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栄養豊富なブロス中で段階希釈したファージ懸濁液を処理群とし、ファージを含まないブロスを対照群としたマルチウェルプレートを用意して開始します。
各ウェルにE. coliを添加します。分光光度計を用いてベースラインの吸光度（OD）を測定し、初期細菌濃度を記録します。
次に、プレートをインキュベートし、細菌の増殖とファージの感染を促進させます。
コントロールでは、細菌が栄養を利用して増殖し、ODが上昇します。
処理において、ファージは細菌の表面受容体に結合し、そのゲノムを細胞質に注入します。
宿主細胞の機構を利用してウイルスゲノムが複製され、ウイルスタンパク質が生成されると、それらが構築されて新しいウイルス粒子となります。これらの粒子が細胞を溶菌させ、子ウイルスを放出します。
一定の間隔でODを測定し、細菌の増殖を比較します。
コントロールウェルではODが漸増しますが、ファージ処理済みのウェルではOD値が低くなり、ファージ濃度が高くなるほど減少幅が大きくなります。
これにより、細菌の増殖を最大限に抑制するために必要なファージ濃度を決定することができます。
まず、交差汚染を避けるため、フィルターチップを使用してマイクロプレートアッセイをセットアップします。最初に、96ウェルマイクロプレートの1〜12列のウェルにmTSBを180 µLずつ加えます。次に、アッセイを行うため、滅菌済みの96ウェルマイクロプレートの1〜8列において、各ファージの10倍段階希釈系列を調製します。マイクロプレートの最上段であるA行の1〜8ウェルに、個別のファージまたはファージカクテルを20 µLずつ加えます。
ファージ不含およびブランク対照として、9列目から12列目の最上段のウェルに20 µLのmTSBを加えます。ピペッティングの際は、少なくとも5回、緩やかに繰り返し吸引してウェル内の溶液を混合し、希釈の合間にチップを交換してください。最下段のH行から20 µLを取り除き、その後、1 mLピペットを用いて希釈培養液2～3 mLをリザーバーに移し、試験対象の細菌株のリザーバーを準備します。
マルチチャンネルピペットを使用し、チップを交換しながら、1列目から10列目までの各ウェルに希釈した細菌培養液を20 µLずつ分注します。マイクロプレートに蓋をし、37 °Cでインキュベートします。2時間ごとにマイクロプレートをインキュベーターから取り出し、マイクロプレートリーダーを用いてプレートを測定します。
あるいは、プレートをマイクロプレートリーダー内でインキュベートし、経時的に測定します。