Name: 遺伝子機能解析のためのダイズ毛状根形質転換 (動画) | JoVE Journal
Uploaded: 2023-05-05T14:40:00.000+00:00
Duration: 7 min 34 s
Description: 学ぶダイズ毛状根形質転換法による遺伝子機能解析。CRISPR-Cas9やRNAiを用いて複数遺伝子を同時に研究し、ポリジェニックネットワークの理解を促進します。安定形質転換前の最適戦略決定に有用です。

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この研究は、カナダ自然科学工学研究評議会(NSERC)の助成金番号RGPIN-2020-06111とブラッドレースからの寛大な寄付によって資金提供されました。K599ア グロバクテリウム と予備プロトコールを提供してくれたWayne Parrott氏(ジョージア大学)と、pGWB2、pGWB6、およびpANDA35HK空ベクターを提供してくれたNakagawa & Hachiya Labs(島根大学)に感謝します。

注意: すべての手順を無菌条件下で実行することをお勧めします。
1.大豆種子の殺菌
<ol><li>バイオセーフティキャビネットに、16〜20個の丸いウィリアムズ82大豆種子を手付かずの状態(つまり、ひび割れや傷がない)で50mLの遠沈管に入れます。</li>
	<li>30 mLの70%イソプロピルアルコールを加え、30秒間軽く振ってから、アルコールをデカントします。</li>
	<li>種子を30 mLの10%漂白剤で10秒間静かに振とうし、種子を室温(RT、25°C)で5分間溶液に入れます。5分後、漂白剤を排出します。</li>
	<li>すすぎごとに1分間、30mLの滅菌超高純度H2Oで3回振とうを繰り返し、各すすぎの間にH2Oを廃棄します。</li>
	<li>滅菌した種子を、5 mLの発芽共培養(GC)培地(オートクレーブ半強度液体ムラシゲおよびスクーグ[MS]培地と1%スクロース[pH = 5.8]で飽和させたろ紙に置き、次に2.5 mL / Lビタミンを添加します)滅菌シャーレに入れます。</li>
	<li>プレートを室温(25°C)の暗所に3日間置いた後、プレートを22°Cで16時間の冷白色T5蛍光灯(100 μE m-2·s-1)の下で4日間移し、種子を発芽させました。 注意: しわやひびの入った種は捨てます。最高の種子は大きくて均一に黄色のものです。一部の種子は損傷、病気、または発芽の失敗のために最適ではない可能性があるため、実験に必要な種子の数の少なくとも2倍を滅菌して、高品質の種子を選択します。</li>
</ol>2. K599による子葉の感染
注:pGWBシリーズベクターは、二重選択によりT-DNAカセット全体のゲノム統合が保証されるため、使用してください。エレクトロポレーションを用いて、目的の遺伝子を保持するバイナリーベクターを A. rhizogenes pRi265918に形質転換した。
<ol><li>A.リゾゲネスpRi2659プラスミド18の配列に基づいて、Tiプラスミド遺伝子VirD2を検出するためのプライマーを設計した(VirD2フォワード:5'-CCCGATCGAGCTCAAGTTAT-3';VirD2 リバース: 5'-TCGTCTGGCTGACTTTCGT-3';予想される増幅サイズ:221 bp)。形質転換後、PCRキットを使用して、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によるVirD2の保持についてアグロバクテリウムコロニーをテストします(材料の表を参照)。PCRサイクル:94°Cで3分間;35サイクル(94°Cで1分間、58°Cで30秒間、72°Cで1分間);72°Cで10分間。</li>
	<li>VirD2と目的遺伝子(GOI)の両方を含むA.リゾゲネスコロニーを選択した後、目的のプラスミドに適した抗生物質(50 mg/L)を含むLuria-Bertani(LB)培地プレートに一部をストリークアウトし、30°Cで一晩インキュベートします。 スペクチノマイシンを使用する場合は、100 mg / Lの濃度を追加します。</li>
	<li>P200ピペットチップを使用して、LBプレートから長さ~1.5 cmのK599 アグロバクテリウム をこすり落とし、細胞を1 mLのリン酸緩衝液(PB;0.01 M Na2HPO4、0.15 M NaCl、pH 7.5)に再懸濁します。</li>
	<li>滅菌済みの超高純度H2O(v / v = 1:1)およびアセトシリンゴン(AS;ジメチルスルホキシド[DMSO]中の100 mMストック、v / v = 1:1000)でアグロバクテリウムを希釈します。キュベットチューブを用いて光学密度600nm(OD600)で吸光度を測定します。予想される最適範囲は 0.5 から 0.8 の間です。</li>
	<li>バイオセーフティキャビネットで、滅菌したメスをK599 アグロバクテリウム 溶液に浸し、子葉の内面(軸方向、平らな面)に沿って1 mmの深さの切り込みを入れます。接種中は、子葉を安定させるために滅菌鉗子を使用してください。</li>
	<li>ASでGC培地で飽和させたろ紙を含むシャーレに、切り取った約6〜8個の子葉を下にして置きます。 注:6枚のプレートを調製するには、50 mLのGC培地と50 μLの100 mM ASで最終濃度100 μMを達成するだけで十分です。</li>
	<li>プレートをRT(25°C)で16時間の日長(~65 μE)下で3日間インキュベートします。</li>
	<li>感染した子葉を毛状根成長(HRG)プレート(3%スクロース[pH = 5.8]および2.6 g / Lゲルザンを含むオートクレーブ半強度MS)に移し、2.5 mL / Lビタミン混合物と500 mg / Lティメンチンを追加します)。 注:いくつかの代替ベンダーのtimentinにはいくつかの問題がありましたが、そのうちK599は排除されませんでした。HRG培地には、背の高いペトリ皿プレート(100 mm x 25 mm)を使用することをお勧めします。</li>
	<li>長さ2〜3 cmの二次根を持つ一次根が観察されるまで(~3〜4週間)、16時間の日長でパラメータを100 μE光に設定して、成長チャンバー内で22°CでHRGプレートをインキュベートします。</li>
</ol>3. 人材の選定と獲得
<ol><li>カルスから成長し、二次根(長さ2〜3 cm)を含む一次根(長さ5〜7 cm)を滅菌メスと鉗子を使用して収穫します。適切な抗生物質を含む選択HRGプレートに移します。選択したHRGプレートでHRをさらに5日間成長させます。 注:カナマイシン(50 mg / L)、ハイグロマイシン(50 mg / L)、またはホスフィノトリシン(10 mg / L)が通常選択に使用されます。発現ベクターの場合、pGWB2は過剰発現に、pANDA35HKはRNAiサイレンシングに、pGWB6は細胞内局在に、pMDC7は誘導発現に使用されます。</li>
	<li>5日目に、長さ3〜6 cmの二次根を持つトランスジェニックHRを収穫します。蛍光タンパク質を観察する場合、二次根はほとんど自家蛍光を有さない。エリシター処理や化学処理を行う場合は、二次根を1cmに切り、HRG寒天に~100mgを山状に据える。次に、パイルを80 μLの適切な処理で飽和させ、プレートをRT(25°C)でインキュベートします。</li>
	<li>所望の治療時間の後、RNAまたは代謝産物の抽出に進みます。</li>
	<li>RNAの場合は、滅菌したペーパータオルで根をすばやく軽くたたいて乾かし、2 mLのマイクロ遠心チューブに直接収穫します。</li>
	<li>パラフィルムを使用してチューブの上部をすぐに密封し、先のとがった鉗子を使用して2つの小さな穴を開け、チューブを液体窒素に浸します。凍結乾燥を3日間行い、サンプルを-80°Cで保存します。 注:白人のHRを選択することが不可欠です。選択的プレート上で5日間成長した後、トランスジェニックHRは白色のままであるが、非トランスジェニック根は茶色に変わる。</li>
</ol>

遺伝子組み換えダイズ毛根の高効率生産

<ol><li>Li, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimization+of+Agrobacterium-mediated+transformation+in+soybean%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Optimization of Agrobacterium-mediated transformation in soybean.</a> Frontiers in Plant Science. 8, 246(2017).</li>
<li>Elhady, A., Hallmann, J., Heuer, H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Symbiosis+of+soybean+with+nitrogen+fixing+bacteria+affected+by+root+lesion+nematodes+in+a+density-dependent+manner%5BTitle%5D)+AND+%22Scientific+Reports%22%5BJournal%5D)">Symbiosis of soybean with nitrogen fixing bacteria affected by root lesion nematodes in a density-dependent manner.</a> Scientific Reports. 10, 1619(2020).</li>
<li>Huang, X. -F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rhizosphere+interactions%3A+root+exudates%2C+microbes%2C+and+microbial+communities%5BTitle%5D)+AND+%22Botany%22%5BJournal%5D)">Rhizosphere interactions: root exudates, microbes, and microbial communities.</a> Botany. 92 (4), 267-275 (2014).</li>
<li>Ma, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Highly+efficient+Agrobacterium+rhizogenes-mediated+genetic+transformation+and+applications+in+citrus%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Highly efficient Agrobacterium rhizogenes-mediated genetic transformation and applications in citrus.</a> Frontiers in Plant Science. 13, 1039094(2022).</li>
<li>Hwang, H. -H., Yu, M., Lai, E. -M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agrobacterium-mediated+plant+transformation%3A+biology+and+applications%5BTitle%5D)+AND+%22The+Arabidopsis+Book%22%5BJournal%5D)">Agrobacterium-mediated plant transformation: biology and applications.</a> The Arabidopsis Book. 15, e0186(2017).</li>
<li>Gutierrez-Valdes, N., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Hairy+root+cultures-a+versatile+tool+with+multiple+applications%5BTitle%5D)+AND+%22Frontiers+in+Plant+Science%22%5BJournal%5D)">Hairy root cultures-a versatile tool with multiple applications.</a> Frontiers in Plant Science. 11, 33(2020).</li>
<li>Ono, N. N., Tian, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+multiplicity+of+hairy+root+cultures%3A+prolific+possibilities%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Science%22%5BJournal%5D)">The multiplicity of hairy root cultures: prolific possibilities.</a> Plant Science. 180 (3), 439-446 (2011).</li>
<li>Kereszt, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agrobacterium+rhizogenes-mediated+transformation+of+soybean+to+study+root+biology%5BTitle%5D)+AND+%22Nature+Protocols%22%5BJournal%5D)">Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation of soybean to study root biology.</a> Nature Protocols. 2 (4), 948-952 (2007).</li>
<li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soybean+hairy+roots+produced+in+vitro+by+Agrobacterium+rhizogenes-mediated+transformation%5BTitle%5D)+AND+%22The+Crop+Journal%22%5BJournal%5D)">Soybean hairy roots produced in vitro by Agrobacterium rhizogenes-mediated transformation.</a> The Crop Journal. 6 (2), 162-171 (2018).</li>
<li>Song, J., Tóth, K., Montes-Luz, B., Stacey, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Soybean+hairy+root+transformation%3A+a+rapid+and+highly+efficient+method%5BTitle%5D)+AND+%22Current+Protocols%22%5BJournal%5D)">Soybean hairy root transformation: a rapid and highly efficient method.</a> Current Protocols. 1 (7), e195(2021).</li>
<li>Fattahi, F., Shojaeiyan, A., Palazon, J., Moyano, E., Torras-Claveria, L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Methyl-%CE%B2-cyclodextrin+and+coronatine+as+new+elicitors+of+tropane+alkaloid+biosynthesis+in+Atropa+acuminata+and+Atropa+belladonna+hairy+root+cultures%5BTitle%5D)+AND+%22Physiologia+Plantarum%22%5BJournal%5D)">Methyl-β-cyclodextrin and coronatine as new elicitors of tropane alkaloid biosynthesis in Atropa acuminata and Atropa belladonna hairy root cultures.</a> Physiologia Plantarum. 172 (4), 2098-2111 (2021).</li>
<li>Farrell, K., Jahan, M., Kovinich, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Distinct+mechanisms+of+biotic+and+chemical+elicitors+enable+additive+elicitation+of+the+anticancer+Phytoalexin+Glyceollin+I%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules%22%5BJournal%5D)">Distinct mechanisms of biotic and chemical elicitors enable additive elicitation of the anticancer Phytoalexin Glyceollin I.</a> Molecules. 22 (8), 1261(2017).</li>
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<li>Tong, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+complete+genome+sequence+of+cucumopine-type+Agrobacterium+rhizogenes+strain+K599+%28NCPPB2659%29%2C+a+nature%27s+genetic+engineer+inducing+hairy+roots%5BTitle%5D)+AND+%22International+Journal+of+Agriculture+Biology%22%5BJournal%5D)">The complete genome sequence of cucumopine-type Agrobacterium rhizogenes strain K599 (NCPPB2659), a nature's genetic engineer inducing hairy roots.</a> International Journal of Agriculture Biology. 20 (5), 1167-1174 (2018).</li>
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<li>Jahan, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Glyceollin+transcription+factor+GmMYB29A2+regulates+soybean+resistance+to+Phytophthora+sojae%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Physiology%22%5BJournal%5D)">Glyceollin transcription factor GmMYB29A2 regulates soybean resistance to Phytophthora sojae.</a> Plant Physiology. 183 (2), 530-546 (2020).</li>
<li>Jahan, M. A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+NAC+family+transcription+factor+GmNAC42-1+regulates+biosynthesis+of+the+anticancer+and+neuroprotective+glyceollins+in+soybean%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Genomics%22%5BJournal%5D)">The NAC family transcription factor GmNAC42-1 regulates biosynthesis of the anticancer and neuroprotective glyceollins in soybean.</a> BMC Genomics. 20, 149(2019).</li>
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<li>Chen, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Overexpression+of+transcription+factor+GmTGA15+enhances+drought+tolerance+in+transgenic+soybean+hairy+roots+and+Arabidopsis+plants%5BTitle%5D)+AND+%22Agronomy%22%5BJournal%5D)">Overexpression of transcription factor GmTGA15 enhances drought tolerance in transgenic soybean hairy roots and Arabidopsis plants.</a> Agronomy. 11 (1), 170(2021).</li>
<li>Savka, M., Ravillion, B., Noel, G., Farrand, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Induction+of+hairy+roots+on+cultivated+soybean+genotypes+and+their+use+to+propagate+the+soybean+cyst+nematode%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Induction of hairy roots on cultivated soybean genotypes and their use to propagate the soybean cyst nematode.</a> Phytopathology. 80 (5), 503-508 (1990).</li>
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<li>Sharma, A. R., Gajurel, G., Ahmed, I., Roedel, K., Medina-Bolivar, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Induction+of+the+prenylated+stilbenoids+arachidin-1+and+arachidin-3+and+their+semi-preparative+separation+and+purification+from+hairy+root+cultures+of+peanut+%28Arachis+hypogaea+l.%29%5BTitle%5D)+AND+%22Molecules%22%5BJournal%5D)">Induction of the prenylated stilbenoids arachidin-1 and arachidin-3 and their semi-preparative separation and purification from hairy root cultures of peanut (Arachis hypogaea l.).</a> Molecules. 27 (18), 6118(2022).</li>
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</ol>

著者は開示するものは何もありません。

過去10年間で、大豆HR法は、窒素固定22,23、生物的および非生物的ストレス耐性24,25、および代謝物生合成経路26,27に関与する遺伝子を研究するための強力なツールとして開発されてきました。植物がどのように代謝産物を産生するかについての知識は、病原体に対する生化学的防御の媒介に関与する遺伝子ネットワークを研究するために使用できるため、農業生産および製薬業界に多くの利点があります28。
生産性とコスト効率を優先するために、このプロトコルは手順を簡素化します。例えば、ゲル化剤を含むより高価な固体培地を使用する代わりに、大豆種子は、液体成長培地で飽和された工業用グレードのペーパータオルを...

大豆(グリシンマックス)は農業で最も価値のある作物の一つです。食品、動物飼料、石油など、何千もの商業的および産業的用途があり、製造用の原材料の供給源として使用されています1。窒素固定土壌微生物、すなわち根粒菌と共生関係を形成する能力は、ダイズ遺伝学研究の重要性をさらに高めます2。たとえば、大豆の根の窒素固定特性を微調整すると、炭素排出量の削減につながり、窒素肥料の要件を大幅に削減できます3。したがって、特にダイズ根生物学の側面を制御する遺伝学を理解することは、農業や産業に広く応用されています。これらの利点を考慮すると、ダイズ遺伝子の機能を解析するための信頼性の高いプロトコルを持つことが重要です。
アグロバクテリウム・ツメファシエンスは、多くの植物種の核ゲノムにトランスファーDNA(T-DNA)を統合する能力を持っているため、おそらく植物の遺伝子形質転換に最も一般的に使用されるツールです。アグロバクテリウム菌が植物に感染すると、腫瘍誘導(Ti)プラスミドが宿主染色体に移され、感染部位に腫瘍が形成されます。 アグロバクテリウムを介した形質転換は、遺伝子機能解析や作物形質改変のために何十年にもわたって広く使用されてきました4。目的の遺伝子は、A. tumefaciensを介した形質転換を介して宿主植物細胞に容易に導入することができるが、この方法にはいくつかの欠点がある。時間と費用がかかり、大豆などの多くの植物種について広範な専門知識が必要です。A. tumefaciensを用いた子葉節アプローチでは、数種類のダイズを形質転換することができるが、このアプローチの非効率性は、迅速かつ高効率の代替遺伝子形質転換技術を必要とする4,5。専門家でなくても、このアグロバクテリウム根圏媒介毛根(HR)形質転換法を使用して、これらの欠点を克服することができます。
HR形質転換は、遺伝子機能の解析だけでなく、特殊な代謝物やファインケミカル、複雑な生理活性糖タンパク質の製造などのバイオテクノロジーアプリケーションにも比較的高速なツールです6。ダイズHRの生産は、子葉の表面を傷つけた後、アグロバクテリウム根粒菌を接種することによって生成できるため、広範な専門知識を必要としません7。 A. rhizogenesは、そのTiプラスミドによってコードされる病原性(Vir)遺伝子を発現し、そのT-DNAセグメントを植物細胞のゲノムに転写、運搬、および統合すると同時に、異所性根の成長を刺激します8。
バイオリスティックスやA. tumefaciensベースの組織、細胞、臓器培養の形質転換などの他のダイズ遺伝子発現システムと比較して、HR発現システムはいくつかの利点を示します。第一に、HRは遺伝的に安定しており、ホルモンフリー培地で迅速に産生されます1,9,10。さらに、HRは、天然の根と同等以上の量の特殊な代謝産物を産生することができます11,12。これらの利点により、HRは、A. tumefaciensと互換性のない植物種、または互換性のある組織を形成するために特別な組織培養条件を必要とする植物種にとって望ましいバイオテクノロジーツールになります。HR法は、RNAシーケンシングを用いて、タンパク質間相互作用、タンパク質細胞内局在、組換えタンパク質産生、ファイトレメディエーション、突然変異誘発、およびゲノムワイド効果を解析するための効率的なアプローチです13、14、15。また、重要な微生物病原体であるフィトフトラ・ソーヤに対する大豆の防御を薬用し、ヒトで印象的な抗癌作用と神経保護作用を持つグリセオリンなど、業界で価値のある特殊な代謝産物の生産を研究するためにも使用できます16,17。
このレポートは、大豆HRを生成するための簡単で効率的なプロトコルを示しています。 以前のHR形質転換法と比較して、このプロトコルは、ダイズ子葉に接種する前にTiプラスミドの存在について A.リゾゲネス 形質転換体を事前にスクリーニングすることにより、HR形成率の有意な(33%-50%)改善を提供します。ダイズ転写因子遺伝子を過剰発現またはサイレンシングするいくつかのバイナリベクターを形質転換することにより、このプロトコルの適用性を実証します。

<table><tbody><tr><td>アセトシリンゴン</td>ケイ<td>マン</td><td>23224</td><td></td></tr><tr><td>漂白剤</td><td></td><td>21124DMSO</td><td></td></tr><tr><td></td><td>フィッシャーバイオ試薬</td><td>195679</td><td></td></tr><tr><td>ゲルザン</td><td>フィトテック</td><td>HYY3251089A</td><td></td></tr><tr><td>ハイグロマイシン</td><td>フィトテック</td><td>HHA0397050B</td><td></td></tr><tr><td>イソプロピルアルコール</td><td>フィッシャー化学</td><td>206462</td><td></td></tr><tr><td>Kanamycin</td><td>Phytotech</td><td>SQS0378007G</td><td></td></tr><tr><td>LBパウダー</td><td>フィッシャーバイオ試薬</td><td>200318</td><td></td></tr><tr><td>MSパウダー</td><td>ケーソンラボ</td><td>2210001</td><td></td></tr><tr><td>Na2HPO4</td><td>Fisherバイオ試薬</td><td>194171</td><td></td></tr><tr><td>NaCl</td><td>フィッシャー化学</td><td>192946</td><td></td></tr><tr><td>ペトリ皿</td> フィ<td>ッシャーブランド</td><td>08-757-11</td><td>100 mm x 25 mm</td></tr><tr><td>ホスフィノトリシン</td><td>シダーラン</td><td>P034-250MG</td><td></td></tr><tr><td>REDExtract-N-Amp PCR キット</td><td>Sigma</td><td>R4775</td><td></td></tr><tr><td>ショ糖</td><td>バイオショップ</td><td>2D76475</td><td></td></tr><tr><td>チメンチン</td><td>ケーソン ラボ</td><td>12222002</td><td></td></tr><tr><td>ビタミン</td><td>ケーソン ラボ</td><td>2211010</td><td></td></tr></tbody></table>

遺伝子機能解析のためのダイズ毛状根形質転換

Soybean Hairy Root Transformation for the Analysis of Gene Function

大豆(グリシンマックス)は、何千もの産業用途を持つ農業における貴重な作物です。ダイズの根は、窒素や病原菌を固定するために共生する土壌微生物との相互作用の主要な場所であり、ダイズの根の遺伝学を含む研究は、その農業生産を改善するために最も重要です。ダイズ毛状根(HR)の遺伝子形質転換は、 アグロバクテリウム・リゾゲネス NCPPB2659株(K599)によって媒介され、ダイズ根の遺伝子機能を研究するための効率的なツールであり、開始から終了までわずか2か月かかります。ここでは、ダイズHRで目的の遺伝子を過剰発現およびサイレンシングする方法を概説する詳細なプロトコルを提供します。この方法論には、ダイズ種子の滅菌、K599による子葉の感染、およびRNA単離および必要に応じて代謝物分析のための遺伝子形質転換HRの選択と収穫が含まれます。このアプローチのスループットは、複数の遺伝子またはネットワークを同時に研究するのに十分であり、長期的に安定した形質転換アプローチに取り組む前に最適な工学戦略を決定することができます。

代表的な結果は、公表されたデータ19、20からのものである。形質転換K599 アグロバクテリウム 菌のコロニーPCR(cPCR)結果を 図1に示す。図 1に陽性コロニーによって示されるように、目的の遺伝子はcPCRによって検出された(図1A)。しかし、コロニーの3分の1から2分の1は VirD2 遺伝子スクリーニングに陰性であり(図1B)、Tiプラスミドの喪失を示しており、カルスや毛状の根を生成することができません。 図2 は、ダイズHRの全体的な調製手順と遺伝子発現解析を示しています。 図3 は、GFP-GmJAZ1-6の細胞内局...

ここでは、トランスジェニックダイズ毛根の高効率生産のためのプロトコルを提示します。

Soybean (Glycine max) is a valuable crop in agriculture that has thousands of industrial uses. Soybean roots are the primary site of interaction with ...

私たちのダイズ毛状形質転換法は、複数の遺伝子またはネットワークの機能を同時に研究するのに十分であり、長期的に安定した形質転換アプローチに取り組む前に最適な工学戦略を決定することができます。ダイズ毛状根形質転換は、ダイズ植物の遺伝子機能解析に有用なツールです。現在使用されている技術には、CRISPR-Cas9ゲノム編集、RNA干渉、トランスクリプトミクスとプロテオミクス、およびイメージング技術が含まれます。機能ゲノミクスのモデル時代における大きな課題は、多数の遺伝子の機能を十分に解析することです。ほとんどの遺伝子は多遺伝子であり、多くの遺伝子の相互作用によって達成されます。私たちの毛深い根のプロトコルは、十分なスループットで遺伝子機能解析を容易にし、ポリジーンネットワークを理解し始めることができます。我々は、アグロバクテリウム根圏菌株におけるTiプラスミドの重要性を確立しました。Tiプラスミドをスクリーニングしないと、形質転換ダイズ子葉が色を出さないリスクが高まることがわかりました。その結果、プラスミドのスクリーニングは形質転換前の重要なステップとなりました。他の遺伝子発現技術と比較して、当社の毛根発現システムは取り扱いが容易で、時間がかからず、費用対効果に優れています。また、私たちの新しいプロトコルは、子葉の形質転換前にTiプラスミドとアグロバクテリウムをチェックすることにより、毛状根の形質転換率を最大50%向上させました。12を超える転写因子遺伝子の機能を特徴付けることにより、私たちの最近の結果は、植物における貴重なファイトアレキシン代謝物の生合成を解き放つことを目的とした多遺伝子工学研究への道を開いた。将来的には、この毛状根形質転換法を用いて、ファイトアレキシンの生合成を制御する転写因子遺伝子ネットワークを解剖する予定です。このアプローチは、製薬および農業産業向けのこれらの特殊な代謝産物の生産を強化するために使用できます。

soybean-hairy-root-transformation-for-the-analysis-of-gene-function

Research

JoVE Journal

Bioengineering

バイオエンジニアリング（生体工学）

プロモーター発現解析は遺伝子の規則の理解と標的遺伝子発現の時空間を改善するために重要です。ここを識別、分離、および植物プロモーターのクローンを作成するためのプロトコルを提案する.さらに、一般的な豆毛状根における根粒特異プロモーターの特性について述べる。...

植物プロモーター解析: 同定とルート、インゲンの根粒特異的プロモーターの解析

我々 は生きているセルで複雑な規制とシグナル伝達メカニズムを研究するダイズプロトプ...

簡便な分離大豆プロトプ ラストと一過的遺伝子発現解析への応用

我々は、アグロバクテリウム・リゾゲネスによって毛深い根を誘導する方法を記述する -...

アグロバクテリウム・リゾゲネスによる毛深い根を誘発する -タータルソバにおける媒介性形質転換(ファゴピラム・タタリカム)

ここでは、複合植物を生産するために アグロバクテリウムツメファシエンス...

アグロバクテリウム・リゾゲネスに基づく毛状根形質転換による効率的かつ再現性の高い複合植物の生産法

プロトコルは シロイヌナズ ナの第一次花序の茎および Brassicaのnapusの hypocotylsを使用して毛が付いている根の誘導を記述する。毛むくじゃらの根は培養され、トランスジェニック植物を再生するための外植片として使用できます。...

シロイヌナズナとアブラナ属の毛根の変形と再生

これは、目的、操作、そして斬新な重力の分光計からの代表的な結果を示すステップバイステップガイドです。...

繊維状タンパク質をストレッチし、測定する新しい重力分光器の使用を実証

この資料では、RootChipのシロイヌナズナ実生の栽培のためのプロトコル、細胞内の代謝産物レベルの微視的なルートのモニタリングおよびFRETベースの測定と成長条件の自動制御を組み合わせたマイクロイメージングプラットフォームを提供します。...

RootChipを使用して、ルート環境の急激な操作によるシロイヌナズナの根の成長のタイムラプス蛍光イメージング

ナノ粒子トラッキング解析（NTA）とポリマー遺伝子送達ナノ粒子を評価するためのハイスループットフローサイトメトリーのためのプロトコルが記載されている。国税庁は、ナノ粒子の粒度分布およびプラスミド当たり粒子分布を特徴付けるために利用される。ハイスループットフローサイトメトリーは、遺伝子送達バイオマテリアルのライブラリの定量的なトランスフェクション効率の評価を可能にします。...

ナノ粒子トラッキング分析とハイスループットフローサイトメトリーによる高分子遺伝子デリバリーナノ粒子の評価

このプロトコルは、電気細胞 - 基質インピーダンスセンシング、細胞の付着、増殖、運動性、および薬理学的および毒性刺激に対する細胞応答の定量化のための接着細胞のインピーダンススペクトルを記録し、分析する方法を検討します。内皮透過性および細胞 - 細胞および細胞 - 基質接点の評価の検出が強調される。...

内皮増殖、バリアー機能、運動性の定量のための電気細胞 - 基質インピーダンスセンシング

二本鎖RNA干渉（dsRNAi）技術は、より低い植物リグニン含量にトウモロコシシンナモイル補酵素Aレダクターゼ（ZmCCR1）遺伝子をダウンレギュレートするために採用される。細胞壁からのリグニンのダウンレギュレーションは、顕微鏡分析によって可視化しクラソン法により定量される。ヘミセルロースおよび結晶セルロース中の組成変化を分析する。...

のリグニンダウンレギュレーション<em&gt;トウモロコシ</em&gt; dsRNAiとクラソンリグニン分析によって

学ぶダイズ毛状根形質転換法による遺伝子機能解析。CRISPR-Cas9やRNAiを用いて複数遺伝子を同時に研究し、ポリジェニックネットワークの理解を促進します。安定形質転換前の最適戦略決定に有用です。

遺伝子機能解析のためのダイズ毛状根形質転換

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