$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
細胞外小胞(EV)は、脳腫瘍細胞を含むさまざまな細胞によって分泌されるナノサイズの不均一な膜結合小胞です。小型EVは、エンドソーム由来EVと膜脱落EVからなる亜集団である。
小さなEVを精製するには、均質な溶液を維持し、EVの構造的完全性を維持するスクロースを添加したバッファーに懸濁して、事前に抽出されたEVを採取することから始めます。
次に、この溶液に適切な量のヨウジキサノール(不活性で無毒の密度勾配媒体)を加えて、目的の密度を達成します。
ヨオジキサノールは、後で除去する汚染タンパク質を可溶化します。
次に、密度を連続的に低下させるヨウジキサノール溶液の層を追加して、不連続な密度勾配を作成します。
チューブを高速で遠心分離します。
浮遊速度に応じて、密度の高いEVは勾配媒体の等密度の層に移動し、密度の低いEVはさらに軽い層に移動し、最も密度の高い汚染物質はチューブの底にペレットを形成します。
次に、適切なバッファーを含む新しいチューブにグラジエント層のごく一部を移します。
その後、低温状態で超高速でチューブを遠心
分離します。
遠心分離中、低温により EV が高速で発生する熱損傷を防ぎます。
純粋なEVがペレットダウンした後、上清を除去します。EVを適切なバッファーに再懸濁し、特性評価とプロテオミクス分析に進みます。
まず、EVを含む1.5ミリリットルのスクロース/トリスバッファーに60%ヨウジキサノール1.5ミリリットルを加えて、30%ヨウジキサノールを含む最終溶液を作成します。液をよく混ぜるために、数回上下にピペットで移動します。
この溶液を5.5ミリリットルの超遠心分離チューブの底に移します。次に、60%ヨウジキサノールストックを超純水と混合して、少なくとも1.5ミリリットルの20%ヨウ素と10%の両方のヨウジキサノール溶液を調製します。
注射器と18G針を使用して、1.3ミリリットルの20%ヨウジキサノール溶液を測定し、下の勾配の上に慎重に重ねます。
針のベベルをメニスカスのすぐ上のチューブの内側に接触させたままにし、密度界面で層が混合されないように溶液を滴下します。
次に、同じ手法を使用して、1.2%ヨウ素キサノール溶液の10ミリリットルを20%層の上に層に重ねます。超遠心分離チューブのバランスを慎重に取り、ローターバケットにロードします。
スイングバケットローターの加速速度と減速速度を最小速度に設定し、268,000 x g、摂氏4度で50分間遠心分離します。
サンプルを遠心分離している間に、密度勾配の画分 1 から 10 に対応するサンプルごとに 10 本の 1.5 ミリリットル微量遠心チューブにラベルを付けます。
遠心分離が完了したら、ローターバケットからチューブをそっと取り外し、安定したホルダーに入れます。グラジエントの上部から490マイクロリットルの連続画分を10回ピペットで対応するチューブにピペットで入れます。
屈折計を使用して、フラクションの屈折率を測定します。次に、各画分を清潔な12ミリリットルの超遠心分離チューブに移します。
各チューブに5ミリリットルの1x PBSを加え、ゆっくりと上下にピペットで混合します。チューブの上部にさらに6ミリリットルの1x PBSを加え、もう一度慎重に混合します。
チューブを100,000 x g、摂氏4度で超遠心分離して、小さな小胞を再ペレット化します。上清をデカントし、チューブを軽くたたいて乾かしてから、タンパク質分析のために小胞を溶解するか、形態学的分析のためにEVを再懸濁します。