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Research Article
Elena Levi-D’Ancona1,2, Vaibhav Sidarala1, Scott A. Soleimanpour1,3,4
1Department of Internal Medicine, Division of Metabolism, Endocrinology and Diabetes,University of Michigan, Ann Arbor, 2Graduate Program in Immunology,University of Michigan Medical School, 3Department of Molecular and Integrative Physiology,University of Michigan, Ann Arbor, 4VA Ann Arbor Healthcare System
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
このプロトコルは膵臓のβ細胞のmitophagyの量的な分析のための2つの方法を輪郭を描く: 最初に、細胞透過性のミトコンドリア特定の染料の組合せ、および二番目に、遺伝的にコードされたmitophagyのレポーター。これら2つの手法は補完的であり、特定のニーズに基づいて展開できるため、ミトコンドリアの品質管理に定量的に取り組む際の柔軟性と精度を高めることができます。
マイトファジーは、最適なミトコンドリア機能を維持するために必要な品質管理メカニズムです。機能不全のβ細胞マイトファジーは、不十分なインスリン放出をもたらします。マイトファジーの高度な定量的評価には、多くの場合、遺伝子レポーターの使用が必要です。ミトコンドリアを標的としたpH感受性二重励起レシオメトリックプローブを発現し、フローサイトメトリーでマイトファジーを定量化するmt-Keimaマウスモデルは、β細胞で最適化されています。酸性と中性のmt-Keima波長の放射の比率は、マイトファジーを頑健に定量化するために使用できます。しかし、複雑な遺伝子マウスモデルや、初代ヒト膵島などのトランスフェクションが困難な細胞を扱う場合、遺伝的マイトファジーレポーターの使用は困難な場合があります。このプロトコルはMtPhagyを使用して第一次膵島のβ細胞mitophagyを定量化する新しい補足の染料ベースの方法を記述する。MtPhagyは、ミトコンドリアに蓄積し、ミトコンドリアが低pH環境にあるとき(マイトファジー中のリソソームなど)に蛍光強度を増加させる、pH感受性の細胞透過性色素です。MtPhagy 色素を、β細胞を選択する Zn2+ インジケーターであるフルオジン-3-AM、およびミトコンドリア膜電位を評価するためのテトラメチルローダミン、エチルエステル(TMRE)と組み合わせることで、フローサイトメトリーを介してβ細胞内のマイトファジーフラックスを特異的に定量できます。これら2つのアプローチは高度に補完的であり、多数のβ細胞モデルにおけるミトコンドリアの品質管理の評価において柔軟性と精度を可能にします。
膵臓のβ細胞は、代謝要求を満たすためにインスリンを産生および分泌し、β細胞機能障害は、1型糖尿病と2型糖尿病の両方で高血糖と糖尿病発症の原因となります。β細胞は、ミトコンドリアのエネルギーと代謝出力を介してグルコース代謝とインスリン分泌を結合し、機能的なミトコンドリア質量の予備力に依存します1,2,3。最適なβ細胞機能を維持するために、β細胞はミトコンドリアの品質管理メカニズムに依存して、老化または損傷したミトコンドリアを除去し、機能的なミトコンドリア質量を維持します4。選択的ミトコンドリアオートファジーは、マイトファジーとも呼ばれ、ミトコンドリア品質管理経路の重要な要素です。
生細胞におけるマイトファジーの評価は、マイトファジー中に起こるミトコンドリアpHの変化に依存することがよくあります。ミトコンドリアのpHはわずかにアルカリ性で、健康なミトコンドリアは通常、pH中性のサイトゾルに存在します。マイトファジーの間、損傷または機能不全のミトコンドリアは選択的にオートファゴソームに取り込まれ、最終的に酸性リソソーム内で除去されます5。mt-Keima6、mitoQC7、CMMR8などのいくつかのin vivoトランスジェニックマイトファジーレポーターマウスモデル、およびCox8-EGFP-mCherryプラスミド9などのトランスフェクタブルマイトファジープローブは、このpH変化を利用してマイトファジーの定量的評価を提供します。mt-Keima pH感受性二重励起レシオメトリックプローブを発現するトランスジェニックマウスの使用は、フローサイトメトリーによる膵島およびβ細胞のマイトファジー評価に最適化されています10,11。酸性から中性へのmt-Keima波長発光の比(561 nmの酸性励起と480 nmの励起に対する酸性の割合)は、マイトファジー6,12の頑健な定量化に用いることができる。
このプロトコルはmtKeimaのtransgenicマウス10,11から隔離される第一次膵島およびβセルのmitophagyの流束を査定するために最大限に活用されたアプローチを記述する。mt-Keimaは高感度プローブですが、複雑な動物育種スキームや細胞のトランスフェクションが必要であり、他の遺伝子モデルや初代ヒト膵島と組み合わせて作業する場合、困難な場合があります。さらに、中性細胞集団と酸性細胞集団を同定するために複数の蛍光レーザーと検出器を使用することで、他の蛍光レポーターのコンビナトリアル使用を制限することができます。
これらの課題を克服するために、このプロトコルでは、孤立したマウス膵島からのβ細胞のマイトファジーを強力に検出するための補完的な単一の蛍光チャネル、色素ベースの方法も説明します。MtPhagy法と呼ばれるこのアプローチは、3つの細胞透過性色素の組み合わせを利用して、β細胞を選択し、マイトファジーを活発に受けている細胞集団を定量し、ミトコンドリア膜電位(MMPまたはΔψm)を同時に評価します。
これらの色素の最初のものは、Ex/Em 494/516 nm13を有する細胞透過性Zn2+指示薬であるFluozin-3-AMです。マウス膵島は、α細胞、β細胞、δ細胞、PP細胞など、機能的に異なる細胞の不均一な集団で構成されています。β細胞はマウス膵島内の細胞の約80%を占め、インスリン顆粒内のZn2+濃度が高いため、他の膵島細胞タイプと区別することができ14,15、フルオジン-3-AMの高集団としてβ細胞の同定を可能にします。化学結合を介してミトコンドリアに固定化され、弱い蛍光を発するpH感受性染料であるMtPhagy色素もこのプロトコルで利用されています16。マイトファジー誘導により、損傷したミトコンドリアが酸性リソソームに取り込まれ、MtPhagy色素は低pH環境(Ex/Em 561/570-700 nm)内で蛍光強度を増加させます。
さらに、テトラメチルローダミン、エチルエステル(TMRE)は、MMPの評価に使用されます。TMREは細胞透過性の正電荷を帯びた色素(Ex/Em 552/575 nm)であり、膜電位によって維持される相対的な負電荷により、健康なミトコンドリアによって隔離される17。損傷したミトコンドリアや不健康なミトコンドリアは、膜電位を消散させ、TMREを隔離する能力を低下させます。これらの色素を併用すると、マイトファジーを起こしているβ細胞は、フローサイトメトリーによってフルオジン高MtPhagy高TMRE低集団として識別できます。マイトファジーは静的プロセスではなく動的プロセスであるため、このプロトコルは、MMP18の消散後にマイトファジーを誘導するK +-イオノフォアであるバリノマイシンを使用してマイトファジーフラックスを評価するように最適化されました。バリノマイシンの存在下と非存在下でのマイトファジーの比較により、異なるサンプルグループにおけるマイトファジーフラックスの評価が可能になります。
現在のアプローチは色素ベースの性質を持っているため、ヒト膵島やその他のトランスフェクションが困難な細胞タイプに外挿することができ、mt-Keimaプロトコルとは異なり、複雑な動物育種スキームの必要性を回避します。このプロトコルの包括的な目標は、2つの独立したフローサイトメトリーベースの方法を介して、単一細胞レベルでβ細胞のマイトファジーを定量化することです。まとめると、このプロトコルは、ミトコンドリアの品質管理の定量的研究における精度と柔軟性の両方を可能にする2つの強力で補完的な方法を説明しています。
このプロトコルで提示された動物実験は、ミシガン大学の施設的動物管理および使用委員会によってレビューおよび承認されました。この研究には、15週間の通常の脂肪食(RFD)または高脂肪食(HFD)のいずれかを摂取した20週齢の雄のC57BL / 6Jマウスを使用しました。
1. 色素ベースのMtPhagyアプローチによるマイトファジーの評価(方法1)
2. 遺伝子コードmt-Keimaレポーターを用いたマイトファジーの評価(方法2)
色素ベースのMtPhagyアプローチによるマイトファジーの評価
この色素ベースのアプローチは、Fluozin-3-AM、TMRE、MtPhagy、およびDAPIを使用して死細胞を除外し、遺伝子レポーターを必要とせずに初代マウスβ細胞内のマイトファジーフラックスを分析するように最適化されました。マイトファジーを誘導するためにこれらの染料をバリノマイシンと組み合わせることにより、このプロトコルは、一次マウスβ細胞18のマイトファジーフラックスを選択的に測定する染料ベースの方法を概説します。このMtPhagy法を用いて示したデータでは、通常の脂肪食(RFD)または高脂肪食(HFD、60 kcal%脂肪)を給餌したマウスから単離した膵島において、基礎マイトファジーとバリノマイシン誘発性マイトファジーの両方を分析し、マイトファジーフラックスに対する代謝ストレスの影響を評価しました。目的の集団を同定するために、未処理のRFD膵島を用いて細胞をゲーティングした。FSCとSSCの電圧は、まず、SSC-A対FSC-Aのプロットでセルが均等に分布するように調整しました(図1A)。単一セルを選択するには、FSC-H vsFSC-WおよびSSC-Hとの比較SSC-Wプロットを使用し、単一セルと比較して幅のシグナル値が高いため、マルチプレットを除外しました(図1B、C)。次に、DAPI陰性細胞を選択して、死細胞20を除外した(図1D)。一次ゲートを確立した後、単一染色コントロールを使用して、Fluorozin-3-AM、MtPhagy、およびTMREの蛍光ゲートを確立し(図1E-G)、およびマルチカラー蛍光フローサイトメトリーのコンペンセーションコントロールを確立しました。
これらの一次ゲートと蛍光ゲートが確立されると、マイトファジーの利用率が高いβ細胞は、バリノマイシン曝露のないRFDを使用して、第3象限(Q3)でフルオジン高MtPhagy高TMRE低集団として定義されました(図1H)。このゲーティング戦略を用いて、基礎マイシンおよびバリノマイシン誘発性マイトファジーレベルをRFDおよびHFD膵島の両方で特徴付けました(図2)。マイトファジーフラックスを定量化するには、基礎 vs.バリノマイシン誘発性マイトファジーレベルは、以下の比率を使用して比較されました。

この比率を用いて、マイトファジーフラックスを定量化し、RFDとRFD で比較した。肥満と末梢インスリン抵抗性の誘発後のマイトファジーの違いを評価するためのHFD β細胞。RFDにおけるマイトファジーフラックスの定量化 vs.HFDサンプルを 図2Eに示します。この結果は、単純な色素ベースのアプローチを使用してβ細胞のマイトファジーを定量するこのアッセイの実現可能性を強調しています。この方法は、ヒト膵島、トランスフェクションが困難な細胞、およびmt-Keimaトランスジェニックモデルとの交配が面倒な複雑な遺伝子モデルから単離された膵島にも適用できます。
遺伝子コードmt-Keimaレポーターを用いたマイトファジーの評価
Mt-Keimaは、ミトコンドリア内膜を標的とするCox8局在配列と融合した二重励起蛍光タンパク質です。mt-Keimaの二峰性蛍光特性により、細胞内コンパートメント6のpHに応じて、励起スペクトルを中性(405 nm)波長から酸性(561 nm)波長に切り替えることができます。これにより、マイトファジーの頑健なレシオメトリック蛍光分析が可能になり、酸性対中性比の増加はマイトファジーの誘導を示します。このプロトコルでは、Fluozin-3-AMがフローサイトメトリーによってβ細胞を選択するのにも使用されました。これらの代表的な研究では、RFD食を与えられたマウスから単離された膵島を使用してマイトファジーフラックスを評価しました10,11。FSCとSSCの電圧は、まずSSC-A対SSC-Aのセルの均等な分布を達成するように調整されました。FSC-Aプロット(図3A)。単一セルを選択するには、FSC-H vsFSC-WおよびSSC-Hとの比較SSC-Wプロットを使用し、単一セルと比較して幅のシグナル値が高いため、マルチプレットを除外しました(図3B、C)。DAPIおよびフルオジン-3-AMの電圧およびゲーティング戦略は、単一染色膵島を用いて決定しました(図3D、E)。次に、バリノマイシンに曝露していないmt-Keima陽性サンプルを使用して、酸性集団と中性集団の三角形のゲートを同定しました(図3F)。
これらの一次ゲートと蛍光ゲートが確立されると、mt-Keima蛍光における基礎およびバリノマイシンによる変化を用いてマイトファジーフラックスを評価しました(図3F、G)。マイトファジーフラックスを定量化するために、基礎マイトファジー vs.バリノマイシン誘発レベルは、以下の比率を使用して比較されました。

この比率を用いて、RFD細胞におけるマイトファジーフラックスを定量した。この結果の定量を 図 3H に示します。重要なことは、これらの結果は、MtPhagyアプローチを使用して生成されたRFD膵島の結果に匹敵することです(図3H)。

図1:MtPhagy法のゲーティングスキーム。 (A)すべてのセルに対して選択するゲーティングスキームを表示するフロープロット。(B) FSC-H vs.FSC-Wおよび(C)SSC-H vs.SSC-Wです。(D)DAPI陰性細胞をゲーティングして死細胞を除外する。(E)β細胞用に選択するフルオジン-3-AMハイセルのゲーティング。(F)MtPhagyhigh細胞集団とMtPhagy low細胞集団を同定するためのMtPhagy 色素のゲーティングスキーム。(g)TMRE高細胞集団およびTMRE低細胞集団を同定するためのTMREのゲーティングスキーム。(H)第3象限(Q3)のフルオジン高MtPhagy高TMRE低細胞をマイトファジーを受けているβ細胞として同定するために、未処理のRFD膵島で確立された象限ゲーティングスキーム。この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図2:MtPhagyゲーティングスキームを用いた代謝ストレス後のマウスβ細胞におけるマイトファジーフラックスの違いの評価。 (A)未処理のRFD β細胞、(B)未処理のHFD β細胞、(C)バリノマイシン曝露RFD β細胞、および(D)バリノマイシン曝露HFD β細胞の代表的なフローサイトメトリープロット。(E)RFDおよびHFDサンプルについて、バリノマイシンに曝露されたMtPhagy高TMRE低 細胞とバリノマイシンに曝露されていないMtPhagy高TMRE低 細胞の比率を使用して計算された、β細胞におけるマイトファジーフラックスの定量。*p < 0.05 は Student's unpaired t-test による。n = 3/グループ。 この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。

図3:mt-Keima法のゲーティング方式と両法の比較 (A)すべてのセルに対して選択するゲーティングスキームを表示するフロープロット。(B) FSC-H vs.FSC-Wおよび(C)SSC-H vs.SSC-Wです。(D)DAPI陰性細胞をゲーティングして死細胞を除外する。(E)β細胞用に選択するフルオジン-3-AMハイセルのゲーティング。(F)mt-Keima/+未処理細胞および(G)mt-Keima/+バリノマイシン曝露細胞の代表的なフローサイトメトリープロット。(H)mt-Keima法を用いて、バリノマイシンに曝露した酸性/中性細胞の比率と、バリノマイシンに曝露しなかった酸性/中性細胞の比率を用いて計算した、RFD給餌マウスのβ細胞におけるマイトファジーフラックスの定量、およびMtPhagy法と比較した(MtPhagyプロトコルのデータ、図2Eに最初に示されている)。n = 3/グループ。この図の拡大版をご覧になるには、ここをクリックしてください。
SASは、小野薬品工業株式会社から助成金を受けており、ノボノルディスクのコンサルタントを務めています。
このプロトコルは膵臓のβ細胞のmitophagyの量的な分析のための2つの方法を輪郭を描く: 最初に、細胞透過性のミトコンドリア特定の染料の組合せ、および二番目に、遺伝的にコードされたmitophagyのレポーター。これら2つの手法は補完的であり、特定のニーズに基づいて展開できるため、ミトコンドリアの品質管理に定量的に取り組む際の柔軟性と精度を高めることができます。
E.L-D.さんNIH(T32-AI007413およびT32-AG000114)からの支援を認める。SASは、JDRF(COE-2019-861)、NIH(R01 DK135268、R01 DK108921、R01 DK135032、R01 DK136547、U01 DK127747)、退役軍人省(I01 BX004444)、Brehmファミリー、Anthonyファミリーからの支援に感謝しています。
| Antibiotic-Antimycotic | Life Technologies | 15240-062 | |
| Attune NxT Flow Cytometer | Thermofisher Scientific | A24858 | |
| ジメチルスルホキシ | ド Sigma-Aldrich | 317275 | |
| 脂肪酸 フリー ヒートショック BSA 粉末 | Equitech | BAH66 | |
| ウシ胎児血清 | Gemini Bio | 900-108 | |
| フルオジン-3AM | サーモフィッシャーサイエンティフィック | F24195 | 100 &MU;g Fluozin-3AM粉末を51 μL DMSO および 51 μL プルロニック F-127 が 1 mM ストックに達する。 |
| ギブコ RPMI 1640 ミディア | ムフィッシャー サイエンティフィ | ック11-875-093 | |
| HEPES (1M) | Life Technologies | 15630-080 | |
| MtPhagy 染料 | 同人堂 | MT02-10 | 5 μg MtPhagy粉末を50 μL DMSO が 100 μ に達するM株 |
| MtPhagy dye | Dojindo | MT02-10 | |
| Penicillin-Streptomycin (100x) | Life Technologies | 15140-122 | 1x ddH2O リン酸緩衝生理食塩水で 1:10 を希釈することによりプロコトールに使用される 1x 溶液 |
| 10x | Fisher Scientific | BP399-20 | 1x 溶液を ddH2O |
| ピルビン酸ナトリウム (100x) | Life で 1:10 希釈することにより、プロコトールに使用されます。テクノロジー | 11360-070 | 5 μg MtPhagy粉末を50 μL DMSO が 100 μ に達するM株 |
| TMRE [テトラメチルローダミン、エチルエステル、過塩素酸塩] | Anaspec | AS-88061 | TMRE粉末をDMSOで再構成して100 μM株。 |
| トリプシン-EDTA(0.05%)、フェノールレッド | サーモフィッシャーサイエンティフィ | ック25300054 | |
| バリノマイシン | シグマ | V0627 | バリノマイシン粉末をDMSOに再溶解して250nMストックに到達しました。 |