本レビューでは、保存されたRTK-RAS-ERK、Notch、およびWntシグナル伝達経路、代表的な変異体、定量的読み出し、遺伝学的ツール、抗がん剤スクリーニング、および化学感覚ベースの応用に焦点を当て、がん経路研究のための相補的なin vivoモデルとしてのCaenorhabditis elegansを評価します。
レビュー記事
本レビューでは、保存されたRTK-RAS-ERK、Notch、およびWntシグナル伝達経路、代表的な変異体、定量的読み出し、遺伝学的ツール、抗がん剤スクリーニング、および化学感覚ベースの応用に焦点を当て、がん経路研究のための相補的なin vivoモデルとしてのCaenorhabditis elegansを評価します。
Caenorhabditis elegans (C. elegans) は、遺伝的な操作が可能で透明度が高く、コスト効率に優れた後生動物モデルであり、メカニズムに基づいた癌研究において、従来の細胞培養アッセイと哺乳類システムを繋ぐ役割を果たします。本経路フォーカスレビューでは、保存されたRAS/MAPK、Notch、およびWntシグナリングの代表的な研究を網羅し、経路の保存性、変異株、定量的な表現型、遺伝学的なツール、ならびにメカニズム研究、化合物スクリーニング、および化学感覚ベースのアッセイへの応用を中心に構成しています。まず、生殖細胞の過剰増殖や多陰門(Muv)表現型を含む、経路構成要素の保存性と腫瘍関連の表現型について説明します。次に、幹細胞の維持、異所性増殖、およびシグナル伝達の調節不全の解析を可能にする、機能獲得型のglp-1およびlet-60株や、機能喪失型のgld-1およびlip-1モデルなどの代表的な変異体をカタログ化します。加えて、RNA干渉、トランスジェニック、MosTIC、TALENs、およびCRISPR/Cas9を含むモデル構築に利用可能なツールについて議論し、癌関連の遺伝子機能研究におけるそれぞれの強みと限界を明らかにします。最後に、抗癌剤スクリーニング、経路の発見、および腫瘍に関連した化学感覚におけるC. elegansの公表された応用例をまとめます。遺伝的な保存性とスケーラブルなin vivo表現型解析を統合することで、C. elegansは仮説構築、経路の検証、および初期段階の治療法発見のための相補的なプラットフォームを提供しますが、得られた知見をヒトの癌生物学に変換する際には、獲得免疫や臓器の複雑性における限界を認識する必要があります。
がんは、世界的な罹患率および死亡率の主要な原因であり続けています。GLOBOCAN 2022の推計では、非メラノーマ皮膚がんを含め、世界で2,000万件近い新規がん症例と970万人のがんによる死亡が報告されています1。人口増加と高齢化に伴い、がんの罹患率は上昇すると予測されており2、保存されたメカニズムを解明し、効率的なターゲットの優先順位付けを支援できる実験系の構築が不可欠です。
がんのメカニズムは、通常、培養細胞で研究され、その後、脊椎動物モデルで検証されます。しかし、細胞培養では個体全体の生理学的機能を再現できず、一方で脊椎動物を用いた研究はコストがかかり、スループットが比較的低くなります。したがって、遺伝学的操作の容易さ、多細胞環境、および迅速な実験サイクルを兼ね備えた相補的なモデルを用いることで、in vitroアッセイと哺乳類での検証との間にある特定の課題を橋渡しすることが可能です。
Caenorhabditis elegans (C. elegans) は、この補完的なニッチを埋めています。20 °Cにおいて、本種は胚から成熟個体まで約3日で成長し、標準的な実験室における寿命は2〜3週間で、約300匹の自殖子孫を産みます3。OrthoList 2では、ヒトの20,310個のタンパク質コード遺伝子のうち10,678個(52.6%)に C. elegans のオーソログが同定されており4、一方で、より早期の比較プロテオーム解析では、C. elegans プロテオームの約83%にヒトのホモログが検出されています5。さらに、キュレーションされたヒトのがんドライバー遺伝子の約72%が、少なくとも1つの C. elegans オーソログを有しています6。保存されているプロセスには、アポトーシス、細胞周期制御、代謝、ストレス応答、およびRTK–RAS–ERK、Notch、Wnt、TGF-β、インスリン/IGFシグナル伝達が含まれます3,4,6。それにもかかわらず、オーソログであることは完全な機能的等価性を意味するわけではなく、この線虫は脊椎動物の器官、適応免疫、血管新生、および循環系を欠いています6。
本レビューでは、RTK(受容体チロシンキナーゼ)–RAS–ERK、Notch、およびWntシグナリングに焦点を当てます。これらの経路は進化的に保存されており、ヒトの癌において頻繁に調節不全が起こり、かつスコア化が容易なC. elegansの表現型に関連しているためです。本稿では、真の生殖細胞系腫瘍を、発生上の過形成や異所的な細胞運命表現型と区別し、代表的な系統と定量的な読み出し方法をまとめ、モデル構築のための遺伝学的ツールを概説し、さらに線虫を用いた実験によって抗癌メカニズムが解明された研究や、化合物の優先順位付けが可能となった研究について論じます。
C. elegansにおけるオンコジェニック・シグナリング経路の保存性
がんは、増殖、分化、生存、ゲノム維持、代謝、および微小環境との相互作用を乱す遺伝学的およびエピジェネティックな変異の組み合わせによって進行します。C. elegansはヒトの悪性腫瘍のあらゆる特徴を再現することはできませんが、個体レベルの文脈において保存された経路機能を単離して解析することが可能です。したがって、最も有益なモデルとは、定義された分子病変を、測定可能な表現型および明確に述べられたヒトがんとの類推と組み合わせたものです。
RTK-RAS-ERKシグナリング
受容体チロシンキナーゼ(RTK)の活性化は、受容体の二量体化または再編成、および細胞質チロシン残基の自己リン酸化を促進します7。ホスホチロシン・ドッキングサイトは、アダプタータンパク質とグアニンヌクレオチド交換因子をリクルートし、これによりRASがGDP結合型からGTP結合型へと変換されます7,8。RAS-GTPはRAFキナーゼを細胞膜へとリクルートし、そこでRAFが活性化されることでRAF–MEK–ERKキナーゼカスケードが開始されます8,9。活性化されたERKは、増殖、分化、生存、および細胞運命を調節する細胞質および核内の基質をリン酸化します10。したがって、がん原性RAS変異または異常なRTK活性は、通常の細胞外制御とは独立して、この経路の出力を持続させることがあります8,11。
C. elegansは、LET-23/EGFRやEGL-15/FGFRを含む複数のRTKをコードしている12。外陰誘導において、LIN-3/EGFはLET-23および保存されたSEM-5/GRB2–SOS-1–LET-60/RAS–LIN-45/RAF–MEK-2–MPK-1/ERKカスケードを活性化させる12,13,14。ERK依存的なLIN-1およびLIN-31の調節が、外陰前駆細胞の運命を決定する12,15。この経路の活性が低下すると外陰欠損表現型が生じる一方、機能獲得型let-60アレルなどの過剰な活性化は多外陰(Muv)表現型を引き起こす15,16。また、同一の経路が排泄管の発達、子宮・外陰接続、およびいくつかのオスおよび生殖細胞系のプロセスも調節している12,17,18,19。EGL-15/FGFRシグナル伝達は、性筋芽細胞の遊走、筋肉の維持、軸索誘導、および体液恒常性を制御している20,21,22,23。経路の出力は組織およびステージに依存するため、有益ながん関連モデルは、特定の分子病変、関連する組織コンテキスト、および定量的な読み取りによって定義される12。
Notchシグナリング
Notchは、ある細胞上の膜結合型Delta/Serrate/LAG-2 (DSL) リガンドが隣接する細胞のNotch受容体を活性化する、接触依存的なシグナリング経路である24,25。受容体の成熟過程において、分泌経路でS1切断が起こる24。その後、リガンドの結合によりS2部位がADAMファミリープロテアーゼにさらされ、続いてγ-セクレターゼによるS3切断が行われる24,25。放出されたNotch細胞内ドメインは核内に移行し、CSLファミリーDNA結合タンパク質およびMastermindファミリー共役活性化因子と転写複合体を形成する24。C. elegansにおいて、これに対応する核因子はLAG-1およびSEL-8である25。
C. elegansには、LIN-12とGLP-1という2つのNotch受容体が存在します25。成体の生殖腺において、遠位先端細胞(DTC)は、隣接する生殖幹細胞/前駆細胞(GSC)上のGLP-1に対して、主にLAG-2およびAPX-1であるDSLリガンドを供給します26,27。高いGLP-1活性は有糸分裂による増殖を維持し、細胞がDTCから離れるにつれてNotchシグナルが減少し、GLDパスウェイによって減数分裂への進入が促進されます28,29。機能獲得型glp-1アレルは、異所的な有糸分裂を維持し、生殖腺腫瘍を形成することがあります25,30。LIN-12は、アンカー細胞/腹側子宮の決定を含む、いくつかの体細胞の運命決定を制御しています。陰門前駆細胞におけるLIN-12の恒常的な活性は多陰門(Muv)表現型を誘導し、また活性化されたGLP-1は異所的に陰門の運命を指定することができます25,31,32。
近位生殖細胞腫瘍は、非細胞自律的な「潜在的ニッチ」メカニズムを介して発生することもあります33。pro-1変異体またはglp-1(ar202)機能獲得変異体では、減数分裂への進入が遅延するため、未分化な近位生殖細胞が、成熟過程にある生殖腺鞘細胞からのAPX-1やARG-1を含むDSLリガンドに接触することになります33。これによりGLP-1/Notch活性化が持続し、有糸分裂と腫瘍の維持がなされます33。対照的に、gld-1の欠損は減数分裂分化の不全による生殖細胞腫瘍を引き起こすため、Notch経路の直接的な活性化として分類されるべきではありません34。
Wntシグナル伝達
Wntシグナル伝達は、コンテキスト依存的な複数の経路を介して、細胞運命、極性、遊走、および増殖を制御している35,36。カノニカルβ-カテニン経路では、WntがFrizzledおよびLRP5/6に結合することでAXIN–APC–GSK3–CK1破壊複合体が抑制され、β-カテニンが蓄積して核内でTCF/LEF因子と協調的に作用する35,36。この経路の調節不全は、いくつかのヒト癌、特に大腸癌において中心的な役割を果たしている36。
C. elegansは、BAR-1/β-cateninを介した標準的経路と、それとは異なるWnt/β-catenin非対称性経路の両方を利用しています37,38。BAR-1依存性シグナリングは、vulvaの発達を含む胚後期の細胞運命決定に寄与しています37,38。非対称性経路では、WRM-1/β-cateninおよびLIT-1/NLKが一方の娘細胞における核内POP-1/TCF量を減少させる一方で、SYS-1/β-cateninが転写共活性化因子として機能します。このようにPOP-1とSYS-1のレベルが不均等になることで、異なる娘細胞の運命が生成されます37,38,39。これらの線虫特有の特徴は哺乳類の標準的Wnt経路とは異なり、個別のシグナリング構造として解釈されるべきものです37,38。
非標準的Wntシグナル伝達は、Frizzled依存性および受容体チロシンキナーゼ様経路を通じて、細胞の極性と遊走を制御している35,40。C. elegansにおいて、Wntリガンドと受容体はニューロンおよび中胚葉の遊走を誘導し、非対称分裂の方向を決定する37,41。線虫自体は転移性の散布をモデル化してはいないが、極性と運動性の変化は浸潤の前提条件となるため、これらの読み取り結果はがん生物学に関連している36,37
代表的なWnt経路の表現型には、bar-1機能喪失動物におけるvulva形成不全42、mom-2またはmom-5変異体における胚の極性異常37,43、およびmig-1またはprkl-1変異体における細胞遊走または軸索誘導の異常37,41が含まれます。これらの系統は経路特異的な発生モデルであり、悪性腫瘍に直接相当するものではありません36,37。
がんに関連する表現型とリードアウトの選択
C. elegansのがん関連モデルにおいて、「腫瘍(tumor)」という用語は慎重に使用すべきである6。C. elegansの生殖腺腫瘍は、異所的に増殖し分化不全となった生殖細胞を含んでおり、したがって、新生物的な過剰増殖に最も近い線虫のアナログとなる30,34,44。対照的に、多vulva(Muv)表現型は、異所的なvulva細胞運命の誘導と組織の増殖を反映しており、RAS/MAPKまたはNotch経路の活性を感度良く示すリードアウトであるが、悪性腫瘍ではない15,16,25。生殖腺の遠位部では、遠位チップ細胞(DTC)由来のNotchシグナリングが有糸分裂前駆細胞プールを維持している28,44。機能獲得型glp-1アレルや、gld-1などの減数分裂分化遺伝子の欠損は、有糸分裂生殖細胞を拡大させることができる30,34,44。vulva前駆細胞において、let-60/RASの機能獲得またはLIP-1などの負の調節因子の活性低下は、Muv表現型を誘導または増強させることができる15,16,45。これらの表現型カテゴリーは、図1に模式的にまとめられている。図1Aは、C. elegansのがん関連アッセイで使用される正常な解剖学的背景とベースラインのリードアウトを示している。図1Dは、LIN-3/LET-23依存的なRAS/MAPKシグナリングとvulva前駆細胞の運命決定を関連付けており、一方で図1Eは、遠位生殖腺幹細胞ニッチにおけるGLP-1/Notchシグナリングと潜在的ニッチ腫瘍のメカニズムを示している。図1Fでは、BAR-1依存的なカノニカルWnt分岐とWnt/β-catenin非対称経路をさらに区別しており、C. elegansにおけるWnt関連のリードアウトは、直接的な悪性腫瘍モデルとしてではなく、発生学的または経路感受性のある表現型として解釈されるべきであることを強調している。推奨される定量的エンドポイントには、Muv個体の割合、異所的vulva突出数、有糸分裂領域の長さ、リン酸化ヒストンH3陽性生殖細胞、生殖腺面積、受精能、リポーターの局在、および用量反応関係が含まれる15,28,30,44,45。表1に、代表的な系統、その分子病変、表現型、定量アッセイ、およびがん関連の応用例をまとめる。
遺伝学的および実験的ツール
C. elegansモデルは、古典的な変異導入、トランスジェネシス、RNA干渉(RNAi)、または標的ゲノム編集によって作成できます46,47,48。生殖腺へのマイクロインジェクションは染色体外アレイを効率的に作成しますが46、放射線照射、マイクロパーティクル銃法、およびシングルコピー挿入システムにより、組み込み型または低コピー数のトランスジェニック系統を構築でき、コピー数やモザイク現象によるアーティファクトを低減できます47,48。部位特異的リコンビナーゼ、Mos1介在性シングルコピー挿入、ジンクフィンガーヌクレアーゼ、TALENs、そして特にCRISPR/Cas9により、標的欠損、点変異、内在性タグ付け、条件付きアレル、およびヒト化変異体の作成が可能になります48,49。手法の選択は、研究において一過性のノックダウン、安定的な欠損、機能獲得、組織特異性、内在性発現、またはヒト癌変異体への置換のいずれが必要かに基づいて決定すべきです48,49。
RNAiは、二本鎖RNAを発現する細菌の生殖腺注入、浸漬、または経口摂取によって導入できます50。この手法は迅速で拡張性に優れていますが、ノックダウン効率は組織や遺伝子によって異なり、またRNAiは定義された遺伝性アレルではなくフェノコピーを誘導します50。化合物の研究においては、経路特異的な効果を毒性、発達遅延、または摂食量減少と区別するために、モデルの検証として遺伝的レスキューまたはエピスタシス、独立したアレル、および直交するリードアウトを含める必要があります6,44。
これらのモデルを適用するための実用的なワークフローは、図2にまとめられています。このフレームワークでは、まずがんに関連する問いを保存されたシグナリング経路と定義された分子病変にマッピングし、次に適切なC. elegans系統または作製モデル、定量的表現型、およびバリデーションコントロールを選択します。この段階的な設計により、経路特異的な変調を一般的な毒性や発生遅延と区別することができ、その後のメカニズム研究、化合物の優先順位付け、または化学感覚に基づくアッセイへの応用のための合理的な根拠が得られます。
従来の研究例
既報の研究により、パスウェイが定義されたC. elegansモデルが、初期段階の化合物優先順位付けに有用であることが示されています。変異特異的なEGFRプラットフォームにおいて、Baeらは、野生型、L858R、およびT790M/L858R変異体を含むヒトEGFRチロシンキナーゼドメイン含有LET-23キメラ受容体を、外陰部細胞に発現させました。活性化型のL858RおよびT790M/L858Rキメラは多外陰(Muv)表現型を誘導し、Muv個体の割合を定量的なスクリーニング・エンドポイントとして利用することが可能となりました。GefitinibとerlotinibはL858Rに関連するMuv表現型を抑制しましたが、T790M/L858Rに関連する表現型は抑制しませんでした。8,960個の低分子化合物を対象としたパイロットスクリーニングでは、AG1478およびU0126がそれぞれEGFR依存性またはMEK依存性のシグナル伝達の阻害剤として同定されました51。Medinaらはさらに、Wnt、Notch、およびRAS–ERKの摂動を代表するパスウェイ定義変異株を用いて、ドラッグリポジショニング候補であるitraconazole、disulfiram、etodolac、およびouabainを評価しました。不妊、不妊化、またはMuv表現型の回復が、化合物の優先順位付けのための表現型エンドポイントとして用いられました52。より最近では、MakhoulらがMT2124 let-60(n1046gf)およびMT4698 let-60(n1700gf)個体においてEAPB02303を試験しました。彼らは、Muv表現型を示す個体の割合と個体あたりの異所性外陰の数の両方を定量化し、LET-60/RAS–MAPKパスウェイ活性の低下と一致する表現型抑制を観察しました。また、相補的な寿命試験およびDAF-16局在化実験により、インスリン/IGF-1–PI3K–AKTシグナル伝達への影響も支持されました53。それにもかかわらず、これらの線虫モデルにおける表現型回復は、パスウェイ調節および初期段階の化合物優先順位付けの根拠として解釈されるべきであり、哺乳類腫瘍における抗がん剤としての有効性の直接的な証明とはみなされるべきではありません。
生殖細胞腫瘍モデルは、持続的な増殖に至るメカニズムの異なる経路を区別して示しています。機能獲得型のglp-1アレルは、生殖細胞におけるGLP-1/Notch依存的な有糸分裂を維持させますが、一方でpro-1変異体は、近接する鞘細胞のDSLリガンドが異常な有糸分裂の維持をサポートするという、非細胞自律的な潜在的ニッチメカニズムを明らかにしています。対照的に、gld-1の機能喪失は、Notch経路の直接的な活性化ではなく、主に減数分裂分化の不全を通じて生殖細胞腫瘍を形成させます。したがって、これらのモデルは、幹細胞の維持、分化不全、および微小環境依存的な腫瘍形成を研究するための相補的なシステムを提供します30,33,34。
その他の癌関連の応用には、LIN-35/Rb合成致死スクリーン、CEP-1/p53依存性アポトーシスアッセイ、およびAMPKおよびPI3Kシグナリングの研究が含まれる6,44。化学感覚ベースの応用は、腫瘍モデル化および薬剤スクリーニングとは別に検討されるべきである。これらの研究では、C. elegansを癌に関連する揮発性または尿中の代謝物に曝露させ、行動反応を潜在的な診断シグナルとして測定する。このようなアッセイは、腫瘍の増殖や抗癌剤の活性をモデル化するものではなく、診断への応用には分析的および臨床的な検証が必要である54,55。
考察
C. elegansは、定量的表現型に結びつけることができる、保存された細胞自律的または全身的なメカニズムに生物学的な問いが依存している場合に最も有用です。適応免疫、血管系、臓器特異的な上皮、および自然転移の欠如を含む限界があるため、多くの腫瘍-ストロマ相互作用や免疫相互作用を直接的にモデル化することは不可能です。今後の展望としては、患者由来変異体の内因性編集、組織特異的な摂動、ハイコンテントイメージング、自動表現型解析、および線虫の遺伝学とヒトがんゲノミクスの統合などが挙げられます。得られた知見は、メカニズムまたは標的を創出するための根拠として扱い、トランスレーショナルな結論を導き出す前に、哺乳類細胞または脊椎動物モデルで検証されるべきです。
C. elegansは、保存された癌関連シグナル伝達の解析や、標的候補または化合物の優先順位付けを行うための、相補的で遺伝学的な操作が容易なin vivoシステムである。最も有益な応用例では、ヒトの癌における変異を、保存された線虫のオーソログ、組織学的コンテクスト、および生殖細胞系の過剰増殖、多陰門形成、レポーター活性、または薬物反応などの定量的表現型と明確に関連付けている。解釈にあたっては、真の生殖細胞腫瘍と発生経路のリードアウトを区別しなければならず、独立したアレル、遺伝学的レスキューまたはエピスタシス、ならびに毒性と発生遅延のコントロールによって裏付けられる必要がある。線虫は獲得免疫、脈管系、臓器特異的な構造、または転移をモデル化することはできないが、迅速な仮説生成および初期段階の経路検証において依然として価値がある。患者由来の変異の内因性編集、組織特異的な摂動、自動表現型解析、および種間検証を組み合わせた今後の研究により、哺乳類の癌生物学へのトランスレーションが強化されるであろう。

図1. C. elegansにおける保存された癌関連シグナリングのリードアウト。 (A) 野生型の解剖学的構造と正常なリードアウト。(B) 有糸分裂領域のリードアウトが拡大した生殖細胞系の腫瘍様過成長。(C) 定量可能なパスウェイリードアウトとしての多陰門(Muv)表現型。(D) 陰門前駆細胞におけるLIN-3/LET-23 RAS/MAPKシグナリング。(E) 生殖細胞幹細胞ニッチにおけるGLP-1/Notchシグナリングと潜在的ニッチ腫瘍のメカニズム。(F) C. elegansのWnt分岐は、BAR-1依存的なカノニカル分岐とWnt/β-catenin非対称パスウェイに分かれている。MuvおよびWnt関連の表現型は、悪性腫瘍の直接的なモデルではなく、発生またはパスウェイに感受性のあるリードアウトである。ここをクリックして、この図の拡大版を表示してください。

図2. C. elegansモデルを癌関連のメカニズムおよび応用へと結びつける実用的なフレームワーク。 このワークフローは、経路の選択、分子病変の定義、モデルリードアウトの選択、定量的検証、および癌関連への応用を連結させている。代表的な活用例として、RAS/MAPK Muv抑制アッセイ、生殖細胞腫瘍メカニズムの研究、経路および毒性制御、ならびに非腫瘍の化学感覚に基づく応用が挙げられる。こちらのリンクから、この図の拡大版をご覧いただけます。
| 系統 | ジェノタイプ | 分子病変 / パスウェイ分岐 | 表現型 / リードアウト | 推奨される定量的エンドポイント | 代表的な用途 / 注意点 |
| CB1026 | lin-1(e1026) IV. | RAS/MAPK転写出力;MPK-1/ERKの下流にあるLIN-1 ETS抑制因子 | 多陰門 (Muv) | % Muv個体;個体あたりの異所性陰門突出数 | 陰門のRAS/MAPK出力;発生パスウェイのリードアウトであり、悪性腫瘍ではない |
| CB1275 | lin-1(e1275) IV. | RAS/MAPK転写出力 | Muv | % Muv;個体あたりの突出数 | パスウェイ出力確認用の代替lin-1アレル |
| MT3516 | lin-1(e1275) cha-1(p1152) IV. | 複雑な遺伝的背景におけるRAS/MAPK出力 | Muv | % Muv;発生タイミング;繁殖力 | cha-1の背景がアッセイに関連する場合を除き、注意して使用すること |
| MT301 | lin-31(n301) II. | RAS/MAPK依存的転写出力;LIN-31フォークヘッド因子 | Muv | % Muv;VPC運命マーカーの局在 | LET-60/MPK-1の下流にある陰門細胞運命のリードアウト |
| MT1001 | lin-1(e1777) IV. | RAS/MAPK転写出力 | Muv | % Muv;個体あたりの突出数 | Wnt関連からRAS/MAPK関連出力に修正済み |
| MT2124 | let-60(n1046gf) IV. | LET-60/RAS機能獲得;過剰活性化したRAS/MAPKシグナリング | Muv | % Muv;個体あたりの突出数;用量反応抑制 | RAS/MAPK抗がん剤スクリーニングおよびパスウェイ抑制アッセイ |
| MT4698 | let-60(n1700gf) IV. | LET-60/RAS機能獲得;過剰活性化したRAS/MAPKシグナリング | Muv | % Muv;個体あたりの突出数;用量反応抑制 | RAS/MAPK化合物スクリーニング系統;EAPB02303パスウェイ抑制研究においてMT2124と共に使用 |
| MT309 | lin-15B&lin-15A(n309) X. | 合成多陰門;陰門誘導の負の調節/RAS許容性背景 | Muv | % Muv;浸透度;個体あたりの突出数 | モディファイアまたは感作Muv背景;直接的な腫瘍モデルではない |
| ZM10942 | lin-15B&lin-15A(n765) X; hpIs774; hpEx4292. | レポーター/トランスジェンコンテキストを持つ合成Muv背景 | Muv / レポーターリードアウト | % Muv;レポーターの局在/強度 | レポーターリードアウトが不可欠な場合に使用し、本文中でトランスジェン/レポーターについて説明すること |
| JK590 | glp-1(q35)/eT1 III; him-5(e1490)/eT1 V. | GLP-1/Notch受容体C末端欠失;Glp表現型を伴う半優性Muv | Muv 不妊 / Glp | % Muv;不妊度;子孫数 | Notch依存的な陰門/生殖細胞系発生リードアウト;遠位生殖細胞腫瘍モデルとグループ化しないこと |
| GC833 | glp-1(ar202) III. | GLP-1/Notch機能獲得 | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;生殖腺面積;繁殖力 | 生殖細胞腫瘍モデルにおける持続的なNotch依存的有糸分裂 |
| BS3164 | unc-32(e189) glp-1(ar202) III. | unc-32マーカー/背景を持つGLP-1/Notch機能獲得 | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;生殖腺面積;繁殖力 | 代替glp-1(ar202)背景;メソッド内でマーカー/背景を明記すること |
| GC565 | pro-1(na48)/mIn1 [dpy-10(e128) mIs14] II. | 潜在的ニッチモデル;減数分裂への進入遅延により、近位DSLリガンドへの曝露とGLP-1/Notch活性化が許容される | 近位生殖細胞腫瘍 | 近位有糸分裂細胞数;pH3+細胞数;生殖腺面積;繁殖力 | 非細胞自律的な腫瘍開始;直接的なglp-1機能獲得と区別すること |
| IT540 | gap-3(kp1) I; puf-8(zh17) unc-4(e120)/mnC1 [dpy-10(e128) unc-52(e444)] II. | 混合RAS/MAPK関連およびRNA結合/分化背景 | Muvおよび生殖細胞腫瘍 | % Muv;有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力 | 表現型が混合パスウェイから生じるため、明確なメカニズム上の根拠がある場合のみ使用すること |
| XA774 | gld-1(q485)/gna-2(qa705) unc-55(e1170) I. | GLD/減数分裂分化不全;直接的なNotch活性化ではない | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;生殖腺面積;繁殖力 | 減数分裂分化不全モデル;Notchとしてラベルしないこと |
| JK3025 | gld-1(q485) I/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). | GLD/減数分裂分化不全 | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力 | バランス型gld-1腫瘍モデル;glp-1/Notch腫瘍と区別すること |
| JK1466 | gld-1(q485)/dpy-5(e61) unc-13(e51) I. | GLD/減数分裂分化不全 | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力 | 代替gld-1背景;Notch駆動型腫瘍と区別すること |
| JK4299 | gld-2(q497) gld-1(q361) I/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). | GLD-1/GLD-2減数分裂進入/分化パスウェイ | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力 | GLDパスウェイ腫瘍モデル;直接的なNotch活性化ではない |
| JK4832 | gld-1(q485) gld-2(q497) lst-1(ok814) sygl-1(tm5040) I/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). | GLDパスウェイおよび幹細胞調節因子背景 | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力;マーカー発現 | メカニズム的に複雑なGLD/幹細胞運命モデル;正確な仮説を明記すること |
| JK2879 | gld-2(q497) gld-1(q485)/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). | GLD-1/GLD-2分化パスウェイ | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力 | 代替のバランス型GLDパスウェイ腫瘍モデル |
| BS3156 | unc-13(e51) gld-1(q485)/hT2 [dpy-18(h662)] I; +/hT2 [bli-4(e937)] III. | マーカー/背景変異を伴うGLD/減数分裂分化不全 | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力 | ジェノタイプ背景を明確に記載して使用すること |
| JK5760 | lst-1(ok814) sygl-1(q828) gld-2(q497) gld-1(q361) I/hT2 [bli-4(e937) let-?(q782) qIs48] (I;III). | GLDパスウェイおよびNotch標的/幹細胞調節因子背景 | 生殖細胞腫瘍 | 有糸分裂領域の長さ;pH3+細胞数;繁殖力;幹細胞マーカー発現 | 複雑な生殖細胞幹細胞/分化モデル;「Notch」にまとめて分類しないこと |
表1: 代表的なC. elegans変異株および推奨されるがん関連経路のリードアウト。 株名および遺伝子型はCGC/WormBaseの記録に基づく。経路および表現型のアノテーション15,16,25,30,33,34,44,45,51,52,53。本表は、がん関連のC. elegans研究で一般的に用いられる経路特異的なリードアウトを示す代表的な株をまとめたものである。
略語:CGC, Caenorhabditis Genetics Center; DSL, Delta/Serrate/LAG-2-family ligand; EGFR, 表皮成長因子受容体; ERK, 細胞外信号調節キナーゼ; gf, 機能獲得; GLD, 生殖細胞系発達不全; Glp, 生殖細胞増殖不全表現型; lf, 機能喪失; MAPK, ミトゲン活性化プロテインキナーゼ; MEK, MAPK/ERKキナーゼ; Muv, 多vulva; pH3+, リン酸化ヒストンH3陽性; RAS, ラット肉腫; RNAi, RNA干渉; VPC, vulva前駆細胞; Wnt, wingless/integrated. ETS, E26 transformation-specific.
著者らは、競合する利益がないことを宣言します。
系統情報およびリソースを提供いただいた、NIH研究インフラストラクチャプログラムオフィス(P40 OD010440)の助成を受けるCaenorhabditis Genetics Centerに感謝いたします。本研究は、浙江省衛生局科学基金(No. 2025KY1608)の支援を受けて行われました。
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