クロマチンの相互作用のマッピングと転写調節を理解するためのペアエンドタグシーケンシング（CHIA-PET）によるクロマチンの相互作用の解析

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2012年4月30日

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2012年4月30日

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Yufen Goh^*¹ , Melissa J. Fullwood^*¹^,²^,³ , Huay Mei Poh¹ , Su Qin Peh¹ , Chin Thing Ong¹ , Jingyao Zhang¹ , Xiaoan Ruan¹ , Yijun Ruan¹^,³

¹Genome Institute of Singapore, Agency for Science, Technology and Research, Singapore, ²A*STAR-Duke-NUS Neuroscience Research Partnership, Singapore, ³Department of Biochemistry, National University of Singapore, Singapore

^* These authors contributed equally

ペアエンドタグシーケンシング（CHIA-PET）によるクロマチンの相互作用分析のための方法です。 de novoの検出。

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Chapters in this video

0:02

タイトル

1:00

ペアエンドタグを用いたクロマチン相互作用解析（ChIA-PET）の概要

2:15

ChIP - クロマチン免疫共沈降

4:24

細胞溶解

5:07

核溶解

7:11

クロマチンの断片化

8:26

洗浄、プレクリアリング、およびビーズへの抗体コーティング

10:08

クロマチン免疫共沈降

11:20

洗浄および溶出

11:48

ChIA-PET - ペアエンドタグシーケンシングを用いたクロマチン相互作用解析

12:29

ChIP DNA断片の末端平滑化

13:33

ビオチン化ハーフリンカーのChIP DNAへのライゲーション

16:02

ChIP DNA断片の溶出および近接ライゲーション

18:08

ChIA-PET DNAのストレプトアビジンビーズへの固定化

20:47

結論