生物科学を教えることは、実験を使用することで、学生にとってより刺激的なものにすることができます。この原稿は、高カロリー食、飢餓、老化に関連する仮説を立ててテストするように学生を奨励するために、教室で利用できる2つの異なる、しかし補完的なプロトコルを提示します。
方法論記事
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生物科学を教えることは、実験を使用することで、学生にとってより刺激的なものにすることができます。この原稿は、高カロリー食、飢餓、老化に関連する仮説を立ててテストするように学生を奨励するために、教室で利用できる2つの異なる、しかし補完的なプロトコルを提示します。
Caenorhabditis elegans(C.エレガンス) は、透明な非寄生性線虫で、単純な生物学を備えているため、細胞またはその分子含有量の染色を通じて生物科学を教えるのに最適なツールになります。ルゴール染料(ヨウ素-ヨウ化カリウム溶液)は、グリコーゲン貯蔵を染色するために生化学で広く使用されています。これに関連して、異なる食事や酸素レベルなどの異なる条件の影響に加えて、給餌された動物と飢餓状態の動物の違いを観察することが可能です。エリオグラウシンは、腸のバリアの喪失を示す青色の染料です。腸のバリアが損なわれていない場合、青い染料は内腔の内側に染みます。しかし、この完全性が損なわれると、染料は体腔内に漏れ出します。実体顕微鏡や顕微鏡を使用して、教師は生理学的および生化学的変化を実証したり、生徒に科学的な質問をするように促したり、これらのアッセイを使用して仮説を立てて仮説を立てたりテストしたりできます。本プロトコルは、学生が容易に実施できる C.エレガンス における2つの染色技術を記載している。
高校での生物科学の教育は、絶え間ない課題です。特に、テクノロジーへのアクセスと使用は、教育学習プロセスに重要な進歩をもたらしましたが、人工知能チャットボットなどのツールは、簡単に(そして時には正しくない)応答が得られるため、合理化と証拠の検索をより困難にします1。そのため、教室での探究型アプローチで実践的な実験を伴う科学的方法を使用することは、学生の批判的思考、創造性、および技術的スキルを開発または刺激するための重要な戦略です2。
この文脈では、自由生活線虫 Caenorhabditis elegans は、その特定の利点のために、教育目的の実験 で成功裏に使用されてきました3:それは寄生虫ではなく、摂食に使用される 大腸菌 はバイオセーフティレベル1であるため、生物学的危険性をほぼゼロに減らします。エレガントで定量化可能な移動運動があり、学生が観察するのは興味深いものです。また、透明であるため、臓器の観察が可能になるだけでなく、生体分子の存在や生理学的変化の発生を示すことができる色素で染色することもできます4。したがって、生化学や老化などの生理学的変化に関連する簡単な仮定を教室で仮定し、検証することが可能です。
グリコーゲンは、グルコシル残基によって形成されるグルコース分子の長い分岐鎖によって形成される貯蔵炭水化物であり、(1→4)-αグリコシドの線形結合と分岐点での(1→6)-αグリコシド結合により形成され、筋肉の収縮、細胞分化、および血糖維持に特に重要です5。グリコーゲンは、酵素グリコーゲン合成酵素のインスリン活性化により、摂食後に合成されます。運動中または空腹時、エピネフリンまたはグルカゴンはそれぞれグリコーゲンホスホリラーゼを活性化し、したがって、多糖類を分解して筋肉細胞にグルコース-6-リン酸を提供するか、遊離グルコースを放出して低血糖を回避します6,7。グリコーゲンレベルの変化は、がんを含むさまざまな生理学的および病態生理学的条件下で、細胞の分化、シグナル伝達、酸化還元調節、および幹細胞性に影響を与えます8。 C.エレガンスでは、グリコーゲンは主に食道筋、皮下組織、腸、ニューロン、そして主に体壁の筋肉に見られます9。グリコーゲン含有量は、ヨウ素がらせん状のコイルに結合してヨウ素-グリコーゲン複合体を形成するため、ルゴールのヨウ素溶液を使用して測定でき、目に見えるシャープな青黒色または茶黒色になり、これはC.エレガンス10のグリコーゲン含有量を示すために成功裏に使用されています。高グルコース摂食によって引き起こされるグリコーゲン蓄積は、線虫の寿命を縮め、したがって老化プロセスを加速させる可能性があることが実証されています11,12。さらに、代謝障害、他のホルモン、および生体異物への曝露もグリコーゲン代謝を変化させる可能性があります13,14。したがって、C.エレガンスのグリコーゲン含有量に関する実験は、さまざまな要因がその代謝を乱し、運動、食事、病気、老化などの横断的なテーマに関連する基本的な生化学に関するクラス内の議論を刺激する可能性があるため、非常に興味深いものです。
老化は、細胞の損傷によって引き起こされる時間依存的な機能低下です。この損傷は、酸化ストレス、テロメアの消耗、タンパク質静止の喪失、炎症、さらには不溶性ポリグルコサン体の蓄積などに関連している可能性があります15。老化の特徴の一つは、生物の生涯に起こるいくつかの慢性疾患に関連する腸の完全性の低下である16。腸の恒常性の維持は、腸上皮の完全性に依存しており、腸上皮は、物理的障壁を形成し、隣接する上皮細胞を接続する結合タンパク質によって支えられています。この上皮に損傷があると、間質への管腔内容物の漏れが起こります17。このメカニズムに基づいて、スマーフ試験は、この青色染料エリオグラウシン二ナトリウム塩が腸膜を通過せず、内腔18に留まるため、いくつかの動物モデルにおける腸の完全性を検証するために使用されてきた。ワームが病原体に感染したり、毒物で汚染されたり、老化したりして間質の完全性が変化すると、染料はバリアを通過してワーム全体に広がり、ワーム全体が青色になります。このアッセイでは、老化の生理学についての議論や、線虫をさまざまな条件にさらすことでこのプロセスを加速または遅延させる要因についての実験が可能になります。ここでのプロトコルでは、生化学と生理学に関連する仮説を立ててテストするように学生を刺激し、刺激するためにクラスで簡単に実行できるこれら2つの染料ベースの方法について詳しく説明します。
プロトコールの最初の部分は、C.エレガンスモデル10のグリコーゲン含有量を定性的および定量的に分析するための適用性を示しています。プロトコルの第 2 部の目的は、C. elegans 腸の完全性を評価することです。この技術により、腸膜の完全性を評価することにより、C.エレガンスの老化をモニタリングすることができます。さらに、それは、物質が老化を加速または遅延させるかどうか、および任意の物質が腸バリア19に毒性の潜在性を有するかどうかを評価することを可能にする。
本研究に用いた C.エレガンス 株は、ブリストルN2野生型であった。ただし、手順は、同等の成長率を示す菌株を使用して再現することも、機器の交換の必要性に基づいて方法を調整する必要があります。それらは同じまたは類似の機能を持っていることを考慮し、または使用する菌株に応じて、特定の菌株には特定のメンテナンスおよび/または感度要件があるためです。この情報は、 Caenorhabditis Genetics Center(CGC)またはWormBaseのWebサイトから入手できます。これらの変更が分析法の再現性に影響を与えることはありません。
注: 大腸菌 OP50(E.coliOP50 )細菌およびブリストルN2野生型株は、米国ミネソタ大学のCGCから、または C.エレガンス 研究所からの寄付から入手できます。研究者の安全のためには、個人用保護具の使用が不可欠です。次亜塩素酸塩や水酸化ナトリウムなどの試薬の濃度は低いですが、これらの化学物質に関連する潜在的なリスクを最小限に抑えるために、原稿で強調されているように、推奨されるPPEを着用することが不可欠です。
1.グリコーゲン含有量

図1: C.エレガンスにおける全体的なグリコーゲン含量アッセイの概略図。 グリコーゲン含量アッセイを実施するためにここで行う実験の概略図です。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
2. 腸管透過性の評価

図2: C.エレガンスにおける腸管透過性アッセイ全体の概略図。 (A) C.エレガンス の準備。(B)エリオグラウシン二ナトリウム塩による染色。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
グリコーゲン含有量アッセイは、グリコーゲンの合成または分解に影響を与える可能性のあるさまざまな菌株の比較研究など、さまざまな試験条件をスクリーニングするための堅牢で迅速な方法を提供します。この研究では、L4線虫を空腹時、摂食、グルコース強化グループの3つの異なる試験条件にさらしました。アッセイは3回実施され、各条件は各アッセイで2回再現されました。代表的な画像を 図3に示します。各アッセイに続いて、ルゴールのヨウ素溶液で染色した線虫を実体顕微鏡で観察し、線虫の染色についてグループ間で定性的に比較しました。目視観察では、空腹時群(飢餓状態)の線虫は、 大腸菌 OP50を給餌した線虫(通常)や大 腸菌 OP50およびD-グルコース(高グルコース)を給餌した線虫と比較して、染色が弱かった。さらに、大腸菌OP50とD-グルコース(高グルコース)を与えられた線虫は、最も強い染色を示しました。

図3:グリコーゲン含量アッセイの代表的な画像。C. elegansのグリコーゲンレベルは、ヨウ素染色によって評価されました。顕微鏡画像は、代表的な線虫を(A)飢餓状態、(B)規則的、または(C)高グルコース条件に48時間さらした様子を示しています。ワームは、ステップ 1.4 で詳述した手順に従って、Lugol のヨウ素/M9 バッファー (1%) の溶液に 5 分間浸漬して染色しました。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
腸管透過性の結果から、腸内が無傷の幼虫(L4)と、加齢により腸管が損傷した老齢虫(成虫7日目)の染色に違いが見られます(図4)。C.エレガンスの腸は、消化と代謝に重要な役割を果たし、ストレス応答と老化調節のシグナル伝達センターとして機能するため、健康にとって中心的に重要な組織です21。若い線虫では、C.エレガンスの腸は腸内容物の漏れを防ぐ強力なバリアで構成されています。しかし、これらの線虫が老化するにつれて、腸のバリア機能は低下し、細胞や微絨毛の進行性の劣化と老化腸内の細菌の蓄積による破壊に対してより敏感になります21,22。若いC.エレガンスが染料エリオグラウシン二ナトリウム塩を摂取すると、線虫の腸が染色されます(図4A)。一方、老化した線虫は、線虫の全身に染料の血管外漏出を示し、腸膜の損傷を示していることが観察できます(図4B)。

図4: C.エレガンス をエリオグラウシン二ナトリウム塩で染色した代表的な画像。 顕微鏡画像は、腸が無傷の 線虫 (L4期)と腸が破裂した線虫(成虫7日目) を示しています。線虫は、ステップ2.2.4に続いて、25%エリオグラウシン二ナトリウム塩溶液に3時間浸漬して染色しました。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
補足図1:C.エレガンスの輪郭を選択するためのImageJスクリーンショット。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足図2:平均を計算するためのImageJスクリーンショット。このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足表1:培地、バッファー、および培養レシピ。 現在のプロトコルで使用されているさまざまなメディア、バッファー、カルチャの構成。 このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
補足ファイル1: 線虫のグリコーゲン含有量を定量化するためのImageJソフトウェアの詳細な説明。 このファイルをダウンロードするには、ここをクリックしてください。
要約すると、このプロトコルは、Lugol染色を使用して個々の C.エレガンス 線虫のグリコーゲン含有量を定性的に評価します:簡単で堅牢で迅速なアッセイです。ルゴール染色は、ラベルフリーで非侵襲的なアプローチであり、細胞内分解能での分子データの取得を容易にし、単一の線虫10内のグリコーゲン含有量の変動のモニタリングを可能にします。さらに、このアッセイは、必要な機器が最小限に抑えられているため、費用対効果が高いという利点があります。画像をキャプチャするために必要なのは顕微鏡または実体顕微鏡のみであり、すべての画像に同じ光/明るさ/露出設定がある限り、携帯電話のカメラを使用して簡単に取得できます。さらに、特定の手続き上の調整により、このプロトコルの有効性を高めることができます。フローフードや遠心分離機などのより複雑な実験装置は、アルコールランプや重力沈殿法で代用できます。これらの代替手段により、この方法はさらに予算にやさしく、幅広い研究者が利用できるようになります。研究者だけでなく、教育者もこのアッセイを学校での教育目的で使用して、グリコーゲンの貯蔵とその生合成に関連する変化を説明することができます。
従来の酵素アッセイではグリコーゲンレベルを定量化できますが、Lugol染色は、 C.エレガンスのグリコーゲン貯蔵を評価するための高感度、正確、費用対効果の高い、ハイスループットな方法として有望視されています。私たちの研究では、データは3つの条件間で染色に顕著な違いがあることを明らかにし、摂食条件と染色の強度との間に潜在的な相関関係があることを示唆しています。言い換えれば、染色強度はグリコーゲン含有量に正比例するため、異なる摂食グループ間でグリコーゲン含有量が異なることを示しています。これらの最初の観察と証拠により、学生は、さまざまな食品、飲料、化学試薬などのさまざまな要因が線虫のグリコーゲン含有量にも影響を与える可能性があるかどうかを調査し、調査することができます。
このアプローチの欠点の1つは、手動の手順と主観的な解釈に依存していることから生じます。目視観察に基づいてスコアが割り当てられる染色評価の主観的な性質は、異なる分析者間でばらつきを生じさせ、結果の解釈に変動をもたらす可能性があります。
また、本報告では、Erioglaucine 二ナトリウム塩という色素を用いたC.エレガンスの腸内完全性の評価も示している。線虫の腸管バリア機能の喪失を評価するには、キューティクルを通して吸収されない青色の染料を線虫に与えることが可能です。このテストは、動物が漫画のスマーフ23のように青くなるため、腸からの染料の漏れをチェックすることを可能にします。この方法論は、以前に腸の評価24,25のための同様の方法を使用してDrosophila melanogasterとDanio rerioに適用されました。C.エレガンスでは、エリオグラウシン二ナトリウム塩と同じ原理の技術を使用し、C.エレガンスの腸の完全性を検証するためのシンプルで再現性のある技術と見なされています19,26。
このプロトコルは、線虫の老化の誘導または遅延を評価するために使用でき、また、複雑な機器を使用することなく、C.エレガンスの腸内の物質の毒性の可能性を簡単かつ迅速に検証するために使用でき、これにより、この方法は経済的に実行可能になります19,27。科学研究での使用に加えて、教師は、C.エレガンスの腸透過性の変化を調査するために、教育機関の教育目的でこのアッセイを使用することもできます。簡単なテストで、老化に関する仮説や、線虫の腸管バリアに対する化学試薬の影響を調査することができます。
このアッセイは、研究の目的に応じて他の 線虫 株および幼虫期を使用するように適合させることができ、代替品がメソッドの再現性を維持するために同じまたは類似の機能を果たす限りです。分析を成功させるには、プロトコルに記載されているように、老化した線虫を3時間染色することが重要です。その後、余分な染料を除去するための洗浄は、この方法の重要なステップであり、ワームが上清とともに除去されないように慎重に行う必要があります。物質を評価する場合、プロトコルに見られる制限の1つは、線虫の腸膜を溶解する容易にアクセス可能なポジティブコントロールを見つけることの難しさです。
著者は何も開示していません。
D.S.Aは、Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento (CNPq/Brazil)、助成金番号 #301808/2018-0、#313117/2019-5、Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio Grande do Sul (FAPERGS/ブラジル)、助成金番号、21/2551-0001963-8、Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES、N.S.JおよびA.C.Sの財務コード001)からの資金提供を認めています。
| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 1.5 mLマイクロチューブ | 地元の | サプライヤー-37 | |
| 度インキュベータ | ーKS4000i | 97014-816 | |
| 50 mLコニカルチューブ | 地元の | サプライヤー-6 | |
| cmペトリプレート | 地元のサプライヤー | - | |
| 寒天菌学 | DinâマイカQuíマイカコンテンポラリーâネア株式会社。 | 9002-18-0 | |
| C. elegans Bristol N2 (野生型) | Caenorhabditis elegans Genetic Center (CGC, Minnesota, USA) | - | |
| CaCL2 | DinâマイカQuíマイカコンテンポラリーâネア株式会社。 | 10035-04-8 | |
| コレステロール | Sigma-Aldrich Brasil Ltda | 57-88-5 | |
| D-(+)-グルコース無水 | ネオン | 50-99-7 | |
| 蒸留H2O | 地元の | ||
| 二ナトリウム塩 | Sigma-Aldrich Brasil Ltda | 3844-45-9 | |
| Escherichia coliOP50 | Caenorhabditis elegans Genetic Center(CGC、ミネソタ州、米国) | - | |
| フローフード | Mylabor | ||
| インキュベーター | 北米のパナソニックヘルスケア会社、MIR-254-PA。 | - | |
| KH2PO4 | ディンâマイカQuíマイカコンテンポラリーâネア株式会社。 | 7778-77-0 | |
| 塩酸レバミゾール | RIPERCOL L 150F | - | |
| ルゴール溶液 | Sigma-Aldrich Brasil Ltda | L6146 | |
| MgSO4 | Synth | S1063-01-AH | |
| 微量遠心分離機 | 遠心分離機 5425R Eppendorf SE, Germany | ||
| Na2HPO4 | DinâマイカQuíマイカコンテンポラリーâネア株式会社。 | 7558-79-4 | |
| NaCl | ディンâマイカQuíマイカコンテンポラリーâネア株式会社。 | 7647-14-5 | |
| Nystatin | Sigma-Aldrich Brasil Ltda | N6261 | |
| ペプトン細菌学 | êxodo científica | 91079-38-8 | |
| 実体顕微鏡 | Leica S8 Apo 実体顕微鏡 (Sãoパウロ、ブラジル) | ||
| ストレプトマイシン硫酸エス | トレプトマックス | - |
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