IR-TEx:マラリアベクトルアノフェレスガンビア用に設計されたビッグデータトランスクリプトミクスのためのオープンソースデータ統合ツール

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2020年1月15日

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Victoria A. Ingham¹ , Andrew Bennett² , Duo Peng³ , Simon C. Wagstaff² , Hilary Ranson¹

¹Vector Biology, Liverpool School of Tropical Medicine, ²Research Computing Unit, Liverpool School of Tropical Medicine, ³Department of Immunology and Infectious Diseases, Harvard T.H. Chan School of Public Health

IR-TExは、種アノフェレスガンビアで殺虫剤耐性関連転写プロファイルを探索します。ここでは、アプリケーションの使用方法、複数のトランスクリプトミックデータセットを探索するための変更、およびフレームワークを使用して、任意のプラットフォームで生成された任意の生物からのトランスクリプトミクトミックデータの収集用の対話型データベースを構築するための完全な手順について説明します。

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