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2017年5月9日
2017年5月9日
•このプロトコルは、初心者のバイオインフォマティシャンのための比較de novoトランスクリプトームアセンブリとアノテーションワークフローの概要を示しています。このワークフローは、CyVerse を通じて完全に無料で利用でき、データストアによって接続されています。コマンドラインとグラフィカルユーザーインターフェイスが使用されますが、必要なすべてのコードをコピーして貼り付けることができます。
Chapters in this video
0:05
タイトル
1:03
プロジェクトの設定、生シーケンシングリードのアップロード、およびFastQCを用いたリードの評価
3:31
生リードのトリミングおよびクオリティフィルタリングによる高品質シーケンスの取得
4:32
AtmosphereにおけるTrinityを用いたde novoトランスクリプトームアセンブリ
6:42
DEにおけるDESeq2を用いたペアワイズ差分的発現解析
7:38
結果:FastQCおよびrnaQUASTレポート
9:24
結論
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