本プロトコルは、プラナリアのシュミッテア地中海をモデルシステムとして用いて、真菌感染時の宿主-病原体の相互作用を研究するための最適化された詳細なガイドを提供します。この方法は、人間の真菌病原体カン ジダ・アルビカンスをプラナリアに感染させるための従来の手法を基にしており、再現性と実験の一貫性を高めるための詳細な指針を提供します。
方法論記事
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本プロトコルは、プラナリアのシュミッテア地中海をモデルシステムとして用いて、真菌感染時の宿主-病原体の相互作用を研究するための最適化された詳細なガイドを提供します。この方法は、人間の真菌病原体カン ジダ・アルビカンスをプラナリアに感染させるための従来の手法を基にしており、再現性と実験の一貫性を高めるための詳細な指針を提供します。
カンジダ・アルビカンスは、ほとんどの人間に無症状で定植する一般的な機会性真菌病原体です。通常は良性の共生性ですが、抗生物質の使用、免疫機能障害、または上皮バリアの破壊による菌叢乱は、表層粘膜疾患から生命を脅かす全身性カンジダ症まで、真菌の過剰増殖や感染を引き起こすことがあります。異なる感染段階および異なる測定可能な宿主アウトカムを対象に、C. albicansの病因をin vivoで解明するためには、新たな前臨床感染モデルが必要です。プラナリアのシュミットテア地中海は、以前からC. albicans感染時の宿主-病原体相互作用研究のための無脊椎動物宿主として確立されていました。地中海サウスは、細菌や真菌を含む病原性微生物による感染を克服できる保存された自然免疫機構に完全に依存しています。プラナリアンの卓越した再生能力とアクセス可能な幹細胞集団により、この生物は早期免疫応答、組織修復、病原体除去を生体内で解析するのに適したモデルとなっています。このモデルは、真菌の病原性と宿主の転写応答の同時解析を支援し、感染動態に関する貴重な洞察を提供します。ここでは、C. albicansによるS. mediterraneaへの感染に関する詳細な修正、標準化された手順、最適化された手順を備えた最新のプロトコルが提示されており、再現性を高め、真菌の病因および宿主防御の体系的な研究を可能にすることを目的としています。
カンジダ・アルビカンスは、無症状で人間の50〜70%に定着する一般的な機会性真菌病原体です(1,2,3)。通常、無害な共生菌であるC. albicansは、微生物叢の不均衡、抗生物質の使用、免疫抑制、上皮バリアの破壊、医療機器の存在などの条件下で過剰成長し、表層粘膜感染から生命を脅かす全身性カンジダ症に至るまで幅広い疾患を引き起こすことがあります。.免疫抑制状態の人々、HIV/AIDS患者、化学療法や免疫抑制療法を受けている患者、慢性疾患を持つ患者、集中治療室にいる患者では、死亡率が70%を超えることがあり、侵襲性カンジダ症の重大な公衆衛生負担を強調しています 6,7,8.世界的に見て、侵襲性真菌感染症は年間650万人以上に影響を及ぼしており、アメリカ合衆国だけでカンジダ関連感染症の直接医療費は年間80億ドルを超えています。利用可能な抗真菌治療法にもかかわらず、C. albicans感染に関連する罹患率と死亡率は数十年にわたりほとんど変化が見られず、真菌疾患における宿主と病原体の相互作用をより深く理解する緊急の必要性を強調しています。
C. albicansは多様な病原性因子を用いており、さまざまな宿主環境での定着、持続、病原性を支えます。これには宿主組織への接着、免疫回避、細胞壁の再形成、加水分解酵素の分泌、形態的可塑性、バイオフィルム形成(11,12,13,14,15,16)が含まれます。これらの形質は、C. albicansが多様な宿主ニッチに適応し、免疫応答を調節し、抗真菌療法に抵抗することを可能にしています(16,17,18,19,20,21)。これらのプロセスが宿主の罹患率、死亡率、病原体除去など感染結果にどのように影響するかを明らかにすることは、より効果的な予防および治療戦略の開発に不可欠です。
これらの宿主-病原体の動態を調べるため、プラナリアのシュミッテア地中海を宿主としてモデルシステム22,23,24を構築しました。このモデルは、浸漬を基盤とした感染法を活用し、C. albicansへの同時曝露を可能にする多系統宿主反応を研究するための多用途プラットフォームとして機能します。以下のセクションでは、このプロトコルを洗練させ、再現性を高め、ラボ間での一貫した実施を促進するためのステップバイステップの手順を紹介します。
プラナリアは自由生活の無脊椎動物で、卓越した再生能力を持ち、損傷や感染で失われた組織を迅速に補充できます25。彼らは適応免疫系を持たず、パターン認識受容体、抗菌ペプチド、粘液分泌、貪食細胞などの保存された自然防御に完全に依存して、26日、27日、28日、29日以内に細菌や真菌病原体を排除します。自然免疫は真核生物における第一防衛線であり、哺乳類系以外では十分に研究されていないため(27)、プラナリア人はこれらの過程を細胞および分子レベルで生体内で研究する機会を提供します。再生能力は成体多能性幹細胞(新芽細胞)によって駆動されており、これらは成体細胞の約30%を占め、感染後の回復に寄与します23,30。これらの特徴により、S. mediterraneaは遺伝的、細胞的、組織的、生物のスケールで病原体の病原性と宿主防御を解剖する強力なモデルとなり、従来の哺乳類システムでは研究が難しい課題に取り組むことを可能にします。
さらに、プラナリア類の小型サイズ(通常は数ミリメートル)、低コスト、メンテナンスの容易さにより、脊椎動物モデルに内在する財政的、倫理的、規制上の制約を回避しつつ大規模な実験を可能にしています。C. albicansと同様に、S. mediterraneaはゲノム的に扱いやすく、完全に配列決定・注釈されたゲノムを持ち、転写プロファイリング、高解像度免疫組織化学・組織学、堅牢なRNA干渉(RNAi)などの高度な分子・細胞技術をサポートしています。32,33,34,35,36,37,38.これらのツールは、感染中の宿主および病原体の応答を並行分析することを可能にします。
真菌感染の研究にはいくつかの代替的な前臨床モデルが用いられています。 Galleria mellonella (ワックスガ)、 Caenorhabditis elegans (回虫)、 Drosophila melanogaster (ショウバエ)、および脊椎動物 のDanio rerio (ゼブラフィッシュ)などの無脊椎動物宿主は、それぞれ実験的には明確な利点を提供しますが、顕著な限界もあります。これらのシステムは生存を主要な終点としていることが多いです。なぜなら、感染は急速に宿主の死を引き起こし、罹患率、回復、多系統反応の詳細な評価を妨げるからです。プラナリアンモデルはこれらの特徴を容易に捉えています。
Mus musculus(マウス)、Rattus norvegicus(ラット)、Oryctolagus cuniculus(ウサギ)、Cavia porcellus(モルモット)などの哺乳類モデルは、人間の生理学をより正確に再現していますが、高コスト、小規模なコホート、倫理的・規制上の要件、そして自然免疫反応と適応免疫応答の区別の難しさに制約されています。さらに、マウスにおける数十年にわたる真菌病原研究は主に後期全身感染に焦点を当ててきました。39,40,41,42,43であり、上皮バリアの破壊や粘膜過剰増殖といった初期の出来事を見落としがちです。これらはヒトにおける真菌病の最も一般的な経路です。
したがって、宿主と病原体の相互作用を研究することは、真菌の病原性、宿主防御、病気の進行の背後にある生物学的プロセスを理解する上で不可欠です。侵襲性真菌感染症は世界的な脅威を増大させており、複数の種が主要な抗真菌薬クラスすべてに対して耐性を示しています。10億人以上が真菌感染の影響を受けていると推定されており、気候変動、抗菌薬の広範な使用、免疫不全患者の増加などの要因が抗真菌耐性病原体の出現を加速させています。病原性菌類がどのように宿主と共存し相互作用するかを理解することは、新たな予防および治療戦略の開発に不可欠です。
以下は、S . mediterraneaとC. albicans の相互作用に関する改訂・標準化された全身感染プロトコルを説明し、再現性を促進し、真菌の病因および宿主防御機構の体系的調査を可能にすることを目的としています。元のプロトコルは、以前の出版物22、23、24でも採用されました。 表1は 、この改訂版に組み込まれた主要な更新内容をまとめており、真菌接種手順の改善、井戸容量の減少、動物の包含基準の定義、感染量および致死量の決定、そして最新の畜産推奨事項が含まれます。このワークフローは、 C. albicansの培養、浸漬曝露によるプラナリアへの感染、症状および致死量条件下での定性的および定量的指標を用いた真菌病原性と宿主反応の評価に関する詳細な指針を提供します(図1)。ここで提示する最適化された手技は、感染動態や宿主アウトカムの主要な決定要因として実証的に特定された変数を取り入れており、再現性を高め、宿主と病原体間の相互作用の体系的な評価を可能にします。
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このプロトコルは前述の手法22,23,24を基盤とし、再現性を高め、南地中海における真菌病因および宿主応答の体系的調査を可能にする明確で標準化された手順を確立します。主要なプロトコルの改良には、あらかじめ定められた動物の包含・除外基準、標準化された微生物調製、宿主エンドポイントの包括的な評価が含まれます。
すべての処置は、適切な無菌および無菌バイオセーフティレベル2技術を用いて行われなければなりません。標準的な実験室用個人用防護具(PPE)は、手袋、白衣、つま先の閉じた靴を常に着用してください。プラナリアの 地中海 動物を用いた処置は、無脊椎動物の倫理的利用に関する制度的ガイドラインに従って実施されました。
すべてのプロトコルの改良は 表1にまとめられています。すべての試薬、重要機器、培地、バッファー、免疫染色レシピは 材料表 および 表2に記載されています。
注:無脊椎動物モデルS . mediterranea を対象としたすべての処置は、動物福祉の最高水準を確保するために実施されるべきです。 南地中海 は自然の生息地を模した最適な環境に飼育されるべきです。実験は、研究全体を通じて倫理的な治療を確保するために、潜在的な痛みや苦痛を最小限に抑えるよう設計されるべきです。
1. 菌類培養
2. プラナリア属の種と維持管理
3. 感染のセットアップ
4. ホストエンドポイントの評価
5. 真菌曝露後の宿主生存率の決定
6. 真菌負荷評価
7. 免疫蛍光抗カンジダ 染色
8. トラブルシューティング
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プラナリアに C. albicans を感染させるための更新プロトコル(図1)と宿主の転帰を体系的に定量化するためのプロトコル(図2)を提示します。この洗練されたワークフローは、罹患率(症状を伴う疾患の重症度)、生存率(致死率)、真菌負荷(CFU)、病原体定着の時空間的動態(蛍光免疫染色)など、複数の感染パラメータの堅牢な評価を支援します。主に生死の二値を示すほとんどの無脊椎動物感染モデルとは異なり、このプラナリアモデルはより広範な感染結果と宿主の応答を捉えています。プラナリアは、亜致死感染による症状性疾患の進行やその後の回復など、さまざまな微生物チャレンジのエンドポイントに使用できます。また、致死量接種を含む生存試験にも使用可能です。これらの能力は、プラナリアンの多様な疾患転帰における宿主-病原体相互作用の柔軟な調査プラットフォームとしての多様性を示しています。
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野生型 C. albicans の感染線量を変えることで、 S. mediterraneaで再現可能かつ線量依存的な罹患率の違いが生じ、真菌病原性の定量的評価に対するモデルの感度性が強調されています。本プロトコルは、実験室で管理されたプラナリアコロニーにおけるベースライン感染および致死量の設定戦略を示し、浸漬による全身感染の成功確認基準を提示します。これらは、CFU定量化および免疫染色を用いた宿主健康スコアと真菌負荷測定の統合です。
系統的な最適化を通じて、一貫した感染動態と再現可能な宿主アウトカムを達成するために不可欠ないくつかの実験パラメータが特定されました。接種物の濃度だけでなく、プラナリアの大きさ、個体密度、表面積と体積の比率などの要因も感染の進行や重症度に大きな影響を与えます。ここで導入された改良点、標準化された包含基準、管理された感染条件、詳細な評価項目スコアリングは再現性を大幅に向上させ、実験や実験室間での意味のある比較を可能にします。
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C.J.N.はバイオフィルム感染症の診断および治療薬を開発する会社、BioSynesis, Inc.の共同創設者です。他のすべての著者は競合する利害関係を一切表明していない。
著者らは、S. mediterranea-C. albicans感染モデルに関する洞察に満ちた議論をしてくれたNobile、Oviedo、Herndayの各研究室のメンバーに感謝し、Edelweiss Pfister氏にはラボ管理とプラナリアの維持管理に感謝しています。この研究は、国立衛生研究所(NIH)国立一般医科学研究所(NIGMS)からのC.J.N.へのR35GM156045およびR35GM124594、N.J.O.へののR35GM158501授与および授与R01GM132753によって支援されました。この研究はまた、カマンガル家の寄付講座としてC.J.N.の支援を受けました。N.M.S.は、国立科学財団(NSF)の細胞・生体分子機械センター(CCBM)科学技術優秀研究センター(CREST)の支援を受け、NSF-HRD-1547848およびNSF-EES-2112675の助成を受けました。
資金提供者は研究の設計、データ収集・分析、データの解釈、原稿の作成、結果の発表決定に関与していません。N.M.S.は、原稿の編集(スペル、文法、フォーマット、文構造のチェック)を支援するためにChatGPTの利用を認めています。
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| 名前 | 会社 | カタログ番号 | コメント |
|---|---|---|---|
| 1.7 mLマイクロ遠心分離機チューブおよびnbsp; | VWR/ジェネメイト | 490004-436-BOXOF500 | クリア、500ピース入りの箱 |
| 20 mL シンチロンバイアル | フィッシャー・サイエンティフィック | 12-100-006 | 免疫染色用の透明ガラス瓶 |
| 24ウェル未処理ポリスチレン板 | フィッシャー・サイエンティフィック | 08-772-51 | 免疫染色 |
| 5.0 mLマイクロ遠心分離機チューブおよび | エッペンドルフ/シグマ・オルドリッチ | EP0030119487-200EA | クリア、200ピース入りの箱 |
| 6ウェル未処理ポリスチレン板 | フィッシャー・サイエンティフィック | 08-772-49 | 感染アッセイ |
| 寒天 | VWR | 89405-066 | YPD培地の細菌グレード |
| アプリケータースティック | サーモフィッシャー/ピューリタン | 22-029-491 | <>C. albicans培養 |
| バイオレンダー | バイオレンダー社 | 該当なし | 回路図の生成に使われる図形設計ソフトウェア |
| 塩化カルシウム(CaCl2) | シグマ・オルドリッチ | C5080-500G | プラナリア水/モンジュイウム1回;C塩 |
| < エム>カンジダ・アルビカンズ ポリクローナル抗体抗ウサギ IgG | サーモ・フィッシャー | PA1-27158 | 免疫染色 |
| 遠心分離機チューブ | VWR | 89039-664 | <>C. albicans収穫 |
| 培養チューブ ホウケイ酸ガラス 18x150mm | VWR | 47729-583 | <>C. albicans培養 |
| キュベット | フィッシャー・サイエンティフィック | 14-955-127 | 培養の光学密度を測定するために |
| デキストロース(D-グルコース) | フィッシャー・サイエンティフィック | D16-3 | YPDメディア |
| グリセロール | フィッシャー・サイエンティフィック | G33-4 | 分子生物学のグレードで、C. albicans の低温保存のための補助剤として;<も> |
| グラフ作成およびデータ可視化ツール | グラフパッド/プリズム | 統計ソフトウェアと視覚化ツール。Verison 10.6.1。 | |
| グラフ作成ツール | R | 統計ソフトウェア。Verison 4.4.3。 | |
| インキュベーターシェーカー | エッペンドルフ | EPM1282-0004-1EA | ニューブランズウィック州イノーバ44/44R<種>C. albicans培養 |
| 塩化マグネシウム(MgCl2) | シグマ | M8266-100G | プラナリアの水に関しては、(1xモンジュウウムル;C塩) |
| 硫酸マグネシウム(MgSO4) | シグマ・オルドリッチ | M7506-500G | プラナリアの水に関しては、(1xモンジュウウムル;C塩) |
| 顕微鏡スライド | VWR | 16004-368 | |
| マルチズーム顕微鏡 | ニコン | ニコンAZ100 | |
| N-アセチル-L-システイン | シグマ・オルドリッチ | A7250-50G | 粘液溶解剤および犠牲試薬;固定 |
| パラマルデヒド、16%溶液、分子生物学グレード | 電子顕微鏡科学 | 15710 | 固定試薬 |
| ペレットペッスルコードレスモーター | フィッシャー・サイエンティフィック | 12-141-361 | プラナリア均質化 |
| ペプトン、細菌学グレード | ヒメディア/VWR | 89129-480 | YPDメディア |
| 乳棒 | フィッシャー・サイエンティフィック | 12-141-368 | プラナリア均質化のためのRNaseフリー使い捨てペレット |
| ペトリ皿、100 x 15 mm | VWR | 25384-342 | |
| ポリ(ビニールアルコール) | シグマ・オルドリッチ | P-8136 | ゲルヴァトルのために |
| 塩化カリウム(KCl) | シグマ・ライフサイエンス | P9541-500G | プラナリアンの媒介物/水 (1xモンジュウウムル;C塩) |
| 二次抗体ヤギ抗ウサギ、IgG、Alexa フルオナ568 | フィッシャー・サイエンティフィック | A-11011 | 免疫染色 |
| SN250 | 真菌遺伝学ストックセンター | 野生型C. albicans 菌株(https://www.fgsc.net/) | |
| アジ化ナトリウム | フィッシャー・サイエンティフィック | S227-100 | ゲルヴァトルのために |
| 重炭酸ナトリウム(NaHCO3) | シグマ・オルドリッチ | S5761-1KG | プラナリアンの媒介物/水 (1xモンジュウウムル;C塩) |
| 塩化ナトリウム(NaCl) | シグマ・ライフサイエンス | S3014-500G | プラナリアンの媒介物/水 (1xモンジュウウムル;C塩) |
| 分光光度計 | アジレント | 26354 | BioTek Epoch 2マイクロプレートによる光学密度測定 |
| 静的インキュベーター | フィッシャー・サイエンティフィック | 15-015-2634 | <>C. albicans culturing |
| 転送ピペット | フィッシャー・サイエンティフィック | 13-711-9CM | 移送プラナリア用の滅菌使い捨てグラデアピペット |
| トリス・ベース | シグマ・オルドリッチ | 252859 | ゲルヴァトルのために |
| 酵母抽出物 | サーモ・フィッシャー | 212750 | YPDメディア |
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