臨床症例を有効にするためのメタデータ抽出アプローチ先端医学の概念の理解

この方法は、疾患の症状、診断および治療手順、および臨床症例報告からの患者の転帰に関する構造化された見解を提供することによって、疾患および病理に関する質問に答える助けとなる。この技術の主な利点は、生物医学文献中の任意の患者コホートに適用できることである。希少または新興の条件の疫学的研究をより再現可能にする。

この方法により、以降のテキスト分析ワークフローがより直感的で、実装が容易になります。豊富なメタデータを使用してテキストデータマシンを読み取り可能にすることで、臨床ケースレポートを見つけやすく、アクセス可能で、相互運用可能で、再利用可能な、または公正なデータリソースとして確立できます。この方法の中心は、選択した臨床症例報告に含まれるすべての臨床情報を抽出するために使用されるメタデータテンプレートである。

図のようにワークフローに従うと、臨床症例報告コーパスの組み立てが可能になる。臨床ケースレポートから医療コンテンツの検索能力、アクセシビリティ、相互運用性、および再使用性を向上させる。制御された語彙からのみ用語を提供するのではなく、各フィールドにコンテキストの詳細を含めます。

一般的に繰り返される単語やフレーズは省略します。注釈テンプレートでは、通常、ドキュメント内で識別される特定の用語を、セミコロンで区切られた主要な用語としてヘッダーに指定します。人口統計値を指定します。

具体的には、性別や性別、年齢の民族や国籍を含む患者の背景を記述するテキスト文。特定の機関の住所以外の臨床の物語内で言及された地理的位置を提供する。患者の活動や一般的な健康に関連する行動を説明するテキスト文を含むライフスタイルの値を提供します。

実際には、これは頻繁に喫煙やアルコール消費習慣を含むが、また、日光暴露、食事または身体活動の特定のタイプの頻度を含む場合があります。家族歴を参照する病歴の値を提供する, の臨床観察を記述する任意のテキスト文を含みます, 兄弟姉妹, 両親や他の家族が経験したイベント.遺伝的状態や否定的な観察と同様に。

人口統計学やライフスタイルのセクションでカバーされていない患者の背景を説明するテキスト文を含む社会史を参照する値を提供します。この声明には、職業史や社会習慣が含まれる場合があります。臨床発表の開始前に行われた医学的観察、治療または他の事象を記述するテキスト文を含む患者の医学的および外科的歴史を参照する値を提供する。

国際統計分類で使用される疾患および関連する健康問題に基づいて、以下の16の疾患システムカテゴリのうち1つ以上を指定します。徴候の発症、持続時間、重症度または症状の解決に関する最初のプレゼンテーションで始まる徴候または症状の医学的観察を記述する任意のテキスト文を含むすべての徴候および症状の詳細を提供する。最初の臨床発表時に存在する明確な疾患を記述する用語またはフレーズを含む任意の併存疾患の詳細を提供する。

診断目的で完了した医療処置の名前を含む、すべての診断技術と手順の詳細を提供します。試験、試験、想像など。テストが行われた条件と関連する解剖学的位置と同様に。

しかし、テスト結果を除外します。診断の詳細を提供します。病気の診断を説明する任意のテキスト文を含む。

最終的な診断があいまいであっても。すべての実験室値とテスト結果を提供します。診断テストの名前、それらの値、およびテストが実行された条件を含みます。

数値値と定性的値の両方を使用することは許容されます。病理の詳細を提供する。病理および組織学研究のすべての結果を説明するテキスト文を含む。

グロス病理、免疫学、顕微鏡検査などの研究。一部の用語は、診断手法および手順のセクションで使用されるものと重複する場合があります。薬理療法のすべてを提供します。

治療の過程で使用される薬物療法と、いつ、どのように治療が停止されたかを説明するテキスト文を含む。抗生物質や特定の薬物名などの一般的な用語を使用する。すべての介入手順を提供します。

治療の過程で使用される治療手順と、処置がいつどのように停止されたかを説明するテキスト文と侵襲的な手順を含む。他の治療法を容易にするために完了した医療機器または手順の移植。患者の結果を提供する。

報告書に記載された臨床プレゼンテーションの終わりの時点で患者の健康を説明する任意のテキスト文を含む。フォローアップテストを含む。次に、すべての診断画像、図、ビデオ、またはアニメーションと表の数を提供します。

レポートに含まれるビジュアル メディアの全カウントを、指定された形式で含める。図と画像を区別するために、臨床診断の任意の製品として画像をカウントします。写真、マイクログラフ、心電図リズム画像または画像診断の他の製品を含む。

図は他のすべての画像を考慮する必要がありますが。一般的に、データプロットとイラストを含みます。この表では、完成した臨床症例レポートのメタデータ注釈の2つのセットの例を示す。

最初の例には、各値の理想的な形式を示すモック データが含まれています。2番目の例には、まれな状態に関する実際に公表された臨床症例報告から抽出された値が含まれています。アクロ皮膚炎エンゴパチア.この方法は、フリーテキストの臨床文書の注釈に人間と自動化の両方のアプローチを容易にします。

構造化メタデータ標準テンプレートを作成することにより、その情報がアクセス可能で有用であることを保証します。このメソッドによって生成されるメタデータは、名前付きエンティティ認識などの下流のテキスト分析をサポートします。研究者は、生物医学文献に代表される患者コホート全体の徴候や症状、診断技術と手順、および実験室の値に関する情報を抽出することを可能にします。