2015年11月10日
この原稿の目標は、MRIを使用して海馬と海馬のサブフィールドを研究することです。この原稿では、海馬と5つの海馬下部構造(cornu ammonis(CA)1、CA2 / CA3、CA4 /dentate gyrus、strata radiatum/lacunosum/moleculare、およびsubiculum)をセグメント化するためのプロトコルについて説明しています。
このプロトコルの全体的な目標は、磁気共鳴画像上のサブフィールドを使用して人間の海馬をセグメント化するための、信頼性が高く、解剖学的に正確な方法を提供することです。ここでは、海馬のサブフィールドは、CA 1、CA 2、ca 3、CA 4、dentate gyrus、S-R-S-L-S-M、および icm の 5 つのラベルに分割されます。この方法は、海馬のサブフィールド構造が健康な状態や病気の状態でどのように変化するかなど、ニューロイメージング分野の重要な質問に答えるのに役立ちます。
この技術の主な利点は、3 Tスキャナーで収集された高解像度画像に合わせて調整され、海馬の前方後部全体のサブフィールド定義が含まれていることです。まず、次のコマンドシーンをターミナルに入力します。T one ウェイト画像でソフトウェアインターフェースを開くには、冠状ビューを拡大して海馬を拡大し、ナビゲーションウィンドウでセグメントを選択してから、XY 半径を選択します。
XY ブラシ サイズを 0.1 に設定します。海馬の最前部の冠状スライスまでスクロールして、スライスa、前方のモットスライスに移動します。海馬の灰白質の最も外側の境界を、周囲の側頭葉白質と出会う場所に描画し、アルベスの高強度の白質を使用して、上境界を支援します。
ナビゲーションウィンドウのセグメンテーションメニューにあるラベル塗りつぶしキーを使用して、境界線内のラベルを塗りつぶします。スライスBでは、海馬の頭が勝ちました。海馬の頭の境界を、側頭葉とアルベスの白質をガイドとして使用して描き続けます。
次にスライスCは、海馬の頭の2つと日付があります。アリウスの白質を使用して海馬の年代を描きます。次に、軸ビューを使用して、外側の海馬の前方の端から水平線を描画し、この線より下にあるものをすべて海馬の一部として指定します。
さて、スライスDでは、海馬の頭部3が、側頭葉の白質に海馬の下縁を描き、側脳室の下角に横方向の境界を描きます。alius fibrの白質に上縁を描き、周囲の貯水槽の低強度領域に内側の縁を引きます。スライスEの場合、下側、上側、および内側の境界を描画します。
前と同様に、海馬がわずかに薄くなり、内側皮質の灰白質に伸びる内側境界の下部分を描くことにより、推論内側境界を定義します。これらのスライスには、海馬のセグメンテーションのオーナスを含めます。次に、前のスライス F.As で海馬体を指定し、痕跡海馬溝の低強度脳脊髄液をセグメンテーションに含めないでください。
次に、スライスGセグメントの場合、海馬の尾が尾のセグメント化を開始します。円蓋の巡航が最初に見えるとき。水疱回の形状を海馬の尾に外挿して、より前方のスライスを行うことにより、水疱回を除外します。
水疱回が区別できなくなったら、目に見えるすべての灰白質を海馬の尾として扱います。次に、スライスHについては、海馬尾部の2つのセグメント、周囲の高強度白質から後部海馬尾部の低強度灰白質。最後に、またはスライスアイは、最も後部のスライスセグメント、側頭葉の周囲の白質からの海馬の灰白質の小さな残りの領域です。
まず、海馬の最前端の冠状スライスまでスクロールし、T 2 の重み付けされた画像でスクロールします。ペイントブラシの色を変更するには、ペイントラベルの設定を選択し、ターミナルに1から255までの数字を入力します。スライスA(最前端のスライス)について、可視の海馬の灰白質をその最も長い可視軸に沿って2つの等しいセクションに分割する線を引きます。
2つの異なる色を使用して、これら2つのセクションの上位をca 1とラベル付けし、下位セクションをスライスBのスルー、海馬の頭の1としてラベル付けします。海馬の形成の中央にある低強度領域にラベルを付けます。SR SLSMとして、下海馬の曲がり角で約1つの境界を下外側csumを定義します。
海馬の最も長い軸をたどり続けて、スライスC、海馬の頭の上内側先端にca one suluの境界線を描きます。誘惑に負けない2つ。ca one ラベルの曲線をたどる暗い S-R-S-L-S-M バンド、S-R-S-L-S-M 内の高強度の灰白質を CA 4 dg としてラベル付けします。
次に、曲がりと下海馬を使用して sicm ca 1 つの境界を定義します。CA 1 と CA 2 の間の境界、CA 3 の間の境界を 45 度の角度線として定義し、S-R-S-L-S-M の最も上外側の端から上方向に延びます。約 2 CA 3 を上縁に沿って内側に延長し、日付の間の谷まで延長し、残りの上縁をスライス D の ca 1 (海馬頭 3) とラベル付けします。
S-R-S-L-S-M CA four、DG、ICMには、先ほど説明したとおりにラベルを付けます。スライス C の場合、CA 2 を延長し、CA 3 を上端の中間まで延長し、上端の残りの半分を CA 1 としてラベル付けします。スーパー内側海馬の頭を垂直に半分に分割します。
内側半分をS-R-S-L-S-Mとラベル付けします。次に、水平方向に、外側の半分を半分に分割します。ここでも、下部分を CA 2、CA 3 とラベル付けし、上部分を CA 4 DG とラベル付けしてスライス E に Angus と海馬の頭を 4
つにします。ca 4 dg の最も内側の端から下方向に伸びる垂直線として、saeculum ca 1 境界を定義します。CA one、CA 2、CA three s、RSL、SM、および ca four DG の境界を引き続き定義します。以前と同様に、海馬の頭部が海馬体に移行するときの海馬のオーナスをオーナスラベルでラベル付けし、中央の低強度領域をSRSLSMとしてラベル
付けします。スライスEを続けて、UCASラベルの下外側のスーパー内側軸に沿って、S-R-S-L-S-Mセクションの上端に線を引きます。この線より上のすべての灰白質は、CA 2、CA 3として、この線より下の任意の非標識灰白質をCA 4 D.Next、または海馬体Fスライスとしてラベル付けします。スライスG、海馬の尾の1にスライスEで述べたように、スールS-R-S-L-S-M ca 4、DG ca 2、CA 3の境界線を引き続き適用します。
ICM ca 1 境界は 45 度の角度線になり、CA 4 DG のスライス H.The hippocampal tail 2 は、低強度の内側層を S-R-S-L-S-M として、外側の高強度層を CA 1 としてラベル付けします。小胞回が海馬形成と区別できなくなったら、中央に残っている灰白質をCA 4 dgとラベル付けします。最後に、スライスアイの場合、最も後部のスライスは全体の構造をCAのものとして残します。
暗いS-R-S-L-S-Mが海馬層で見えなくなると、このプロトコルでは磁気共鳴画像法を使用してヒトの海馬をセグメント化します。ここでは、海馬全体がT one加重画像を使用して9つの冠状スライスに分割されます。5、海馬のサブフィールドは、ここでTの2つの重み付け画像を使用してセグメント化され、CAの1つ、CAの2つ、CAの3つ、CAの4つ、denate gyrus、S-R-S-L-S-M、およびICMは、この海馬の頭のスライス内に見ることができます。
このテクニックを習得すると、適切に実行すれば、各科目に対して40時間で完了することができます。画像内の強度パターンをできるだけ追跡し、この手順に従う被写体間の境界に一貫性を持たせることを忘れないでください。他の自動セグメンテーション手法を実行して、健康な老化を経験している人やアルツハイマー病に苦しんでいる人などの脆弱な集団の海馬の体積と形状に関する質問に答えることができます。
このビデオを見た後、このプロトコルを確実に再現し、被験者の詳細な海馬サブフィールドの解剖学的構造についての洞察を得ることができるはずです。
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本稿では、MRIを用いてヒト海馬およびその亜領域をセグメンテーションするためのプロトコルを提示します。高解像度画像に特化した、解剖学的に正確な手法の提供に焦点を当てています。
3T MRIを用いた海馬亜領域の高解像度手動セグメンテーションにより、早期発見およびトランスレーショナル神経科学の研究開発に不可欠な精密な解剖学的描出が可能になります。本プロトコルは、海馬形態の堅牢な定量分析を支援し、神経精神疾患および神経変性疾患の研究におけるメカニズムのリスク低減(de-risking)とターゲットバリデーションを促進します。信頼性の高い亜領域セグメンテーションは、バイオマーカー開発における予測の信頼性とポートフォリオの優先順位付けの決定を向上させます。
このセグメンテーションプロトコルは、発見から前臨床段階までの連続的なプロセスに組み込まれており、仮説検証、リード化合物の同定、およびトランスレーショナルバイオマーカー開発のための基礎的な解剖学的データを提供します。