0 閲覧数 • 5:06 分 • July 8th, 2025
化学療法剤は、がん細胞に一本鎖および二本鎖のDNA切断を誘導し、DNA損傷と細胞死を引き起こします。
DNA損傷を定量化するには、化学療法で治療されたがん細胞を溶融した低融点アガロースと混合します。この混合物をアガロースでプレコートされたスライドガラスにピペットで移動させます。溶融アガロースを固化させ、多孔質ゲルマトリックス内に細胞を埋め込みます。
高濃度の洗剤と塩を含む溶解バッファーで処理します。界面活性剤は細胞膜と核膜を可溶化します。さらに、高塩分はDNAからヒストンタンパク質を剥がし、核マトリックスに結合したスーパーコイルDNAを残します。
アルカリ電気泳動バッファーでインキュベートします。アルカリ性環境により、DNAスーパーコイルが巻き戻され、一本鎖、二本鎖のDNA切断が露出します。
スライドを電気泳動バッファーを含むゲルトレイに入れます。電気泳動を開始します。
負に帯電しているため、DNAは正の陽極に引き寄せられます。損傷したDNA断片は核から外に移動し、多孔質ゲルマトリックスを通って移動し、長さの長い断片は短い断片よりもゆっくりと移動します。それどころか、損傷していないDNAは容易に移動しず、核内にとどまります。
電気泳動後、蛍光核酸色素溶液で細胞を染色します。色素分子はDNAに結合します。
蛍光顕微鏡下では、損傷したDNAを含む単一細胞が蛍光彗星の構造を示します。彗星の「頭」は損傷していないDNAを表し、「尾」は損傷したDNA断片で構成されています。
彗星の「尾」の長さと強度は、化学療法で治療された個々のがん細胞におけるDNA損傷の程度を示しています。
細胞懸濁液を1%溶融低融点アガロースと1:10の体積比で混合します。上下にピペッティングして穏やかに混合し、すぐにスライドに30マイクロリットルをピペットで移します。ピペットチップの側面を使用してアガロース細胞混合物を広げ、薄い層を確実に形成します。スライドを摂氏4度の暗所で10分間平らに置きます。スライドを摂氏4度の溶解液に暗所で1時間から一晩浸します。
アルカリ彗星アッセイでは、溶解液からスライドをそっと取り出し、余分な液体を排出し、スライドを摂氏4度の暗所で1時間AESにそっと浸して、DNAを巻き戻します。
電気泳動スライドトレイに事前に冷却されたAESを追加します。スライドから0.5センチメートルを超えないようにしてください。スライドを中に置き、キャップで覆います。電源電圧を1ボルト/センチメートルに設定し、摂氏4度で30分間動作させます。電気泳動が完了したら、スライドから余分なAESを排出します。
スライドを室温の蒸留水に2回、毎回5分間そっと浸します。その後、スライドを室温で70%エタノールに5分間そっと浸します。
スライドを摂氏37度の暗所で10〜15分間乾燥させることから染色手順を開始します。次に、50〜100マイクロリットルの緑色蛍光核酸染色液を各スライドの乾燥アガロースに置き、室温で暗所で15分間染色します。スライドを蒸留水で短時間すすぎ、暗闇で摂氏37度で完全に乾燥させます。
本記事では、化学療法剤によって誘発されるがん細胞内のDNA損傷を定量化する方法について解説します。本手法では、電気泳動を通じてDNA断裂を可視化するアルカリコメットアッセイを用います。
単一細胞レベルでのDNA損傷の定量的な評価は、腫瘍学における創薬での化学療法薬の有効性評価およびメカニズム的なリスク低減において極めて重要です。アルカリコメットアッセイは、DNAの単鎖および二重鎖切断の両方を高感度に検出することを可能にし、初期段階の化合物評価における予測の信頼性を高めます。この能力は、がん細胞におけるDNA標的活性の直接的な根拠を提供することで、開発継続の判断(go/no-go決定)やポートフォリオの優先順位付けに寄与します。
アルカリコメットアッセイは、発見から前臨床に至る連続的なプロセスに組み込まれ、オンコロジーポートフォリオにおける初期のメカニズム研究とトランスレーショナルリサーチを橋渡しします。
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最終更新:22 8月 2026