Name: 海洋細菌の生態毒性学的方法 Vibrio anguillarum環境汚染物質の急性毒性を評価する (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2017-05-26T13:00:00.000+00:00
Duration: 11 min 26 s
Description: 学ぶ海洋細菌Vibrio anguillarumを用いた生態毒性学的方法。環境汚染物質の急性毒性を6時間曝露で評価し、LC50を算出する信頼性の高いプロトコルを確立。海洋生態系のバイオインジケーターとして有用です。

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このプロジェクトは、「NanoBioTech ambiente salute」プロジェクトの資金提供を受けました。「Progetto 2：環境モニタリングのための環境モニタリング」（ 「ナノバイオテクノロジー：環境と健康」プロジェクト2：環境。生態毒性のためのツールと方法 Regione Lazio-Consorzio HypatiaからLMに付与された「ナノ粒子のモニタリング」 ）。 ARは、以前に引用されたプロジェクトの枠組みの下、Tor Vergata / Regione Lazio-Consorzio Hypatia大学からのポスドクグラントによって資金提供されました。 ISPRA-Tor Vergata大学（N。2015/52857）との合意は、施設の相互利用と研究者の交流を可能にした。 著者は、微生物世界への関心を高め、研究の改善を強力に助けるために、すべての微生物活動の保護者であるMaria Cristina Thaller教授に借りています。著者たちはAndreaTornambèとEriに感謝しているカマガラッティは、植物プランクトン生態学および生態毒性学のISPRAラボとの貴重な協力を得ました。

1.試薬/材料の調製<ol><li>細菌懸濁液の連続希釈のための滅菌1.5 mLチューブ（約300個）と、試験濃度で標識された試験容器としての15 mL滅菌チューブを準備する。 </li><li>暴露培地として2％NaCl溶液を調製し、それを滅菌する。あるいは、塩分が5〜40の滅菌合成海水または天然海水を使用してください。 </li><li>ラベルの指示に従って2％NaClを含むトリプシン大豆寒天培地（TSA）を培地に調製し、培地中に既に存在するNaClの量を考慮する。 </li><li>試験濃度および暴露時間、反復回数、および希釈係数で予め標識した90mmペトリ皿にTSA（冷たいが液体のまま）を注ぎ、 19 mLが適切な容量です。 </li><li>ラベルの指示に従ってトリプシン大豆ブロス（TSB）増殖培地を調製する。適切な量​​のNaClを加えて、暴露培地と同じ塩分を得る。 </li><li>準備する二重蒸留水を用いてCuSO 4ストック溶液を調製し、0.22μmのシリンジフィルターを使用して（必要な）アリコートを滅菌する。環境サンプルの場合は、適切な希釈間隔でサンプルを調製し、0.22μmシリンジフィルターを使用してサンプルを滅菌します。 </li><li>試験濃度で標識された15 mLチューブに試験溶液を調製する。ネガティブコントロールを5 mLの暴露培地（2％NaCl）で満たします。他の試験管に適切な量の暴露培地とCuSO 4原液を満たし、最終濃度5 mLの試験濃度を得る。 </li></ol> 2.細菌接種物の調製<ol><li>試験の12〜18時間前に、 Vibrio anguillarumの液体の新鮮な培養液を調製する。滅菌ループを使用して、固体培地（TSA）上で一晩培養した単離した単離コロニーを選択する。 10mLのTSBで満たされたチューブに接種し、細菌培養物を25℃で12〜18時間インキュベートする。 </li&gt; <li> 12〜18時間後、接種材料の細菌濃度を分光光度的に推定する。接種材料をボルテックスし、TSBをブランクとして600 nm波長で光学密度を測定する。 </li><li>既知の細菌濃度を得るために、この式で計算したTSBの量を添加することによってボルテックスした接種材料2mLを希釈する： TSBmL = [（OD / 0.14）* 2] -2。 </li><li>希釈した接種材料の光学密度が0.140（±0.005）であることを確認します。これは、McFarland比濁標準の0.5ポイントに相当します。 </li><li>希釈した接種材料を3,000gで10分間遠心分離する。上清を除去し、微生物ペレットを1mLの2％NaCl溶液（暴露培地）に再懸濁する。 </li></ol> 3.露出のテスト<ol><li>コントロールを含む各チューブに再懸濁した細菌接種材料150μLを添加する。 V. anguillarum懸濁液を25℃で6時間、暗黒下でインキュベートし、連続して沈降を避けるために振とうする。 </li><li>暴露時間の開始（T 0 ）および終了（T 6 ）に、コロニー形成単位（CFU）計数法を用いて、全ての暴露された細菌懸濁液中で細菌計数を行う。 </li><li> 10倍希釈係数（10 -5まで）を適用して、各曝露された細菌懸濁液の連続希釈物を三重に調製する。 900μLの暴露培地（2％NaCl）で既に満たされた対応するチューブに100μLの各細菌懸濁液を加える。連続希釈を続け、各段階でボルテックスして細菌を再懸濁する。 </li><li>対応するセグメントのTSAペトリ皿上に10 -4および10 -5希釈物10μLをプレートする。プレートを回転させることで、小さな円をすばやく滑らせます。プレートを25℃で48時間インキュベートする。 </li></ol> CFUカウンティング<ol><li> 48時間後、ペトリ皿上で増殖したコロニーを数え、 bを含むプレート正確な計数には5〜50コロニーが最適です。 </li><li>以下の式を適用して、各曝露された細菌懸濁液のmL当たりの生菌数を計算する： 10 -4 →CFU / mL = n°CFU×100×10,000 10 -5 →CFU / mL = n°CFU×100×100,000 </li><li>対照と比較して死亡率を評価するために、平行反復で得られたカウントの平均を用いる。死亡率をパーセンテージとして次の公式で計算します。 M％= 100 - [（N / C）×100] 注：N =毒性物質に暴露した後に生育したCFU / mLの数。 C =対照培地中で増殖したCFUの数。 </li><li>適切な統計ソフトウェア（材料表参照）を用いた非線形回帰分析により、LC 50 （ すなわち、活発に複製する細菌の数をmL当たり50％減少させる毒性物質の濃度; CFU / mL）を計算する。一方向分散分析（ANOVA）を実行する事後的なペアワイズt検定により、治療間の有意差を評価した。 </li></ol>

<ol><li>Guidance on information requirements and chemical safety assessment. , ECHA (European CHemicals Agency). Available from: 
 <a target="_blank" href="http://guidance.echa.europa.au/docs/guidance document/information">http://guidance.echa.europa.au/docs/guidance document/information</a> (2008).</li>
<li>Parvez, S., Venkataraman, C., Mukherji, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+review+on+advantages+of+implementing+luminescence+inhibition+test+%28Vibrio+fischeri%29+for+acute+toxicity+prediction+of+chemicals%5BTitle%5D)+AND+%22Environm.+Internat%22%5BJournal%5D)">A review on advantages of implementing luminescence inhibition test (Vibrio fischeri) for acute toxicity prediction of chemicals.</a> Environm. Internat. 32 (2), 256-268 (2006).</li>
<li>Rad, M., Shahsavani, D. <a target="_blank" href="http://journals.tubitak.gov.tr/veterinary/issues/vet-10-34-4/vet-34-4-15-0812-5.pdf">Isolation and characterization of Vibrio (Listonella) anguillarum from catfish.</a> Turkish J. Veter. Animal. 34 (4), 413-415 (2010).</li>
<li>Thompson, F., Iida, T., Swings, J. <a target="_blank" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15353563">Biodiversity of Vibrios.</a> Microbiol. Mol. Biol. Rev. 68, 403-431 (2004).</li>
<li>Austin, B., Austin, D. A. Vibrionaceae representatives: characteristics of the disease. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aAustin%2C+B+%22Bacterial+Fish+Pathogens%3A+Disease+of+Farmed+and+Wild+Fish%22">Bacterial Fish Pathogens: Disease of Farmed and Wild Fish</a>. 29-30, Springer-Praxis. Chichester, UK. 108-115 (1999).</li>
<li>Larsen, J. L., Mellergaard, S. Microbiological and hygienic problems in marine aquaculture: furunculosis and vibriosis in rainbow trout (Salmo gairdneri). L.). Bull. Eur. Assoc. Fish Pathol. 1, 29-31 (1981).</li>
<li>Oliver, J. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+viable+but+nonculturable+state+in+bacteria%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Microbiol%22%5BJournal%5D)">The viable but nonculturable state in bacteria.</a> J. Microbiol. 43 (1), 93-100 (2005).</li>
<li>Hsieh, C. -Y., Tsai, M. -H., Ryan, D. K., Pancorbo, O. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Toxicity+of+the+13+priority+pollutant+metals+to+Vibrio+fisheri+in+the+Microtox+chronic+toxicity+test%5BTitle%5D)+AND+%22Sci.+Total+Environ%22%5BJournal%5D)">Toxicity of the 13 priority pollutant metals to Vibrio fisheri in the Microtox chronic toxicity test.</a> Sci. Total Environ. 320, 37-50 (2004).</li>
<li>Migliore, L., Rotini, A., Thaller, M. C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Low+doses+of+Tetracycline+trigger+the+E.+coli+growth%3A+a+case+of+hormetic+response%5BTitle%5D)+AND+%22Dose-Response%22%5BJournal%5D)">Low doses of Tetracycline trigger the E. coli growth: a case of hormetic response.</a> Dose-Response. 11, 550-557 (2013).</li>
<li>Adams, M. S., Stauber, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Development+of+a+whole-sediment+toxicity+test+using+a+benthic+marine+microalga%5BTitle%5D)+AND+%22Environm.+Toxicol.+Chem%22%5BJournal%5D)">Development of a whole-sediment toxicity test using a benthic marine microalga.</a> Environm. Toxicol. Chem. 23 (8), 1957-1968 (2004).</li>
<li>Manfra, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ecotoxicity+of+diEthylene+Glycol+and+risk+assessment+for+marine+environment%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Hazard.+Mat%22%5BJournal%5D)">Ecotoxicity of diEthylene Glycol and risk assessment for marine environment.</a> J. Hazard. Mat. 284, 130-135 (2015).</li>
<li><a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=%22Microtox%C2%AE+Acute+Toxicity+Solid-Phase+Test%22">Microtox® Acute Toxicity Solid-Phase Test</a>. , Azur Environmental. 20 (1995).</li>
<li><a target="_blank" href="http://www.rsambiente.it/data/photo/APAT%20CNR%20IRSA%201030%20Man%2029%202003.pdf">Metodi analitici per le acque. Manuali e Linee Guida (Analytical methods for waters. Manual and Guidelines).</a> Metodi Ecotossicologici (Ecotoxicological methods). 29 (3), APAT IRSA-CNR. 8030(2003).</li>
<li>Heinlaan, M., Ivask, A., Blinova, I., Dubourguier, H. -C., Kahru, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Toxicity+of+nanosized+and+bulk+ZnO%2C+CuO+and+TiO2+to+bacteria+Vibrio+fischeri+and+crustaceans+Daphnia+magna+and+Thamnocephalus+platyurus%5BTitle%5D)+AND+%22Chemosphere%22%5BJournal%5D)">Toxicity of nanosized and bulk ZnO, CuO and TiO2 to bacteria Vibrio fischeri and crustaceans Daphnia magna and Thamnocephalus platyurus.</a> Chemosphere. 71, 1308-1316 (2008).</li>
<li>Mortimer, M., Kasemets, K., Heinlaan, M., Kurvet, I., Kahru, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((High+throughput+kinetic+Vibrio+fischeri+bioluminescence+inhibition+assay+for+study+of+toxic+effects+of+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Toxicol.+In+Vitro%22%5BJournal%5D)">High throughput kinetic Vibrio fischeri bioluminescence inhibition assay for study of toxic effects of nanoparticles.</a> Toxicol. In Vitro. 22 (5), 1412-1417 (2008).</li>
<li>Bondarenko, O. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multilaboratory+evaluation+of+15+bioassays+for+%28eco%29+toxicity+screening+and+hazard+ranking+of+engineered+nanomaterials%3A+FP7+project+NANOVALID%5BTitle%5D)+AND+%22Nanotoxicology%22%5BJournal%5D)">Multilaboratory evaluation of 15 bioassays for (eco) toxicity screening and hazard ranking of engineered nanomaterials: FP7 project NANOVALID.</a> Nanotoxicology. 10 (9), 1229-1242 (2016).</li>
<li>Matranga, V., Corsi, I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Toxic+effects+of+engineered+nanoparticles+in+the+marine+environment%3A+model+organisms+and+molecular+approaches%5BTitle%5D)+AND+%22Mar.+Envir.+Res%22%5BJournal%5D)">Toxic effects of engineered nanoparticles in the marine environment: model organisms and molecular approaches.</a> Mar. Envir. Res. 76, 32-40 (2012).</li>
<li>Corsi, I., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Common+strategies+and+technologies+for+the+ecosafety+assessment+and+design+of+nanomaterials+entering+the+marine+environment%5BTitle%5D)+AND+%22ACS+NANO%22%5BJournal%5D)">Common strategies and technologies for the ecosafety assessment and design of nanomaterials entering the marine environment.</a> ACS NANO. 8 (10), 9694-9709 (2014).</li>
<li>Handy, R. D., von der Kammer, F., Lead, J. R., Hassellöv, M., Owen, R., Crane, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+ecotoxicology+and+chemistry+of+manufactured+nanoparticles%5BTitle%5D)+AND+%22Ecotoxicology%22%5BJournal%5D)">The ecotoxicology and chemistry of manufactured nanoparticles.</a> Ecotoxicology. 17, 287-314 (2008).</li>
<li>Kasemets, K., Suppi, S., Kunnis-Beres, K., Kahru, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Toxicity+of+CuO+nanoparticles+to+yeast+Saccharomyces+cerevisiae+BY4741+wild-type+and+its+nine+isogenic+single-gene+deletion+mutants%5BTitle%5D)+AND+%22Chem.+Res.+Toxicol%22%5BJournal%5D)">Toxicity of CuO nanoparticles to yeast Saccharomyces cerevisiae BY4741 wild-type and its nine isogenic single-gene deletion mutants.</a> Chem. Res. Toxicol. 26, 356-367 (2013).</li>
<li>Ivask, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mechanisms+of+toxic+action+of+Ag%2C+ZnO+and+CuO+nanoparticles+to+selected+ecotoxicological+test+organisms+and+mammalian+cells+in+vitro%3A+A+comparative+review%5BTitle%5D)+AND+%22Nanotoxicology%22%5BJournal%5D)">Mechanisms of toxic action of Ag, ZnO and CuO nanoparticles to selected ecotoxicological test organisms and mammalian cells in vitro: A comparative review.</a> Nanotoxicology. 8 (1), 57-71 (2013).</li>
</ol>

著者らは、競合する金銭的利益がないと宣言している。

この研究は、明確な用量 - 反応関係を示す、基準毒性物質であるCuSO 4の毒性効果を評価するために首尾よく適用された海洋細菌V. anguillarumによる新しいバイオアッセイを記載している。海洋細菌V. anguillarumは、耐塩性、遍在性、海洋生態系を代表するため、モデル生物として選ばれました。 試験は、広範囲の塩分値（5〜40）で行うことができ、微生物が試験全体の期間中容易に生存できる限り、曝露培地として生理食塩水および合成海水または天然海水を使用することができる。これにより、汽水環境や海洋環境など、さまざまな種類の試料の分析が可能になります。 暴露段階では、汚染物質8との干渉および生物学的応答への影響を避けるために増殖培地は必要ではない。 Theプロトコルは信頼性が高く、迅速で、コスト効率が高く、比較的容易です。液体 - プレートマイクロカウント9の手順は、小さな（サンプル）体積を使用する利点をもたらすが、これは高度の精度と堅牢性を意味する。 3つの独立した試行の結果および各治療の反復は、この方法の高い再現性を示す。生物学的モデルとしての細菌の使用、ならびにこの技術の適合性は、この手順の生態学的および環境的関連性を支持する。他の重要な技術的問題は、細菌接種物の調製における正確さおよび手順のいくつかのステップで必要とされる無菌性である。 提案された試験は、他の海洋生態毒性試験（24〜96時間）よりも迅速であり（6時間）、高等生物の使用に伴う倫理的問題を引き起こさない。さらに、基準毒物に関するデータは、急性期tで得られた値と同等のLC 50値を示す<html>他の海洋生物10,11についての推定値であり、良好な感度を示している。細菌バイオアッセイの中で、 V.フィッシェリ発光阻害試験が最も一般的でよく標準化されている12 。このバイオアッセイは非常に迅速であり（15〜30分）、固相試料を試験するのに有効ですが、発光測定に干渉する着色サンプルや混濁サンプルの影響を受ける可能性があります。塩濃度は2％NaClを必要とする上述の試験の使用における制限要因である13 。これに対して、 V. anguillarumで提案された試験は、塩分濃度の幅広い範囲で手頃な結果をもたらし、濁ったまたは着色したサンプルに関する制限がなく、ルミネッセンス分析器に比べてより安価な装置を必要とする。我々の研究の結果とV. fisheri 14の文献で利用可能なものとの比較 は、ss = &quot;xref&quot;&gt; 15,16は同等のEC 50値を示し、このバイオアッセイの有効性をさらに裏付けています。 このバイオアッセイは、微生物に現在利用可能な試験で使用される集団成長速度または酵素活性阻害の代わりに、一般に死亡率と呼ばれる細菌培養可能性の低下を評価する。 LC 50計算は、生存率/死亡率をエンドポイントとすることが多い海洋環境の生態毒性評価に一般的に適用される他のバイオアッセイとの比較を可能にします。この試験の信頼性と再現性を評価/確認し、その標準化と規制プロトコルでの使用をサポートするためには、校正訓練が緊急に必要です。 ナノマテリアルの使用の増加とその環境中への放出は、リスクアセスメントの必要性を示唆している17 。しかし、clasこれらの出現する汚染物質のための（環境に優しい）毒物学的アプローチは手頃な結果をもたらさないようであり、いくつかの適応が必要となる18 。この新しいバイオアッセイの特徴は、ナノ粒子の毒性評価へのその容易で有用な応用を可能にする。事実、異なる塩度でアッセイを実施する可能性は、異なるイオン強度（毒性に重大な影響を与える可能性のある環境パラメータ変数）下でのナノ粒子の挙動を説明する19 。さらに、有機物は毒性を高めることにより吸収を促進することができるため、生物学的利用率を低下させ、その毒性を低下させるため、増殖媒体と栄養素の使用は特に推奨されていない21 。 結論として、 Vibrio anguillarumのバイオアッセイはap海洋および汽水環境の状態の評価と同様に、古典的および新興の汚染物質のリスクアセスメントのためのツールを提供しています。

生態毒性バイオアッセイは、生態系に及ぼす物理的、化学的、生物学的ストレッサーの影響を統合し、標準的な生物学的モデルを用いて化学物質または環境サンプルの毒性を評価する。生態系の複雑さのため、生態毒性リスクアセスメントは、異なる栄養段階の生物を含む一連のバイオアッセイを検討する必要があります。実験動物の毒性試験は高価で時間がかかり、倫理的に疑わしいものです。現在の欧州の法律の枠組みで報告されているように、動物試験を制限し、代替的なアプローチ（ 例えば、バクテリアおよび非脊椎動物の動物について）を開発することの重要な課題は、EU動物防疫指令、第7回改正EUの化粧品指令、およびREACH。 甲殻類、魚類、および藻類は、海洋環境における毒性測定のために主に使用されている1 。細菌は重要な成分です微生物群集への変化は、生物地球化学的循環および他の重要な生態系サービスに重大な影響を及ぼす可能性がある。微生物に基づく毒性試験は、比較的迅速で、再現性があり、安価であり、倫理的問題を引き起こさないため、人気が高まっています2 。この研究の目的は、環境汚染物質に暴露された海洋細菌Vibrio anguillarum （ Listonella anguillarum、 Vibrionaceae）の応答を評価するための生態毒性プロトコルを記述することである。 V.アンギララム（V. anguillarum）は、 極性鞭毛を有するグラム陰性の短い曲線状のロッド細菌（0.5×1.5μm）である。典型的には、汽水または塩水に見出され、約20の最適塩分および25〜30℃の最適温度を有する、耐塩性である。その普遍性とその重要な生態学的役割のために生物モデルとして選ばれました世界的に4 。 V. anguillarumのいくつかの血清型は、様々な海洋性または汽水性の魚種においてウイルス虫症を引き起こすことが知られている5,6 。このためには、実験のいくつかのステップで標準的な微生物学的手法が必要ですが、特別な安全装置や予防措置は必要ありません。提案された毒性試験プロトコルは、バクテリアの培養可能性（ すなわち、複製能力およびコロニーを形成する能力）をエンドポイントとして使用し、LC 50（細菌を活発に複製およびコロニーを形成する50％の減少を引き起こす濃度）の決定を可能にする。 6時間の露出。 ビブリオでは、他の微生物と同様に、一般的に死亡率として示されているこの減少は、部分的には生存可能であるが非培養可能な（VBNC）段階の個体に起因する可能性がある7 。本研究では、この方法を適用して、硫酸銅（CuSO 4）、基準毒物である。 この方法は、ナノ物質などの汚染物質を含む汚染物質/化学物質の生態毒性評価のための適切な微生物ベースの試験を提供するために開発された。微生物に使用される既存の方法と比較してこのプロトコルの新規性は、主に暴露培地およびエンドポイントに関連する。事実、曝露は生理食塩水中で行われ、生物学的反応に影響を与えるかもしれない調査された汚染物質による増殖培地の干渉を回避する。エンドポイントは、細菌の培養可能性の低下であり、生存率/死亡率に基づいて、海洋/汽水環境での生態毒性スクリーニングに使用される他の急性エンドポイントと容易に比較することができる。さらに、このプロトコールは、 大腸菌 9で既に使用されている液体 - プレート - マイクロカウント技術を使用して、体積を減らし、したがって実験的な効果を減少させるort（詳細はプロトコルのステップ3.3と3.4を参照）。

<table><tbody><tr><td>Vibrio anguillarum (AL 102株、血清型O1)</td><td></td><td></td><td>NOIFMA(ノルウェー)の研究室コレクションから入手した</td></tr><tr><td>トリプチン大豆寒天&nbsp;</td><td>Liofilchem</td><td>610052</td><td>脱水培養培地</td></tr><tr><td>トリプシン性大豆ブロス 増殖培地</td><td>Liofilchem</td><td>610053</td><td>脱水培地</td></tr><tr><td>CuSO4&middot;5H2O</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>209198</td><td></td></tr><tr><td>NaCl&nbsp;</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>S-3014</td><td></td></tr><tr><td>機器名</td><td>会社</td><td>カタログ番号</td><td>コメント/説明</td></tr><tr><td>Biosafety層流フード&nbsp;</td><td>ESCO</td><td></td><td></td></tr><tr><td>インキュベーター&nbsp;</td><td>Fratelli Galli</td><td>Mod. 2100</td><td></td></tr><tr><td>ソフトウェアの名前</td><td>会社</td><td>カタログ番号</td><td>コメント/説明</td></tr><tr><td>Benchmark Dose Software&nbsp;</td><td>米国EPA</td><td>ベンチマーク用量2.4.0&nbsp;</td><td>2012</td></tr></tbody></table>年度

海洋細菌の生態毒性学的方法<em&gt; vibrio anguillarum</em&gt;環境汚染物質の急性毒性を評価する

Ecotoxicological Method with Marine Bacteria Vibrio anguillarum to Evaluate the Acute Toxicity of Environmental Contaminants

細菌は生態系の重要な構成要素であり、微生物の共同体の変化は生物地球化学サイクリングおよび食物網に重大な影響を及ぼす可能性がある。微生物に基づく毒性試験は、比較的迅速で、再現性があり、安価であり、倫理的問題に関連していないため、広く使用されている。ここでは、海洋細菌Vibrio anguillarumの生物学的応答を評価するための生態毒性学的方法について説明します。この方法は、環境試料だけでなく、ナノ粒子などの新しい汚染物質を含む化学化合物の急性毒性を評価する。終点は、有毒物質への暴露による細菌の培養可能性の低下（ すなわち、複製およびコロニーを形成する能力）である。この減少は、一般的に死亡率と呼ぶことができる。この試験により、LC 50 、すなわち細菌を50％減少させる濃度であるコロニーをコロニーを形成しながら積極的に複製させることが可能になる6時間の暴露。培養可能な細菌をコロニー形成単位（CFU）でカウントし、「死亡率」を評価し、対照と比較する。この研究では、硫酸銅（CuSO 4 ）の毒性を評価した。明確な用量反応関係が観察され、3回の独立した試験の後、平均LC 50は1.13mg / Lであった。このプロトコールは、微生物を用いた既存の方法と比較して、より広い範囲の塩分に適用可能であり、着色/濁ったサンプルには制限がない。それは、曝露媒体として生理食塩水を使用し、調査された汚染物質と増殖培地の可能性のある干渉を回避する。 LC 50の計算は、海洋環境の生態毒性評価に一般的に適用される他のバイオアッセイとの比較を容易にします。

V. anguillarumを4種類の濃度のCuSO 4に暴露させた3つの独立した試験の結果は、明確な用量 - 反応関係と、対照毒性物質の濃度が増加するにつれて積極的に複製しコロニーを形成する細菌の有意な減少を示す（ 図1 ; ANOVA、F = 20.28、p &lt;0.001）。コントロール（CNTR）と比較して、CFU / mLの数は1.25mg / Lで有意に減少した（Tukey後の試験、p &lt;0.05）。すべての培養可能な細菌が試験された最高濃度で検出された。暴露培地の広い塩分範囲（ すなわち、 5,20、または35g / L NaCl、データは示さず）に沿って、CuSO 4毒性の差異は見られなかった。非線形回帰を示す統計的解析の代表的な出力は補足図1に報告されている。 3つの独立した試験（&lt;表1）は、この方法の実行可能性と再現性を強調している。 <img alt="図1" src="/files/ftp_upload/55211/55211fig1.jpg" /> 図1：CuSO 4に暴露されたビブリオ・アンギララム 4.異なる濃度のCuSO 4に6時間暴露されたCFU / mL（CFU =コロニー形成単位）の平均数。値は、3つの独立した試験の平均（±SD）を表す。コントロール（CNTR）に関して積極的に複製およびコロニーを形成する細菌の減少は、黄色のボックス（パーセントとして）に報告される。ポストホックのTukey検定に基づくコントロールとの有意差は、アスタリスクで示されている（* = p &lt;0.05; ** = p &lt;0.01）。 <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55211/55211fig1large.jpg" target="_blank">この図の拡大版を見るには、ここをクリックしてください。</a> 表1：CuSO 4に暴露されたビブリオ・アンギララムの致死濃度（LC 50 ）値。 3つの独立した試験および平均（±SD）の結果が報告されている。 補足図1：非線形回帰分析。非線形回帰分析（Logit-Hillモデル）の代表的な出力は、試験の結果に対して行われた。 <a href="http://ecsource.jove.com/files/ftp_upload/55211/suppl_fig_1.tif" target="_blank">この図をダウンロードするにはここをクリックしてください。</a>

この研究では、海洋細菌Vibrio anguillarumを用いて、ナノ物質などの新たな汚染物質を含む汚染物質の生態毒性を評価する新しいプロトコルについて説明します。この方法は、6時間の曝露後に、細菌の培養可能性を50％低下させる濃度であるLC 50または死亡率の測定を可能にする。

海洋細菌の生態毒性学的方法<em&gt; Vibrio anguillarum</em&gt;環境汚染物質の急性毒性を評価する

Bacteria are an important component of the ecosystem, and microbial community alterations can have a significant effect on biogeochemical cycling and food ...

私たちは、ローマにあるイタリア環境保護・研究機構およびトル・ヴェルガータ大学の研究者です。私たちは、環境中の汚染物質の影響を評価するためのツールを開発し、生物指標としてモデル生物を特定しています。私たちは、トル・ヴェルガータ大学生物学部の生態毒性学研究室に所属しています。このビデオでは、海洋細菌Vibrio anguillarumの生物学的応答を評価するための生態毒性学的手法について説明します。このビデオでは、毒性試験の準備から実施までのすべての手順を詳しく解説します。通常の実験器具に加えて、以下の材料を用意してください。細菌懸濁液の連続希釈に使用する1.5 milliliterチューブ。細菌を塗布するための直径90 millimetersのペトリ皿。対照区を含め、各試験濃度につき最低2枚のプレートが必要です。ペトリ皿の側面に、試験濃度と曝露時間を記載します。ペトリ皿の底面に6つの区画線を引き、反復番号と希釈倍率を記載します。試験容器として使用する15 milliliters滅菌チューブに、試験濃度を記載します。本試験では、曝露培地として2%塩化ナトリウム滅菌溶液を使用しました。滅菌した合成海水または天然海水も、5〜40 g/Lの開始濃度範囲で使用可能です。2%塩化ナトリウムを含むtryptic soy agar増殖培地を十分な量調製してください。培地中に既に含まれている量を考慮して塩化ナトリウムを加え、最終濃度を2%にします。これを滅菌し、冷却後も液状であるうちに、あらかじめラベルを貼ったペトリ皿に分注します。塩化ナトリウムを含む増殖用培地として、トリプチケースソイブロスを調製します。曝露培地と同じ塩分濃度にするため、塩化ナトリウムを添加します。その際、培地にすでに含まれている塩化ナトリウムの量を常に考慮してください。本試験では、2% 塩化ナトリウムを含むtryptic soy brothを使用しました。滅菌し、使用前に冷却させておきます。本試験では、硫酸銅を参照毒物として使用します。二回蒸留水を用いてストック溶液を調製し、4 °Cで保存してください。0.22ミクロンのシリンジフィルターを用いて、必要な分量を滅菌します。環境試料の場合は、試料の適切な希釈系列を調製してください。試験容器には15ミリリットルチューブを使用します。曝露チューブに曝露培地を満たします。陰性対照を5 mL調製します。曝露チューブに、最終容量5 mLで目的の試験濃度となるように、適切な量の曝露培地と硫酸銅ストック溶液を分注します。この試験には、Vibrio anguillarumの新鮮な培養物が必要です。滅菌ループを使用して、寒天プレートから単離された単一のコロニーを選択します。前日にその細菌を接種しておきます。チューブを斜めに保持し、接種物を付着させたループでチューブの表面を塗り広げます。10 mLのトリプチケースソイブロスを満たします。細菌培養物を25 °Cで12〜18時間培養します。接種菌液の細菌濃度を分光光度計で推定します。接種菌液をボルテックスで攪拌し、波長600 nmにおける光学密度を測定します。ブランクにはトリプトイソソイブローンを用います。既知の細菌濃度を得るために、ボルテックス処理した接種液2 mLに、以下の計算式で算出した量のトリプチックソイブロスを加えて希釈します。希釈した接種液の吸光度が、マクファーランド濁度標準の0.5相当である0.14であることを確認してください。希釈した接種液を3,000 gで10分間遠心分離します。上清を除去し、微生物ペレットを1 mLの2%塩化ナトリウム溶液で再懸濁します。再懸濁した細菌接種液を各チューブに150 µLずつ加えます。Vibrio anguillarum懸濁液を、沈殿を防ぐため連続的に振とうしながら、暗所、25 °Cで6時間培養します。曝露開始時および6時間後の曝露終了時に、コロニー形成単位（CFU）計数法を用いて、すべての曝露細菌懸濁液の細菌数計測を行う。細菌懸濁液を10倍段階希釈し、10⁻⁵まで無菌的に希釈して調製する。各細菌懸濁液について、5本のチューブ1セットを3反復で調製する。チューブに希釈倍率と反復回数を記載し、すべてのチューブに2%塩化ナトリウム溶液を900 µLずつ分注します。対応するチューブに細菌懸濁液を100 µL加えます。各ステップでボルテックス処理を行いながら、連続希釈を進めます。最後から2番目と最後の希釈液を、それぞれ10 µLずつ対応するセグメントのtryptic soy agar培地プレートに播種し、プレートを回転させて液滴を小さな円状に素早く広げます。その後、プレートを25 °Cで48時間培養します。48時間後、ペトリ皿上に形成されたコロニー数を計測します。正確な計数には、5個から50個のコロニーが形成されているプレートが最適です。各試験溶液中の1 mLあたりの生存細菌数を算出し、死亡率を評価して対照群と比較することができます。1 mLあたりのコロニー形成単位（CFU）を算出するには、並行して作成した繰り返し試料で得られたコロニーの平均値に、既知の希釈倍率 N と 100 を掛け合わせます。死亡率（%）は以下の式で算出します。3回の独立した試験の結果から、それに依存する死亡率を示します。毒性物質に曝露した細菌コロニーの50%を死滅させる致死濃度であるLC 50は、Benchmark Dose Softwareを用いた既知の線形回帰分析ロジットLモデルによって算出されます。3回の独立した試験によるLC50の結果は、本手法の実現可能性と再現性を強調しています。結論として、我々は海洋細菌Vibrio anguillarumの生物学的応答を評価するための生態毒性学的手法を記述しました。この微生物は、耐塩性を持ち、遍在しており、海洋生態系を代表するものであるため選定されました。この新しい試験を硫酸銅の毒性評価に適用したところ、明確な用量反応関係が認められ、成功裏に実施されました。本プロトコルを他の微生物を用いた既存の手法と比較すると、サンプルの制限なく、より広い範囲のpHおよび塩分濃度で適用可能です。したがって、環境試料に対しても実施することができます。さらに、本バイオアッセイでは、成長率や酵素活性の阻害ではなく、死亡率を評価しています。これにより、死亡率をエンドポイントとする他の海洋環境向け急性生態毒性試験との比較が容易になります。本試験は、ナノ粒子などの新興汚染物質の生態毒性を評価するように設計されており、現在この課題に関する研究が進められています。

ecotoxicological-method-with-marine-bacteria-vibrio-anguillarum-to

Research

JoVE Journal

Environment

環境

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海洋細菌の生態毒性学的方法

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