このプロトコルは、DSヒトiPS細胞を使用してダウン症(DS)の神経新生障害を再現するための方法論を概説しています。プロトコルは、ダウン症候群の神経新生障害の原因として二相性細胞周期の欠陥を特定しました。これは、DSに関連する異常なニューロン新生の根底にある細胞および分子メカニズムを理解するための堅牢なプラットフォームを提供します。
方法論記事
このプロトコルは、DSヒトiPS細胞を使用してダウン症(DS)の神経新生障害を再現するための方法論を概説しています。プロトコルは、ダウン症候群の神経新生障害の原因として二相性細胞周期の欠陥を特定しました。これは、DSに関連する異常なニューロン新生の根底にある細胞および分子メカニズムを理解するための堅牢なプラットフォームを提供します。
ダウン症(DS)は、21番染色体のコピーが余分にあることによって引き起こされ、知的障害の主な原因です。この知的障害の主な要因の1つは、胎児期以降に観察される神経新生の障害です。これらの神経発達異常を研究するために、DS患者から得られた細胞を使用して生成されたヒト誘発多能性幹細胞(hiPSC)は、貴重で関連性のあるモデルを提供します。ここでは、DS胎児期に観察されるDS障害ニューロン新生を再現するための包括的なプロトコルについて説明します。このプロトコルは、21 番染色体の 3 つのコピーを持つ DS-iPSC のペアと、2 つの染色体 21 つのコピーを持つその同質正倍数体 iPSC を利用します。重要なことに、ここに記載されているプロトコルは、DS障害のあるニューロン新生を再現し、二相性細胞周期の欠陥、すなわち、神経原性段階の初期段階でのDS神経前駆細胞(NPC)の増殖の減少、続いて神経原性段階の後期段階でのDS NPCの増殖の増加がDS障害ニューロン新生の原因であることを発見しました。神経原性期の後期にDS NPCの増殖が増加すると、細胞周期からの退出が遅れ、DS NPCからの有糸分裂後ニューロンの生成が減少します。このプロトコルには、ヒトiPS細胞の維持、神経原性段階での二相性細胞周期欠損を示す神経系統への分化、およびその後のDS細胞における神経分化の減少の検証のための詳細な手順が含まれています。この方法論に従うことで、研究者はDSの神経発達状態を模倣した堅牢な実験システムを作成することができ、21トリソミーによって引き起こされる脳の発達の特定の変化を探求することができます。
ダウン症(DS)または21トリソミーは、最も一般的な染色体異常であり、知的障害(ID)の主な原因です1。DS胎児発育中の神経新生障害は、DS2の知的障害の原因の1つです。ヒトDS胎児研究では、脳の重量と体積の減少、ニューロンの減少、アストロサイトの増加3,4、および第II層とIV層のニューロンの異常な分布が示されています5,6。さらに、皮質発達の第2段階、すなわちラミネーションの出現は、DS7では遅延し、無秩序である。
DSの神経発達障害は、主にTs65Dn、Ts1Rhr、Ts1cjeなどのDSのマウスモデルを使用して研究されています8。しかし、これらのマウスモデルは、マウスとヒトとの間の生理学的および発達的な違い9のために、DS研究で観察されたさまざまな表現型を完全に再現することができず、臨床試験の失敗につながった10。人工多能性幹細胞11,12の発明は、DS患者に直接由来する細胞を用いてダウン症の神経学的障害をモデル化する機会を提供した。しかし、ヒトiPS細胞を用いてDSの神経発達障害をモデル化する以前の試みでは、一貫性のない結果が得られ、DS胎児の脳切片13,14,15,16で観察された神経発達障害を完全に説明することはできませんでした。例えば、Shiらが発表した報告では、DS関連のアルツハイマー病の表現型が見つかりましたが、正倍数体対照と比較してDSの神経新生に差はなかったと報告されています15。同様に、Weickらは、正倍数体対照と比較して、DSのシナプス活性の低下が正常な神経新生を報告した16。しかし、これらの論文で報告されたDSの正常な神経新生は、DS胎児の脳切片からの観察と一致しませんでした。その後、Hibaouiらによる報告により、DSの神経新生の減少が報告されましたが、これはDSの胎児脳セクション14からの観察と一致していました。しかし、この報告と別の最近の報告では、DS NPCの増殖の減少がDSの神経新生の減少の原因として説明されています17。しかし、DS NPCの増殖の減少だけでは、DS胎児の脳の発達中にアストログリア細胞の増加とラミネーションの出現の遅延を説明できませんでした。
最近発表された研究では、ヒトiPS細胞を用いたDS欠損型ニューロン新生モデルが開発され、ニューロン新生の減少が示されました。このモデルでは、DSの神経新生障害は、神経原性(多能性幹細胞から神経前駆細胞が生成される段階)の二相性細胞周期の欠陥によるものであることがわかりました。神経原性段階の最初の段階では、DS NPCは同質正倍数体神経細胞と比較して増殖が減少し、続いて神経原性病期18の後期に同質正倍数体細胞と比較してDS NPCの増殖が増加します。
この原稿では、ダウン症の iPSC とその同質正倍数体 iPSC を皮質ニューロンに分化するための段階的な詳細なプロトコルについて説明しました。この方法の全体的な目標は、DS に関連するニューロン新生欠損のモデル化に焦点を当てて、DS hiPSC のペアとその同質正倍数体 iPSC を皮質ニューロンに区別するための詳細な段階的なプロトコルを提供することです。このプロトコルは、DS 障害の神経新生を引き起こす異常の根底にある細胞および分子メカニズムを調査するための堅牢で再現性の高いシステムを提供するように設計されています。
このプロトコルの開発の背後にある理論的根拠は、発生神経生物学の原則を利用して多能性幹細胞の皮質ニューロンへの分化を可能にし、それによって疾患/障害によって生じる表現型の同定を可能にすることです。これは、cAMPやDAPTのような化合物を避けることにより、iPS細胞の神経分化に最小限のアプローチを取ることを目指しました。これは、それぞれCa++ チャネルまたはNOTCH経路の欠陥によって生じる疾患の表現型を隠す可能性があります。同様に、アスコルビン酸、BDNF、およびGDNFの使用も避けられ、神経新生を増強することにより他の神経疾患関連の表現型を隠す可能性があります。
この手法が他の方法よりも優れているのは、DS胎児の脳切片で観察された神経学的表現型の堅牢な再現を提供することにあります。注目すべきは、マウスモデルと比較して、ヒトiPS細胞ベースのシステムは異種間の違いを排除し、ヒト特異的な神経発達過程を研究する ためのより適切なモデルを提供している9が、これまでDS胎児期以降に観察されるDS障害のニューロン新生を再現することができなかった。さらに、iPS細胞の同遺伝子ペアの使用により、観察された表現型の違いのばらつきが減少し、信頼性が向上します。このプロトコルは、神経発達障害とヒトの神経新生を研究する研究者にとって特に興味深いものとなるでしょう。これは、DSのヒト特異的な側面をモデル化しようとしている人や、21トリソミーに関連する神経新生欠損を標的とする治療的介入の開発に関心のある人に特に関連します。
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次のプロトコルに続いて、2組のダウン症候群とその同質正倍数体ヒトiPS細胞を使用しました。1組は、レトロウイルス媒介送達法であるリプログラミング19を用いて作製し、もう一組(NSi003-AおよびNSi003-B)は、非統合型仙台ウイルス送達法を用いて作製した20。プロトコルは、大きく分けて 2 つの段階で構成されています: 神経原性段階 (ステージ 1) と神経分化段階 (ステージ 2)。さらに、ダウン症候群と同質正倍数系細胞株の増殖の違いに基づく2つの段階、すなわち、初期期と後期期が神経原性段階で観察されます。この研究で使用した試薬、培地、および機器の詳細は、材料表に記載されています。
1. ダウン症のヒトiPS細胞と同質正倍数系ヒトヒトPS細胞の培養と維持
2. 神経細胞の分化
注:フィーダーコンディショニング培地(FCM)の調製:T-75フラスコを使用し、フラスコごとに4 x 106 フィーダーセルをプレートします。翌日、40 mLのhiPSC培地と4 ng/mLのbFGFを加えます。7日間集めます。各デイチューブは-20°Cで最大1か月間保管してください。15 cmのディッシュに10 mLの0.1%ゼラチンを37°Cで少なくとも2時間コーティングしてから、細胞を解離します。細胞を解離する1日前に、hESC修飾基底膜マトリックス(以下「適格マトリックス」という)で6ウェルプレートをコーティングします。プロトコール全体で細胞を解離する場合は、細胞剥離溶液( 材料表を参照)、DPBS、およびプレーティング培地(FCMに25 ng/mL bFGFを添加)に10 μMのRIを添加します。あらゆる差別化に対応するフレッシュフィーダーコンディショニング培地(FCM)を調製します。hiPSCの過剰ピペッティングは避けてください。
3. 免疫細胞化学(ICC)
注:細胞を覆い、洗浄段階での吸引中にウェルが乾燥するのを防ぐのに十分なバッファーをすべての段階で追加します。
4. 画像の取得と解析
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特異化したヒトiPS細胞を、シングルセル懸濁液として適格なマトリックスコーティング皿に播種し、bFGFを除去することで分化を開始しました。非外胚葉分化を阻害するために、BMPシグナル伝達阻害剤であるドルソモルフィンをDIV 2-1821から添加した。神経原性段階から前駆細胞をさらに分化させるために、単一細胞懸濁液を適格なマトリックス(図1)上に低密度で再播種し、さらに6〜10週間、早期の神経分化を観察しました。神経分化段階(ステージ2)の後、85日目の分析では、DS培養におけるTUBB3+ニューロンの有意な減少が、同質正倍数体細胞を持つニューロンと比較して明らかになりました(図2A)。定量では、DS培養におけるTUBB3+ニューロンの約2倍の減少が示されました(図2B)。このことは、DS細胞が神経細胞の分化が減少していることを示しており、これはDS胎児の脳切片からの観察と一致しており、この研究で使用された
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この研究では、Euploid hiPSCsとDS hiPSCsの同遺伝子ペアに対する効率的な非指向性単層皮質神経分化プロトコルについて説明します。細胞は単層として増殖するため、培養条件によりさらされやすく、これは、他のプロトコル14,16で一般的に使用されるiPS細胞の分化に胚様体を使用するのと同じ程度には不可能です。オルガノイドシステムの有用性が増大する一方で、単層ベースの神経分化システムは、細胞に均質な分化環境を提供するという利点を持っています。オルガノイドベースのシステムでは、その3次元的な性質により、局所的なパターニング中心のような活性が形成される可能性があります。さらに、オルガノイド内のすべての細胞は、外因的に添加された成長因子に平等にアクセスできるわけではなく、オルガノイドの中心での細胞死から明らかなように、制御不能なモルフォゲン勾配につながります。オルガノイド法にはいくつかの改良が提案されていますが、ヒトサンプルで観察された表現型を再現する...
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著者には、開示すべき利益相反はありません。
著者らは、ダウン症と同質正倍数系のiPSCを提供してくださったStuart H. Orkin教授に感謝します。また、著者らは、この研究を実施するための資金を提供してくれたプネーの国立細胞科学センター(BRIC-NCCS)にも感謝しています。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| MEF 培地: | |||
| DMEM 高グルコース | Gibco | 11965-092 | |
| FBS | VWR | 97068-085 | 10% 最終濃度 |
| 非必須アミノ酸 | ハイクロン | SH30238.01 | 最終濃度 1X 最終濃度 |
| ペニシリン/ストレプトマイシン | ハイクロン | SV30010 | 1X 最終濃度 |
| β-メルカプトエタノール | Gibco | 21985-023 | 1X 最終濃度 |
| <強>hiPSC 培地: | |||
| ノックアウト DMEM/F12 | Gibco | 12660-012 | |
| ノックアウト血清交換 (KOSR) | Gibco | 10828-028 | 20% 最終濃度 |
| 非必須アミノ酸 | Hyclone | SH30238.01 | 1X 最終濃度 |
| Glutamax | Gibco | 35050061 | 1X 最終濃度 |
| ペニシリン/ストレプトマイシン | Hyclone | SV30010 | 1X 最終濃度 |
| &β;-メルカプトエタノール (1000X) | Gibco | 21985-023 | 1X 最終濃度 |
| DDM medium: | |||
| Knockout DMEM/F12 | Gibco | 12660-012 | |
| 非必須アミノ酸 | Hyclone | SH30238.01 | 1X 最終濃度 |
| Glutamax | Gibco | 35050061 | 最終濃度 1X |
| ペニシリン/ストレプトマイシン | Hyclone | SV30010 | 1X 最終濃度 |
| Albumax (10%) | Invitrogen | 11020-021 | 0.5 X of 10% Albumax is final concentration |
| NPC medium: | |||
| DDM medium | |||
| N2 Supplement | Gibco | 17502048 | 最終濃度 |
| B-27 サプリメント (50X) の 1X からビタミン A を差し引いた | Gibco | 12587010 | 1X 最終濃度 |
| 神経分化培地 (ND): | |||
| DDM 培地 | 1/2 体積の | ||
| Neurobasal 培地 | Gibco | 21103-049 | ボリューム |
| N2サプリメント | Gibcoの1/2 | 17502048 | 0.5 X 最終濃度 |
| B-27 サプリメント (50X) | Gibco | 17504044 | 0.5 X 最終濃度 |
| Glutamax | Gibco | 35050061 | 1X ニューロ基礎培地 |
| ペニシリン/ストレプトマイシン | ハイクロン | SV30010 | 1X ニューロ基礎培地 |
| <ストロング>抗体および免疫染色用試薬:> | |||
| パラホルムアルデヒド | Sigma-Aldrich | 158127-500G | 4% |
| DPBS、カルシウムなし、マグネシウムなし | Sigma-Aldrich | D5652 | |
| Triton-X-100 Solution | Sigma-Aldrich | X100-500ML | 0.20% |
| BSA | Hyclone | A7979-50ML | 1.00% |
| 精製抗チューブリン &β;-3 (TUBB3) (TUJ1) | BioLegend | 801202 | 1:500 希釈 |
| Donkey 抗マウス IgG (H+L) 二次抗体、Alexa fluor 594 コンジュゲート | Life Tech Invitrogen | A21203 | 1:250 希釈 |
| 精製マウス-抗ヒト Ki67 | BD Pharmingen | 550609 | 1:100 希釈 |
| 精製抗 PAX6 | BioLegends | 901302 | 1:100 希釈 |
| Alexa fluor 488 ロバ (抗ウサギ) | Life Tech Invitrogen | A21206 | 1:250 |
| DAPI溶液(5 mg/mL) | Sigma | D9542 | 1:1000 |
| <強>その他> | |||
| 細胞剥離液(アキュターゼ) | ギブコ | A11105-01 | すぐに使用できる作業溶液 |
| Rock inhibitor (RI) | セレチケム | Y27632 | 10 mM/ml 最終濃度 |
| ドルソモルフィン | セレチケム | S7306 | 0.125 nM/ml 最終濃度 |
| DPBS with カルシウムおよびマグニジウム (DPBS+ Ca, Mg) | Gibco | 14040133 | |
| カルシウムとマグニジウムを含まないDPBS | Gibco | 14190136 | すぐに使える作業溶液 |
| ゼラチンA型 | シグマ | G2500-100G | 0.10% |
| hESC認証基底膜マトリックス(マトリゲルGFR) | コーニング | 356230 | 1 mg ストックバイアル 希釈 1:240 |
| トリプシン 0.05% | Gibco | 25300054 | |
| トリパンブルー | Gibco | 15250-061 | 0.40% |
| 塩基性フィブラブラスト成長因子 (bFGF) | Peprotech | 100-18B | 25 ng/ml 最終濃度 |
| コラゲナーゼ | ギブコ | 17104-019 | 1mg/mL 最終濃度 |
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