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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
ここに提示されるのは、局所脱細胞化肺組織の単離のためのプロトコルである。このプロトコルは、細胞外マトリックスおよび細胞-マトリックス相互作用の複雑さを研究するための強力なツールを提供します。
肺移植は、重度の肺疾患の後期段階の患者にとって唯一の選択肢であることがよくありますが、これは適切なドナー肺の供給と移植後の急性および慢性の両方の拒絶反応の両方のために制限されています。病気の肺の交換のための新しいバイオエンジニアリングアプローチを確認することは、患者の生存率を改善し、現在の移植方法論に関連する合併症を回避するために不可欠です。代替アプローチは、典型的には急性および慢性拒絶反応の原因である細胞成分を欠く脱細胞化全肺の使用を含む。肺は非常に複雑な器官であるため、血管系、気道、肺胞組織など、特定の領域の細胞外マトリックス成分を調べることは興味深いことです。このアプローチの目的は、研究者が完全に脱細胞化された肺から領域特異的組織を解剖および分離できる簡単で再現性のある方法を確立することです。現在のプロトコルはブタとヒトの肺のために考案されていますが、他の種にも適用される可能性があります。このプロトコルでは、組織の4つの領域、すなわち気道、血管系、肺胞、およびバルク肺組織が指定されました。この手順により、従来のバルク分析方法とは対照的に、脱細胞化肺組織の内容をより正確に表す組織のサンプルを調達できます。
慢性閉塞性肺疾患(COPD)、特発性肺線維症(IPF)、嚢胞性線維症(CF)などの肺疾患は、現在、治療法のないままです1,2,3,4。肺移植は、多くの場合、後期の患者にとって唯一の選択肢ですが、適切なドナー肺の供給と移植後の急性および慢性の両方の拒絶反応の両方のために、これは限られた選択肢のままです3,5,6。そのため、新しい治療戦略が非常に重要です。呼吸生物工学における有望なアプローチの1つは、脱細胞化された天然肺組織から調製された組織由来足場の適用です。無細胞全肺足場は、天然の細胞外マトリックス(ECM)組成と生物活性の複雑さの多くを保持しているため、全臓器工学のために、また肺疾患メカニズムを研究するための改良モデルとして集中的に研究されてきました7,8,9,10。並行して、オルガノイドおよび他の組織培養モデルにおける細胞間および細胞-ECM相互作用を研究するためのヒドロゲルおよび他の基質として、肺を含む異なる器官からの脱細胞化組織を利用することへの関心が高まっている11,12,13,14,15,16,17.これらは、腫瘍源に由来するマトリゲルなどの市販の基質よりも関連性の高いモデルを提供します。しかしながら、ヒト肺由来ヒドロゲルに関する情報は、現時点では比較的限られている。我々は以前に脱細胞化ブタ肺に由来するヒドロゲルを記載し、それらの機械的および材料的特性の両方を特徴付け、ならびに細胞培養モデルとしてのそれらの有用性を実証した18,19。最近の報告は、脱細胞化された正常および罹患(COPD、IPF)ヒト肺に由来するヒドロゲルの初期機械的および粘弾性特性を詳述した20。また、脱細胞化正常およびCOPDヒト肺のグリコサミノグリカン含有量を特徴付ける初期データ、および細胞間および細胞-ECM相互作用の研究へのそれらの適用性も提示しました11。
これらの例は、調査目的で脱細胞化ヒト肺ECMを利用することの力を示しています。しかし、肺は複雑な器官であり、構造と機能の両方が、ECM組成やこわばりなどの他の特性など、肺のさまざまな領域で異なります21,22。そのため、気管と大気道、中小気道、肺胞、大血管、中血管、小血管など、肺の個々の領域でECMを研究することは興味深いことです。この目的のために、私たちは、脱細胞化されたヒトおよびブタの肺を解剖し、続いてそれらの解剖学的領域のそれぞれを単離するための信頼性が高く再現性のある方法を開発しました。これにより、正常な肺と罹患した肺の両方における局所タンパク質含量の詳細な差異分析が可能になった21。
すべての動物実験は、バーモント大学(UVM)のIACUCに従って実施されています。すべてのヒト肺はUVM剖検サービスから取得され、関連する研究はUVMのIRBのガイドラインに従って実施されました。
注:ブタおよびヒト肺の脱細胞化は、我々のグループ7,8,9,10,21によって以前に説明されている。簡単に言うと、肺葉全体は、蠕動ポンプを使用して一連の2 L洗剤および酵素溶液で気道および血管系を順次灌流することによって脱細胞化される:0.1%Triton-X 100、2%デオキシコール酸ナトリウム、1 M塩化ナトリウム、30 μg/mL DNase/1.3 mM MgSO 4/2 mM CaCl2、0.1%過酢酸/4%エタノール、 脱イオン水洗浄。効率的な脱細胞化を確認するための標準的な方法には、脱細胞化肺内の<50 ngmg残留二本鎖dnaの測定、ゲル電気泳動によるdna断片の不存在、およびヘマトキシリンおよびエオジン(h&e)染色による核染色が含まれます9,21。
1. セットアップ
2.気道を露出させる
3.血管系の領域の露出と切除
4.肺胞組織の識別と切除
プロトコルの全体図を図1に示します。一度習得すると、脱細胞化肺組織の局所解剖は容易に再現可能である。切断された各組織サンプルの分類を決定することは、解剖手順の成功に不可欠です。血管組織は気道よりも実質的に弾力性があるため、鉗子を使用して組織を伸ばすことは、特定のサンプルが血管系か気道かの強力な指標となることがよくあります。典型的には、血管組織は気道と平行に走る(図2A)。血管組織はまた、気道組織(図2C)よりも色が白く不透明に見える傾向があります(図2B)。プロトコルに記載されている外科的はさみ拡散技術を図3に示します。気道の大きなサンプルは、気道自体よりもわずかに白く見える軟骨の輪に囲まれています。したがって、軟骨リングを観察することは、問題のサンプルが気道であることの即時の指標です(図4)。サンプルが主に肺胞であるかどうかを判断することは、肺胞が肺全体に存在し、肉眼で観察するには小さすぎるため、やや複雑です。除去されると、肺胞組織は球根のような形状に後退する傾向があり、比較的均質に見えます(図5)。時々、肺胞組織は斑点があるように見えることがありますが、これは中型から大型の気道または血管系の存在を示唆する可能性があるため、目に見える白い縞を含むべきではありません。白い縞やその他の識別できない構造が観察された場合は、組織サンプルをバルク肺として分類し、対応するラベル付きチューブに入れる必要があります。この解剖プロセスは不正確であるため、肺胞組織のカテゴリーを肺胞濃縮として分類します。このプロトコルを使用して、100%純粋な肺胞組織サンプルを得ることは不可能です。しかし、我々は以前に質量分析法を用いて、ECM組成が全肺ECM(wECM)、肺胞富化ECM(aECM)、気道ECM(airECM)、血管系ECM(vECM)を含む脱細胞化肺の個々の領域間で異なることを示した(図6A-F)21。特に、肺疾患の既往歴のない患者から得られた脱細胞化肺では、aECMで基底膜関連タンパク質(すなわちラミニン)が濃縮され、airECMはアグリカン(ACAN)などの軟骨関連ECMタンパク質で濃縮され、vECMはフィブロネクチン(FN1)および血管に関連する他の可溶性ECMタンパク質で濃縮されます(図6G、H)21.さらに、IPFまたはCOPD患者ではECM組成が領域特異的に変化することを以前に示しており、ここで説明するように個々の肺領域を調べる方法の必要性を強調しています21。

図1:肺全体の脱細胞化および解剖プロセスの概略図。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図2:解剖中の脱細胞化気道と血管組織の違いを示す例 。 (A)気道と血管系が並置された初期解剖学的構造。(B)気道および(C)血管系は、それぞれ鉗子で保持されている。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図3:血管系を特定して採取するための手順 。 (A)肺血管系の広い領域が鉗子で直立している。軟骨リングはなく、組織にはある程度の弾力性があり、サンプルが血管系であることが確認されています。(B)外科用ハサミを使用して、血管系の上部を慎重に切断します。(C)十分な血管系がカットの下に保持されているため、簡単に再配置してさらに解剖できます。(D)切片化することができるより遠位血管系の切片。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図4:気道を特定して収穫するための手順 。 (A)鉗子で直立している気道の広い領域。画像は透明な軟骨リングを示しており、サンプルが気道であることを確認しています。(B)外科用ハサミを使用して、気道の上部を慎重に切断します。(C)十分な気道がカットの下に保持されているため、簡単に再配置してさらに解剖することができます。(D)切断された気道は、対応するラベル付きチューブに配置されます。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図5:肺胞組織の代表試料を示す実施例。 単離された肺胞組織は、鉗子で検査のために持ち上げられています。肺胞組織サンプルは、肺から抽出した後は球形であり、均一な着色を有する。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。

図6:脱細胞化肺母体は解剖学的領域によって異なる。 腹側(A)および背側(B)の脱細胞化ヒト肺の代表的な画像と、その後の孤立した気道(C)および血管(D)への解剖。脱細胞化肺ECM(wECM)、肺胞濃縮(aECM)、気道濃縮(airECM)、および血管系濃縮(vECM)領域からのECMの液体窒素粉砕ECM粉末。(F)地域特異的サンプル間の総母体組成の類似性を示す主成分分析(PCA)プロット。(g)脱細胞化肺特異的領域からの平均基底膜組成の比率。(H)すべての脱細胞化肺領域にわたる上位25のマトソームタンパク質のヒートマップ。この図はHoffmanら21から転載されています。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
著者の誰も利益相反を持っていません。
ここに提示されるのは、局所脱細胞化肺組織の単離のためのプロトコルである。このプロトコルは、細胞外マトリックスおよび細胞-マトリックス相互作用の複雑さを研究するための強力なツールを提供します。
著者らは、ヒト肺調達のためのUVM剖検サービスと、解剖技術全体への貢献に対してRobert Pouliot博士に感謝しています。これらの研究はR01 HL127144-01(DJW)の支援を受けた。
| ボンはさみ | ファインサイエンスツール | 14184-09 | |
| モン#5 - ファイン鉗子 | ファインサイエンスツール | 11254-02 | |
| 鉗子、湾曲、S / S、鈍器、鋸歯状 - 130mm | CellPath | N / A | |
| 硬化ファインはさみ | ファインサイエンスツール | 14090-11 | |
| リアアイリス鉗子 | ファインサイエンスツール | 11373-22 | |
| パイレックスガラスキャセロールディッシュ | コールパー | マー3175-10 |