本プロトコルでは、ポリアクリルアミドジルコニウム水酸化水素ゲル(ZrOHハイドロゲル)を、異なる作物発育段階の完全な土壌根から根から浸出するカルボン酸塩を非破壊的かつ現場で採取する方法を詳述します。また、イオンクロマトグラフィー質量分析法(IC-MS)を用いたこれらのカルボン酸塩の局所化マッピングと定量についても概説しています。
Method Article
本プロトコルでは、ポリアクリルアミドジルコニウム水酸化水素ゲル(ZrOHハイドロゲル)を、異なる作物発育段階の完全な土壌根から根から浸出するカルボン酸塩を非破壊的かつ現場で採取する方法を詳述します。また、イオンクロマトグラフィー質量分析法(IC-MS)を用いたこれらのカルボン酸塩の局所化マッピングと定量についても概説しています。
土壌で育てられた植物根からの根の浸出物のサンプリングと信頼性の高い定量化は依然として困難です。さらに、根箱栽培の植物根から噴出する7種類のカルボキシレート(アコニ酸、クエン酸、フマー酸、乳酸、マレート、シュウ酸、スクシ酸)のサンプリング、2Dマッピング、定量化のための非破壊手法を開発しました。ここで説明する方法は、ポリアクリルアミドジルコニウム水酸化水素ゲル(ZrOHハイドロゲル)を用い、検査されたカルボン酸塩を全て取り込み、95.3%±3.12%から111%±1.99%の効率で溶出可能です。ZrOHハイドロゲルはカルボキシレートに対して高い結合能力を持ち、溶液のpHやカルボキシレート種によって最大1.82μmol cm²に達し、通常根圏で得られる濃度よりも高いです。さらに、ZrOHハイドロゲルに結合したカルボン酸は安定しており、分析前に4°Cで数週間保存可能です。用途のために、植物は根系への影響を最小限に抑えて容易にアクセスできる土壌充填のリゾボックスで栽培されます。根から放出されたカルボキシレートを採取するために、ZrOHハイドロゲルを関心領域に24時間慎重に塗布します。ZrOHハイドロゲルを採取した後、マッピングのために切断され、ゲル片はイオンクロマトグラフィー質量分析などの後続分析のために溶出されます。私たちの発見は、ZrOHハイドロゲルが根圏内のカルボキシレート濃度を捕捉・決定するのに効果的であることを示しています。この方法の新規性は、完全な土壌栽培植物根からの根の分泌物を採取できることと、従来の方法(土壌・水耕栽培ハイブリッド方式)が破壊的で単発採取のみを可能にするのに対し、時間分解によるサンプリングが可能であることにあります。最も重要なのは、定量的かつ高解像度のミリメートルスケールの2D画像生成が可能であり、根軸に沿ったカルボキシレートの浸出物や根圏内の空間分布の可視化を容易にすることです。さらに、この方法は成長サイクルのさまざまな段階での根の浸出物のサンプリングを容易にします。
植物の根は様々な化合物を根圏に放出し、その物理的、化学的、生物学的特性を形成します1.植物が非生物的および生物的ストレスにさらされると、根の浸出が特に引き起こされます。根の分泌物は、実際には栄養素や金属の利用可能性と動員、微生物群集と活動、土壌の集合体の安定性、そして植物の病原体に対する防御に直接的または間接的に影響を与える可能性があります1,2,3。最も重要な根の浸出物の一つはカルボン酸塩であり、これらは栄養塩の溶解(リン(P)、鉄(Fe)、銅(Cu)、亜鉛(Zn)など)、重金属耐性、そして根圏2,3,4,5の有益微生物の増強に関与しています。
特に、排出されたカルボン酸塩にはクエン酸、乳酸、シュウ酸、マレート、スクシネート、フマル酸塩が含まれます 6,7,8。例えば、クエン酸塩はFeやアルミニウム(Al)(水素)酸化物に結合したPを動員することでPの獲得に重要な役割を果たします 7,9。しかし、土壌栽培植物からの根の噴出物を正確にサンプリングし定量化することは、主に未攪乱の土壌根系への物理的アクセスの困難や根の滲出液サンプルの取得の困難さから、依然として実験的な課題となっています10,11。さらに、浸出した化合物は微生物分解を急速に進め(数分から数時間以内)、土壌ミネラル表面に強く吸着します1,10。根の浸出研究におけるさらなる課題は、根を乱したり土壌で育てられた植物を収穫したりするため、時間をかけて浸出物を監視することであり、同じ根を再度評価するのが難しいためです。1,11。したがって、根の浸出物の正確なサンプリング、定量化、モニタリングには、空間的変動を捉え、植物成長中の繰り返しサンプリングを容易にする技術が必要です11。
本研究では、Tizianiらがクエン酸塩向けに最初に開発した非破壊的現地法を提示し、現在はさらに改良され、土壌内の土壌で栽培された植物根から噴出する6種類の追加のカルボキシレート(アコニ酸、フマル酸、乳酸、乳酸、マレート、シュウ酸、スクシナ酸)のサンプリング、空間的定在、定量化に応用されています。この方法は、根の浸出物13の採取にジルコニウム水酸化物系ポリアクリルアミド水素ゲル(ZrOHハイドロゲル)を使用します。ZrOHハイドロゲルは、容易に溶出できるアニオン(カルボキシル酸を含む)に対して強い結合能力を示します 12,13,14。ZrOHハイドロゲルは、(1) 土壌で育てられた植物の根から、ヒドロゲルを根系に単純に配置することで根カルボン酸塩を採取することを可能にします。(2) 結合したカルボン酸塩を微生物の鉱化から少なくとも6週間効果的に保護すること、(3) ゲルに結合しても根圏内のカルボン酸塩の空間分布が維持されること、(4) カルボン酸塩のミリスケール2次元マッピングを可能にします 12.
根の分泌物採取の既存の方法は、土壌栽培植物からの土壌技術(根洗浄や土壌水耕栽培ハイブリッド、土壌-根浸出物収集装置(SOIL-REC)装置、マイクロ吸引カップ、フィルターペーパー/寒天シート、浸出トラップ、RHIZOテスト技術)と水耕栽培浸出液採取法のいずれかに分類されます。根洗浄または土壌-水耕栽培ハイブリッドアプローチは、植物全体を土壌から慎重に除去し、根系を洗浄し、サンプリング溶液に浸して根の分泌物15を採取する方法です。その簡便さから土壌栽培植物の浸出物採取で最もよく使われている方法です。しかし、根を土壌から抽出すると根毛や細い根が失われるリスクがあります。さらに、根の徹底的な清掃が必要であり、これにより根を損傷し、根の浸出物の質や量が損なわれ、時間分解によるサンプリングが不可能になる可能性があります。SOIL-REC法は、特別に設計されたリゾボックスシステムで植物を育て、根を2つの多孔質ナイロンメッシュ(≤ 30 μm)の間に伸ばし、根の浸出物を採取するルートエクスプレートを用いて採取します。この方法は根系を保存し、土壌汚染を最小限に抑え、根のエクスプーデートを繰り返し採取できるようにします。しかし、複雑な構成(複製数は少なく)、サンプリングに用いる大体積からの浸出物の希釈が高く、再現性が難しく、8回目の複製間で大きな変動があるため、最適化も必要です。
周囲の溶液と平衡化できる小さな樹脂片、寒天ゲルシート、または浸出物を対象の根区間に吸着させる(すなわち、根箱や根窓を利用)18,19。この方法は時間分解によるサンプリングと局所的な浸出物組成の部分的測定を可能にしますが、空間分解能は低いです。一方で、微生物の鉱化による人工物の影響を受けやすく、取り扱いが厄介です。同様に、溶出トラップは個々の根のセグメントからの浸出物を採取するために用いられます。ここでは、単一の根を水平の側室に閉じ込め、密閉されたパースペックスリングに採取液を収め、局所的に配置されます。この方法は水耕栽培根と土壌栽培根の両方に適用可能であり、局所的なサンプリングを可能にします。しかし、少量の採集が可能で、時間分解によるサンプリングはほぼ不可能であり、個々の根を分離することは機械的応力を受けやすく、根の代謝や浸出に影響を与える可能性があります。マイクロ吸盤は根圏内の土壌溶液の採取に用いられ、土壌で育てられた根からの現地サンプリングを可能にします。しかし、少量の採集が行われ、採取は部分的に時間分解され、滲出物は吸着や微生物分解を受けやすい16です。RHIZOテスト技術は、根を小さな円筒形で水耕栽培し、底部に30μmのナイロンメッシュで覆い、土壌ディスクに移すことで根と土壌間の溶質交換を可能にします。根マットをサンプリング溶液に浸すことで、浸出物を採取します。この方法は根や土壌との接触を維持しつつ人工的な成長条件を用います。短期実験に限定され、時間分解サンプリングはありません。これらの方法の中で、空間的な浸出パターンを決定するために使用できるのは樹脂、寒天ゲルシート、フィルターペーパー、浸出トラップ、マイクロ吸盤のみです。
水耕栽培抽出法には、水耕栽培および半水耕栽培技術が含まれます。水耕栽培は根の滲出液を収集する際によく使われる簡単な方法であり、植物を栄養液で育てた後、その代わりにサンプリング溶液(H2O、CaSO4、CaCl2、マイクロパー)を用いて浸出物サンプルを得ます15,23。この方法はシンプルで、根にかかる機械的応力が最小限です。再現性が高く、必要に応じて無菌性があるため、根の浸出物の品質が向上し、時間分解によるサンプリングが可能になります 5,16。それでも、これは植物の生理学、形態(例:根毛の発生)、根の分泌過程を変化させる非常に人工的なシステムです6,15。セミハイドロポニックスでは、植物をガラスビーズ、砂、またはバーミキュライトの上で、継続的に浸透する栄養溶液で栽培し、浸出物を浸透溶液に集めます8,18。この方法は水耕栽培に比べてやや人工的ではなく、時間分解によるサンプリングが可能です。しかし、このシステムはほぼ完全に水分飽和状態であるため、部分的に嫌気性条件に耐性のある植物が必要です。
他の手法と比較して、ZrOHハイドロゲル法はいくつかの利点を提供します。ZrOHハイドロゲルは、土壌栽培(自然条件に近い環境)で根系への影響を最小限に抑えて根の浸出物を採取でき、植物のライフサイクル中に時間分解されたサンプリングを行い、微生物分解の低減と高いカルボキシレート結合能力により根の浸出物を24時間以上収集することが可能です12。さらに、ハイドロゲルのサンプル/保存にバイオサイド(例:マイクロパー、NaN3)は不要であり、長期的に分析機器に影響を与え化学分析の妨げとなる可能性があります。これはカルボン酸塩がZrOHハイドロゲルに化学的に結合しているためです。さらに、サンプルは分析前に数週間から数ヶ月保存できるため、1つの実験装置から多くのサンプルを採取でき、これはハイドロゲル中のZrの抗菌特性によるものと考えられます。さらに、ZrOHハイドロゲルは根圏内の噴出化合物やその他の陰イオンの2Dミリ分解能マッピングを可能にし、根系全体のサンプリングも可能です。ZrOHハイドロゲルは、従来の方法が通常冷凍庫(-20°C)で保存される大量の量に比べて、冷蔵庫内の保管スペースが4°Cで少なくて済みます。主な制約は、気泡を最小限に抑えた高品質のZrOHハイドロゲルを製造することに慣れること、そしてリゾボックスが人工的な栽培環境であることです。もう一つの制約は、この方法が7つのカルボキシレート(アコニテート、クエン酸塩、フマル酸塩、乳酸、マレート、スクシネート、シュウサレート)12、スルホンアミド(スルファジアジン、スルファメタジン、スルファクロロピリダジン、クリンダマイシン)27、および無機陰イオン(硫化物およびP、V-バナジウム、As-ヒ素、セレン、モリブデン、Sb-アンチモンのオキシアニオン)14,26,28,29)に対してのみ開発されていることです。ZrOHハイドロゲルは、リゾスフィア28、29、30におけるサイオン(Al、Fe、Ca-カルシウム、Mg-マグネシウム、Mn-マンガン、Ni-ニッケル、Zn-亜鉛)の生原サンプリングおよびマッピングにおいて、懸濁粒子試薬であるイミノジアセチン酸と組み合わせて使用されています。
ここでは、土壌成長根系からのカルボキシル酸塩の時間および空間的に分離された現地サンプリングを可能にするZrOHハイドロゲルベースの手法を提供します。根の浸出物のサンプリングや2Dマッピングを含む、ZrOHハイドロゲル技術を用いたリゾボックス実験の詳細な説明を提供します。この実験では、ヒドロゲルの調製、リゾボックス充填、植物の栽培、ハイドロゲルの施布、回収と切断、ヒドロゲルからのカルボキシレートの洗脱および分析、そして2D画像生成が続きます。さらに、イオンクロマトグラフィー質量分析(IC-MS)を用いたカルボキシレート分析などの重要なステップに関するノートも提供しています。
1. ZrOHハイドロゲル製剤
注意:ゲルの調製には汚染を防ぐために清潔な環境と材料が必要です。溶液の調製、ゲルのすがい、品質保証のため水和時には、実験室用グレードIの水(≤18 MΩ·cm)のみを使用してください。ハイドロゲル製製開始前に、有害廃棄物容器(液体および固体)がすでにフムフードに入れられていることを確認してください。ゲルの準備を始める前に、オーブンを約42〜45°Cまで1時間予熱してください。材料および化学物質の詳細は 材料表に記載されています。
2. Rhizobox実験セットアップ
注意:植物は土壌で満たされたリゾボックスで栽培されており、その設計は様々です。水やりを容易にし、均一な水分分布を確保するために、底または背面に穴が開けられたリゾボックスの使用を推奨します( 補足図1参照)。材料や化学物質の詳細は 材料表に記載されています。
3. 根の滲出物サンプリング 12,26
注意:ここでは根の滲出物の非破壊サンプリングの詳細を記載しています。必要な材料はすべてサンプリング前に準備され、実験用ブランクもサンプリング中に含まれていることを確認してください。材料および化学物質の詳細は 材料表に記載されています。
4. カルボキシレートの洗脱と測定12
注意:ブランクおよび標準品の準備には、新鮮な実験室用グレードI水と高純度の分析基準が必要です。品質保証として、認証済み品質管理基準を使用するべきです。分析前に0.2μmまたは0.45μmのナイロンフィルターで試料をろ過し、チューブの詰まりを防ぐために溶液(試料および標準物質)に粒子が含まれていないことを確認します。材料および化学物質の詳細は 材料表に記載されています。
5. 2次元マッピング
注:浸出データの2D画像を作成する専用ソフトウェアはありません。マッピングはMicrosoft ExcelとPythonで行えます。
ZrOHハイドロゲル法は、もともと土壌栽培植物根からシエン酸をサンプリングするために開発され、11の浸出物の空間的分布を解消するために成功裏に用いられました。この方法を他のカルボキシレートに採用する前に、ZrOHハイドロゲルが他のカルボキシレートとも適合しているかを特性評価しました(補足表1参照)。さらに、2019年に実施されたリゾボックス実験から蓄積されたロードZrOHハイドロゲルを溶出・解析しました。ZrOHハイドロゲルは、Tizianiらが定めた12(1 mL, 0.5 mol L-1 NaOH)と同じ洗脱パラメータを用いて、アコニ酸、シナイト酸、フマル酸、乳酸、マレート、シュウ酸、スクシン酸に対して、5時間(~0.2 μmol、10 mL)以内に負荷量の100%を吸収できます。ZrOHハイドロゲルは最大3.29 μmol cm-2±0.40 μmol cm-2のカルボキシル酸塩に結合でき、通常根圏で見られる(多くはnmol範囲)よりもはるかに高い濃度です。さらに、カルボキシレートを含んだZrOHハイドロゲルは安定しており、分析前に数週間保存できるため、サンプリング中および後の微生物分解を最小限に抑えます。
図3の結果は、P欠乏土壌で栽培された土壌栽培のルピヌス・アルバスL(ルピナス)植物のクラスター根に沿ったシトレートの噴出物の空間分布を2次元で可視化しています。このマップは、2019年8月のシトレートサンプリング後、ZrOHゲルを2025年8月に区切分けした5×2 mmゲル片上で行われた48件の個別測定で構成されています。明らかに、ZrOHハイドロゲルは浸出したクエン酸塩を効果的に吸収し、小型ゲル(0.10 cm2)でも、エリュートの前濃縮を必要とせずに定量的な結果が得られました。最も高いクエン酸塩の浸出率はクラスター根領域(最大2.8 nmol cm-2 gel h-1)で見られ、1日目には67.2 nmol cm-2のゲルに相当し、最も低い濃度は土壌に接触したゲル片で観察されました。クラスター根の長さは0.2 mmから15.6 mmまで幅があり、全長は250 mmでした。これらの結果は、ヒドロゲルが根放出によるカルボキシレートサンプリングに24時間適していることを確認しています。ZrOHハイドロゲルは、クエン酸塩に加えて、乳酸、フマル酸、マレート、シュウ酸など他のカルボキシレートとも結合することができました(表1)。ZrOHハイドロゲルから6年間4°Cで保存されたほとんどのカルボキシル酸が検出されたことは、カルボキシル酸の分解が最小限であることを示唆しています。しかし、異なる植物種から検出された7種類のカルボン酸について、さらに多くの情報を集めるための実験が進行中です。

図1: ポリアクリルアミドゲルの準備の重要なステップ。(A) ガラス板アセンブリの位置合わせ(約1mmのオフセット)。(B) ゲル鋳造および (C) プレート中心からゲル溶液を均一に広げること。(D) 角からカミソリの刃を使ってガラス板をレバーに持ち上げる。(E) ガラス板から外すためにゲルを浸す。(F) ゲルをビーカーに洗い流す。 この図の拡大版はこちらをクリックしてください。

図2: ZrOHハイドロゲルを用いた根箱栽培植物根系の根部からの根の滲出物採取。(A)前面プレートとプラスチックを取り外した後、リゾボックスを開ける。(B)洗浄ボトル内の脱イオン水を用いた土壌-根の界面を適切に湿らせる。(C)湿った土壌-根の界面に取り付けられた核孔トラックエッチ膜。(D)関心領域にZrOHハイドロゲルを塗布し、前面プレートに対するジェル保護のためにプラスチックホイルで覆われたリゾボックス。 この図の拡大版はこちらをクリックしてご覧ください。

図3:ZrOHハイドロゲルを用いた根の滲出物採取およびシトレート浸出のミリスケール2次元画像。 (A) マッピング用のグリッド作成のために、関心のある根領域に重ねたZrOHハイドロゲルの写真。(B) リン不足土壌で育つ白いルピヌス・アルバスL.(ルピン)クラスター根の分布を示すシトレート浸出率の分布を示すミリ波スケールの2D画像。各グリッドは5×2 mmのゲル片を表しています。この図の拡大版はこちらをクリックしてください。
| 工場 | 治療 | アコニタテ | クエン酸塩 | フマーレート | 乳酸 | マラテ | シュウ酸 | サシネート |
| mg P kg-1 土壌 | NMOL CM-2 H-1 | |||||||
| ルパン | 50 | 0.02 | 0.21 | 0.15 | 0.06 | |||
| ルパン | 250 | 0.02 | 0.4 | 0.17 | 0.02 | 0.2 | ||
| ルパン | 250 | 0.05 | 0.31 | 0.09 | 0.01 | 0.19 | ||
| ルパン | 0 | 0.03 | 0.21 | 0.15 | 0.02 | 0.1 | ||
| ライス(DJ123) | 250 | 0.01 | 0.24 | 0.04 | 0.02 | 0.1 | ||
| ライス(DJ123) | 250 | 0.01 | 0.39 | 0.12 | 0.1 | |||
| ライス(ネリカ4) | 50 | 0.01 | 0.24 | 0.35 | 0.09 | |||
表1:0、50、250 mg P kg-1土壌に作用した場合の、土壌栽培のLupinus albus L.(ルピン)およびOryza sativa L.(稲)のアコニテート、クエン酸塩、フマル酸塩、乳酸酸塩、マレート、シュウ酸塩、シュク酸塩の分泌率。LOQは定量の限界です
補足表1:7つのカルボキシレートに対するZrOHハイドロゲルの洗脱パラメータ(1 mL、0.5 mol L-1)および容量(溶出効率および補正係数)。データは平均の標準偏差±平均値(個々のカルボキシレートの洗脱効率と容量はn=4、カルボキシレート混合物はn=40)です。このファイルをダウンロードするにはこちらをクリックしてください。
補足図1:水やりを容易にするための推奨リゾボックスの概略図。リゾボックスは、底部と背面に均等に配置された水飲み穴を備えたリゾボックスフレームと、実験中の根の成長監視用の取り外し可能な透明な前面プレートで構成されています。このファイルをダウンロードするにはこちらをクリックしてください。
補足図2:Rhizoboxの組み立ておよび土壌充填工程。 (A)Rhizoboxフレームの裏側の穴を粘着テープで覆います。(B)Rhizozboxフレームの前面または開口側に(核孔膜)、その後プラスチックホイルを貼り付けます(十分にきつく平らであることを確認してください)。(C)前面プレートを設置し、ライゾボックスをクランプします。(D)リゾボックスを前方に傾けて、細かい粒子が取り外し可能な表面に落ちるようにして、写真のように滑らかな表面にします。(E) または、開口側から覆われたリゾボックスフレーム(A)を充填し、取り外し可能なプレートで水平にし、その後核孔膜、プラスチックホイル、前面プレートで覆う。(F) 最終セットアップ、水やりと植え付け。代替の充填手順はWagnerら(2020)に示されている。このファイルをダウンロードするにはこちらをクリックしてください。
補足ファイル1: このファイルには、ヒートマップを生成するために使用されたRスクリプトの詳細が含まれています。このファイルをダウンロードするには、こちらをクリックしてください。
ここで説明するカルボキシレートサンプリング法はZrOHハイドロゲルを用いており、適切なゲルの調製と取り扱いが不可欠です。ZrOHハイドロゲルを扱う際は、数滴の実験室用水で湿った状態に保つことを推奨します。調製時には、ゲル混合物を準備した後(ステップ1.1.3)、迅速にゲルを鋳造し、ガラス板間に気泡が形成されないようにすることが重要です。特にZrOHハイドロゲルの中心部にある気泡は、サンプリングの妨げになるため重要です。一方、塗布前にゲルをトリミングすることで端の気泡を除去できます。さらに、根から放出されたカルボン酸塩はハイドロゲル内の沈殿したZrOHに結合するため、沈殿時に均等に分布するZrが不可欠です。ゲル内のZr分布が不均一であると、カルボキシル酸の横方向拡散を引き起こし、空間分布を歪め、2次元局在化の信頼性を損なう可能性があります。Zrの均等分布は、ポリアクリルアミドゲルをZrOCl2·8H2O溶液に2時間以上浸け、より広いビーカーに浸漬し、ゲル数を減らすことで達成できます(ステップ 1.2.3)。さらに、Zr分布はZrOHハイドロゲルを開発したGuanら14が推奨した走査型電子顕微鏡(SEM, S-3400N II、日立・日本)を用いて検証可能です。しかし、SEMは巨大なサンプルに対して標準的な手法としては実現できません。
もう一つの重要なステップは、カルボキシレートサンプリングのためのリゾボックス充填、核孔膜の塗布、ゲル塗布前の水やりです。砂質または重質粘土質土壌の充填および取り扱いには、均一に滑らかな表面を確保するために特に注意が必要です。これは適切なゲル接触と排水の良好な環境を維持するために不可欠です。滑らかな表面は核孔膜の適切な接続にも不可欠です。核孔膜が土壌表面に正しく付着し、気泡を最小限に抑えることで、根とZrOHハイドロゲルの間に良好な接触を確立することが重要です。ZrOHゲル塗布前には、土壌を適切に飽和させ、ZrOHハイドロゲルがしっかりと接着し、平らに保ち、湿った状態を保ち、サンプリング中にその完全性を保つことが重要です。2次元カルボキシレートマッピングのためにゲルを切断する際、ミリメートル単位の正確な切断を達成するのは難しい場合があります。したがって、2×2 mm未満の解像度は推奨しません。さらに、ゲルは乾燥時に収縮するため、採取後は完全性を保つために湿らせておくことが重要です(ステップ3.12)。現在の方法は、カルボキシレートの分解を防ぐために微生物阻害剤としてNaN3を使用することを推奨したTizianiら12から応用されています。このプロトコルでは、根の浸出物(NaN3またはAgCl3ベースの材料であるMicropur)のサンプリングに一般的に使われる微生物阻害剤23は、分析手法への干渉やIC-MS系への潜在的な影響のため、使用しません。
これまでのところ、この方法は7種類のカルボン酸(アコニ酸、クエン酸、フマル酸、乳酸、マレート、シュウ酸、スクシナ酸)のみで検証されており、根のエスドームは複雑な化合物混合物(例:フェノール酸、アミノ酸、炭水化物、カルボキシレート)で構成されています。これらの他の重要な化合物は現在この方法で考慮されておらず、ZrOHハイドロゲルもそのサンプリングで特徴付けられていません。土壌中の他のオキシアニオン(リン酸塩、硝酸塩など)の存在は、カルボキシレートの取り込み、容量、溶解、さらにICやHPLCでのカルボキシレート定量に影響を与える可能性があります。さらに、大型植物(例:樹木や低木)から非常に大きな全根系をサンプリングすることは、非常に大きなZrOHハイドロゲル(>30 cm)の生成が困難であるため非常に困難です。しかし、これは現在のすべての浸出物サンプリング技術で問題となっています8。さらに制限はリゾボックスの使用です。リゾボックスでの植物成長は水耕栽培システムよりもはるかに現実的ですが8は依然として人工的な構造であり、根の発達のための三次元空間が限られています。さらに、サンプリングは2次元表面で行われるため、理論的にはゲルに接触しない方向に放出されたカルボキシレートの損失を引き起こす可能性があります。しかし、この制約は拡散、カルボキシレートに対するZrOHハイドロゲルの結合能力の向上、施布中の根圏土壌の高い水分量によって緩和可能です。しかし、これらの側面を明らかにするにはさらなる検証が必要です。
根から放出されたカルボン酸塩を採取するZrOHハイドロゲル法は、一般的に使われている方法(すなわち土壌-水耕栽培ハイブリッドや水耕栽培法)に比べていくつかの利点があります。この新しい手法により、攪乱されていない土壌の根系からのカルボン酸塩の現地サンプリング、時間分解によるサンプリング(Santner, Mühlbacherら、未発表データ)、およびミリメートルスケールの2Dマッピングが可能になります。さらに、ZrOHハイドロゲルは根に対して少なくとも24時間12時間使用可能です。また、同じ根セグメントをより長期間にわたって繰り返しサンプリングすることも可能であるはずです。この方法は、フィルターペーパーの適用などの類似手法よりもはるかに発展し、特徴付けが格段に高まります。ZrOHハイドロゲルはカルボキシレートの高いゲル容量により長時間のサンプリングが可能です。例えば、マラートの最低ゲルは0.44 μmol cm²± pH 4.00のスクシネートは1.66 μmol cm²±0.10 μmol cm⁻2で、カルボキシレートを混合すると合計3.29 μmol cm²±0.40 μmol cm⁻2となります(補足表1参照)。土壌・水耕ハイブリッド法では根洗浄の工程(通常1株あたり20〜30分かかる)を省略することで、根系の損傷やそれに伴うバイアスが大幅に減り、より現実的で代表的なデータが得られます。
特筆すべきは、ロードされたZrOHハイドロゲルは特別な保管条件を必要とせず、冷蔵のみで済み、これまでの応用では浸出後の前濃縮は必要なかったことです。ZrOHハイドロゲルは他のアニオンとも結合し、同じ条件下で溶出され、IC14,34で解析可能です。これにより、カルボキシレートの浸出を根圏内の栄養素の空間分布と結びつけることが可能になります。
結論として、根放出されたカルボキシル酸塩をサンプリングするこの新しいアプローチは、根圏研究の基本的なステップです。カルボン酸は植物栄養素(例:P、Fe)35,36の動員と獲得、さらに有益微生物の導入において重要な役割を果たしているため、この方法は根の形質や植物育種のスクリーニングに用いられます。
著者らは、本論文で報告された研究に影響を与えた可能性のある競合する財政的利害関係や個人的な関係は知られていないと述べています。
「ボルツァーノ/ボーゼン自治州 – 南チロル州」(共同プロジェクト Südtirol-DFG 2023、D-SÜD、契約番号6/34、CUPI53C22003410003、DGT Exudates AG2222)および「ドイツ研究協会」(DFG、ドイツ研究財団、プロジェクト番号525026426)からの財政支援に感謝します。また、ボッツァーノ自由大学のオープンアクセス出版基金からの財政支援にも感謝いたします。また、解析手法の開発とDGT根源浸出物プロジェクトの推進に不可欠な献身と専門知識を果たした故ファビオ・トレヴィサン博士にも深い悲しみを込めて感謝いたします。
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| エタノール | シグマ・オルドリッチ | 70% | |
| シュウ酸 | シグマ・オルドリッチ | 194131-250G | 98% |
| トランスアコニティック酸 | シグマ・オルドリッチ | 122750-25G | 98% |
| ジルコニウム二塩酸化物オクタハイドレート(ZrOCl2 & times2O、98%) | サーモ・サイエンティフィック | A12342.22 | 98% |
| クエン酸 | シグマ・オルドリッチ | C83155-500G | 99% |
| 硝酸ナトリウム | VWRケミカルズ | ロット番号:19H224150 | 100% |
| 硝酸(HNO3、3) | シグマ・オルドリッチ | CAS番号:7697-37-2 | >65%が分析に値します EMSURE®リーグ。Ph Eur,ISO |
| フマー酸 | シグマ・オルドリッチ | 240745-100G | >99% |
| 水酸化ナトリウム | シグマ・オルドリッチ | S8045-500G | ≥98% |
| 過硫酸アンモニウム(APS_(NH4)2S2O8) | サーモ・サイエンティフィック | 201531000 | ≥98.0%、超純度、電気泳動用 |
| スクシン酸 | シグマ・オルドリッチ | S3674-100G | ≥99% |
| 2-(N-モルフォリノ)-エタンスルホン酸(MES)バッファー | シグマ・オルドリッチ | M8250-250G | ≥99.5% |
| 塩化ナトリウム | シグマ・オルドリッチ | 71376-1KG | ≥99.5% |
| 架橋剤 | DGTリサーチ社(ランカスター、イギリス) | な | 2%、アガロース誘導体 |
| プレートシェーカーまたは水平シェーカー | Any | ||
| イオンクロマトグラフィーまたはIC-MS | サーモ・フィッシャー・サイエンティフィック | な | 高性能または超高性能の液体クロマトグラフィー(HPLCまたはUHPLC)は、高度なMS(例:飛行時間測定やオービトラップ)や分光光度検出器など、さまざまな検出器と組み合わせて使用可能です |
| pHメーター | 任意の実験室用pH電極を使用できます | ||
| オーブン | バインダー | な | 特定の温度を保つ小型オーブンなら何でも使えますが、できれば小さいものが望ましいです。 |
| ナイロンfilters_13 mm 0.45 & マイクロ;M | GVSフィルター技術 | ロット番号:7135431 | より大きなナイロンフィルターも使えますが、エリュートの量が小さいため小さい方が好まれます。 |
| 硫酸カルシウム二水和物 | シグマ・オルドリッチ | C3771-1KG / CAS-No: 10101-41-4 | CaSO4も使用可能です。 |
| アクリルアミド溶液、40% | G-バイオサイエンス | 786-508 | 混合されたアクリルアミド溶液は使わないでください。ビスアクリルアミド。有害な化合物で、煙の中には注意して取り扱うべきです。 |
| リゾボックス | https://www.rhizosphere.com/ | な | 当社のリゾボックスは Rhizosphere.com のデザインに基づいてカスタムメイドされています |
| ポリプロピレンバイアルキット、1.5 mL | サーモ・サイエンティフィック | 79812 | プラスチック製ICバイアルは冷凍保存が可能で、割れずに使えるため好ましいです。330 & マイクロ;Lも使えますが、気泡が入らないように注意が必要です |
| シスアコニティック酸 | サーモ・サイエンティフィック | A16010.06 | 技術 85% |
| N,N,N',N'- テトラメチルエチレンジアミン(TEMED) | シグマ・オルドリッチ | ロット番号:BCBN1173V | 慎重に扱うべき有毒化合物 |
| 250 mL PPバイアル | サーステット | ロット番号:2406082 | |
| アルミニウム箔 | 地元のスーパーマーケット | な | |
| Beakers_1 L/2L | |||
| クランプ | 地元の倉庫 | な | |
| ガラス板(6.1 x 17 x 0.4 cm) | 地元の倉庫 | な | |
| L-(-)-マリン酸 | シグマ・オルドリッチ | M6413-25G | |
| ICの乳酸標準 | シグマ・オルドリッチ | 07096-100ML | |
| 層流ベンチ | |||
| L-乳酸無水 | サーモ・サイエンティフィック | L13242.14 | |
| 核孔トラックエッチングMembrane_0.2および微小;m | シチバ | ロット番号:A29983896 | |
| ビニールホイル/ビニール袋 | 地元の倉庫 | な | |
| プラスチックピンセット | セマデニ | 602 | |
| プレキシガラス板 | 地元の倉庫 | な | |
| PP 30 mLバイアル | アプタカ温泉 | ロット番号:250552 | |
| PTFE spacer_0.25/0.4 mm | https://www.krishplasticindustries.com/teflon-sheet.html | ||
| カミソリの刃 | 地元の倉庫 | な | |
| 支配者 | 地元の書店 | な | |
| 次亜塩素酸ナトリウム(NaClO) | カルロ・エルバ 試薬 | CAS-No: 7681-52-9 | |
| Syringes_1 mL | ヘンケ・サス・ウルフ(ヘンケ・ジェット) | ロット番号:22A17C8 | |
| ビニール電気テープ | 地元の倉庫 | な |
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