Name: 培養細胞からの染色体の準備 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2014-01-28T13:00:00.000+00:00
Duration: 7 min 42 s
Description: 学ぶ 培養細胞から染色体を収集し、GバンディングやFISHなどの細胞遺伝学的解析に適した標本作製法。リンパ球や線維芽細胞を用いた信頼性の高い染色体調製手法を習得できます。

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本稿で説明した作業は、パトリック·F·テイラー財団からの資金によって可能になりました。

1。接着細胞の染色体収穫<ol><li> 標準プロトコル <ol><li>特定の細胞培養条件に応じて細胞を増殖させる。細胞が対数増殖期（80％コンフルエント）に達したとき、細胞培養フラスコにコルセミドを10μl/ミリリットル加える。 2×10 6セルの最小を推奨します。 </li><li> 45分間、5％CO 2インキュベーター中37℃で細胞をインキュベートする。滅菌ピペットを使用して、15ミリリットルコニカルチューブに細胞からメディアを転送。置いておきます。 </li><li>穏やかフラスコにHBSS緩衝液2 mlを添加することによって細胞を洗浄する。スワールは、バッファしてからピペットを用いて除去する。捨てる。 </li><li>それがフラスコの表面全体を覆​​うことを確実にする、1mlのトリプシンを加える。わずか約2分間トリプシンで細胞を残す。細胞の大部分が分離したら、戻って細胞上にコニカルチューブ内のメディアをピペット。 </li><li>を15mlコニカルチューブに、10mlの一定分量中の細胞懸濁液を移す。10分間200×gで遠心分離する。上清を除去し、ペレットを再懸濁。 </li><li>コニカルチューブ内の残りのペレットに37℃に温めておいてきた0.075MのKClを10ミリリットルを追加します。 KClおよび細胞を混合する程度の速度で渦管。 </li><li> 10分間37℃で細胞をインキュベートする。 25℃で5分間200×gで遠心分離（約0.5ミリリットル残るまで）上清を除去し、ペレットを再懸濁し。 </li><li>ボルテックスしながら細胞に：慎重に新鮮なカルノア固定液（氷酢酸メタノールの3:1比率）の5ミリリットルを追加。その後、10ミリリットルの合計ボルテックスせずに固定液より5ミリリットルを追加します。 </li><li> 5分間200×gで遠心分離する。上清と再懸濁細胞を除去する。各チューブに固定液の5ミリリットルを追加します。 </li><li> 5分間200×gで遠心分離する。上清と再懸濁細胞を除去する。各チューブに固定液の5ミリリットルを追加します。細胞はこれまでに一年間、4℃で保存することができる。 </li></ol></li><li> 議定書の修正：染色体harvestiリンパ芽球様細胞株のngの<ol><li>特定の細胞培養条件に応じて細胞を増殖させる。 （使用して、培養された細胞の量に適したフラスコ）。細胞は（細胞が分割され、約2日後）対数期に達すると、細胞培養フラスコにコルセミドの10μL/ mLを加え。 </li></ol></li><li> 議定書の修正：全血から染色体収穫 フィトヘマグルチニン（PHA）、金時豆に由来したレクチンは、ヒトT細胞16のための強力なマイトジェンである。 72時間の培養にPHAを添加した後、細胞の約45％がS期にある。これは、ピーク分裂活性を示し、染色体研究のために採取するれる最適点である。 B細胞17,18を分析するとき、例えばヤマゴボウ（1-10μg/ ml）をのような他のマイトジェンを使用することができる。 <ol><li>緑のトップヘパリンナトリウム管内における全血を少なくとも1ミリリットルを収集します。採取後3日以内に使用してください。 RT国連で保存血使用する準備がゴマ。 </li><li>アリコートL-グルタミン（20％ウシ胎児血清、1％ペニシリン/ストレプトマイシン、1％ファンギゾン、および1％PHA）を含有する完全RPMI培地10ml中の全血0.25mlの。 5％のCO 2、37℃で培養する。 </li></ol></li><li> 議定書の修正：骨髄から染色体収穫 染色体異常クローンの観察は、白血病の特定のタイプのための診断され得るように、骨髄での細胞遺伝学的解析は、多くの悪性血液疾患に有用である。染色体の研究はまた、急性転化および治療に対する応答の発症などの疾患の進行を評価するために使用される。骨髄細胞が活発に分裂しているので、まだマイトジェン刺激9,19は不要である。急性白血病のために24および48時間培養も設定されています。 <ol><li>緑のトップヘパリンナトリウム管内における骨髄の少なくとも1ミリリットルを収集します。アリコートL-グルタミンを含む完全RPMI培地10ml中の骨髄0.25mlの（20％ウシ胎児血清、1％ペニシリン/ストレプトマイシン、1％ファンギゾン）。 5％のCO 2、37℃で培養する。 </li></ol></li></ol> 2。スライドの準備とソリッド染色 1代表スライドの迅速な評価は、例えば、G-バンディング、魚、CGH、または空のようさらなる手続きに進む前に、収穫の品質に関する情報を提供します。いくつかの研究室では、固体染色するために迅速な収穫と染色体評価のための細胞を好む。代替的には、位相差顕微鏡は、この分析のために使用することができる。湿度が約50％と温度雰囲気（20〜25℃）である場合、スライドを最も良く調製される。 <ol><li> 25℃で5分間、200×gで細胞を遠心分離唯一の0.3〜0.5ミリリットル残るまで上清を取り除きます。 </li><li>優しくペレットを再懸濁した後、ピペット約45°の角度で傾いたとサスペンションを許可されたスライド上では約2の距離から細胞懸濁液の3滴スライド上を流れていき。スライドに新鮮なカルノア固定液の1大粒を追加します。 </li><li>ペーパータオルの上のスライドの裏側を乾燥した後、少なくとも10分間乾燥さ引き出して座る。スライドは完全に乾燥する必要があります。 </li><li>新鮮ギムザ染色液（ガーバッファおよびギムザ染色の3:1の比）を準備します。染色ラックにスライドを置きます。ギムザ染色液中のスライド全体をカバーしています。スライドを5分間染色溶液中に残存してみましょう。 、蒸留水でスライドをすすいで排水し、空気乾燥させ。 </li><li> 4パーマウント滴のスライドにカバースリップを追加します。カバースリップの下に気泡がないことを確認してください。過剰のパーマウントは、紙タオルで除去することができる。 </li><li> 10Xと100X拡大して光学顕微鏡で細胞を分析します。中期細胞が豊富でよく普及している場合、残りのスライドを、他の実験手順を用いることができる。 </li></ol> 3。トリプシンおよびギムザを用いて、G-バンディング（GTG） &lt;のp&gt;トリプシンは、得られたより高い転写活性を有するDNA領域にユークロマチン、ヒストンを変性タンパク質分解酵素である。ギムザ染色後、これらの領域は、光のバンドとして表示されます。ほとんど、あるいは全く転写活性（ヘテロクロマチン）と高度に凝縮クロマチンをトリプシンから保護そのヒストンの大部分を持つことになりますので、ギムザ染色後暗く染色します。それは、最初にG-バンドのスライドに状況を監視し、必要に応じてその後のスライドでトリプシンタイミングを調整することが不可欠である。 <ol><li> 4コプリンジャーに以下の手段を追加します。 ジャーファー＃1X HBSSの1 = 30ミリリットルと10倍のトリプシン（0.5％）の4ミリリットル 1XのHBSSのJAR＃2 = 50ミリリットル 1X HBSSおよびウシ胎児血清の5ミリリットルのジャーファー＃3 = 45ミリリットル 1X HBSSのJAR＃4 = 50ミリリットル</li><li> 5秒のJAR＃1の各スライド、ジャー＃2の迅速なリンスを浸し、少なくとも30秒間ジャー＃3の各スライドのまま、ジャー＃4クイックすすぎ、その後、スライドを乾燥させます。 </li><li> FRESを準備しますHギムザ染色液（ガーバッファおよびギムザ染色の3:1の比）。染色ラックにスライドを置きます。ギムザ染色液中のスライド全体をカバーしています。スライドを5分間染色溶液中に残存してみましょう。 </li><li>これらは染色されたのと同じ順序でスライドを蒸留水ですすぐ。スライドを約10分間乾燥させます。スライドは完全に乾燥する必要があります。 </li><li> 4パーマウント滴のスライドにカバースリップを追加します。カバースリップの下に気泡がないことを確認してください。過剰のパーマウントは、紙タオルで除去することができる。 </li><li> 10Xと100X拡大して光学顕微鏡で細胞を分析します。最初のスライドの結果に基づいてスライドの残りのトリプシンタイミングを調整する。 </li></ol>

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</ol>

著者らは、開示することは何もありません。

我々は、種々のヒトから得られた細胞型、アカゲザル、ラットおよびマウス11,20-22を含む種々の生物の細胞から染色体を単離するための本手順を利用している。標準的なプロトコルが提供されるが、特定の重要なステップと変数は、細胞のこれらの多様なタイプのために調整される必要があり得る。いくつかの具体的な手順は、染色体の準備と結果の可能な限り最高の品質を確保するために、G-バンディングの両方に重要である。アッセイに影響を与えることができる変数の一つは、コルセミドのインキュベーション時間である。コルセミドでの不十分な時間が少ない中期スプレッドと長く、重なった染色体が得られます。コルセミドでのより長いインキュベーション時間を分析することは困難である短く、太く、染色体になります。もう一つの重要な変数は、低張液のモル濃度である。 0.075 M塩化カリウム溶液は、単に十分な細胞を溶解することなく、拡散適切な染色体を生成するために、細胞を膨潤する。追加しているとき混合しながら、カルノア固定液溶液は、第5mlのペレットに添加しなければならない。これは、余分なタンパク質の全てがサンプルを保存するか、スライドを準備する前に除去されることを保...

染色体分析は、染色体不安定性と遺伝性疾患や悪性腫瘍の1,2,8,9につながる再配列を診断するために、世界的に利用される従来の手法である。また、憲法および癌取得した遺伝的異常の診断および研究のための高解像度は、例えば、蛍光in situハイブリダイゼーション （FISH）などの古典的な細胞遺伝学的手順および分子細胞遺伝学的方法論の組み合わせ、比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）で達成することができる、およびスペクトル核型分析（SKY）14,15。より最近では、これらの技術は、幹細胞研究に関連付けられた染色体不安定性の評価のために利用されている。そのような長期培養胚細胞（ES）および種々の生物の成体幹細胞の異数性のような核型異常は、複数の研究室により報告されている。最近の証拠は、いくつかの細胞系は本質的に、染色体に対してより傾斜していることを裏付けるinstabi関係なく、培養条件のLITY。確立および/またはヒト、マウス、アカゲザル幹細胞株を維持するときに、この理由のため、染色体分析は、品質管理プロセスの一部として推奨されている。多くの報告が文化10月13日中の幹細胞および悪性細胞または様々な生物の染色体の安定性を監視するためのルーチンおよび分子細胞遺伝学の使用の関心の高まりを説明します。これらのプロトコルは、ますます培養細胞の迅速な13染色体非遺伝的評価のために実験室で使用されている。我々は、様々な生物由来の臨床研究のため、細胞の両方に適用することができる種々の細胞型からの染色体を調製するための我々の基本的な手順を提示する。

<table><tbody><tr><td>KaryoMAX Colcemid</td><td>Gibco</td><td>15212-012</td><td></td></tr><tr><td>HBSS Buffer</td><td>Gibco</td><td>24020-117</td><td></td></tr><tr><td>0.5% トリプシン EDTA 10x</td><td>Gibco</td><td>15400-054</td><td></td></tr><tr><td>Permount</td><td>Fisher Scientific</td><td>SP15-100</td><td></td></tr><tr><td>緩衝剤 "GURR"</td><td>Gibco</td><td>10580-013</td><td></td></tr><tr><td>Geimsa Stain</td><td>Ricca Chemical Company</td><td>3250-16</td><td></td></tr><tr><td>遠心分離機5810</td>エ<td>ッペンドルフ</td><td></td><td></td></tr><tr><td>メタノール</td><td>カレドン研究所化学薬品</td><td>6700130</td><td></td></tr><tr><td>氷酢酸</td><td>Krackeler Scientific Inc.</td><td>〒11-9508-05</td><td></td></tr></tbody></table>

培養細胞からの染色体の準備

Chromosome Preparation From Cultured Cells

染色体（細胞遺伝学的）分析は、染色体不安定性の検出のために広く使用されている。 G-バンディングや、in situハイブリダイゼーション（FISH）蛍光として分子技術が続く場合には、このアッセイは、1つ以上の染色体が関与するゲノム再配列の部分の損益を伴う収差を個々の細胞を分析するための強力な能力を持っています。ヒトでは、染色体異常は約1 160あたりの出生1,2、すべての流産の60から80パーセントで発生する3,4、死産の10％の2,5、先天性心疾患6、3から6パーセントを持つ個人の13％不妊のケース2の、そして発達遅滞と先天性欠損7と多くの患者において。クローン性染色体異常の観察は、診断および予後的意義8,9の両方を有することが示されているように、悪性腫瘍の細胞遺伝学的分析は、日常的に、研究者や臨床医によって使用される。60、染色体の分離は、遺伝子治療のための非常に貴重であり、ヒト以外の霊長類とげっ歯類10月13日を含む生物の幹細胞研究。 染色体は、血液リンパ球、皮膚線維芽細胞、羊膜細胞、胎盤、骨髄、および腫瘍検体を含む生体組織の細胞から単離することができる。染色体は、それらが最も凝縮された場合に、有糸分裂の中期段階で分析され、したがって、よりはっきりと見える。染色体分離技術の最初のステップは、後続の後期段階に進むから細胞を防ぐためにコルセミドとのインキュベーションによって、紡錘糸の破壊を伴う。次いで、細胞を低張液で処理し、カルノア固定液との膨潤した状態で保存されている。次いで、細胞をスライドガラス上に滴下し、次いで、種々の手順のために利用することができる。 Gバンド法は、特徴的な明暗の帯を作成するためにギムザで染色し、トリプシン処理を必要とする。同じPR染色体を単離するocedureは、例えば、in situハイブリダイゼーション （FISH）、 蛍光 、比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）、スペクトル核型分析（SKY）14,15のような手順のための細胞の調製のために使用することができる。

高品質の中期スプレッドは、染色体分析のために不可欠です。成功したアッセイは、よく普及し、適切な染色体の形態である染色体が得られます。適切にG-バンド染色体特性明暗バンドパターンが含まれています。 <img alt="図1" fo:content-width="5in" fo:src="/files/ftp_upload/50203/50203fig1highres.jpg" src="/files/ftp_upload/50203/50203fig1.jpg" /> 図1。染色体は平均長さである、成功した染色体スプレッドは、十分に普及し、簡単に識別できる相互に、そして明暗バンドの間に十分なコントラスト。グッド染色体の形態は示す任意の再編成のための個々の染色体と評価の同定を可能にする染色体不安定性の。

染色体は、例えば、リンパ球または皮膚線維芽細胞等の生細胞から、ヒトまたはマウスを含む生物から単離することができる。これらの染色体調製物は、さらに、ルーチンG-バンディングなどsituハイブリダイゼーション （FISH）、 蛍光 、比較ゲノムハイブリダイゼーション（CGH）、スペクトル核型分析（SKY）のような分子細胞遺伝学手順のために利用することができる。

Chromosome (cytogenetic) analysis is widely used for the detection of chromosome instability. When followed by G-banding and molecular techniques such as ...

本手順の全体的な目的は、GB染色および分子細胞遺伝学的検査のために染色体を回収し、調製することです。まず、細胞を対数増殖期まで培養します。次に、smid、低張液、および固定液を用いて染色体を回収します。細胞懸濁液をスライドに滴下します。1枚のスライドを染色します。染色体標本のモニターとして、残りのスライドを用いてGBバンド法または分子生物学的な手法に進みます。GBバンディングの最終ステップとして、光学顕微鏡による分析と核型分析を行います。最終的に、染色体と核は核型分析やFISH法に使用可能になります。私がこの手法を公開しようと考えたきっかけは、様々な生物の多種多様な細胞における染色体不安定性の検出、およびその後の分子細胞遺伝学的検査への支援を求める他の研究者からの要望が非常に多かったためです。この技術は、診断の根拠となる染色体再構成の可視化を可能にするため、がんを含む多くの先天性遺伝疾患の診断、そして最終的には予後判定において不可欠です。この手法により、さまざまな種類のヒト細胞で見られる染色体再構成に関する知見を得ることができます。また、ルエスモンキー、ラット、マウスの培養細胞など、他の生物由来の細胞にも適用可能です。コンフルエンシーが80%に達した2 million個の接着細胞に、10 µg/mLの溶液を10 µL添加します。細胞密度は10^6 cells/mLとします。細胞を37 °C、5% CO2インキュベーター内で45分間インキュベートします。次に、滅菌ピペットを用いて、培養液を15 mLコニカルチューブに移し、後で使用するために保存します。細胞を洗浄するため、フラスコに2 mLのHBSSを加え、撹拌してバッファーを除去します。続いて、フラスコの底面全体を覆うようにトリプシンを1 mL加えます。大部分の細胞が剥離した後、コニカルチューブに入れていた培養液をピペットで細胞に加えます。細胞懸濁液を10 mLずつ、15 mLコニカルチューブに分注します。200 Gsで10分間遠心分離します。上清を除去します。ペレットを、37 °Cに予熱した75 mM 塩化カリウム 10 mLに再懸濁し、37 °Cで10分間インキュベートします。200 ×gで5分間遠心分離します。25 °Cにおいて、上清を0.5 mLまで取り除き、ペレットを慎重に再懸濁します。5 mLの新鮮なカルノア固定液を細胞に加えます。さらに5 mLの固定液を加え、200 Gsで5分間ボルテックス遠心分離します。各細胞ペレットを5 mLの固定液で再懸濁します。細胞を4°Cで最大1年間保存します。細胞を200 ×gで5分間遠心分離します。温度は25°Cに設定してください。ペレットを穏やかに再懸濁させた後、上清を0.3～0.5 mLが残るまで取り除きます。細胞懸濁液を3滴、約45度の角度に傾けたスライドグ

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Research

JoVE Journal

Biology

生物学

核型分析は、広く遺伝子変異を検出するために使用されるシンプルかつ有用な技術である。ここでは、文化の中で維持、これらの細胞の染色体の状態を監視するためのヒト胚性幹細胞の染色体の広がりの準備のためのステップのプロトコルバイステップで説明します。...

染色体分析のためのヒト胚性幹細胞の染色体スプレッドの準備

染色体の複製タイミングの解析のための定量的な方法が記載されている。この方法は、蛍光との組み合わせでBrdUの取り込みを利用...

蛍光灯と組み合わせることで染色体の複製タイミング<em&gt;その場</em&gt;ハイブリダイゼーション

DNA修復経路は、ゲノムの完全性の維持および変異および癌を予防するために必須である。このプロトコルの目的は、中期の染色体異常の直接観察によりゲノム不安定性を定量化することであるテロメアDNA反復のためのin situハイブリダイゼーション （FISH）、 蛍光を使用して、マウスのB細胞から広がる。...

PNA-FISHによるマウスのBリンパ球における染色体異常の迅速分析

高度に圧縮された有糸分裂クロマチンの脱凝縮の分子メカニズムは明確に定義されていません。HeLa細胞から単離された有糸分裂クロマチンクラスターとXenopus...

無細胞アッセイは、有糸分裂の終了時クロマチン脱凝縮を勉強します

植物におけるFISHのための適切な高速空気乾燥滴下染色体製造方法

このプロトコルは、周囲の空気の粒子状物質で処理した後、RAW264.7マウスマクロファージにおけるin vitroで染色体異常の定量および特徴付けのための手法について説明します。...

使用周囲粒子状物質によって誘発される染色体異常の解析<em&gt;インビトロ</em&gt;システム

これ以降のプロテオーム解析の架橋クロマチンのシーケンス固有のキャプチャに依存する特定のターゲット遺伝子の新規 DNA...

交配の適応は哺乳類細胞プロテオミクスのクロマチン関連タンパク質の捕捉します。

DNAハロー調製物と蛍光in situハイブリダイゼーションを組み合わせることで、核酸骨格とのゲノム相互作用の高分解能解析が可能になります。付着したゲノムは、抽出された残留核内に位置するハイブリダイズした蛍光シグナルをもたらしますが、非付着ゲノムは、残留核を取り囲むDNAのハローにあります。...

全染色体、テロメア、遺伝子座を明らかにするためのDNAハロー調製物での蛍光In situハイブリダイゼーション

長さスケール全体で染色体コンフォメーションをキャプチャする

このプロトコルは、トポロジー的会合ドメイン(TAD)の境界や、調節と他のDNA配列要素との間の長距離クロマチン相互作用など、メガベースサイズの標的ゲノム領域の3D組織を高解像度で特徴付けるために使用されるCapture Hi-C法について説明しています。...

キャプチャHi-C による 高分解能3Dクロマチン構成の解読

学ぶ 培養細胞から染色体を収集し、GバンディングやFISHなどの細胞遺伝学的解析に適した標本作製法。リンパ球や線維芽細胞を用いた信頼性の高い染色体調製手法を習得できます。

培養細胞からの染色体の準備

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