古代生物群集抱いて内部を調査するための冷凍コアの外側部分からの外因性物質の除去

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2016年7月3日

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Robyn A. Barbato¹ , Natàlia Garcia-Reyero² , Karen Foley¹ , Robert Jones¹ , Zoe Courville³ , Thomas Douglas⁴ , Edward Perkins² , Charles M. Reynolds⁴

¹Biogeochemical Sciences Branch, Cold Regions Research and Engineering Laboratory, US Army Engineer Research & Development Center, Hanover, NH, ²Environmental Processes Branch, Environmental Laboratory, US Army Engineer Research & Development Center, Vicksburg, MS, ³Terrestrial and Cryospheric Scienes Branch, Cold Regions Research and Engineering Laboratory, US Army Engineer Research & Development Center, Hanover, NH, ⁴Biogeochemical Sciences Branch, Cold Regions Research and Engineering Laboratory, US Army Engineer Research & Development Center, Fairbanks, AK

雪氷圏は過去の環境条件の下で持続保存生物へのアクセスを提供しています。プロトコルは、収集し、土壌や氷の永久凍土コアを除染するために提示されています。外因性コロニーとDNAの不在が検出された微生物は、掘削や処理からの材料ではなく、汚染を表すことを示唆しています。

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凍結コアの除染

クライオスフィア解析

永久凍土サンプリング

アイスコア処理

無菌操作法

DNA汚染管理

Serratia marcescensの検出

コールドルームプロトコル

微生物コミュニティ解析

16S rRNAシーケンシング

Chapters in this video

0:05

Title

1:06

Material Preparation

3:24

Permafrost and Ice Core Processing in a Cold Room Facility

5:33

Check for Growth of S. marcescens Colonies

7:25

Results: Permafrost Tunnel Samples, Fox, AK

8:15

Conclusion

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