、細胞をZIKV MR766またはPRVABC59のいずれかの3つの異なるMOIに、さまざまな化合物濃度の存在下または非存在下で感染させ、インピーダンスプロファイルをモニターしました。図3C−Hから観察できるように、特定の化合物濃度は、ZIKV感染によって引き起こされるインピーダンス低下を阻害または遅延させる。これは、AUC 値が計算されるときにも反映されます。CEIアッセイの結果はまた、抗ウイルス活性がMOIおよび効力評価の時点に依存することを視覚的に示している。AUCnの計算を使用して、図3Iに示すようにIC50値を決定することができます。最後に、図3Hは、CIT50値を使用して化合物の効力を決定および比較することもできることを示しています。不活性化合物または化合物濃度は、VCに匹敵するCEIプロファイル、AUC、およびCIT50値によって特徴付けられます。

図1:アッセイのワークフローの概略図。 CEIアッセイのタイムラインとさまざまな取り扱いおよびインキュベーションステップがここに示されています。略語:CEI =セルベースの電気インピーダンス。ZIKV = ジカウイルス;D =日数。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図2:異なる密度でのZIKV感染細胞の正規化されたCEIプロファイル。 (A,D)A549、(B,E)HEL 299、または(C,F)U87細胞を、96ウェルCEIプレートに(A-C)15,000〜20,000(「最適」)または(D-F)75,000(「準最適」)細胞で播種した。インピーダンスモニタリングの24時間後、細胞をZIKV MR766の10倍MOI希釈液で感染させた。インピーダンスはさらに5日間連続して監視した。代表的な実験のCEIプロファイル(2つの技術反復の平均±範囲)を示す。略語:CEI =セルベースの電気インピーダンス。MOI =感染の多様性;ZIKV = ジカウイルス;ノルム=正規化。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図3:2つのZIKV株による感染および抗ウイルス化合物による阻害後のA549細胞の正規化されたCEIプロファイル。 (A)接着A549細胞にZIKV MR766またはZIKV PRVABC59のいずれかのさまざまなMOIを感染させ、インピーダンスを継続的に監視しました。代表的な実験の3つの技術反復の平均±SDが示されている。(B)CIT50値は、AのCEIプロファイルに基づいて計算され、比較されました。実行された3つのテクニカル反復の平均±SDが示されています。(C-H)接着性A549細胞を様々な化合物濃度で処理し、続いてZIKV MR766(C−E)またはZIKV PRVABC59(F−H)のいずれかの特異的MOIで感染させた。インピーダンスは継続的に監視されました。代表的な実験の2つの技術反復の平均±範囲が示されている。(i)異なるZIKV株および希釈液に対する化合物阻害を比較するために、AUC nを計算し、すべての条件をCC AUC nで減算し、VC AUCnで割ることによって阻害率を決定した。(J)C−Hで示される実験のCIT50値を、異なるZIKV株およびMOIを比較するために計算した。2つのテクニカル反復の平均±範囲が示されています。略語:CEI =セルベースの電気インピーダンス。MOI =感染の多様性;ZIKV = ジカウイルス;ノルム=正規化。CIT 50 =未処理の制御と比較してインピーダンスが50%減少した時間。AUC =曲線の下の面積。CC =セル制御;VC = ウイルス制御。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
この記事では、ZIKV抗ウイルス研究におけるCEIアッセイの使用について説明します。このアッセイにはリアルタイムモニタリングの利点があるため、選択的化合物によるZIKV感染および抗ウイルス阻害の動態を評価するために使用できます。この方法で得られたデータは、ウイルス誘発性CPEおよび潜在的な抗ウイルス化合物の効力の客観的かつ視覚的観察を可能にする。
CEIは非常に感度の高い方法であるため、この細胞アッセイを実行する際には細心の注意を払う必要があります。ピペッティングのばらつきをできるだけ避けるために、正確なピペッティングを行うことが重要です。さらに、細胞数や使用済みウイルスストックなど、実験結果に影響を与える可能性のある他の要因は、実験の繰り返し間で一定に保つ必要があります。これらは、細胞の成長と感染の速度に大きく影響する要因であるため、計算されたCIT50 値やその他のパラメーターの変動につながる可能性があります。
(潜在的な)抗ウイルス化合物の存在下でCEIアッセイを実施する場合、それらがウイルスの非存在下で細胞のインピーダンスに影響を与えるかどうかを判断することが重要です。この技術は非常に感度が高いため、インピーダンスの変化は化合物の細胞毒性濃度19をはるかに下回って測定される可能性があります。
この記事ではZIKVデータのみを示していますが、このアッセイは、最適なCEIモニタリング頻度の決定など、最小限の最適化作業で、他の細胞病原性(フラビ)ウイルスに簡単に適用できます。CEIアッセイの適応は、チクングニア、インフルエンザA、ヒトおよびウマヘルペスウイルスなどのさまざまなヒトおよび動物ウイルスで採用されています25,26,27,28。ここでは、ウイルス力価の定量や抗ウイルス化合物の同定のための簡単な方法としても使用されます。これらの研究では、CEIの代替方法であるリアルタイム細胞分析を使用しました。
CEI技術の使用は、アッセイの原理が電極埋め込みウェル全体に広がる接着細胞の特性に依存しているため、接着細胞タイプに限定されています。フィブロネクチンなどのウェル表面コーティングは、細胞付着を改善するために使用することができる29。この方法論には他にもいくつかの欠点があり、最初の欠点はそのコストに関連しています。CEI監視装置とそれに付随するハードウェアおよびソフトウェアへの投資とは別に、消耗品もやや高価です。さらに、このプロトコルではウイルス感染を数日間監視する必要があるため、週に1枚の96ウェルプレートを評価できます。高コストと相まって、これは使用を低から中程度のスループット設定に制限します。
これらのスループットの問題のため、この技術は抗ウイルススクリーニングの設定には適していません。ただし、特定の疾患関連環境でのZIKV感染の研究のための細胞感受性を評価する場合など、初期の実験段階では非常に魅力的です。この技術は、トランスフェクトまたはノックアウト細胞株でも有用であり、例えば、特定の侵入受容体の有無にかかわらず、感染動態の変化を容易に観察することができます。これは、ZIKV感染における細胞因子の関与を調査するときに興味深いものです。さらに、後の前臨床段階で、特定のリード候補が選択されている場合、CEIアッセイを使用して、選択された化合物のさらなる詳細な特性評価を行うことができます。CEIバイオセンサは、ウイルス18の検出のために、ウイルス特異的抗体などの特定の生体認識要素を固定化することによって修飾することもできる。全体として、これはウイルス学の設定におけるCEIの多様な使用を浮き彫りにします。
著者らは、利益相反がないことを確認しています。
著者は、原稿を校正してくれたClément HeymannとGorrit Lootsmaに感謝します。この研究は、ウイルス学および化学療法研究所(レガ研究所、KUルーヴェン)の内部助成金によって支援されました。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| A549細胞 | American Type Culture Collection (ATCC) | CCL-185 | これらの細胞は、10% FBS、2 mM L-グルタミン、0.075% 重炭酸ナトリウムを添加した MEM Rega-3 で培養されます。 |
| Acridine Orange/Propidium Iodide Stain | Logos Biosystems | F23001 | 生/死染色 |
| Cellstar ポリプロピレンチューブ、15 mL | Greiner bio-one | 1,88,271 | |
| Cellstar ポリプロピレンチューブ、50 mL | Greiner bio-one | 2,27,261 | |
| Dulbecco's Modified Essential Medium (DMEM) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 41965-039 | U87 用細胞培養培地および HEL 299 細胞 |
| ダルベッコリン酸緩衝生理食塩水 (DPBS) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 14190-094 | |
| ECIS 培養器 96W20idf | Applied BioPhysics | 96W20idf | CEI デバイス用 PET アッセイプレート |
| 電気細胞-基板インピーダンスセンシング (ECIS) Z アレイステーション | Applied BioPhysics | CEIデバイスには、96ウェルステーション、外部制御モジュール、制御、取得、表示ソフトウェアを備えたラップトップが含まれます。必要なソフトウェアは出荷前にインストールされています。注:このデバイスは現在生産されておらず、より高度なECIS Z-Thetaデバイスに置き換えられています | |
| ファルコンポリスチレンチューブ、5mL | コーニング | 352054 | |
| ウシ胎児血清(FBS) | Cytiva | SV30160.03 | すべての使用細胞に添加された細胞培養培地 |
| HEL 299細胞 | ATCC | CCL-137 | これらの細胞は、10% FBSと0.01 M HEPESを添加したDMEMで培養されます。 |
| HEPES buffer, 1 M | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 15630-056 | U87細胞用細胞培養培地添加物 |
| ラビリントホプチン A1 | Roderich Sü教授からの親切な贈り物;ssmuth、工科大学äこの | ベルリン。DMSOに溶解します。 | |
| L-Glutamine, 200 mM | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 25030-024 | A549細胞用細胞培養培地添加剤 |
| Luna細胞計数スライド | Logos Biosystems | L12001 | |
| Luna-FLデュアル蛍光細胞カウンター | Logos Biosystems | L20001 | 細胞生存率カウンター |
| Minimum Essential Medium Rega-3 (MEM Rega-3) | Gibco, Thermo Fisher Scientific | 19993013 | A549細胞用細胞培養培地 |
| 重炭酸ナトリウム、7.5% | Gibco、サーモフィッシャーサイエンティフィック | 25080-060 | A549細胞用細胞培養培地添加剤 |
| 組織培養フラスコ T75 | TPP | Y9076 | |
| トリプシン-EDTA、0.25% | Gibco、サーモフィッシャーサイエンティフィック | 25200-056 | 解離試薬 |
| U87細胞 | ATCC | HTB-14 | これらの細胞は、10% FBS と 0.01 M HEPES を添加した DMEM で培養されます。 |
| Virkon Rely+On tablets | Lanxess | 115-0020 | 消毒液 |
| ジカウイルス (ZIKV) MR766 | ATCC | VR-84 | ZIKV プロトタイプ株、1968 年にウガンダのセンチネル アカゲザルから分離 |
| ZIKV PRVABC59 | ATCC | VR-1843 | 2015 年にプエルトリコの患者から分離された ZIKV 株 |
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