Single-cell RNA Sequencing and Analysis of Human Pancreatic Islets

Yurong Xin; Christina Adler; Jinrang Kim; Yueming Ding; Min Ni; Yi Wei; Lynn Macdonald; Haruka Okamoto

doi:10.3791/59866

JoVE Journal
Genetics

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JoVE Journal Genetics

Single-cell RNA Sequencing and Analysis of Human Pancreatic Islets

ヒト膵島の単一細胞RNAシーケンシングと解析

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11:34 min

July 18, 2019

DOI: 10.3791/59866-v

Yurong Xin¹, Christina Adler¹, Jinrang Kim¹, Yueming Ding¹, Min Ni¹, Yi Wei¹, Lynn Macdonald¹, Haruka Okamoto¹

¹Regeneron Pharmaceuticals, Inc

Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.

ここでは、液滴ベースのマイクロ流体単一細胞RNAシーケンシング技術を用いて、単体ヒト膵島から単一細胞の高品質で大規模なトランスクリプトームデータを生成するプロトコルを提示する。

このプロトコルは、個々のヒト小胞体細胞の高スループット転写データを生成し、アノクロム細胞の異種性の研究、希少細胞タイプの同定、疾患における遺伝子調節に使用することができる。この手法は、より大きなスケールの単一セルデータを生成し、使いやすく、処理時間がかなり短い。この方法は、他の種からの小島に適用され、他の新たに単離された組織をプロファイルすることができます。

しかし、プロトコルは、組織固有の解離手順に合わせて最適化する必要があります。高品質の解体細胞を準備することが重要です。.単一セル分割前の細胞懸濁液のQCが重要であり、エマルジョンを慎重かつ迅速に処理している。

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