に薬剤耐性に関連する新規スプライス変異体を検出するために、RNA配列決定を使用して、

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2016年12月9日

10.3791/54714-v

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Rocco Sciarrillo¹^,²^,³ , Anna Wojtuszkiewicz¹ , Irsan E. Kooi⁴ , Valentina E. Gómez³ , Ugo Boggi⁵ , Gerrit Jansen⁶ , Gert-Jan Kaspers¹^,⁷ , Jacqueline Cloos^*¹ , Elisa Giovannetti^*³^,⁸^,⁹

¹Department of Pediatric Oncology/Hematology, VU University Medical Center, ²Department of Hematology, VU University Medical Center, ³Department of Medical Oncology, VU University Medical Center, ⁴Department of Clinical Genetics, VU University Medical Center, ⁵Division of General and Transplant Surgery, Azienda Ospedaliera Universitaria Pisana, Universita’ di Pisa, ⁶Amsterdam Immunology and Rheumatology Center, VU University Medical Center, ⁷Princess Máxima Center for Pediatric Oncology, ⁸Cancer Pharmacology Lab, AIRC Start-Up Unit, University of Pisa, ⁹Institute of Nanoscience and Nanotechnology, CNR-Nano

^* These authors contributed equally

ここでは、固形腫瘍および血液悪性腫瘍における薬剤耐性に異常なスプライシングの影響を調査することを目的とプロトコルについて説明します。この目標のために、我々は、RNA-seqのを介してin vitroモデルにおける親及び抵抗性のトランスクリプトームプロフィールを分析し、候補遺伝子を検証するための定量RT-PCRベースの方法を確立しました。