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TOPICAL COLLECTIONS

クロマチン構造とそのゲノム調節における役割を研究するためのアプローチ
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Guest Editor

Dongyan Tan

Dongyan Tan

Stony Brook University, Department of Pharmacological Sciences

Dongyan Tan博士は、ニューヨーク州ストーニーブルック大学薬理科学科の助教授です。中国の中山大学で生命科学の学士号を、2009年にアルバート・アインシュタイン医科大学で生物物理学および生理学の博士号を取得しました。その後、ハーバード医学大学に転じ、構造生物学および電子顕微鏡(EM)の博士研究員としてのトレーニングを受けました。2016年、Tan博士はストーニーブルック大学で独立した研究キャリアを開始しました。Tan博士は、生化学、生物物理学、細胞生物学の幅広い背景を持っており、異なる分野の科学者と協力して複雑な生物学的課題を解決してきた実績があります。クロマチン生物学およびゲノム調節への関心は、ハーバード医学大学在籍時に始まりました。彼女の研究室では、クライオ電子顕微鏡(cryo-EM)および多様な生化学的・生物物理学的アプローチを用いて、正常な発生過程や疾患における遺伝子調節で重要な機能を担う高分子を研究しています。現在、彼女の研究室では、ヒストンバリアントやクロマチン結合タンパク質がクロマチンの構造とダイナミクスをどのように調節し、これらのプロセスが転写やDNA損傷修復にどのように影響するかを解明することに重点を置いています。 

Collection Overview

適切な遺伝子発現は、正常な細胞機能と個体形成を確実にするために極めて重要です。真核生物において、ゲノムはクロマチンとして構成されています。この動的なDNA-タンパク質複合体は、ゲノム機能を形成する強力なプラットフォームとして機能します。クロマチンがどのように構成されているかを理解することは、生理学におけるゲノム調節を理解し、またその調節不全がどのように疾患につながるかを解明するために不可欠です。

本コレクションでは、核内およびin vitroでの単離状態におけるクロマチン構造と機能を研究するために用いられる既存の手法に焦点を当てています。これには、個体レベルおよび単一細胞解像度の両方でゲノムアーキテクチャをマッピングする定量的手法(3Cベースの手法)が含まれており、これらの一連の技術は、クロマチン構造がゲノム機能とどのように密接に絡み合っているかについて重要な知見を提供します。また、クロマチン構造のダイナミクスの理解に大きく貢献してきた技術である分析超遠心法も含まれています。そして最後に、異なるスケールでクロマチンの直接的な可視化を可能にするイメージング技術を取り上げています。具体的には、超解像イメージングによって、細胞内クロマチンのin situでのナノスケール構造情報が得られています。また、クライオ電子顕微鏡に基づく技術は、ナノメートルスケールから原子レベルに近い解像度まで構造情報を生成し、クロマチン組織を研究するための重要なツールとして登場しています。

要約すると、本コレクションはこれらの手法の詳細なプロトコルを提供するだけでなく、急速に進化するクロマチン生物学の分野における最新の手法的進展を紹介するプラットフォームとしての役割も果たしています。